Marcelo Afonso Vallim
Instituto de Ciência e Tecnologia
Programa de Pós-Graduação: Biologia Química
Programa de Pós-Graduação: Biotecnologia
E-Mail: marcelo.vallim@unifesp.br
Resumo
Fonte: Lattes CNPq
Nomes em citações bibliográficas
VALLIM, M A;Vallim, MA;Vallim, Marcelo Afonso;Vallim, Marcelo A.;VALLIM, MARCELO;Vallim, Marcelo Affonso;VALLIM, MARCELO AFONSO
Exportar dados
Exportar produção no formato BIBTEX
Perfis na web
Tags mais usadas
Pular nuvens de palavrasIdiomas
Inglês
Compreende bem, Fala bem, Lê bem, Escreve bem
Espanhol
Compreende razoavelmente, Fala pouco, Lê razoavelmente, Escreve pouco
Italiano
Compreende razoavelmente, Fala razoavelmente, Lê razoavelmente, Escreve pouco
Formação
Doutorado em Genetica e Melhoramento de Plantas
Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase.
Genética Molecular e de Microorganismos
Orientação: Aline Aparecida Pizzirani-Kleiner
Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz
Mestrado em Genetica e Melhoramento de Plantas
Clonagem de uma sequência genômica de Phanerochaete chrysosporium homóloga ao gene Beta-glucosidase de Trichoderma reesei.
Genética Molecular e de Microorganismos
Orientação: Aline Aparecida Pizzirani-Kleiner
Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz
1990 a 1994
Graduação em Ciencias Biologicas
Universidade Federal de São Carlos
1986 a 1989
Produção
2022
2020
-
Spectroscopic analysis of chicken meat contaminated with E. coli, Salmonella and Campylobacter (2020)
Artigo publicado
Autores: Lilia Coronato Courrol; VALLIM, MARCELO AFONSO
Fonte: FOOD ANALYTICAL METHODS (INTERNET) , v. - , p. - - Extrato QUALIS: A1
-
Biological functions of the autophagy-related proteins Atg4 and Atg8 in Cryptococcus neoformans (2020)
Artigo publicado
Autores: ROBERTO, THIAGO NUNES; LIMA, RICARDO FERREIRA; PASCON, RENATA CASTIGLIONI; IDNURM, ALEXANDER; Marcelo Afonso Vallim
Fonte: PLoS One , v. 15 , p. e0230981 - Extrato QUALIS: A1
-
Coumaric acid analogues inhibit growth and melanin biosynthesis in Cryptococcus neoformans and potentialize amphotericin B antifungal activity (2020)
Artigo publicado
Autores: OLIVEIRA, LIDIANE; PASCON, RENATA C.; Márcio Ferrarini; DOS SANTOS, ALEXANDRE PAES; Marina Themoteo Varela; CORRÊA, ISABELA TERESA SANTOS; André Gustavo Tempone; MELHEM, MARCIA S.C.; VALLIM, MARCELO A.; João Paulo dos Santos Fernandes
Fonte: EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES , v. 153 , p. 105473 - Extrato QUALIS: A1
2019
-
Amino acid permeases in Cryptococcus neoformans are required for high temperature growth and virulence; and are regulated by Ras signaling (2019)
Artigo publicado
Autores: CALVETE, CRISLAINE LAMBIASE; MARTHO, KEVIN FELIPE; FELIZARDO, GABRIELLE; PAES, ALEXANDRE; NUNES, JOÃO MIGUEL; FERREIRA, CAMILA OLIVEIRA; Marcelo Afonso Vallim; Pascon, Renata C.
Fonte: PLoS One , v. 14 , p. e0211393 - Extrato QUALIS: A1
-
First report of cis-1,4-polyisoprene degradation by Gordonia paraffinivorans (2019)
Artigo publicado
Autores: BRAGA, STEFANIA PEGORIN; Marcelo Afonso Vallim; PASCON, RENATA CASTIGLIONI; DOS SANTOS, ALEXANDRE PAES; PAGANINI, THAIS; BARBOSA, DEIBS; EPAMINO, GEORGE WILLIAN CONDOMITTI; MORAIS, CARLOS; MARTINS, LAYLA FARAGE; SILVA, ALINE MARIA; SETUBAL, JOÃO CARLOS
Fonte: BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 50 , p. 1 - Extrato QUALIS: A2
-
The Glycerol Phosphatase Gpp2: A Link to Osmotic Stress, Sulfur Assimilation and Virulence in Cryptococcus neoformans (2019)
Artigo publicado
Autores: Kevin Felipe Cruz Martho; BRUSTOLINI, OTÁVIO J. B.; VASCONCELOS, ANA TEREZA; Marcelo Afonso Vallim; PASCON, RENATA C.
