Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Escola Paulista de Medicina
Programa de Pós-Graduação: Microbiologia e Imunologia
E-Mail: jpccunha@unifesp.br
Resumo
Possui graduação em Ciências Biológicas-Modalidade Médica pela Universidade Federal de São Paulo (2001), doutorado em Microbiologia e Imunologia pela Universidade Federal de São Paulo (2007) e pós-doutorado no Instituto Ludwig (2007-2010). Tem experiência na área de Bioquímica, Biologia Molecular de parasitas e células de mamíferos. Atualmente é pesquisadora científica VI do Instituto Butantan onde estuda alterações proteômicas e epigenéticas em tripanossomas utilizando abordagens ômicas (proteômica, transcriptomica e genômica).Obteve financiamento na categoria de Jovem Pesquisadores (FAPESP) e Instituto Serrapilheira. Atualmente possui projetos financiados pela FAPESP incluindo Jovem Pesquisador -fase 2.
Fonte: Lattes CNPq
Nomes em citações bibliográficas
da CUNHA, J. P.;Cunha, Júlia P. C.;da Cunha, Julia Pinheiro Chagas;da Cunha, J.P.C.;daCunhaJ;DA CUNHA, JÚLIA P.C;DA CUNHA, JÚLIA P.C.;DA CUNHA, JULIA PC;DA CUNHA, JÚLIA P. C.;CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO;DA CUNHA, JULIA P. C.;CHAGAS DA CUNHA, JULIA P.;Cunha, Julia P.C. da;CUNHA, JULIA P. C. DA;DA CUNHA, J. P. C.;DACUNHA, J;Cunha, Júlia Pinheiro Chagas da;DA CUNHA, JÚLIA PINHEIRO CHAGAS;DA CUNHA, JULIA P C;CUNHA, JULIA P. C.;Cunha, Julia;Pinheiro Chagas da Cunha, Julia
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Formação
Doutorado em Microbiologia e Imunologia
Modificações pós-traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma cruzi. Caracterizacao bioquimica e funcional ao longo do ciclo celular, ciclo de vida e no dano ao DNA.
Orientação: Sergio Schenkman
Universidade Federal de São Paulo
Graduação em Ciências Biológicas-Modalidade Médica
ESTUDO DE ACETILAÇÃO DE HISTONAS EM TRYPANOSOMA CRUZI
Orientação: SERGIO SCHENKMAN
Universidade Federal de São Paulo
1998 a 2001
Produção
2023
-
Trypanosoma cruzi infection changes the chromatin proteome profile of infected human cells (2023)
Artigo publicado
Autores: FLORENTINO, P.T.V.; VITORINO, F.N.L.; MENDES, D.; DA CUNHA, J.P.C.; Carlos Frederico Martins Menck
Fonte: Journal of Proteomics , v. 272 , p. 104773 - Extrato QUALIS: A1
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Navigating the boundaries between metabolism and epigenetics in trypanosomes (2023)
Artigo publicado
Autores: MENEZES, ANA PAULA; MURILLO, ANA MILENA; DE CASTRO, CAMILA GACHET; BELLINI, NATALIA KARLA; TOSI, LUIZ RICARDO ORSINI; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE; Elias, Maria Carolina; SILBER, ARIEL MARIANO; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: TRENDS IN PARASITOLOGY , v. 39 , p. 682 - Extrato QUALIS: A1
-
TgKDAC4: A Unique Deacetylase of Toxoplasma?s Apicoplast (2023)
Artigo publicado
Autores: FRAGOSO, MARIANA SAYURI ISHIKAWA; DE SIQUEIRA, CAROLINE MORAES; VITORINO, FRANCISCA NATHÁLIA LUNA; VIEIRA, ALEXANDRE ZANATTA; MARTINS-DUARTE, ÉRICA SANTOS; FAORO, HELISSON; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; ÁVILA, ANDRÉA RODRIGUES; NARDELLI, SHEILA CRISTINA
Fonte: Microorganisms , v. 11 , p. 1558 - Extrato QUALIS: A3
-
The antiproliferative effect of FGF2 in K-Ras-driven tumor cells involves modulation of rRNA and the nucleolus (2023)
Artigo publicado
Autores: DE LUNA VITORINO, FRANCISCA N.; ARMELIN, HUGO AGUIRRE; FLORENS, LAURENCE A.; WASHBURN, MICHAEL P.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; LEVY, MICHAELLA J.; MANSANO WAILEMANN, ROSANGELA A.; LOPES, MARIANA; SILVA, MARIANA LOTERIO; SARDIU, MIHAELA E.; GARCIA, BENJAMIN A.; MACHADO MOTTA, MARIA CRISTINA; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO
Fonte: JOURNAL OF CELL SCIENCE , v. 136 , p. 1 - Extrato QUALIS: A3
2022
-
Open chromatin analysis in Trypanosoma cruzi life forms highlights critical differences in genomic compartments and developmental regulation at tDNA loci (2022)
Artigo publicado
Autores: LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO; MOTTA, MARIA CRISTINA MACHADO M.; SILBER, ARIEL M.; ELIAS, M. CAROLINA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; SILVA, HERBERT GUIMARÃES DE SOUSA; POUBEL, SALOE; ROSÓN, JULIANA NUNES; DE LIMA, LOYZE PAOLA OLIVEIRA; COSTA-SILVA, HÉLLIDA MARINA; GONÇALVES, CAMILA SILVA; Galante, Pedro A. F.; HOLETZ, FABIOLA
Fonte: Epigenetics & Chromatin , v. 15 , p. 22 - Extrato QUALIS: A2
-
