Marcelo Ribeiro da Silva Briones nacionalidade brasileira

Escola Paulista de Medicina

Programa de Pós-Graduação: Microbiologia e Imunologia

E-Mail: marcelo.briones@unifesp.br


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De 2015 a 2024
Trabalhos publicados
Participações em projetos

Resumo

Possui Bacharelado e Licenciatura em Biologia pela Universidade de São Paulo. Fez Mestrado pela Universidade de São Paulo e Doutorado pela Universidade Federal de São Paulo (1994) e Pós-doutorado pela New York University (EUA) (1994-1996). É professor da Universidade Federal de São Paulo desde 1996 e foi pesquisador internacional do Howard Hughes Medical Institute (EUA) (2000-2005). Tem experiência na área de Genômica e Biologia Molecular, com ênfase em processos evolutivos e bioinformática. Participou como investigador principal do projeto genoma da Xylella fastidiosa da FAPESP, foi coordenador de centro de sequenciamento no projeto genoma humano do câncer (FAPESP e Instituto Ludwig) e do transcriptoma do cérebro epilético. É membro titular da Academia de Ciências do Estado de São Paulo, Life Fellow do Galton Institute (Reino Unido), e foi membro do comitê gestor da iniciativa brasileira de medicina de precisão (BIPMED). É editor associado de bioinformática e biologia computacional do periódico "Frontiers in Genetics" e coordenador do Centro de Bioinformática Médica da Escola Paulista de Medicina da UNIFESP. Recebeu o Prêmio DASA-Veja Saúde de inovação em Medicina na categoria "Genômica" (2021) e é membro pleno eleito da Sociedade Científica "Sigma Xi, The Scientific Research Honor Society" dos Estados Unidos (EUA).

Fonte: Lattes CNPq

Nomes em citações bibliográficas

BRIONES, M. R. S.;Briones, M.R.S.;Briones, Marcelo R.S.;BRIONES, MARCELO R. S.;BRIONES, MRS;DA SILVA BRIONES, MARCELO RIBEIRO;BRIONES, MARCELO RS;Marcelo Ribeiro Briones;Briones, Marcelo Ribeiro;DA SILVA BRIONES, M. R.;SILVA, NULL;BRIONES, MARCELO RIBEIRO DA SILVA


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Formação

  • Doutorado em Microbiologia e Imunologia

    Caracterizacao, expressao genica e evolucao da trans-sialidase de formas epimastigotas de Trypanosoma cruzi

    Orientação: Sergio Schenkman

    Universidade Federal de São Paulo

      Desde 1994

  • Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)

    A posicao taxonomica de Leishmania tarentolae inferida pela analise filogenetica do gene ribossomico 18S

    Orientação: Lucile M. Floeter

    Universidade de São Paulo

    1989 a 1991

  • Graduação em Abi - Ciências Biológicas

    Universidade de São Paulo

    1984 a 1988

  • Produção


    2024


    • Convergent Mutations and Single Nucleotide Variants in Mitochondrial Genomes of Modern Humans and Neanderthals (2024)

      Artigo publicado

      Autores: FERREIRA, RENATA C.; RODRIGUES, CAMILA R.; BROACH, JAMES R.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 25 , p. 3785 - Extrato QUALIS: A2

    • Reconstructing Prehistoric Viral Genomes from Neanderthal Sequencing Data (2024)

      Artigo publicado

      Autores: Ferreira, Renata C.; ALVES, GUSTAVO V.; RAMON, MARCELLO; ANTONELI, FERNANDO; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Viruses-Basel , v. 16 , p. 856 - Extrato QUALIS: A2


    2022


    • The epitranscriptome of Vero cells infected with SARS-CoV-2 assessed by direct RNA sequencing reveals m6A pattern changes and DRACH motif biases in viral and cellular RNAs (2022)

      Artigo publicado

      Autores: João Henrique Coelho Campos; Gustavo V. Alves; Juliana T. Maricato; Carla T. Braconi; Fernando Martins Antoneli Junior; Luiz Mario Ramos Janini; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 12 , p. 906578 - Extrato QUALIS: A2

    • Whole-genome analysis of monozygotic Brazilian twins discordant for type 1 narcolepsy: a case report (2022)

      Artigo publicado

      Autores: João Henrique Coelho Campos; Ana C. R. Aguilar; Fernando Martins Antoneli Junior; Giselle Truzzi; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Renata Carmona e Ferreira; Fernando M. S. Coelho

      Conteúdo completo

      Fonte: BMC Neurology , v. 22 , p. 439 - Extrato QUALIS: A4


    2021


    • Direct RNA Sequencing Reveals SARS-CoV-2 m6A Sites and Possible Differential DRACH Motif Methylation among Variants (2021)

      Artigo publicado

      Autores: João Henrique Coelho Campos; Juliana T. Maricato; Carla T. Braconi; Fernando Martins Antoneli Junior; Luiz Mario Ramos Janini; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Viruses-Basel , v. 13 , p. 2108 - Extrato QUALIS: A2

    • Research Article Temporal data series and logistic models reveal the dynamics of SARS-CoV-2 spike protein D614G variant in the COVID-19 pandemic (2021)

      Artigo publicado

      Autores: Fernando Martins Antoneli Junior; Taima Furuyama; Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Luiz Mario Ramos Janini

      Conteúdo completo

      Fonte: GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 20 , p. gmr18960 - Extrato QUALIS: B2

    • Research Article Impact of ancient oxygen levels on mitochondrial genome evolution inferred by supertrees, supermatrices, and relaxed molecular clocks (2021)

      Artigo publicado

      Autores: Luciano R. Lopes; Renata Carmona e Ferreira; Fernando Martins Antoneli Junior; Paulo Bandiera Paiva; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 20 , p. gmr18485 - Extrato QUALIS: B2


    2020


    • Hardy-Weinberg Equilibrium in different mitochondrial haplogroups of four genes associated with neuroprotection and neurodegeneration (2020)

      Artigo publicado

      Autores: MEHRPOUR, SHEIDA; RODRIGUES, CAMILA RONQUI; FERREIRA, RENATA CARMONA; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; OLIVEIRA, ACARY SOUZA BULLE