Fonte: Frontiers in Microbiology , v. 10 , p. 2728 - Extrato QUALIS: A2
-
The regulation of the sulfur amino acid biosynthetic pathway in Cryptococcus neoformans: the relationship of Cys3, Calcineurin, and Gpp2 phosphatases (2019)
Artigo publicado
Autores: DE MELO, AMANDA TEIXEIRA; Pascon, Renata C.; MARTHO, KEVIN FELIPE; ROBERTO, THIAGO NUNES; NISHIDUKA, ERIKA S.; MACHADO, JOEL; BRUSTOLINI, OTÁVIO J. B.; TASHIMA, ALEXANDRE K.; VASCONCELOS, ANA TEREZA; Marcelo Afonso Vallim
Fonte: Scientific Reports , v. 9 , p. 11923 - Extrato QUALIS: A1
-
AKT/protein kinase B associates with β-actin in the nucleus of melanoma cells (2019)
Artigo publicado
Autores: COA, LARISSA LEGGIERI; ABREU, THIAGO FERREIRA; TASHIMA, ALEXANDRE KEIJI; GREEN, JANAINA; PASCON, RENATA CASTIGLIONI; Marcelo Afonso Vallim; MACHADO-JR, JOEL
Fonte: BIOSCIENCE REPORTS , v. 39 , p. BSR20181312 - Extrato QUALIS: B1
2018
-
A Wor1-like transcription factor is essential for virulence of Cryptococcus neoformans (2018)
Artigo publicado
Autores: Hugo Costa Paes; Maria Sueli Soares Felipe; Larissa Fernandes; Lorena da Silveira Derengowski; Luísa de Franco Ferreira Peconick; Patrícia Albuquerque; Georgios Joannis Pappas; Andre Moraes Nicola; Fabiana Brandão Alves Silva; Marcelo Afonso Vallim; J A Alspaugh
Fonte: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 8 , p. 369 - Extrato QUALIS: A2
2017
-
Chemical Composition and In Vitro Cytotoxic and Antimicrobial Activities of the Essential Oil from Leaves of Zanthoxylum monogynum St. Hill (Rutaceae) (2017)
Artigo publicado
Autores: SILVA, FERNANDA; SANTOS, NARA; Pascon, Renata; Marcelo Afonso Vallim; FIGUEIREDO, CARLOS; MARTINS, ROBERTO; Sartorelli, Patricia
Fonte: Medicines , v. 4 , p. 31 - Extrato QUALIS: C
-
The role of Aspartyl aminopeptidase (Ape4) in Cryptococcus neoformans virulence and authophagy (2017)
Artigo publicado
Autores: Fabiano de Assis Gontijo; Amanda Teixeira de Melo; Renata C Pascon; Marcelo Afonso Vallim; L Fernandes; Hugo Costa Paes; James Andrew Alspaugh; Marcelo A Vallim
Fonte: PLoS One , v. 12 , p. e0177461 - Extrato QUALIS: A1
2016
-
Cytotoxic and Antimicrobial Constituents from the Essential Oil of Lippia alba (Verbenaceae) (2016)
Artigo publicado
Autores: Nara O. Santos; Renata Pascon; Marcelo A Vallim; Carlos R. Figueiredo; Marisi Gomes Soares; Joao Henrique Ghilardi Lago; Patricia Sartorelli
Fonte: Medicines , v. 3 , p. 22 - Extrato QUALIS: C
-
Amino Acid Permeases and Virulence in Cryptococcus neoformans (2016)
Artigo publicado
Autores: Kevin Felipe Cruz Martho; Patricia Sartorelli; Marcelo Afonso Vallim; Renata C Pascon; Amanda Teixeira de Melo; Juliana Possato Fernandes Takahashi; Juliana Mariotti Guerra; Dayane Cristina da Silva Santos; Sônia Ueda Purisco; Marcia de Souza Carvalho Melhem; Raquel dos Anjos Fazioli; Clerlune Phanord
Fonte: Plos One , v. 11 , p. e0163919 - Extrato QUALIS: A1
2015
-
Chemical composition and antimicrobial activity evaluation of essential oils from Brazilian plants - Eremanthus erythropappus (Asteraceae), Plectrantuns barbatus, and P. amboinicus (Lamiaceae) (2015)
Artigo publicado
Autores: Nara O. Santos; Bruna Mariane; Joao Henrique Ghilardi Lago; Patricia Sartorelli; Marisi Gomes Soares; Adalberto Manoel da Silva; Harri Lorenzi; Marcelo A Vallim; Renata Pascon
Fonte: Molecules (Basel. Online) , v. 20 , p. 8440 - Extrato QUALIS: A2
-
The Role of Amino Acid Permeases and Tryptophan Biosynthesis in Cryptococcus neoformans Survival (2015)
Artigo publicado
Autores: FERNANDES, JOÃO DANIEL SANTOS; MARTHO, KEVIN; TOFIK, VERIDIANA; Marcelo Afonso Vallim; Pascon, Renata C.