Previously Unidentified Histone H1-Like Protein Is Involved in Cell Division and Ribosome Biosynthesis in Toxoplasma gondii (2022)
Artigo publicado
Autores: SEVERO, VANESSA; SOUZA, RODOLPHO; VITORINO, FRANCISCA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; ÁVILA, ANDRÉA; ARRIZABALAGA, GUSTAVO; NARDELLI, SHEILA
Fonte: mSphere , v. 7 , p. 1 - Extrato QUALIS: A2
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H2B.V demarcates divergent strand-switch regions, some tDNA loci, and genome compartments in Trypanosoma cruzi and affects parasite differentiation and host cell invasion (2022)
Artigo publicado
Autores: ROSÓN, JULIANA NUNES; Calderano, Simone Guedes; FRAGOSO, STENIO PERDIGÃO; SIEGEL, T. NICOLAI; Elias, Maria Carolina; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; VITARELLI, MARCELA DE OLIVEIRA; COSTA-SILVA, HÉLLIDA MARINA; PEREIRA, KAMILLE SCHMITT; PIRES, DAVID DA SILVA; LOPES, LETICIA DE SOUSA; CORDEIRO, BARBARA; KRAUS, AMELIE J.; CRUZ, KARIN NAVARRO TOZZI
Fonte: PLoS Pathogens , v. 18 , p. e1009694 - Extrato QUALIS: A1
2021
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Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms (2021)
Artigo publicado
Autores: LIMA, ALEX R. J.; DE ARAUJO, CHRISTIANE B.; BISPO, SALOE; PATANÉ, JOSÉ; SILBER, ARIEL M.; ELIAS, M. CAROLINA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: PLoS Pathogens , v. 17 , p. e1009272 - Extrato QUALIS: A1
-
FGF-2 induces a failure of cell cycle progression in cells harboring amplified K-Ras, revealing new insights into oncogene-induced senescence (2021)
Artigo publicado
Autores: LUND, PEDER J.; LOPES, MARIANA; SIDOLI, SIMONE; CORADIN, MARIEL; VITORINO, FRANCISCA NATHÁLIA DE LUNA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; GARCIA, BENJAMIN A.
Fonte: Molecular Omics , v. 17 , p. 725 - Extrato QUALIS: B4
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PI3K-AKT, JAK2-STAT3 pathways and cell-cell contact regulate maspin subcellular localization (2021)
Artigo publicado
Autores: LONGHI, M. T.; SILVA, L. E.; PEREIRA, M.; MAGALHÃES, M.; REINA, J.; VITORINO, F. N. L.; GUMBINER, B. M.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; CELLA, N.
Fonte: Cell Communication and Signaling , v. 19 , p. 1 - Extrato QUALIS: A3
-
The ribosome assembly factor Nop53 has a structural role in the formation of nuclear pre-60S intermediates, affecting late maturation events (2021)
Artigo publicado
Autores: BAGATELLI, FELIPE F M; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA N; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; OLIVEIRA, CARLA C
Fonte: NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 49 , p. 7053 - Extrato QUALIS: A1
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DNA damage and oxidative stress in human cells infected by Trypanosoma cruzi (2021)
Artigo publicado
Autores: FLORENTINO, PILAR T. V.; MENDES, DAVI; VITORINO, FRANCISCA NATHALIA L.; MARTINS, DAVI J.; CUNHA, JULIA P. C.; MORTARA, RENATO A.; Carlos Frederico Martins Menck
Fonte: PLoS Pathogens , v. 17 , p. e1009502 - Extrato QUALIS: A1
2020
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Replication origin location might contribute to genetic variability in Trypanosoma cruzi (2020)
Artigo publicado
Autores: DE ARAUJO, CHRISTIANE BEZERRA; MCCULLOCH, RICHARD; Elias, Maria Carolina; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; INADA, DAVI TOSHIO; DAMASCENO, JEZIEL; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO; HIRAIWA, PRISCILA; MARQUES, CATARINA; GONÇALVES, EVONNILDO; NISHIYAMA-JUNIOR, MILTON YUTAKA
Fonte: BMC GENOMICS , v. 21 , p. 414 - Extrato QUALIS: A2
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Improvements on the quantitative analysis of Trypanosoma cruzi histone post translational modifications: Study of changes in epigenetic marks through the parasites metacyclogenesis and life cycle (2020)
Artigo publicado
Autores: DE LIMA, LOYZE P; POUBEL, SALOE BISPO; YUAN, ZUO-FEI; ROSÓN, JULIANA NUNES; VITORINO, FRANCISCA NATHALIA DE LUNA; HOLETZ, FABIOLA BARBIERI; GARCIA, BENJAMIN A.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: Journal of Proteomics , v. 225 , p. 103847 - Extrato QUALIS: A1
-
Proteomic analysis of Trypanosoma cruzi spliceosome complex (2020)
Artigo publicado
Autores: BARBOSA, ROSICLER L.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; MENEZES, ARTHUR T.; MELO, RAÍSSA DE F.P.; Elias, Maria Carolina; SILBER, ARIEL M.; COLTRI, PATRICIA P.