      Conteúdo completo

      Fonte: Arquivos de Neuro-Psiquiatria (Online) , v. 78 , p. 269 - Extrato QUALIS: B2


    2018


    • A Kolmogorov-Smirnov test for the molecular clock based on Bayesian ensembles of phylogenies (2018)

      Artigo publicado

      Autores: Fernando Martins Antoneli Junior; Fernando Marcon Passos; Luciano R. Lopes; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: PLoS One , v. 13 , p. e0190826 - Extrato QUALIS: A1

    • A Possible Role for Platelet-Activating Factor Receptor in Amyotrophic Lateral Sclerosis Treatment (2018)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Amanda M Snyder; Renata Carmona e Ferreira; Elizabeth B Neely; James R Connor; James Riley Broach

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Neurology , v. 9 , p. 39 - Extrato QUALIS: A4

    • Whole-Genome Sequences and Annotation of the Opportunistic Pathogen Strain SC5314 Grown under Two Different Environmental Conditions (2018)

      Artigo publicado

      Autores: Thais Fernanda Bartelli; Danielle Carmo Bruno; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 6 , p. e01475-17

    • Evidence for Mitochondrial Genome Methylation in the Yeast Candida albicans: A Potential Novel Epigenetic Mechanism Affecting Adaptation and Pathogenicity? (2018)

      Artigo publicado

      Autores: Thais Fernanda Bartelli; Danielle Carmo Bruno; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Genetics , v. 9 , p. 166 - Extrato QUALIS: A4

    • Genome Sequence of a Staphylococcus epidermidis Strain (GTH12) Associated with Candida albicans SC5314 Cultured under Hypoxia at 37°C in Glycerol for 12 Weeks (2018)

      Artigo publicado

      Autores: Danielle Carmo Bruno; Thais Fernanda Bartelli; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 6 , p. e00533-18

    • Prolonged growth of Candida albicans reveals co-isolated bacteria from single yeast colonies (2018)

      Artigo publicado

      Autores: BRUNO, DANIELLE DO CARMO FERREIRA; BARTELLI, THAIS FERNANDA; RODRIGUES, CAMILA RONQUI; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 65 , p. 117 - Extrato QUALIS: A2


    2017


    • PKS: Programa para teste de relógio molecular por Kolmogorov-Smirnov em conjuntos de filogenias Bayesianas (2017)

      Software

      Autores: PASSOS, FERNANDO M.; Fernando Antoneli; Luciano R Lopes; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte:


    2016


    • A model of gene expression based on random dynamical systems reveals modularity properties of gene regulatory networks (2016)

      Artigo publicado

      Autores: Fernando Martins Antoneli Junior; Renata Carmona e Ferreira; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Mathematical Biosciences , v. 276 , p. 82 - Extrato QUALIS: A3

    • Histone deacetylase 1 is essential for rod photoreceptor differentiation by regulating acetylation at histone H3 lysine 9 and histone H4 lysine 12 in the mouse retina (2016)

      Artigo publicado

      Autores: FERREIRA, RENATA C; POPOVA, EVGENYA Y; JAMES, JESSICA; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; ZHANG, SAMUEL S; BARNSTABLE, COLIN J

      Conteúdo completo

      Fonte: The Journal of Biological Chemistry (Print) , v. 291 , p. jbc.M116.756643 - Extrato QUALIS: A1


    2015


    • Genetic diversity of medically important and emerging Candida species causing invasive infection (2015)

      Artigo publicado

      Autores: MERSEGUEL, KARINA BELLINGHAUSEN; NISHIKAKU, ANGELA SATIE; Anderson Messias Rodrigues; PADOVAN, ANA CAROLINA; E FERREIRA, RENATA CARMONA; SALLES DE AZEVEDO MELO, ANALY; DA SILVA BRIONES, MARCELO RIBEIRO; COLOMBO, ARNALDO LOPES

      Conteúdo completo

      Fonte: BMC Infectious Diseases (Online) , v. 15 , p. 57 - Extrato QUALIS: A3

    • International Society of Human and Animal Mycology (ISHAM)-ITS reference DNA barcoding database--the quality controlled standard tool for routine identification of human and animal pathogenic fungi (2015)

      Artigo publicado

      Autores: IRINYI, L.; GIRALDO, A.; DA CUNHA, K. C.; SANDOVAL-DENIS, M.; HENDRICKX, M.; A S Nishikaku; DE AZEVEDO MELO, A. S.; MERSEGUEL, K. B.; KHAN, A.; ROCHA, J. A. P.; SAMPAIO, P.; SERENA, C.; GARCIA-HERMOSO, D.; ARABATZIS, M.; Arnaldo Lopes Colombo; DESNOS-OLLIVIER, M.; VU, D.; CARDINALI, G.; ARTHUR, I.; NORMAND, A.-C.

      Fonte: Medical Mycology (Oxford. Online) , v. mmy , p. myv008 - Extrato QUALIS: A1

    • MIA: Mutual Information Analyzer, a graphic user interface program that calculates entropy, vertical and horizontal mutual information of molecular sequence sets (2015)

      Artigo publicado

      Autores: Flavio Lichtenstein; Fernando Martins Antoneli Junior; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: BMC Bioinformatics , v. 16 , p. 409 - Extrato QUALIS: A1

    • MIA: Um programa com interface gráfica para cálculo de entropia informacional e informação mútua em sequências genômicas (2015)

      Software

      Autores: Flavio Lichtenstein; Fernando Antoneli; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte:


    2014


    • Extracellular enolase of Candida albicans is involved in colonization of mammalian intestinal epithelium (2014)

      Artigo publicado

      Autores: SILVA, RICHARD C.; Padovan, Ana Carolina B.; Daniel Carvalho Pimenta; Ferreira, Renata C.; Claudio Vieira da Silva; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 4 , p. 66 - Extrato QUALIS: A2

    • Trypanosoma cruzi: Genome characterization of phosphatidylinositol kinase gene family (PIK and PIK-related) and identification of a novel PIK gene (2014)

      Artigo publicado

      Autores: Oliveira, Priscila; Renato Arruda Mortara; José Franco da Silveira Filho; Bahia, Diana; Lima, Fabio Mitsuo; CRUZ, MARIO COSTA; FERREIRA, RENATA CARMONA; SANCHEZ-FLORES, ALEJANDRO; Cordero, Esteban Maurício; CORTEZ, DANIELLE RODRIGUES; FERREIRA, ÉDEN RAMALHO; BRIONES, MARCELO RIBEIRO DA SILVA

      Conteúdo completo

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 25 , p. 157 - Extrato QUALIS: A2


    2013


    • Intraspecific comparative genomics of Candida albicans mitochondria reveals non-coding regions under neutral evolution (2013)

      Artigo publicado

      Autores: BARTELLI, THAIS F.; FERREIRA, RENATA C.; Arnaldo Lopes Colombo; BRIONES, MARCELO R.S.