Fonte: Plos One , v. 10 , p. e0132369 - Extrato QUALIS: A1
-
MALDI-TOF MS Assessment to Identify Environmental Mycobacteria (2015)
Artigo publicado
Autores: PAULA UZAM, CAMILLA PEREIRA DE; Cristina Viana Niero; BRIANESI, URZE ADOMAITIS; ROMAGNOLI, CAMILA; GOMES, KAREN MACHADO; Rafael Silva Duarte; Chimara, Erica; OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO DE; VALLIM, MARCELO AFFONSO; PASCON, RENATA CASTIGLIONI
Fonte: ADVANCES IN MICROBIOLOGY , v. 05 , p. 620 - Extrato QUALIS: B3
2014
-
The role of tryptophan biosynthetic genes TRP3 and TRP5 on the survival of C. neoformans and their applicability as drug targets (2014)
Trabalhos em eventos
Autores: João Daniel Fernandes; Veridiana Tofik; Joel Machado-Jr; Marcelo A Vallim; Marcelo Afonso Vallim; Renata C Pascon
Fonte: Mycoses: diagnosis, therapy and prophylaxix of fungal diseases , p. 57
-
B-Raf oncogenic mutation and cellular adhesion state modulate AKT nuclear localization in human melanoma cells. (2014)
Trabalhos em eventos
Autores: Larissa Coa; Sarah Franco Figueira; Pascon, Renata C.; Marcelo A Vallim; Marcelo Afonso Vallim; Joel Machado Junior
Fonte: Signalling and Acquired Resistance to Targeted Cancer Therapeutics
-
A simple and effective method to synthesize fluorescent nanoparticles using tryptophan and light and their lethal effect against bacteria (2014)
Artigo publicado
Autores: Ricardo Almeida de Matos; TOMITA, RAFAEL JUN; VALLIM, MARCELO AFONSO; Lilia Coronato Courrol
Fonte: Journal of Photochemistry and Photobiology. B, Biology , v. 140 , p. 157 - Extrato QUALIS: A1
-
The role of Aspartyl aminopeptidase (APE4) in Cryptococcus neoformans virulence and autophagy (2014)
Trabalhos em eventos
Autores: Marcelo A Vallim; Marcelo Afonso Vallim; Fabiano de Assis Gontijo; Pascon, Renata C.; Joel Machado-Jr; Larissa Fernandes
Fonte: Mycoses: diagnosis, therapy and prophylaxis of fungal diseases , p. 95
-
Structural Crystalline Characterization of Sakuranetin - An Antimicrobial Flavanone from Twigs of Baccharis retusa (Asteraceae) (2014)
Artigo publicado
Autores: Simone dos Santos Grecco; Paulete Romoff; Patricia Sartorelli; Joao Henrique Ghilardi Lago; Antonio Carlos Dorigueto; Kevin Marto; Ricardo Lima; Iara Landre; Marisi Gomes Soares; Renata Pascon; Marcelo A Vallim; Tabata M. Capello
Fonte: MOLECULES , v. 19 , p. 7528 - Extrato QUALIS: A2
-
The role of the de novo pyrimidine biosynthetic pathway in Cryptococcus neoformans high temperature growth and virulence (2014)
Artigo publicado
Autores: Fabiano de Assis Gontijo; Pascon, Renata C.; Larissa Fernandes; Joel Machado-Jr; J A Alspaugh; Marcelo Afonso Vallim
Fonte: Fungal Genetics and Biology (Print) , v. 70C , p. 12 - Extrato QUALIS: A3
-
The evaluation of bioremediation potential of a yeast collection isolated from composting (2014)
Artigo publicado
Autores: Bianca Trama; João Daniel dos Santos Fernandes; Georgia Labuto; Julio Cesar Franco de Oliveira; Cristina Viana Niero; Renata C Pascon; Marcelo Vallim
Fonte: Advances in Microbiology , v. 4 , p. 796 - Extrato QUALIS: B3
2013
-
So Paulo Zoo composting as a source of bacteria with bioremediation potential (2013)
Artigo publicado
Autores: Elisangela Souza Dutra; Renata C Pascon; Marcelo Afonso Vallim; Marcelo A Vallim
Fonte: AFRICAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY RESEARCH , v. 7 , p. 5200 - Extrato QUALIS: B3
-
Correction: Metagenomic Analysis of a Tropical Composting Operation at the São Paulo Zoo Park Reveals Diversity of Biomass Degradation Functions and Organisms (2013)