Fonte: Journal of Proteomics , v. 223 , p. 103822 - Extrato QUALIS: A1
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Trypanosomatid selenophosphate synthetase structure, function and interaction with selenocysteine lyase (2020)
Artigo publicado
Autores: DA SILVA, MARCO TÚLIO ALVES; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; VALENTINI, SANDRO ROBERTO; ZANELLI, CLESLEI FERNANDO; BORGES, JÚLIO CESAR; DIAS, MARCIO VINICIUS BERTACINI; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; MITTRA, BIDYOTTAM; ANDREWS, NORMA W.; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE; SILVA, IVAN ROSA E; FAIM, LÍVIA MARIA; BELLINI, NATÁLIA KARLA; PEREIRA, MURILO LEÃO; LIMA, ANA LAURA; DE JESUS, TERESA CRISTINA LEANDRO; COSTA, FERNANDA CRISTINA; WATANABE, TATIANA FARIA
Fonte: PLoS Neglected Tropical Diseases , v. 14 , p. e0008091 - Extrato QUALIS: A1
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Identification of Novel Interspersed DNA Repetitive Elements in the Trypanosoma cruzi Genome Associated with the 3-UTRs of Surface Multigenic Families (2020)
Artigo publicado
Autores: CALDERANO, SIMONE GUEDES; NISHIYAMA JUNIOR, MILTON YUTAKA; MARINI, MARJORIE; NUNES, NATHAN DE OLIVEIRA; REIS, MARCELO DA SILVA; PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER; José Franco da Silveira Filho; DA CUNHA, JULIA PINHEIRO CHAGAS; ELIAS, MARIA CAROLINA
Fonte: Genes , v. 11 , p. 1235 - Extrato QUALIS: A3
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HISTONAS EM Trypanosoma cruzi: SUAS VARIANTES E MODIFICAÇÕES AO LONGO DO CICLO DE VIDA (2020)
Capítulo de livro publicado
Autores: ROSÓN, JULIANA NUNES; Silva, Héllida Marina Costa; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: Atualidades em Medicina Tropical no Brasil: Protozoários , p. 48
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Gene co-expression and histone modification signatures are associated with melanoma progression, epithelial-to-mesenchymal transition, and metastasis (2020)
Artigo publicado
Autores: Hatylas Azevedo; Guilherme Cavalcante Pessoa; Francisca Nathália de Luna Vitorino; Jérémie Nsengimana; Julia Newton-Bishop; Eduardo Moraes Reis; Júlia Pinheiro Chagas da Cunha; Miriam Galvonas Jasiulionis
Fonte: Clinical Epigenetics , v. 12 , p. 127 - Extrato QUALIS: A2
2019
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One minute analysis of 200 histone posttranslational modifications by direct injection mass spectrometry (2019)
Artigo publicado
Autores: SIDOLI, SIMONE; ANDREWS, ANDREW J.; GARCIA, BENJAMIN A.; KORI, YEKATERINA; LOPES, MARIANA; YUAN, ZUO-FEI; KIM, HEE JONG; KULEJ, KATARZYNA; JANSSEN, KEVIN A.; AGOSTO, LAURA M.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: GENOME RESEARCH , v. 23 , p. 1800203 - Extrato QUALIS: A1
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Comparison of the RNA Content of Extracellular Vesicles Derived from Paracoccidioides brasiliensis and Paracoccidioides lutzii (2019)
Artigo publicado
Autores: PERES DA SILVA, ROBERTA; LONGO, LARISSA G. V.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; SOBREIRA, TIAGO J. P.; RODRIGUES, MARCIO L.; FAORO, HELISSON; GOLDENBERG, SAMUEL; ALVES, LYSANGELA R.; PUCCIA, ROSANA
Fonte: Cells , v. 8 , p. 765 - Extrato QUALIS: A3
2018
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A Carbohydrate Moiety of Secreted Stage-Specific Glycoprotein 4 Participates in Host Cell Invasion by Trypanosoma cruzi Extracellular Amastigotes (2018)
Artigo publicado
Autores: FLORENTINO, PILAR T. V.; REAL, FERNANDO; ORIKAZA, CRISTINA M.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; VITORINO, FRANCISCA N. L.; CORDERO, ESTEBAN M.; SOBREIRA, TIAGO J. P.; MORTARA, RENATO A.