      Conteúdo completo

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 14 , p. 302 - Extrato QUALIS: A2

    • Examining marginal sequence similarities between bacterial type III secretion system components and Trypanosoma cruzi surface proteins: Horizontal gene transfer or convergent evolution? (2013)

      Artigo publicado

      Autores: Danielle Carmo Silva; richard cardoso silva; Renata Carmona e Ferreira; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Frontiers in Genetics , v. 4 , p. 143 - Extrato QUALIS: A4

    • The Genome Sequence of Leishmania (Leishmania) amazonensis: Functional Annotation and Extended Analysis of Gene Models (2013)

      Artigo publicado

      Autores: REAL, F.; MORTARA, R. A.; BARBIERI, C. L.; MIECZKOWSKI, P.; DA SILVEIRA, J. F.; BRIONES, M. R. D. S.; PEREIRA, G. A. G.; BAHIA, D.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; MONDEGO, J. M. C.; COSTA, G. G. L.; HERAI, R. H.; Martin Rodrigo Alejandro Wurtele Alfonso; DE CARVALHO, L. M.; E FERREIRA, R. C.

      Fonte: DNA Research , v. 20 , p. 567 - Extrato QUALIS: A2

    • A quick and low-cost PCR-based assay for Candida spp. identification in positive blood culture bottles (2013)

      Artigo publicado

      Autores: XAFRANSKI, HEMÍLIO; MELO, ANALY SA; MACHADO, ANTONIA M; BRIONES, MARCELO RS; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: BMC Infectious Diseases (Online) , v. 13 , p. 467 - Extrato QUALIS: A3

    • The hidden factors in impact factors: a perspective from Brazilian science (2013)

      Artigo publicado

      Autores: Renata Carmona e Ferreira; Fernando Martins Antoneli Junior; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Genetics , v. 4 , p. 1 - Extrato QUALIS: A4


    2012


    • Phylogenetic evidence based on Trypanosoma cruzi nuclear gene sequences and information entropy suggest that inter-strain intragenic recombination is a basic mechanism underlying the allele diversity of hybrid strains (2012)

      Artigo publicado

      Autores: Ferreira, Renata C.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 12 , p. 1064 - Extrato QUALIS: A2

    • Accurate Identification of Candida parapsilosis (Sensu Lato) by Use of Mitochondrial DNA and Real-Time PCR (2012)

      Artigo publicado

      Autores: SOUZA, A. C. R.; FERREIRA, R. C.; Sarah Santos Gonçalves; QUINDOS, G.; ERASO, E.; BIZERRA, F. C.; BRIONES, M. R. S.; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology (Print) , v. 50 , p. 2310 - Extrato QUALIS: A1

    • Neutral and Stable Equilibria of Genetic Systems and the Hardy¿Weinberg Principle: Limitations of the Chi-Square Test and Advantages of Auto-Correlation Functions of Allele Frequencies (2012)

      Artigo publicado

      Autores: Bosco, Francisco; diogo castro; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Genetics , v. 3 , p. 276 - Extrato QUALIS: A4

    • Molecular identification of Candida strains from a large brazilian collection (2012)

      Artigo publicado

      Autores: Karina Merseguel; A S Nishikaku; D C Pires; Ana Carolina B. Padovan; FERREIRA, R. C.; Melo, Analy S. A.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Arnaldo Lopes Colombo

      Fonte: MYCOSES , v. 55 , p. 273 - Extrato QUALIS: A1

    • Differential Infectivity by the Oral Route of Trypanosoma cruzi Lineages Derived from Y Strain (2012)

      Artigo publicado

      Autores: CORTEZ, CRISTIAN; YOSHIDA, NOBUKO; TRAUB-CSEKÖ, YARA M.; MARTINS, RAFAEL M.; ALVES, RENAN M.; SILVA, RICHARD C.; BILCHES, LUCIANA C.; MACEDO, SILENE; ATAYDE, VANESSA D.; Kawashita, Silvia Y.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 6 , p. e1804 - Extrato QUALIS: A1


    2011


    • A Falácia Ateísta de Richard Dawkins (2011)

      Textos em jornais de notícias/revistas

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Mensageiro Luterano , p. 10


    2010


    • Network genealogy of 195-bp satellite DNA supports the superimposed hybridization hypothesis of Trypanosoma cruzi evolutionary pattern? (2010)

      Artigo publicado

      Autores: Ienne, Susan; Pedroso, Aurélio; Carmona e Ferreira, Renata; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Zingales, Bianca

      Conteúdo completo

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 10 , p. 601 - Extrato QUALIS: A2


    2009


    • Decoherence in yeast cell populations and its implications for genome-wide expression noise (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Francisco Assis Ribas Bosco

      Conteúdo completo

      Fonte: Genetics and Molecular Research , v. 8 , p. 47 - Extrato QUALIS: B2

    • Scaling properties of transcription profiles in gene networks (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Ferreira, Renata C.; Bosco, Francisco; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: International Journal of Bioinformatics Research and Applications (Print) , v. 5 , p. 178 - Extrato QUALIS: B1