Artigo publicado
Autores: Layla Farage Martins; Eric H. Ostroski; Guilherme P.Telles; Zanoni Dias; João Batista da Cruz; Luiz Juliano Neto; Sergio Verjovski-Almeida; Aline Maria da Silva; João Carlos Setubal; Luciana Principal Antunes; Renata Castiglioni Pascon; Julio Cezar Franco de Oliveira; Luciano A. Digiampietri; Deibs Barbosa; Bruno Malveira Peixoto; Marcelo A Vallim; Marcelo Afonso Vallim; Cristina Viana-Niera
Fonte: Plos One , v. 8 , p. 61928 - Extrato QUALIS: A1
-
The Seasonal Variation of the Chemical Composition of Essential Oils from Porcelia macrocarpa R.E. Fries (Annonaceae) and Their Antimicrobial Activity (2013)
Artigo publicado
Autores: DA SILVA, ERICA; SOARES, MARISI; Mariane, Bruna; Marcelo Afonso Vallim; Pascon, Renata; Sartorelli, Patricia; LAGO, JOÃO
Fonte: Molecules (Basel. Online) , v. 18 , p. 13574 - Extrato QUALIS: A2
-
Metagenomic Analysis of a Tropical Composting Operation at the São Paulo Zoo Park Reveals Diversity of Biomass Degradation Functions and Organisms (2013)
Artigo publicado
Autores: Layla Farage Martins; Eric H. Ostroski; Guilherme P. Telles; Zanoni Dias; João Batista da Cruz; Luiz Juliano; Sergio Verjovski-Almeida; Aline Maria da Silva; Joao Carlos Setubal; Luciana Principal Antunes; Renata Castiglioni Pascon; Julio Cezar de Oliveira; Luciano A. Digiampietri; Deibs Barbosa; Bruno Malveira Peixoto; Marcelo Afonso Vallim; Cristina Viana Niero
Fonte: Plos One , v. 8 , p. e61928 - Extrato QUALIS: A1
2012
-
-
High temperature growth arrest in Cryptococcus neoformans madiated by APE4 an aspartyl amino peptidase involved in autophagy (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Pedro José Amorim-Pinto; Fabiano de Assis Gontijo; Renata C Pascon; Marcelo Afonso Vallim; L Fernandes; Vallim MA
Fonte: 11th European Conference on Fungal Genetics
-
The role of Cryptococcus neoformans URA4 on de novo pirimidine biosynthesis pathway and its impact upon high temperature growth (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Fabiano de Assis Gontijo; Pedro José Amorim-Pinto; Renata C Pascon; Marcelo Afonso Vallim; L Fernandes; Marcelo A Vallim
Fonte: 11th European Conference on Fungal Genetics
2011
-
Chemical and Biological Evaluation of Essential Oils from Two Species of Myrtaceae ¿ Eugenia uniflora L. and Plinia trunciflora (O. Berg) Kausel (2011)
Artigo publicado
Autores: Joao Henrique Ghilardi Lago; Santos, Roberta T. dos; Sartorelli, Patricia; Souza, Elisângela Dutra; Mariane, Bruna; Pascon, Renata; Vallim, Marcelo A.; Martins, Roberto Carlos C.; Baroli, Adriana A.; Carvalho, Bianca A.; Soares, Marisi G.
Fonte: Molecules (Basel. Online) , v. 16 , p. 9827 - Extrato QUALIS: A2
-
Amylolytic Microorganism from São Paulo Zoo Composting: Isolation, Identification, and Amylase Production (2011)
Artigo publicado
Autores: Pascon, Renata C.; Bergamo, Rogério Faria; Spinelli, Rafael Xavier; de Souza, Elisangela Dutra; Assis, Diego Magno; Juliano, Luiz; Marcelo Afonso Vallim
Fonte: Enzyme Research , v. 2011 , p. 1 - Extrato QUALIS: A4
-
Internally Quenched Fluorescent Peptide Libraries with Randomized Sequences Designed to Detect Endopeptidases (2011)
Artigo publicado
Autores: Oliveira, Lilian C.G.; Juliano, Maria A.; Juliano, Luiz; Silva, Vinícius O.; Okamoto, Debora N.; Kondo, Marcia Y.; Santos, Saara M.B.; Hirata, Isaura Y.; Marcelo Afonso Vallim; Pascon, Renata C.; Gouvea, Iuri E.