Fonte: Frontiers in Microbiology , v. 9 , p. 1 - Extrato QUALIS: A2
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FGF-2 Antiproliferative Stimulation Induces Proteomic Dynamic Changes and High Expression of fosB and junB in K-Ras-Driven Mouse Tumor Cells (2018)
Artigo publicado
Autores: VITORINO, FRANCISCA NATHALIA DE LUNA; REIS, MARCELO SILVA; FLORENS, LAURENCE A; WASHBURN, MICHAEL P; ARMELIN, HUGO AGUIRRE; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; MONTONI, FABIO; MORENO, JAQUELINE NEVES; DE SOUZA, BRUNO FERREIRA; LOPES, MARIANA DE CAMARGO; CORDEIRO, BARBARA; FONSECA, CECILIA SELLA; GILMORE, JOSHUA M; SARDIU, MIHAELA I
Fonte: PROTEOMICS , v. 23 , p. 1800203 - Extrato QUALIS: A2
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Trichostatin A induces Trypanosoma cruzi histone and tubulin acetylation: effects on cell division and microtubule cytoskeleton remodelling (2018)
Artigo publicado
Autores: DE OLIVEIRA SANTOS, JEAN; ZUMA, ALINE ARAUJO; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; DE SOUZA, WANDERLEY; MOTTA, MARIA CRISTINA M.
Fonte: PARASITOLOGY , v. 13 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1
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Human RNF113A participates of pre-mRNA splicing in vitro (2018)
Artigo publicado
Autores: GATTI DA SILVA, GUILHERME H.; JURICA, MELISSA S.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; OLIVEIRA, CARLA C.; COLTRI, PATRICIA P.
Fonte: JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY , v. 1 , p. 1 - Extrato QUALIS: A3
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Extracellular Vesicles From Sporothrix brasiliensis Are an Important Virulence Factor That Induce an Increase in Fungal Burden in Experimental Sporotrichosis (2018)
Artigo publicado
Autores: IKEDA, MARCELO AUGUSTO KAZUO; DE ALMEIDA, JOSÉ ROBERTO FOGAÇA; JANNUZZI, GRASIELLE PEREIRA; CRONEMBERGER-ANDRADE, ANDRÉ; Ana Claudia Trocoli Torrecilhas; MORETTI, NILMAR SILVIO; DA CUNHA, JULIA PINHEIRO CHAGAS; DE ALMEIDA, SANDRO ROGÉRIO; FERREIRA, KAREN SPADARI
Fonte: Frontiers in Microbiology , v. 9 , p. 1 - Extrato QUALIS: A2
2017
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Quantitative Proteomic Analysis of Replicative and Nonreplicative Forms Reveals Important Insights into Chromatin Biology of Trypanosoma cruzi (2017)
Artigo publicado
Autores: LEANDRO DE JESUS, TERESA CRISTINA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Calderano, Simone Guedes; VITORINO, FRANCISCA NATHALIA DE LUNA; LLANOS, RICARDO PARIONA; LOPES, MARIANA DE CAMARGO; DE ARAÚJO, CHRISTIANE BEZERRA; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE; REIS, MARCELO DA SILVA; Elias, Maria Carolina
Fonte: MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS , v. 16 , p. 23 - Extrato QUALIS: A1
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Identification of karyopherins involved in the nuclear import of RNA exosome subunit Rrp6 in Saccharomyces cerevisiae (2017)
Artigo publicado
Autores: GONZALES-ZUBIATE, FERNANDO A; OKUDA, ELLEN K; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO
Fonte: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY , v. 24 , p. jbc.M116.772376 - Extrato QUALIS: A1
2016
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Chromatin proteomics reveals variable histone modifications during the life cycle of Trypanosoma cruzi (2016)
Artigo publicado
Autores: DE JESUS, TERESA CRISTINA LEANDRO; Elias, Maria Carolina; JANZEN, CHRISTIAN J.; SCHENKMAN, SERGIO; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; NUNES, VINICIUS SANTANA; LOPES, MARIANA DE CAMARGO; MARTIL, DAIANA EVELIN; IWAI, LEO KEI; MORETTI, NILMAR SILVIO; MACHADO, FABRICIO CASTRO; DE LIMA-STEIN, MARIANA L; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE
Fonte: Journal of Proteome Research (Print) , v. 15 , p. 2039 - Extrato QUALIS: A2
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Protein SUMOylation is Involved in Cell-cycle Progression and Cell Morphology in Giardia lamblia (2016)
Artigo publicado
Autores: DI GENOVA, BRUNO M.; DA SILVA, RICHARD C.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; GARGANTINI, PABLO R.; MORTARA, RENATO A.; TONELLI, RENATA R.
