Luiz Mário Ramos Janini nacionalidade brasileira

Universidade Federal de São Paulo

Escola Paulista de Medicina

Programa de Pós-Graduação: Infectologia

E-Mail: janini.mario@unifesp.br


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De 2020 a 2024
Trabalhos publicados

Resumo

O Dr. Luiz Mario Janini tem se dedicado ao estudo do HIV-1 desde 1992 ano em que ingressou no mestrado no Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes - Universidade Federal do Rio de Janeiro. Sob a orientação do Dr. José Mauro Peralta, em 1993, o Dr. Janini recebeu o convite para realizar a parte experimental de sua tese de mestrado no Centers for Disease Control and Prevention, CDC, Atlanta, Georgia, EUA. No CDC, o Dr. Janini adquiriu sólida formação em Virologia, Biologia Molecular, Biologia Celular, Cultivo Celular e técnicas de Biossegurança incluindo o trabalho em laboratório de Biossegurança nível 3. Ao fim do seu primeiro ano de trabalho no CDC, o Dr. Janini foi convidado a permanecer e realizar sua tese de doutoramento. Durante os anos de 1993 a 1997 o Dr. Janini trabalhou sob a supervisão dos Drs. George Schochetman, Mark Rayfield e Danuta Pieniazek. Suas principais linhas de investigação foram: a epidemiologia molecular do HIV-1 e as infecções duplas do HIV-1. Durantes estes anos o Dr. teve a oportunidade de publicar trabalhos nos temas acima citados e participar inúmeras vezes de congressos internacionais. Em 1998 o Dr. Janini obteve seu titulo de doutor pela Universidade Federal do Rio de Janeiro/CDC sob as orientações dos Drs. Amilcar Tanuri, José Mauro Peralta e Danuta Pieniazek. Neste mesmo ano recebeu convite das Dras. Francine McCutchan e Jean Carr para que realizasse seu Pós-doutoramento sob a supervisão da Dra. Francine McCutchan. O Dr. Janini realizou seu Pós-doutoramento na Fundação Henry M. Jackson, Rockville, Mayland, EUA durante os anos de 1998 a 2001. Lá teve a oportunidade de trabalhar com duas das pesquisadoras mais reconhecidas mundialmente no estudo da epidemia e classificação global do HIV-1, da recombinação do HIV-1 e do estudo do genoma completo viral. Durante estes anos mais uma vez o Dr. Janini obteve sólida formação no estudo da recombinação do HIV-1 e da análise do genoma viral. Entretanto mesmo estando em ambiente tão marcado por uma linha de pesquisa muito bem sucedida, a Dra. Francine McCutchan permitiu que o Dr. Janini implantasse uma nova linha de pesquisa em seu laboratório, o estudo da hipermutação do HIV-1. Ao longo dos três anos que permaneceu em Maryland o Dr. Janini foi capaz de elaborar novos meios de detecção e análise dos genomas virais hipermutados sendo este trabalho publicado em importante revista internacional de Virologia.

Fonte: Lattes CNPq

Nomes em citações bibliográficas

JANINI, Luiz Mário Ramos;Janini, Luiz Mário;Janini, Luiz Mario;Janini, L. M.;Janini, Luiz M.;Janini, LM;Janini, Luiz M. R.;JANINI, LUÍZ MÁRIO RAMOS;JANINI, LUIZ MARIO RAMOS;LM. Janini;JANINI, L.MARIO;JANINI, LUIZ M;JANINI, LUIZ MÁRIO R.;JANINI, LUIZ MARIO R.;JANINI, MARIO;JANINI, LUIS MARIO RAMOS;JANINI, LUIS MÁRIO RAMOS;Luís Mário Janini;JANINI, LUÍS MÁRIO;JANINI, LRM;JANINI LRM;JANINI, LUIZ RAMOS MÁRIO;JANINI, L.M.R.;RAMOS JANINI, LUIZ M.