Fonte: Analytical Biochemistry (Print) , v. 421 , p. 299 - Extrato QUALIS: A2
2010
-
Core sampling test in large-scale compost cells for microorganism isolation (2010)
Artigo publicado
Autores: Ana Luisa Vietti Bitencourt; Marcelo Vallim; Daniela Maia; Rafael Spinell; Renata Angeloni; Luciana Principal; Elisangela Souza; Renata Pascon
Fonte: AFRICAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY RESEARCH , v. 4 , p. 1631 - Extrato QUALIS: B3
2009
-
Brain and lung cryptococcoma and concurrent corynebacterium pseudotuberculosis infection in a goat: a case report (2009)
Artigo publicado
Autores: Luvizotto, MCR; Carreira, VS; Ferrari, HF; Ribeiro, D; Marcelo Afonso Vallim; Azevedo, V; Cardoso, TC
Fonte: The Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases (Online) , v. 15 , p. 553 - Extrato QUALIS: A2
2006
-
The Complete Nucleotide Sequence and Genomic Organization of Citrus Leprosis Associated Virus, Cytoplasmatic type (CiLV-C) (2006)
Artigo publicado
Autores: Marcelo Afonso Vallim; Silva GG; Cardozo JC; Vallim MA; Franco SF; Silva VH; Kitajima JP; Breton MC; Assumpção L; Greggio C; Zanca AS; Okura VK; Alegria MC; Camargo ME
Fonte: Virus Genes , v. 32 , p. 289 - Extrato QUALIS: B1
2005
-
A Rac Homolog Functions Downstream of Ras1 To Control Hyphal Differentiation and High-Temperature Growth in the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans (2005)
Artigo publicado
Autores: Marcelo Afonso Vallim; C B Nichols; L Fernandes; K L Cramer; J A Alspaugh
Fonte: Eukaryotic Cell , v. 4 , n. 6 , p. 1066
2004
-
The RAM1 gene encoding a protein-farnesyltransferase  -subunit homologue is essential in Cryptococcus neoformans (2004)
Artigo publicado
Autores: Marcelo Afonso Vallim
Fonte: Microbiology (Reading. Print) , v. 150 , n. 6 , p. 1925 - Extrato QUALIS: A4
2003
2002
-
Quantification of Xylella fastidiosa from Citrus Trees by Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay (2002)
Artigo publicado
Autores: Antonio C Oliveira; Marcelo Afonso Vallim; Marcelo A Vallim; Camile P Semighini; Wellington L Araujo; Gustavo H Goldman; Marcos A Machado
Fonte: Phytopathology , v. 92 , n. 10 , p. 1048 - Extrato QUALIS: A1
2001
2000
-
Aspergillus SteA (Sterile12-like) is a homeodomain-C2/H2-Zn+2 finger transcription factor required for sexual reproduction (2000)
Artigo publicado
Autores: Marcelo Afonso Vallim; Karen Y Miller; Bruce L Miller
Fonte: Molecular Microbiology (Print) , v. 36 , n. 2 , p. 290 - Extrato QUALIS: A2
1998
-
Phanerochaete chrysosporium cellobiohydrolase and cellobiose dehydrogenase transcripts in wood (1998)
Artigo publicado
Autores: Marcelo Afonso Vallim; Bernard J Janse; Jill Gaskel; Aline A Pizzirani Kleiner; Daniel Cullen
Fonte: Applied and Environmental Microbiology (Print) , v. 64 , n. 5 , p. 1924 - Extrato QUALIS: A1
-
Transcript patterns of Phanerochaete chrysosporium genes in organopollutant-contaminated soils and in wood (1998)
Artigo publicado
Autores: A V Wymelenberg; B Janse; J Gaskell; D Dietrich; Marcelo Afonso Vallim; D Cullen
Fonte: Proceedings Of The Fourth Meeting On The Genetics And Cellular Biology Of Basidiomycetes , p. 89
1997
1994
Atuações
Alellyx Applied Genomics
-
Pesquidor
2004 a 2005
Duke University
-
Research Associate
2001 a 2004
Universidade Federal de São Paulo
-
Professor Adjunto
2006 a 2014
-
Professor Associado
Desde 2014
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
-
Membro de comitê assessor
Desde 2008
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2008
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
-
Membro de comitê assessor
Desde 2008
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2011
Brazilian Journal of Microbiology (Impresso)
-
Revisor de periódico
Desde 2010
African Journal of Microbiology Research
-
Revisor de periódico
Desde 2013
Journal of Toxicology and Environmental Health Sciences
-
Revisor de periódico
Desde 2014
Journal of Agriculture and Ecology Research International
-
Revisor de periódico
Desde 2014
British Microbiology Research Journal
-
Revisor de periódico
Desde 2014
mSphere
-
Revisor de periódico
Desde 2016
Universidade de São Paulo
-
Desde 2022
Ensino
Orientações e supervisões
Tese de doutorado em andamento
-
Impacto da deleção dos genes VAC8, VPS15 e VPS34 no processo de autofagia e fatores de virulência do patógeno fúngico Cryptococcus neoformans
Biotecnologia
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
Dissertação de mestrado em andamento
-
Extração, isolamento e caracterização de aminoácidos do tipo micosporina a partir de Naganishia friedmannii compotencial uso em protetores solares.
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Desde 2023
-
Estudo genético do fungo Aspergillus oryzae aplicado à produção do molho de soja
Biotecnologia
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
Tese de doutorado concluídas
-
Caracterização das proteínas parceiras de Ape4, Ams1 e Atg8 durante o processo de autofagia em Cryptococcus neoformans: estudo sobre os impactos na virulência e sensibilidade aos antifúngicos
Doutorado em Ciências (CPG Biologia Quimica)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2015
Dissertação de mestrado concluídas
-
IMPACTO DA DELEÇÃO DE GPP2 SOBRE O PROCESSO DE AUTOFAGIA EM Cryptococcus neoformans
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2021
-
Avaliação da deleção do gene PEP4 em Cryptococcus neoformans: estudos sobre os impactos nos fatores de virulência
Biotecnologia
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade de São Paulo
Concluído em 2021
-
Cryptococcus neoformans: Crescimento a 37ºC mediado por APE4, uma aspartil aminopeptidase envolvida em autofagia.