Fonte: The Journal of Eukaryotic Microbiology , v. - , p. 1 - Extrato QUALIS: A4
2015
2014
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Proteomics evaluation of FGF2 stimulus on adrenocarcinoma cells by label free and SILAC quantification (2014)
Trabalhos em eventos
Autores: Daniel Ferreira Silva; Mariana de Camargo Lopes; Natalie Nanae Takara; J. Gilmore; M.E. Sardiu; Florens L; Michael P. Washburn; Hugo Aguirre Armelin; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: 2 BrProt
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Proteome of cell wall-extracts from pathogenic Paracoccidioides brasiliensis: Comparison among morphological phases, isolates, and reported fungal extracellular vesicle proteins (2014)
Artigo publicado
Autores: LONGO, LARISSA V.G.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; SOBREIRA, TIAGO J.P.; PUCCIA, ROSANA
Fonte: EuPA Open Proteomics , v. 3 , p. 216 - Extrato QUALIS: B1
2013
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FGF-2 alters protein expression of DNA replication and chromatin remodeling machineries in a murine carcinoma cell (2013)
Trabalhos em eventos
Autores: Carolina Santacruz Perez; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Natalie Nanae Takara; Mariana de Camargo Lopes; Daniella A Franze; J. Gilmore; M.E. Sardiu; Florens L; Michael P. Washburn; Hugo Aguirre Armelin
Fonte: Chromatin, Replication and Chromosomal Stability 2013
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The Human Cell Surfaceome of Breast Tumors (2013)
Artigo publicado
Autores: da Cunha, J. P. C.; Galante, Pedro A. F.; Jorge E de Souza; Martin Pieprzyk; Dirce Carraro; Lloyd J Old; Anamaria Aranha Camargo; Sandro José de Souza; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: BioMed Research International , v. 2013 , p. 1 - Extrato QUALIS: A3
2012
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Quantitative proteomic analysis of murine carcinoma cells after FGF-2 treatment using MudPIT technology (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Daniella A Franze; Natalie Nanae Takara; Carolina Santacruz Perez; J. Gilmore; M.E. Sardiu; Florens L; Michael P. Washburn; Hugo Aguirre Armelin
Fonte: 1 Encontro de Proteômicos
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SurfaceomeDB: a cancer-orientated database for genes encoding cell surface proteins (2012)
Artigo publicado
Autores: Jorge E S de Souza; Pedro Alexandre Favoretto Galante; almeida rvb; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Daniel T Ohara; ohno-machado l; L J Old; sandro jose de Souza
Fonte: Cancer Immunity , v. 1 , p. 12
2011
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Optimization of phosphoprotein identification and enrichment using mitosis-blocked Y1 cells (2011)
Trabalhos em eventos
Autores: Natalie Nanae Takara; Daniella A Franze; Ismael Feitosa Lima; Ferreira-Junior, JMC; Hugo Aguirre Armelin; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: XIII Reunião Cientifica Anual do Instituto Butantan
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2009
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Bioinformatics construction of the human surfaceome and experimental identification of new tumor targets at cell surface (2009)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; W A da Silva Jr; R O Perez; Beatriz Stransky; Martin Pieprzyk; J Moore; Otavia Caballero; A Habr-Gama; W P Kuo; A J Simpson; A A Camargo; Galante, Pedro A. F.; L J Old; Jorge E S de Souza; Robson F de Souza; Patricia Marra de Carvalho; Daniel T Ohara; Ricardo P Moura; Sueli Oba; Sueli Marie
Fonte: 100th Annual Meeting of AACR
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Bioinformatics construction of the human cell surfaceome (2009)
Artigo publicado
Autores: da Cunha, J. P. C.; Silva, W. A.; R O Perez; Beatriz Stransky; Martin Pieprzyk; J Moore; Otavia Caballero; J Gama-Rodrigues; A Habr-Gama; W P Kuo; A J Simpson; Pedro Alexandre Favoretto Galante; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Jorge E de Souza; Robson F de Souza; Patricia Marra de Carvalho; Daniel T Ohara; Ricardo P Moura; Oba-Shinja, S. M.; Marie, S. K. N.
Fonte: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 106 , p. 16752 - Extrato QUALIS: A1
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Tumor somatic mutations in exonic splicing enhancers and silencers (2009)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Jorge E de Souza; Pedro Alexandre Favoretto Galante; Patricia Marra de Carvalho; sandro jose de Souza
Fonte: High throughput analysis for alternative splicing , p. 77
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Distinct acetylation of Trypanosoma cruzi histone H4 during cell cycle, parasite differentiation, and after DNA damage (2009)
Artigo publicado
Autores: Sheila Cristina Nardelli; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; M Cristina Motta; Sergio Schenkman
Fonte: Chromosoma (Berlin. Print) , v. 118 , p. 487 - Extrato QUALIS: A2
2008
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Different Evolutionary Strategies for the Origin of Caspase-1 Inhibitors (2008)
Artigo publicado
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Galante, Pedro A. F.; Souza, Sandro J.