    • A novel allele of HWP1, isolated from a clinical strain of Candida albicans with defective hyphal growth and biofilm formation, has deletions of Gln/Pro and Ser/Thr repeats involved in cellular adhesion. (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Ana Carolina Barbosa Padovan; Guilherme Maranhão Chaves; Arnaldo Lopes Colombo; Marcelo Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Medical Mycology (Oxford) , v. 47 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1

    • Homology, paralogy and function of DGF-1, a highly dispersed Trypanosoma cruzi specific gene family and its implications for information entropy of its encoded proteins (2009)

      Artigo publicado

      Autores: KAWASHITA, S; DASILVA, C; MORTARA, R; BURLEIGH, B; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 165 , p. 19 - Extrato QUALIS: A4

    • Haplotype distribution of five nuclear genes based on network genealogies and Bayesian inference indicates that Trypanosoma cruzi hybrid strains are polyphyletic (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Laize Tomazi; Silvia Yukie Kawashita; Priscila Martins Pereira; Bianca Zingales; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Genetics and Molecular Research (Online) , v. 8 , p. 458 - Extrato QUALIS: B2

    • Characterization of a 21kDa protein from Trypanosoma cruzi associated with mammalian cell invasion (2009)

      Artigo publicado

      Autores: da Silva, Claudio V.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Kawashita, Silvia Y.; Probst, Christian M.; Dallagiovanna, Bruno; Cruz, Mário C.; da Silva, Erika A.; Souto-Padrón, Thaís C.B.S.; Krieger, Marco A.; Goldenberg, Samuel

      Conteúdo completo

      Fonte: Microbes and Infection , p. 1 - Extrato QUALIS: A3

    • A new consensus for Trypanosoma cruzi intraspecific nomenclature: second revision meeting recommends TcI to TcVI (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Bianca Zingales; Carlos R. Machado; Michael A. Miles; Alvaro J. Romanha; Nancy R. Sturm; Michel Tibayrenc; Alejandro G. Schijman; Sônia G. Andrade; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; David A Campbell; Egler Chiari; Octavio Fernandes; Felipe Guhl; Elaine Lages-Silva; Andrea M. Macedo

      Conteúdo completo

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso) , v. 104 , p. 1051 - Extrato QUALIS: A4

    • Prevalence rates and antifungal susceptibility profiles of the Candida parapsilosis species complex: results from a nationwide surveillance of candidaemia in Brazil (2009)

      Artigo publicado

      Autores: Sarah Santos Gonçalves; AMORIM, C. S.; NUCCI, M.; PADOVAN, A. C. B.; BRIONES, M. R. S.; MELO, A. S. A.; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: Clinical Microbiology and Infection (Print) , v. 17 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1


    2008


    • Association of loss of heterozygosity with cytogenetic abnormalities in acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome (2008)

      Artigo publicado

      Autores: Pinheiro, R.F.; Serio, F.M.; Silva, M.R.R.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Chauffaille, M.L.L.F.

      Conteúdo completo

      Fonte: Brazilian Journal of Medical and Biological Research , v. 41 , p. 610 - Extrato QUALIS: A3


    2007


    • Hippocampal gene expression analysis using the ORESTES methodology shows that homer 1a mRNA is upregulated in the acute period of the pilocarpine epilepsy model (2007)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Avedissian; Beatriz de Oliveira Monteiro; Carolina Jaqueta; Beatriz Schnabel; Paulo Paiva; Luiz EAM Mello; Briones MR

      Conteúdo completo

      Fonte: Hippocampus (New York, N.Y. Print) , v. 17 , p. 130 - Extrato QUALIS: A2

    • Minimization of transcriptional temporal noise and scale invariance in the yeast genome (2007)

      Artigo publicado

      Autores: Renata Carmona e Ferreira; Francisco Assis Ribas Bosco; Paulo Bandiera Paiva; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Genetics and Molecular Research , v. 6 , p. 297 - Extrato QUALIS: B2

    • Identification of midgut microvillar proteins from Tenebrio molitor and Spodoptera frugiperda by cDNA library screenings with antibodies (2007)

      Artigo publicado

      Autores: A .H. P. Ferreira; P. T. Cristofoletti; D. M. Lorenzini; L. O. Guerra; Paulo Bandiera Paiva; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Walter Ribeiro Terra; Clélia Ferreira

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Insect Physiology , v. 17 Jun , p. Epub - Extrato QUALIS: A1

    • The localized adherence pattern of an atypical enteropathogenic Escherichia coli is mediated by intimin omicron and unexpectedly promotes HeLa cell invasion (2007)

      Artigo publicado

      Autores: Rodrigo Tavanelli Hernandes; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Tânia Aparecida Tardelli Gomes; Rosa Maria Silva; Sylvia Mendes Carneiro; Fábia Andréia Salvador; Maria Cecília Di Ciero Fernandes; Ana Carolina B. Padovan; Denise Yamamoto; Renato Arruda Mortara; Waldir Pereira Elias

      Conteúdo completo

      Fonte: Cellular Microbiology (Online) , p. 071003010119002 - Extrato QUALIS: A2


    2006


    • The Candida albicans AAA ATPase homologue of Saccharomyces cerevisiae Rix7p (YLL034c) is essential for proper morphology, biofilm formation and activity of secreted aspartyl proteinases. (2006)

      Artigo publicado

      Autores: A.S.A. Melo; ACB Padovan; RC Serafim; L. Puzer; Adriana Karaoglanovic Carmona; Luiz Juliano; A. Brunstein; M.R.S. Briones

      Fonte: Genetics and Molecular Research , v. 5 , p. 664 - Extrato QUALIS: B2

    • Deletion of 17p13 and LIS1 Gene Mutation in Isolated Lissencephaly Sequence (2006)

      Artigo publicado

      Autores: ELIAS, R; GALERA, M; SCHNABEL, B; BRIONES, M; BORRI, M; LIPAY, M; Gianna Maria Griz Carvalheira; BRUNONI, D; MELARAGNO, M

      Conteúdo completo

      Fonte: Pediatric Neurology , v. 35 , p. 42 - Extrato QUALIS: A2


    2005


    • Fungi evolution revisited: application of the penalized likelihood method to a bayesian fungal phylogeny provides a new perspective on phylogenetic relationships and divergence dates of Ascomycota groups (2005)