Biologia Química
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2014
-
Análise das permeases de metionina em Cryptococcus neoformans e sua aplicabilidade como alvo de drogas antifúngicas
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2014
-
Comportamento metabólico de isolados de leveduras da compostagem do Parque Zoológico de São Paulo frente a presença de disruptores endócrinos orgânicos e inorgânicos
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2013
-
IDENTIFICAÇÃO DE MICRORGANISMOS ISOLADOS DE COMPOSTAGEM E VERIFICAÇÃO DE ATIVIDADE CELULOLÍTICA
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2013
-
Isolamento e seleção de microorganismos da compostagem do Parque Zoológico de São Paulo com portencial para Biorremediação
Biologia Química
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo - Campus Diadema
Concluído em 2010
Gestão
Pesquisa
Universidade Federal de São Paulo
-
O papel da autofagia no crescimento a alta temperatura (37°C) e virulência em Cryptococcus neorformans.
As infecções fúngicas são muitas vezes difíceis de tratar, em virtude das semelhanças entre as células fúngicas e animais por esta razão muitos dos compostos antifúngicos são tóxicos aos hospedeiros. Cryptococcus neoformans é um fungo patogênico oportunista dos seres humanos que causa a doença que se não tratada pode ser fatal, principalmente em pacientes imunocomprometidos. Em decorrência de opções limitadas de antifúngicos para o tratamento desta micose, muitos investigadores têm explorado novos alvos para drogas que visam fatores de virulência, tais como a capacidade de crescer à temperatura fisiológica dos mamíferos (37°C). Com objetivo de aumentar este conhecimento, foi estabelecida uma biblioteca de mutantes insercionais mediada por Agrobacterium tumefaciens (AMT, Agrobacterium mediated transformation). Esta biblioteca foi pesquisada com o intuito de se identificar mutantes incapazes de crescer em temperatura fisiológica (Gontijo et al., 2014). Entre os vários mutantes termossensíveis a 37°C, caracterizamos um onde a interrupção ocorreu no gene APE4, o qual codifica uma aspartil aminopeptidase que em Saccharomyces cerevisiae está envolvido nos processos Cvt (cytoplasm to vacuole targeting) e autofagia. O mutante ape4 de Cryptococcus neoformans não é capaz de crescer a 37°C e é avirulento em modelo animal (murino). Em C. neoformans os processos Cvt e autofagia foram pouco estudados e a relação entre termotolerância e autofagia ainda não havia sido estabelecida. Dentre os cinco genes que codificam proteínas envolvidas nesses processos em S. cerevisiae (APE1, APE4, AMS1. ATG19 e ATG8) apenas três foram prontamente identificados no genoma de C. neoformans (APE4, AMS1 e ATG8) usando as ferramentas clássicas de bioinformática. Isso deixa claro que existem diferenças fundamentais entre C. neoformans e S. cerevisiae no que tange estes dois processos biológicos. Portanto, o objetivo geral deste projeto é esclarecer as bases moleculares do mecanismo de Cvt e autofagia em C. neoformans. Para atingir tal objetivo este projeto contempla: 1) a deleção dos genes AMS1 e ATG8 do genoma desta levedura e análise dos mutantes, visando efetivar o elo entre Cvt, autofagia, termotolerância e virulência; 2) verificar a localização subcelular destas proteínas de fusão ao GFP (green fluorescent protein) levando em conta a temperatura de crescimento e as diversas condições nutricionais, como a privação de nutrientes essenciais, e diferentes fontes de carbono e nitrogênio (preferenciais e não preferenciais); 3) levando em consideração que algumas proteínas importantes do processo Cvt e autofagia de S. cerevisiae não foram identificadas no genoma de C. neoformans, este projeto buscará identificar por meio da metodologia de duplo híbrido os parceiros moleculares das proteínas APE4 e AMS1, os quais devem colocá-las corretamente no local onde ocorre a formação das vesículas de degradação mediadas por ATG8. No sentido amplo este projeto pretende elucidar as bases moleculares da autofagia em C. neoformans, uma vez que o mesmo parece ser bastante diferente de S. cerevisiae, bem como associar estes elementos à virulência e patogênese. Espera-se que estes conhecimentos sejam úteis na proposta de novas terapias antifúngicas.
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Renata C Pascon
Desde 2015
-
Estudos da diversidade microbiana do Parque Zoológico do Estado de São Paulo
Este projeto tem por objetivo geral coletar, analisar e prospectar dados moleculares de três microbiomas existentes no Parque Zoológico do Estado de São Paulo: compostagem vegetal da mata atlântica, lago, e fezes de macacos bugio. A escolha destes três microbiomas contempla a diversidade de ambientes no parque e a missão de preservação de animais da Fundação PZSP. O projeto dará continuidade a outro projeto financiado pela FAPESP (processo 2009/52030-5R) o qual focaliza somente a unidade de compostagem do parque. O projeto fará uso de diversas metodologias, sendo as principais a metagenômica por pirossequenciamento, a identificação dos isolados microbianos por espectrofotometria de massa, e bioinformática. Como resultados esperados incluem-se diversos bancos de dados, dois websites, uma coleção de isolados, publicações científicas de alto nível e material de divulgação para educação em microbiologia junto aos visitantes do parque e para ensino fundamental e médio. O projeto inclui pesquisadores da USP (campi Butantan e Zona Leste), da UNIFESP (campi Vila Clementino e Diadema), e da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. O projeto atende à chamada do programa BIOTA-microorganismos dando ênfase aos seguintes aspectos: caracterização da biodiversidade de microorganismos e de biomas específicos, com prospecção e o estabelecimento de coleções de linhagens microbianas; desenvolvimento de estratégias para a rápida identificação e transferência de linhagens com potencial de aplicação biotecnológica e industrial; e bioprospecção de produtos microbianos..