Fonte: Journal of Molecular Evolution , v. 66 , p. 591 - Extrato QUALIS: A3
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Somatic mutations in splicing regulators elements and its association with alternative splicing (2008)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Jorge E de Souza; sandro jose de Souza
Fonte: Fourth International Conference for the Brazilian Association for Bioinformatics and Computional Biology
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Nuclear Localization of Acetylated Forms of Histone H4 Associated with the Cell Cycle, Transcription and DNA Repair in Trypanosoma cruzi (2008)
Trabalhos em eventos
Autores: Sheila Cristina Nardelli; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; D G Passos-Silva; Carlos Renato Machado; Sergio Schenkman
Fonte: Dynamic Organization of Nuclear Function-Cold Spring Harbor
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Histone H1 of Trypanosoma cruzi Is Concentrated in the Nucleolus Region and Disperses upon Phosphorylation during Progression to Mitosis (2008)
Artigo publicado
Autores: Luciana M Gutiyama; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Sergio Schenkman
Fonte: EUKARYOTIC CELL , v. 7 , p. 560
2007
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Specific nuclear localization of acetylated H4 histone residues ans bromodomain proteins in Trypanosoma cruzi (2007)
Trabalhos em eventos
Autores: Sheila Cristina Nardelli; G V VILLANOVA; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; M Cristina Motta; E Serra; Sergio Schenkman
Fonte: XXXIV Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 46
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Trypanosoma cruzi histone H4 is acetylated at specific lysines after DNA damage (2007)
Trabalhos em eventos
Autores: Sheila Cristina Nardelli; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Sergio Schenkman
Fonte: XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology10th IUBMB conference Conference: Infectious Diseases: Biochemistry of Parasites, Vectors and Hosts
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Trypanosoma cruzi histone H1 nuclear localization depends on its phosphorylation (2007)
Trabalhos em eventos
Autores: Luciana M Gutiyama; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Sergio Schenkman
Fonte: XXXIV Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 45
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Morphological Events during the Trypanosoma cruzi Cell Cycle (2007)
Artigo publicado
Autores: ELIAS, M; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; DEFARIA, F; MORTARA, R; FREYMULLER, E; Schenkman, S
Fonte: PROTIST , v. 158 , p. 147 - Extrato QUALIS: A4
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Response to Horn: Introducing histone modifications in trypanosomes (2007)
Artigo publicado
Autores: Sergio Schenkman; Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Fonte: Trends in Parasitology , v. 23 , p. 242 - Extrato QUALIS: A1
2006
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Phosphorylation and dephosphorylation of Trypanosoma cruzi histone H1 through the cell cycle (2006)
Trabalhos em eventos
Autores: Luciana M Gutiyama; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Sergio Schenkman
Fonte: XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 48
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Is Histone H4 acetylation variable in Trypanasoma cruzi forms and cell cycle stages? (2006)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Ernesto S Nakayasu; Igor C de Almeida; Sergio Schenkman
Fonte: XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 95
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Subcellular and molecular dynamics during Trypanosoma cruzi cell cycle (2006)
Trabalhos em eventos
Autores: Maria Carolina Elias; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Ha, V.S.J.; Fernando Macedo Dossin; Mortara, R.A; Edna Freymuller; Sergio Schenkman
Fonte: XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 19
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Post-translational modifications of Trypanosoma cruzi histone H4 (2006)
Artigo publicado
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Ernesto Satoshi Nakayasu; Igor C de Almeida; Sergio Schenkman
Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology (Print) , v. 150 , n. 2 , p. 268 - Extrato QUALIS: A4
2005
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Cell cycle progression of Trypanosoma cruzi is related to flagellum growth (2005)
Trabalhos em eventos
Autores: Elias, M.C.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Alberio, S.H.V.; de Faria, F.P.; Mortara, R.A; Haapalainem, E; Sergio Schenkman
Fonte: XXXII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XXI Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 55
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Trypanosoma cruzi histone H1 is phosphorylated in a typical cyclin dependent kinase site accordingly to the cell cycle (2005)
Artigo publicado
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Ernesto S Nakayasu; Daniel C Pimenta; Federico Rojas; Manuel Munoz; Maria Teresa TellezInon; Igor C de Almeida; Sergio Schenkman
Fonte: Molecular and Biochemical Parasitology (Print) , v. 140 , n. 1 , p. 75 - Extrato QUALIS: A4
2004
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Post-translational modifications of Trypanosoma cruzi histone H4 (2004)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Ernesto S Nakayasu; Igor C de Almeida; Sergio Schenkman
Fonte: XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 138
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Temporal organization and morphological alterations during the cell division cycle of Trypanosoma cruzi. (2004)
Trabalhos em eventos
Autores: Maria Carolina Elias; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Alberio, S.H.V.O.; Faria, F.P.; Haapalainen, E; Mortara,R.; Schenkman, S
Fonte: XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 74
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Trypanosoma cruzi metacyclic trypomastigotes express a proliferating cell nuclear antigen a protein found normally in replicating cells (2004)
Trabalhos em eventos
Autores: Rubin,S. S.C.; Ha, V.S.J.; Elias, M.C.; Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Sergio Schenkman
Fonte: XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology , p. 75
2003
2001
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Post-translational modifications of histones during the life cycle of Trypanosoma cruzi (2001)
Trabalhos em eventos
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha; Marília B. Malta; Rafael Marques Porto; Sergio Schenkman
Fonte: XXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease & XVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology
Atuações
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer
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pos doc student
Bolsista recém-doutor
2007 a 2010
Genetics and Molecular Biology
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Revisor de periódico
Desde 2008
Instituto Butantan
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Pesquisador Científico
Desde 2010
PlosOne
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Revisor de periódico
Desde 2012
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2010
Ensino
Orientações e supervisões
Supervisão de pós-doutorado em andamento
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Instituto Butantan
Desde 2021
Tese de doutorado em andamento
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Análise de interações de regiões enriquecidas com histonas variantes H2B.V e H4.V e sua importância na estrutura 3D da cromatina em Trypanosoma cruzi
Biologia da Relação Patógeno Hospedeiro
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade de São Paulo
Desde 2023
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Pedro Leonardo Carvalho de Lima
Caracterização do processamento, degradação de transcritos nascentes em Trypanosoma cruzi.
