Grupos de pesquisa do Instituto das Cidades (grupos certificados pela Unifesp e cadastrados no CNPq)

- Centro de Estudos Periféricos (CEP)
Coordenação: Tiaraju Pablo D'Andrea

- Cidade, Participação e Educação
Coordenação: Jorge Luiz Barcellos da Silva

- Transborda - Estudos da Urbanização Crítica
Coordenação: Magaly Marques Pulhez; Guilherme Moreira Petrella

- LANAUrb - Laboratório de Narrativas Urbanas
Coordenação: Joana da Silva Barros; Ricardo Santhiago