      Artigo publicado

      Autores: Ana Carolina B. Padovan; GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Adriana Brunstein; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Molecular Evolution , v. 60 , p. 726 - Extrato QUALIS: A3

    • Comparative analysis of genomic sequences suggests that Trypanosoma cruzi CL Brener contains two sets of non-intercalated repeats of satellite DNA that correspond to T. cruzi I and T. cruzi II types (2005)

      Artigo publicado

      Autores: Maria Carolina Q. B. Elias; Nancy Vargas; Laize Tomazi; Aurélio Pedroso; Bianca Zingales; S. SCHENKMAN; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 140 , p. 221 - Extrato QUALIS: A4


    2004


    • Changes in G+C content of a neutrally evolving gene under a non-reversible dynamics measured by computer simulations based on experimental evolution data (2004)

      Artigo publicado

      Autores: Adriana Brunstein; Leonardo Varuzza; GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Genetics and Molecular Biology , v. 27 , n. 4 , p. 632 - Extrato QUALIS: A3

    • Characterization of isolates of the cucumovirus Cucumber Mosaic Virus present in Brazil (2004)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Eiras; A.J. Boari; A. Colariccio; A.L.R. Chaves; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; A.R. Figueira; R. Harakawa

      Fonte: Journal of Plant Pathology , v. 86 , n. 1 , p. 61

    • Computer Programs for Genome Annotation by Comparative Analysis of Maximum Likelihood Phylogenies and Molecular Clock Estimates (2004)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Paulo Bandiera Paiva; Rogério Furquim Mauad; Leonardo Varuzza; Adriana Brunstein

      Fonte: Proceedings of the Third Brazilian Symposium on Mathematical and Computational Biology , p. 132

    • A Transcript Finishing Initiative for Closing Gaps in the Human Transcriptome (2004)

      Artigo publicado

      Autores: Mari C. Sogayar; La Torre; Simpson AJ; Luciana Oliveira Cruz; Theri Leica Degaki; Fernanda Festa; Katlin B. Massirer; Fernando Camargo Filho; Luiz Paulo Camargo; Marco A. V. Cunha; Sandro de Souza; Anamaria A. Camargo; Fabiana Bettoni; Janete Maria Cerutti; Dirce Maria Carraro; Lilian C. Pires; Raphael B. Parmigiani; S A Ferreira; de Sá Moreira; do Rosário

      Conteúdo completo

      Fonte: Genome Research , v. 14 , p. 1413 - Extrato QUALIS: A1


    2003


    • Identification of genes differentially expressed in hyphae of Candida albicans (2003)

      Artigo publicado

      Autores: A. S. A. MELO; Rui Cosme Serafim; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Brazilian Journal of Microbiology , v. 34 , p. 135 - Extrato QUALIS: A2

    • Phylocomp: Um programa UNIX para análise filogenômica de genomas (2003)

      Software

      Autores: Paulo Bandiera Paiva; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte:

    • Outbreak of Candida rugosa candidemia: an emerging pathogen that may be refractory to amphotericin B Thepary. (2003)

      Artigo publicado

      Autores: Arnaldo Lopes Colombo; Analy Salles de Azevedo Melo; Robert Fabian Crespo Rosas; Reinaldo Salomão; Marcelo Briones; Michael A. Pfaller

      Conteúdo completo

      Fonte: Diagnostic Microbiology and Infectious Disease , v. 46 , n. 4 , p. 253 - Extrato QUALIS: A4

    • The generation and utilization of a cancer-oriented representation of the human transcriptome by using expressed sequence tags (2003)

      Artigo publicado

      Autores: Helena Brentani; et al.; Otávia L. Caballero; Anamaria Aranha Camargo; Emmanuel Dias Neto; Wilson Araújo da Silva Junior; Andrew John George Simpson; Andre Luiz Vettore de Oliveira; Marco Antonio Zago; Heloisa Zalcberg

      Conteúdo completo

      Fonte: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 100 , n. 23 , p. 13418 - Extrato QUALIS: A1


    2002


    • Experimental phylogeny of neutrally evolving DNA sequences generated by a bifurcate series of nested polymerase chain reactions (2002)

      Artigo publicado

      Autores: GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Silvia Yukie Kawashita; Adriana Brunstein; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Molecular Biology and Evolution , v. 19 , n. 2 , p. 170 - Extrato QUALIS: A1

    • Application of Mathematical Models of DNA Sequence Evolution in Experimental Phylogenetics and Studies of Trypanosoma cruzi Genetic Diversity (2002)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Silvia Yukie Kawashita; Rogério Amino; Adriana Brunstein; Bianca Zingales

      Fonte: Proceedings of the First Brazilian Symposium on Mathematical and Computational Biology , p. 37

    • Liver Stage Quantitation by Competitive RT-PCR (2002)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Kyle McKenna

      Fonte: Methods in Molecular Medicine: Malaria Methods and Protocols , p. 141

    • IDate: Uma ferramenta computacional para datação de tempos de divergência de sequências moleculares (2002)

      Software

      Autores: Rogério Furquim Mauad; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte:


    2001


    • Maximum-Likelihood divergence date estimates based on rRNA gene sequences suggest two scenarios of Trypanosoma cruzi intraspecific evolution (2001)

      Artigo publicado

      Autores: Silvia Yukie Kawashita; GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Octavio Fernandes; Bianca Zingales; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Molecular Biology and Evolution , v. 18 , n. 12 , p. 2250 - Extrato QUALIS: A1

    • From the Cover: The contribution of 700,000 ORF sequence tags to the definition of the human transcriptome (2001)

      Artigo publicado

      Autores: Anamaria A. Camargo; Marco Antônio Zago; Luis Eduardo Coelho de Andrade; Carrer; EL-DORRY; Espreafico; Habr-Gama; Daniel Gianella Neto; Gustavo Henrique Goldman; Gruber A; Christine Hackel; Helena P. B. Samaia; Emmanuel Dias-Neto; Daniel F Simao; Janete Maria Cerutti; Italo A Migotto; Briones MR; Costa; Maria Aparecida Nagai; Sergio Verjovski Almeida