Biologia da Relação Patógeno Hospedeiro
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade de São Paulo
Desde 2023
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Identificação de sítios de início de transcrição e possíveis regiões promotoras em Trypanossoma cruzi
Biologia da Relação Patógeno Hospedeiro
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade de São Paulo
Desde 2023
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Herbert Guimaraes de Sousa Silva
Explorando o papel das proteínas associadas à cromatina detectadas no Trypanosoma cruzi
Microbiologia e Imunologia
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2020
Dissertação de mestrado em andamento
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Caracterização das proteínas associadas à cromatina do lócus do Spliced Leader de Trypanosoma cruzi pela técnica de Cas9 Locus-associated proteome (CLASP)
Microbiologia e Imunologia
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
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Evidenciando regiões centroméricas em Trypanosoma cruzi: uma abordagem in silico e experimental
Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade de São Paulo
Desde 2022
Tese de doutorado concluídas
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Estudo proteômico nos sítios de início e final de transcrição da RNA Polimerase II de Trypanosoma cruzi
Microbiologia e Imunologia
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2023
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Francisca Nathalia de Luna Vitorino
Caracterização do perfil de proteínas associadas à cromatina frente ao tratamento com FGF2
Biotecnologia
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Programa interunidades biotecnologia
Concluído em 2022
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Análise de alterações induzidas por fator de crescimento no proteoma nuclear ao longo do ciclo celular de células tumorais de camundongo
Microbiologia e Imunologia
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2019
Dissertação de mestrado concluídas
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Analise de RNAs nascentes em T.cruzi
Micro-Imuno-Parasitologia
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2023
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Análise Funcional da histona H2B variante em Trypanosoma cruzi
Micro-Imuno-Parasitologia
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2016
Gestão
Pesquisa
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer
Instituto Butantan
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A Network for an Integrative Biology in Neglected Diseases: Bridging Epigenetics, Metabolism and Cell Cycle in Pathogenic Trypanosomatids.
The goal of this proposal is to understand the interaction among three essential core processes: metabolism, cell cycle and epigenetic gene expression regulation, with the goal of establishing a broader comprehension of how the metabolic environment affects parasite proliferation and determines inheritable adaptations. The information to be obtained will be fundamental to elucidate the basic biology of these pathogens as well as to discover new druggable points, greatly contributing for the development of novel therapies.
Desde 2019
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Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição.
Regiões clássicas de eu e heterocromatina estão presentes nos núcleos de T.cruzi que mudam dramaticamente durante a diferenciação de epimastigotas para metacíclicos (E --> M). Tradicionalmente, essas regiões de cromatina (e algumas histonas MPTs) estão associadas à regulação da transcrição. No entanto, em tripanossomas, é geralmente aceito que mecanismos pós-transcricionais governam a expressão gênica, já que não foram encontradas regiões promotoras clássicas de RNA Pol II, e a transcrição é principalmente policistrônica. Assim, nosso principal objetivo é entender essa aparente controvérsia, investigando o papel da regulação da cromatina em um potencial controle de transcrição.