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Renata C Pascon, Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Julio Cezar Franco de Oliveira, Luiz Juliano Neto, Aline Maria da Silva, João Carlos Setubal, Renata C Pascon, Cristina Viana-Niero
2012 a 2014
-
Avaliação dos genes da via de biossíntese do triptofano no patógeno oportunista Cryptococcus neoformans quanto a sua aplicabilidade como alvo de drogas antifúngicas
As micoses causadas por fungos oportunistas, como a Candida albicans, Aspergillus fumigatus e o Cryptococcus neoformans são cada vez mais ameaçadoras para a saúde pública considerando o grande aumento na população imunocomprometida mundial, principalmente àqueles relacionados a casos de transplantes de órgãos, quimioterapia anti-tumoral e imunossupressão causada por HIV. Especificamente em pacientes com AIDS o tratamento é prolongado e implica na administração de antifúngicos para o resto da vida do paciente, o que leva ao surgimento de cepas resistentes com alta freqüência. Além disso, os antifúngicos apresentam baixa toxicidade seletiva, uma vez que a célula fúngica é mais parecida com a célula animal do que a célula procariótica, diminuindo assim a disponibilidade de alvos úteis para o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas. Por esta razão, faz-se necessário um esforço constante da comunidade científica no sentido de ampliar a prospecção e validação de alvos, bem como a identificação de inibidores mais específicos, o que pode refletir em terapias mais diligentes. Anteriormente, Pascon et al. (2004) demonstraram que a via de biossíntese da metionina é um alvo significante para o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas, uma vez que mutações em genes desta via afetam diversos fatores de virulência. Os aminoácidos aromáticos são essenciais ao crescimento de qualquer organismo, mas são sintetizados de novo somente pelos microrganismos, plantas, e parasitas apicomplexos, sendo a sua síntese ausente em animais superiores. O triptofano, ao contrário da tirosina e da fenilalanina, possue somente uma rota de síntese. Esta via biossintética nunca foi estudada em C. neoformans. O objetivo deste trabalho é validar o uso dos quatro genes envolvidos na síntese do triptofano como alvo de novos antifúngicos. Serão avaliados vários aspectos da biologia desta levedura nas linhagens mutantes e nas reconstituídas, dentre os quais, a interação patógeno-hospedeiro
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Pascon, Renata C., Joel Machado Junior
Desde 2012
-
Estabelecimento de um laboratório de Microbiologia Aplicada no Zoológico de São Paulo: Identificação e isolamento de microrganismos que produzam enzimas e seus inibidores de aplicação nas áreas médica, veterinária e industrial
Descrição: A Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP) possui uma unidade de produção de composto orgânico (UPCO) que aproveita a matéria orgânica de várias origens como: excremento de aproximadamente 3.500 animais, oriundos de varias partes do mundo, carcaças, sedimentos e coluna de água do lago, restos de cama de animais, resíduos de poda dos jardins do Parque, restos vegetais da Mata Atlântica e resíduos alimentares. O composto final, cerca de 600 toneladas/ano é utilizado como fertilizante orgânico na fazenda do Zoológico, para produção de cerca de 70% dos alimentos consumidos pelos animais do Parque, fechando assim um ciclo virtuoso de sustentabilidade. Além disso, a compostagem evita que a matéria orgânica seja depositada em aterros sanitários, aumentando o volume de lixo. A riqueza microbiológica deste material é incalculável, visto que ali poderão ser encontradas inúmeras espécies que ainda não foram descritas e/ou cultivadas. Baseado nisso, foi estabelecida uma parceria entre a UNIFESP e FPZSP para nuclear um programa de microbiologia aplicada com o objetivo de prospectar esta diversidade microbiana e aplicá-la em processos biotecnológicos. O objetivo geral deste projeto é isolar conhecer, preservar e caracterizar microrganismos da compostagem e das águas do parque. Nossos dados preliminares demonstram que os métodos tradicionais de isolamento e preservação podem ser utilizados na prospecção dos microrganismos cultiváveis da compostagem, no entanto, estima-se que a maior parte dos microrganismos que habitam este material não seja passível de cultivo. Os microrganismos isolados serão identificados por espectrometria de massa (MALDI/TOF-MS), uma metodologia que está sendo implementada no laboratório de Biofísica do INFAR/UNIFESP. As identificações serão validadas pelo sequenciamento da subunidade menor do ribossomo (SSU rDNA). Os microrganismos isolados da compostagem serão testados para produção de enzimas de grande interesse industrial, como as celulases, xilanas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Luiz Juliano Neto, Renata C Pascon