      Conteúdo completo

      Fonte: PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 98 , p. 12103 - Extrato QUALIS: A1


    2000


    • Shotgun sequencing of the human transcriptome with ORF expressed sequence tags (2000)

      Artigo publicado

      Autores: Emmanuel Dias-Neto; Ricardo G. Correa; Sergio Verjovsky-Almeida; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Et al

      Fonte: PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 97 , n. 7 , p. 3491 - Extrato QUALIS: A1

    • The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa. (2000)

      Artigo publicado

      Autores: A.J.G. SIMPSON; Andre Luiz Vettore de Oliveira; G.S. BAIA; M.A. VAN SLUYS; C.B.M VITORELLO; M.A. ZAGO; M. ZATZ; J. MEIDANIS; J.C. SETÚBAL; C.S. BAPTISTA; M.H. BARROS; S. BORDIN; M.R.S BRIONES; M.R.P. BUENO; A.A. CAMARGO; L.E.A. CAMARGO; D.M. CARRARO; H. CARRER; F. DE C. REINACH; N.B. COLAUTO; C. COLOMBO; F.F. COSTA; C.R. COSTA; C.M. COSTA Neto; L.L. COUTINHO; M. CRISTOFANI; E. DIAS-NETO; C. DOCENA; H. EL-DORRY; P. ARRUDA; A.P. FACINCANI; A.S. FERREIRA; V.C.A. FERREIRA; J.A. FERRO; J.S. FRAGA; S.DE.C. FRANÇA; M.C. FRANCO; L.R. FURLAN; G.H. GOLDMAN; M.H.S. GOLDMAN; F.A. ABREU; S.L. GOMES; A. GRUBER; P.L. HO; E.E.K. IZIOKA; M.L. JUNQUEIRA; E.L. KEMPER; J.P. KITAJIMA; J.E. KRIEGER; M.R. LAMBAIS; L.C. DE C. LEITE; M. ACENCIO; E.G.M. LEMOS; M.V.F. LEMOS; S.A. LOPES; C.R. LOPEZ; M.A.MACHADO; A.M.B.N. MADEIRA; H.M.F. MADEIRA; C.L. MARINO; M.V. MARQUES; E.A.L. MARTINS; S.V ALMEIDA; E.M.F. MARTINS; A.Y. MATSUKUMA; C.F.M. MENCK; E.C. MIRACCA; C.Y. MIYAKI; D.H. MOON; M.A. NAGAI; A.L.O. NASCIMENTO; A. NHANI; F.G NÓBREGA; R. ALVARENGA; L.R. NUNES; M. OLIVEIRA; M.C DE OLIVEIRA; R.C. DE OLIVEIRA; B.R.PEIXOTO; G.P. PEREIRA; H.A. PEREIRA Jr; J.B. PESQUERO; R.B. QUAGGIO; P.G. ROBERTO; L.M.C. ALVES; V.RODRIGUES; A.J.DE M. ROSA; V.E. DA ROSA JR; R.G. DE SÁ; R. SANTELLI; H.E SAWASAKI; A.C.R. DA SILVA; F.R. DA SILVA; A.M. SILVA; W.A. SILVA JR.; J.E. ARAYA; J.F. DA SILVEIRA; M.L.Z. SILVESTRI; W.J. SIQUEIRA; L.E. SOARES NETO; A.P. DE SOUZA; M.F. TERENZI; D. TRUFFI; S.M. TSA; M.H. TSUHAKO; H. VALLADA

      Conteúdo completo

      Fonte: Nature (London) , v. 406 , n. 6792 , p. 151 - Extrato QUALIS: A1

    • Identification of human chromosome 22 transcribed sequences with ORF expressed sequence tags (2000)

      Artigo publicado

      Autores: Sandro de Souza; Anamaria A.Camargo; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Et al

      Fonte: PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 97 , p. 12690 - Extrato QUALIS: A1

    • PCR-restriction enzyme analysis (PRA) of a HIV-positive patient bone marrow isolate discloses polyclonal infection with two Mycobacterium avium strains (2000)

      Artigo publicado

      Autores: Oliveira, R.S.; Sircili, M.P.; Ueki, S.Y.M.; Telles, M.A.S.; Schnabel, B.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Sylvia Leão

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology , v. 38 , p. 4643 - Extrato QUALIS: A1

    • Typing of Candida glabrata in clinical isolates by comparative sequence analysis of the cytochrome c oxidase subunit 2 gene distinguishes two clusters of strains associated with geographical sequence polymorphisms (2000)

      Artigo publicado

      Autores: GERDINE FERREIRA DE OLIVEIRA SANSON; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology , v. 38 , n. 1 , p. 227 - Extrato QUALIS: A1


    1999


    • Epidemiology, Biochemistry and Evolution of Trypanosoma cruzi lineages based on the ribosomal RNA sequences (1999)

      Artigo publicado

      Autores: Bianca Zingales; Ricardo Peres Souto; Beatriz Stolf; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 94 , n. SUPPL.1 , p. 159 - Extrato QUALIS: A4

    • Identification of two novel Mycobacterium avium allelic variants by PCR-Restriction enzyme analysis in pig and human isolates from Brazil (1999)

      Artigo publicado

      Autores: Sylvia Leão; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Sircili, M.P.; Balian, S.C.; Mores, N.; Ferreira-Neto, J.S.