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha, THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE, Ariel Mariano Silber, ELIAS, M, Luiz Tosi
Desde 2019
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Análise funcional da Histona H2B variante de Trypanosoma cruzi
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
2017 a 2019
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Unravelling the epigenome of a simpler organism through differentiation: a shortcut to understand key epigenetics questions
Muitas questões ainda não foram respondidas em epigenética, incluindo o papel da modulação da estrutura da cromatina (e suas marcas epigenéticas) em relação a regulação transcricional. Nós investigaremos esta questão usando um modelo celular eucariótico simples, o Trypanosoma cruzi. Além de ter um importante apelo médico na América Latina, nestes organismos não há regulação transcricional gene-específica para a maioria dos transcritos, o que nos permite visualizar os efeitos da dinâmica do epigenoma sem a interferência da regulação transcricional. Marcas epigenéticas e alterações globais na estrutura da cromatina já foram descritas em tripanossomas, e, há evidências de serem moduladas na diferenciação celular. Nós investigaremos o epigenoma ao longo da diferenciação celular das formas epimastigotas para tripomastigotas metacíclicos utilizando Gro-seq, Faire-seq e proteômica quantitativa. A integração destes resultados permitirá elucidar questões importantes no campo da epigenética
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
2018 a 2019
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CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-resposta e sinalização Celular.
No Instituto Butantan toxinologia e regulação da resposta imune são, tradicionalmente, áreas conexas de pesquisa científica e desenvolvimento biotecnológico, através das quais o Instituto, historicamente, construiu sua reputação internacional de excelência. Na cultura do Instituto, venenos são misturas complexas de toxinas, selecionadas ao longo da evolução para sinergicamente exercerem efeitos biológicos sistêmicos, através de mecanismos bioquímicas, moleculares e celulares altamente específicos. Portanto, a análise química de venenos tem boas chances de levar à descoberta de novas moléculas de toxinas com potencial terapêutico. Essas premissas foram seguidas com sucesso por pesquisadores do Centro de Toxinologia Aplicada (CATcepid-FAPESP), projeto iniciado há 10 anos, que isolaram, caracterizaram quimicamente e patentearam diversas toxinas de natureza proteica, que se tornaram pontos de partida para desenvolvimento de inovação farmacêutica em parceria com indústrias locais. A ênfase em proteínas e peptídeos levou o CATcepid a instalar laboratórios no estado da arte para transcriptômica, proteômica, biologia molecular do DNA recombinante e síntese de peptídeos. Mais recentemente, estudos dos mecanismos de ação, bioquímicas, moleculares e celulares, dessas promissoras moléculas foram iniciados com o objetivo de estabelecer provas de conceito. Assim, o CAT estabeleceu, no Instituto Butantan, as condições iniciais para a criação de um centro de toxinas e resposta imune fundamentado nas abordagens atuais da biologia sistêmica. Por conseguinte, 10 pesquisadores, entre os mais competitivos do Instituto Butantan, propõem a criação do novo Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalização Celular, com aspirações a centro de excelência de classe mundial, aproveitando a histórica reputação internacional do Butantan e o sucesso recente do CATcepid. O Plano de pesquisa do Centro Integra subprojetos voltados para a pesquisa científica com subprojetos de vocação para a inovação tecnológica. Um Grande grupo de cientistas seniores do Instituto Butantan, de outras instituições brasileiras e de renomadas instituições estrangeiras serão colaboradores do Centro proposto.
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha, Saloe Bispo Poubel
Desde 2013
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Alterações nucleares e na cromatina ao longo do ciclo celular e senescência de células de mamíferos
O núcleo celular é uma organela complexa formada por ácidos nucléicos e proteínas intimamente relacionadas. O proteoma nuclear, em especial a cromatina, desempenha funções envolvidas com a regulação e gerenciamento de ações no genoma que culminam com o controle da expressão gênica e do fenótipo celular. Diversas evidências apontam para um papel importante do núcleo e da cromatina no controle do ciclo celular de eucariotos. O fator de crescimento de fibroblastos 2 bloqueia transitoriamente células tumorais de camundongos nas transições G1S do ciclo celular e em seguida bloqueia irreversivelmente em G2M levando ao aparecimento de células com fenótipo senescente. Assim, o objetivo central desse projeto é estudar o papel das proteínas nucleares e da cromatina no ciclo celular e na senescência induzida por FGF2 estudando quantitativamente as alterações no proteoma e fosfoproteoma nuclear. Para tal, pretendemos estabelecer uma plataforma de análise proteômica quantitativa com principal enfoque no estudo do núcleo celular e da cromatina utilizando uma perspectiva de Biologia Sistêmica para análise e interpretação dos dados. Pretendemos ainda analisar em maiores detalhes o padrão de modificações pós traducionais em histonas ao longo do ciclo e senescência celular a fim de investigar se as mesmas podem desempenhar um papel importante no ciclo/senescência. A dinâmica da ligação de proteínas ao DNA ao longo do ciclo celular também será investigada e integrada com a dinâmica das alterações proteômicas a fim de obter uma visão mais completa e sistêmica dos efeitos causados por FGF2 no núcleo.
Autores: Julia Pinheiro Chagas da Cunha, Maria Carolina Elias, Solange M T Serrano, Hugo Aguirre Armelin, Ana Marisa Chudzinski-Tavassi, Denise Vilarinho Tambourgi, Osvaldo Augusto Brazil Esteves Sant'Anna, Wilmar Dias da Silva, Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo, Yara Cury, Junior Barrera
2011 a 2017
Atualização Lattes em 2024-02
Processado em 2024-07-22