Sistema de Seleção Unificado, que utiliza a nota do Exame Nacional de Ensino Médio – ENEM é o único meio de ingresso para alguns cursos ministrados na UNIFESP. Todo o procedimento é administrado pelo Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anisio Teixeira – INEP.

Além do ENEM, alguns cursos da UNIFESP aplicam uma prova complementar e enquadram-se assim no Sistema Misto de Ingresso. A nota final do candidato é obtida conjugando-se as notas do ENEM e da UNIFESP.

 Curso modalidade a distância (EAD), cujo meio de ingresso dá-se exclusivamente com base nos resultados obtidos pelos estudantes no Exame Nacional do Ensino Médio - ENEM.