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology , v. 37 , n. 8 , p. 2592 - Extrato QUALIS: A1

    • The evolution of two Trypanosoma cruzi subgroups inferred from rRNA genes can be correlated with the interchange of American mammalian faunas in the Cenozoic and has implications to pathogenicity and host specificity (1999)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; Ricardo Peres Souto; Beatriz Stolf; Bianca Zingales

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 104 , p. 219 - Extrato QUALIS: A4


    1998


    • Evolutionary distances and identification of Candida species in clinical isolates by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) (1998)

      Artigo publicado

      Autores: Analy Salles de Azevedo Melo; Leila Paula de Almeida; Arnaldo Lopes Colombo; Marcelo Briones

      Conteúdo completo

      Fonte: Mycopathologia , v. 142 , p. 57 - Extrato QUALIS: A3

    • Proteasome Inhibitors Block Development Of Plasmodium Spp. (1998)

      Artigo publicado

      Autores: S. M. GANTT; J. M. MYUNG; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; E. J. COREY; S. OMURA; V. NUSSENZWEIG; P. SINNIS

      Fonte: Antimicrobial Agents and Chemotherapy , v. 42 , p. 2731 - Extrato QUALIS: A1

    • Two distinct groups of mucin-like genes are differentially expressed in the developmental stages of Trypanosoma Cruzi (1998)

      Artigo publicado

      Autores: L. H. G. FREITAS JR; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; S. SCHENKMAN

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 93 , p. 101 - Extrato QUALIS: A4


    1997


    • Sporozoites Of Plasmodium Yoelii Infect Mice With Targeted Deletions In Icam-1 And Icam-2 Or Complement Components C3 And C4 (1997)

      Artigo publicado

      Autores: A. A. SULTAN; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; N. GERWIN; M. C. CARROLL; V. NUSSENZWEIG

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 88 , p. 263 - Extrato QUALIS: A4


    1996


    • Remnant Proteins Inhibit Malaria Sporozoite Invasion Of Hepatocytes (1996)

      Artigo publicado

      Autores: P. SINNIS; T. E. WILLNOW; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; J. HERZ; V. NUSSENZWEIG

      Fonte: Journal of Experimental Medicine , v. 184 , p. 945 - Extrato QUALIS: A1

    • The Large Difference In Infectivity For Plasmodium Berghei And Plasmodium Yoelii Cannot Be Correlated With Their Ability To Enter Into Hepatocytes (1996)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; M. TSUJI; V. NUSSENZWEIG

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 77 , p. 7 - Extrato QUALIS: A4

    • Organization Of Trans-Sialidase Genes In Trypanosoma Cruzi (1996)

      Artigo publicado

      Autores: C. M. EGIMA; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; L. H. G. FREITAS JR; R. P. F. SCHENKMAN; H. UEMURA

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 77 , p. 115 - Extrato QUALIS: A4


    1995


    • Trans-Sialidase Genes Expressed In Mammalian Forms Of Trypanosoma Cruzi Evolved From Ancestor Genes Expressed In Insect Forms Of The Parasite (1995)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; C. M. EGIMA; D. J. EICHINGER; S. SCHENKMAN

      Fonte: JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION , v. 41 , p. 120 - Extrato QUALIS: A3

    • Trypanosoma Cruzi Trans-Sialidase Lacking C-Terminal Repeats And Expressed In Epimastigote Forms (1995)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; C. M. EGIMA; D. J. EICHINGER; S. SCHENKMAN

      Fonte: MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY , v. 70 , p. 9


    1994


    • Trans-Sialidase and sialic acid acceptors from insect to mammalian stages of Trypanosoma cruzi (1994)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; C. M. EGIMA; A. ACOSTA; S. SCHENKMAN

      Fonte: Experimental Parasitology , v. 79 , p. 211 - Extrato QUALIS: A4


    1993


    • Trans-sialidase from Trypanosoma cruzi epimastigotes is expressed at stationary phase and is different from the enzyme expressed in trypomastigotes (1993)

      Artigo publicado

      Autores: CHAVES, L.B.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; S. SCHENKMAN

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 61 , p. 97 - Extrato QUALIS: A4


    1992


    • Leishmania Tarentolae Taxonomic Relatedness Inferred From Phylogenetic Analysis Of The Small Subunit Ribosomal Rna Gene (1992)

      Artigo publicado

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones; K. NELSON; S. M. BEVERLEY; M. H. T. AFFONSO; E. P. CAMARGO; L. M. FLOETER-WINTER

      Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology , v. 53 , p. 121 - Extrato QUALIS: A4

    Atuações

    Universidade Federal de São Paulo

    • Professor Associado

      Desde 1996

    Frontiers in Genetics

    • Membro de corpo editorial

      Desde 2011

    Plos One

    • Revisor de periódico

      Desde 2012

    Ensino

    Orientações e supervisões

    Supervisão de pós-doutorado em andamento

    Tese de doutorado em andamento

    • Camila Ronqui Rodrigues

      Genômica da resposta à drogas em Esclerose Lateral Amiotrófica esporádica

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2018

    Dissertação de mestrado em andamento

    • Ilda Manuelly Santos

      Polimorfismos no genoma mitocondrial humano associados com a Esclerose Lateral Amiotrófica

      Microbiologia e Imunologia

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2018

    Tese de doutorado concluídas

    • João Henrique Coelho Campos

      Associação de variantes do genoma mitocondrial à Esclerose lateral amiotrófica e sua distribuição em haplogrupos

      Microbiologia e Imunologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2021

    • Danielle do Carmo Ferreira da Silva

      Distribuição e morfologia de mitocôndrias der Candida albicans em condições de hipóxia e choque térmico

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Luciano Rodrigo Lopes

      Investigação da transferência de genes mitocondriais para o genoma nuclear e comparação evolutiva entre ambos os genomas

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Thais Fernanda Bartelli

      Alterações no genoma mitocondrial de Candida albicans em microaerofilia, anaerobiose e variação térmica

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2016

    • Flavio Lichtenstein

      Diferenciação de espécies biológicas através de algoritmos de análise de entropia utilizando dados de sequências genéticas

      Gestão e Informática em Saúde

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2015

    • Silvia Yukie Kawashita

      Homologia, paralogia e função da DGF-1, uma família gênica específica de Trypanosoma cruzi

      Microbiologia e Imunologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Ana Carolina Barbosa Padovan

      Análise do biofilme de Candida albicans na perspectiva da genética molecular

      Microbiologia e Imunologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2008

    • Renata Carmona e Ferreira

      Frequências do uso de codons como estimadores do nível de expressão de genes hipotéticos

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Paulo Bandiera Paiva

      Filogenias moleculares de sequências genômicas: aplicação na análise de receptores acoplados à proteína-G