2010 a 2012
-
AQUISIÇÃO DE PLATAFORMA DE MICROARRAY PARA O CAMPUS DIADEMA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO
Projeto para aquisição de uma plataforma de microarray dentro da chamada de equipamento multiusuários da FAPESP
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Marcelo A Vallim, Andre Vettore Oliveira, Fabiola Lopes
2010 a 2012
-
Uso sustentável da biodiversidade de áreas remanescentes da Mata Atlântica do Estado de São Paulo - avaliação, isolamento e caracterização molecular de metabólitos secundários bioativos em espécies vegetais
fapesp 2011/51739-0 pesquisados Associado sob coordenação do Joao Henrique Ghilardi Lago
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Renata Castiglioni Pascon, Prof. Joao Henrique Ghilardi Lago, Patricia Sartorelli
2011 a 2014
-
Caracterização molecular (genotipagem) de isolados clínicos de Cryptococcus neoformans proveniente de diferentes Estados do Brasil, Venezuela e Chile
O fungo dimórfico Cryptococcus neoformans é um patógeno oportunista de pacientes imunocomprometidos pela AIDS, transplantes e tratamento contra o câncer. O número progressivo de pacientes submetidos a transplantes, quimioterapia e outros medicamentos imunossupressores tem aumentado a população de pacientes susceptíveis a infecção por este patógeno. Do total de transplantes renais realizados no país, cerca de 18% é realizado na Unidade de Transplante Renal da UNIFESP e, segundo os dados da literatura, 2 a 14% desses pacientes poderão desenvolver criptococcose. O Laboratório Especial de Micologia (LEMI) da UNIFESP é centro de referência para a investigação de aspectos clínicos e microbiológicos de infecções por Candida spp, mas não conta com linhas de pesquisa consolidadas na investigação de outras leveduras de interesse médico. Tendo em vista a importância de infecções por C. neoformans no cenário clínico atual, há grande interesse na estruturação de um núcleo de pesquisa em criptococose na UNIFESP. A presente proposta de trabalho pretende iniciar a implementação de uma linha de pesquisa empregando ferramentas de biologia molecular (RADP) com o objetivo de caracterizar os diferentes genótipos obtidos a partir de pacientes afetados pela criptococose trançando com isso um perfil epidemiológico dessa doença em diferentes Estados do Brasil e dos países Chile e Venezuela
Autores: Marcelo Afonso Vallim
2006 a 2006
-
Cryptococcus neoformans:Estudos da via de transdução de sinal que controla o crescimento à 37°C empregando ferramentas de biologia molecular, e caracterização epidemiológica molecular e enzimática relacionando isolados clínicos e severidade da criptococco
O fungo dimórfico Cryptococcus neoformans é um patógeno oportunista de pacientes imunocomprometido pela AIDS, transplantes e sob o tratamento contra o câncer. Dentro da espécie C. neoformans existem três variedades: neoformans, grubii e gattii, e 5 sorotipos: A (var. grubii) D e AD para C. neoformans e, B e C para C. neoformans var gattii. A distribuição de Cryptococcus neoformans vars neoformans e grubii é mundial, enquanto que C. neoformans var gattii é encontrada em regiões tropicais e subtropicais. O sorotipo A é prevalente tanto em isolados clínicos como ambientais. C. neoformans é um fungo heterotálico possuindo dois ?mating-types?: Mata e Mata. As células do ?mating-type? Mata são mais virulentas em modelo animal e, também, são prevalente tanto no ambiente como em isolados clínicos. O fato de C. neoformans causar doenças em pacientes imunocomprometidos leva a necessidade de tratamento para o resto da vida do paciente com antifúngicos do tipo azoles. Entretanto, linhagens do fungo, as quais adquiriram resistência contra o tratamento, são isoladas em pacientes. Assim torna-se essencial as pesquisadas de alternativas de tratamentos. Para tal, é indispensável que se conheça a biologia do fungo para que, novos alvos para ação de drogas sejam identificados. A biologia de C. neoformans tem sido estudada extensivamente e vários fenótipos que relacionam-se com virulência foram identificados. Dentre eles destaca-se a caracterização de uma via de transdução de sinal que permite este fungo cresça a temperatura fisiológica de mamíferos (37°C), a qual é controlada pela proteína RAS1. Poucos elementos que compõem esta via de transdução de sinal foram identificados. Neste sentido, um projeto de supressão por múltipla cópia empregando uma biblioteca genômica feita em um plasmídio telomérico, levou ao isolamento do gene que codifica a proteína RAC1. Super expressão dessa proteína resgata a capacidade do mutante ras1 de C. neoformans de crescer a 37°C. A técnica de supressã
Autores: Marcelo Afonso Vallim, Renata Castiglioni Pascon
2007 a 2013
Universidade de São Paulo
Atualização Lattes em 2024-03
Processado em 2024-07-22