      Ciências Biológicas (Biologia Molecular)

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2004

    • Laize Tomazi

      Filogenias moleculares e análise do polimorfismo de Trypanosoma cruzi sugerem hibridização introgressiva nos subgrupos rDNA 1/2 e Zimodema 3

      Microbiologia e Imunologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2004

    • Analy Sales de Azevedo Melo

      Identificação e caracterização de genes diferencialmente expressos em hifas de Candida albicans

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2004

    • Gerdine Ferreira de Oliveira Sanson

      Modelos probabilísticos de substituição de nucleotídeos aplicados à evolução in vitro do gene rRNA 18S e ao estudo da diversidade genética de Trypanosoma cruzi

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2002

    • Jessé Reis Alves

      Uso do RT-PCR na análise de expressão dos genes CDR1, CYP51A1 e CaMDR1, relacionados a resistência a azólicos, em isolados de Candida albicans

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2001

    Dissertação de mestrado concluídas

    • Ilda Manuelly Santos

      Polimorfismos no genoma mitocondrial associados à esclerose lateral amiotrófica

      Microbiologia e Imunologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2019

    • Camila Ronqui Rodrigues

      Recombinação no DNA mitcondrial humano na perspectiva de testes de Bootscan

      Microbiologia e Imunologia

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Danielle do Carmo Ferreira da Silva

      Similaridades entre as sequências de proteínas de invasão celular de Trypanosoma cruzi e bactérias intracelulares: transferência horizontal de genes ou convergência evolutiva?

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Thais Fernanda Bartelli

      Identificação de domínios de evolução neutra no DNA mitocondrial de Candida albicans e suas possíveis aplicações em tipagem

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2012

    • Richard Cardoso da Silva

      Caracterização de genes hipotéticos e o papel da Enolase da superfície de C. albicans na adesão celular

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2010

    • Melissa Mitne Petry

      Identificação de polimorfismo no gene de Dectina-1 (CLEC7A) humana

      Informática em Saúde

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Luiz Fernando Alvarez

      Análise das seqüências do gene RBR2 na perspectiva da sistemática molecular e suas implicações na epidemiologia de Candida albicans

      Informática em Saúde

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Rogério Furquim Mauad

      IDATE: Um programa computacional para estimar tempos de divergência com um teste de razão de máxima verossimilhança

      Ciências Biológicas (Biologia Molecular)

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2003

    • Gerdine Ferreira de Oliveira Sanson

      Tipagem de leveduras patogênicas do gênero Candida por análise comparativa de sequências do gene mitocondrial da subunidade 2 da citocromo c oxidase

      Microbiologia e Imunologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2000

    • Analy Salles de Azevedo Melo

      Identificação de espécies de leveduras patogênicas provenientes de amostras clínicas pela técnica de "RAPD" (Rendomly Amplified Polymorphic DNA)

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 1999

    • Raquel Maria Lima Lemes

      Análise fenotípica e genotípica de leveduras de ambiente hospitalar, profissionais de saúde e pacientes: Implicações na colonização e rotas de infecção

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 1998

    Gestão

    Pesquisa

    Universidade Federal de São Paulo

    • Investigação de elementos induzidos pela resposta vacinal nos indivíduos submetidos aos testes clínicos com a vacina ChAdOx1 nCOV-19

      Esta proposta de pesquisa consiste em um desdobramento do projeto internacional com amostras de indivíduos voluntários para o teste da vacina Oxford-UNIFESP ChAdOx1 nCoV-19. A proposta envolverá as 2.000 amostras de voluntários, e os períodos correspondentes, para estabelecer principalmente um repositório para toda a comunidade acadêmica do Estado de São Paulo. Este repositório será convertido em um biobanco após a conclusão do projeto, conforme declarado na legislação atual. Além disso, as amostras armazenadas no biorrepositório serão usadas para realizar análises dessas amostras que não se sobrepõem às "Medidas de resultados primários e secundários", conforme descrito na documentação do ensaio clínico disponível em ClinicalTrials.gov (Institutos Nacionais de Saúde, ID NCT04400838). O projeto será coordenado pelo Prof. Luiz Mario Ramos Janini e incluirá uma equipe de pesquisadores principais em diferentes áreas, referentes aos objetivos específicos e histórico de pesquisa da FAPESP. Os objetivos deste projeto são: (1) estabelecer um biorrepositório contendo todas as amostras obtidas de voluntários antes e depois da vacinação. Este biorrepositório estará disponível, de acordo com os procedimentos legais, para toda a comunidade científica do Estado de São Paulo, conforme determinado pelas diretrizes da FAPESP; (2) avaliar a capacidade de neutralização de soros de indivíduos vacinados contra cepas SARS-CoV-2 circulantes específicas do Brasil e outras cepas específicas de coronavírus para avaliação da imunidade cruzada; (3) caracterizar isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudar a variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína "Spike" específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos; (4) gerar e analisar perfis de citocinas de soros de voluntários antes e após a vacinação para avaliar a resposta inflamatória e efeitos associados; (5) analisar e comparar os transcriptomas sanguíneos de voluntários, por RNA-seq, antes e após a vacinação. Essa análise será quantitativa e qualitativa para avaliar o impacto da vacina nos níveis diferenciais de expressão gênica e avaliar a variação individual na resposta genética à vacina e (6) analisar o perfil de secretoma no sangue total dos voluntários, antes e após a vacinação, para avaliar o tipo de resposta imune predominante e possível "priming" por outro coronavírus.

      Desde 2021

    • Evolução de Trypanosoma cruzi e Candida spp. na perspectiva da sistemática molecular

      Autores: Marcelo Ribeiro da Silva Briones, Fernando Antoneli, Isabel MVG Carvalho, Luiz mario ramos janini

      Desde 1996

    • Biologia Molecular de Candida spp.

      Desde 1996

    • Projeto genoma da Xylella fastidiosa

      1998 a 2000

    • Identificação de integrinas no Trypanosoma cruzi

      Desde 2002

    • Projeto genoma humano do câncer

      1999 a 2004

    Atualização Lattes em 2024-05

    Processado em 2024-07-22