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Formação

  • Livre Docência

    Virologia

    Biologia e Fisiologia dos Microorganismos

    Universidade Federal de São Paulo

    Concluído em 2011

  • Doutorado em Ciências (Microbiologia)

    Genetic variation of HIV-1and horizontal and vertical transmission of HIV-1 dual infections

    Orientação: Amicar Tanuri e Jose Mauro Peralta

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

      Desde 1998

  • Mestrado em Ciências (Microbiologia)

    Study of HIV-1 genetic variation and identification of HIV-1 dual infections from a Rio de Janeiro cohort

    Orientação: Jose Mauro Peralta

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    1992 a 1995

  • Graduação em Medicina

    Universidade do Estado do Rio de Janeiro

    1981 a 1987

  • Produção


    2022


    • The epitranscriptome of Vero cells infected with SARS-CoV-2 assessed by direct RNA sequencing reveals m6A pattern changes and DRACH motif biases in viral and cellular RNAs

      Artigo publicado

      Autores: CAMPOS, JOÃO H. C.; ALVES, GUSTAVO V.; MARICATO, JULIANA T.; BRACONI, CARLA T.; Fernando Martins Antoneli Junior; JANINI, LUIZ MARIO R.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 12 , p. 906578

    • One-year surveillance of SARS-CoV-2 in wastewater from vulnerable urban communities in metropolitan São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: BARBOSA, MIKAELA RENATA FUNADA; DA SILVA, RENAN LOURENÇO OLIVEIRA; IKO, BEATRIZ YUKIE; KONDO, VICTOR KENJI MATSUOKA; DE ARAÚJO, RONALDA SILVA; DA SILVEIRA, VANESSA BARBOSA; DE ANDRADE, TATIANE MONTES; NUNES, DANILO ROSA; JANINI, LUIZ MÁRIO RAMOS; Carla Torres Braconi; MARICATO, JULIANA TERZI; GARCIA, SUZI CRISTINA; SATO, MARIA INÊS ZANOLI; BRUNI, ANTONIO DE CASTRO; MACHADO, FLÁVIO SILVA; DE OLIVEIRA, ROBERTO XAVIER; DROPA, MILENA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ELCIO; BRANDÃO, CARLOS JESUS

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: JOURNAL OF WATER AND HEALTH , v. 21 , p. 1-19/1

    • SARS-CoV-2 infection and replication kinetics in different human cell types: The role of autophagy, cellular metabolism and ACE2 expression

      Artigo publicado

      Autores: BARTOLOMEO, CYNTHIA SILVA; JANINI, LUIZ MARIO RAMOS; OKUDA, LIRIA HIROMI; LEE, KIL SUN; Carla Máximo Prado; URESHINO, RODRIGO PORTES; STILHANO, ROBERTA SESSA; LEMES, ROBERTHA MARIANA RODRIGUES; MORAIS, RAFAEL LEITE; PERERIA, GABRIELA CRUZ; NUNES, TAMIRES ALVES; COSTA, ANGELICA JARDIM; DE BARROS MACIEL, RUI MONTEIRO; BRACONI, CARLA TORRES; MARICATO, JULIANA TERZI

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: LIFE SCIENCES , v. 308 , p. 120930

    • Polymeric Nanoparticles and Nanomicelles of Hydroxychloroquine Co-Loaded with Azithromycin potentiate anti-SARS-CoV-2 effect'

      Artigo publicado

      Autores: Aline Oliveira da Siliva de Barros; Ralph Santos-Oliveira; Suyene Rocha Pinto; Sara Rhaissa Rezende dos Reis; Eduardo Ricci-Junior; Luciana Magalhães Rebelo Alencar; Nancy Cristina Junqueira Bellei; Luiz Ramos Mário Janini; Juliana Terzi Maricato; Daniela Santoro Rosa

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: Journal Of Nanostructure In Chemistry , v. X , p. 1

    • From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?

      Artigo publicado

      Autores: ANDREATA'SANTOS, ROBERT; Luiz Mário Ramos Janini; DURÃES'CARVALHO, RICARDO

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: Journal of Medical Virology , v. 94 , p. 1773

    • Antiretroviral Drug-Resistance Mutations on the Gag Gene: Mutation Dynamics during Analytic Treatment Interruption among Individuals Experiencing Virologic Failure

      Artigo publicado

      Autores: HUNTER, JAMES R.; DOS SANTOS, DOMINGOS E. MATOS; Patricia Munerato; Luiz Mário Ramos Janini; Castelo, Adauto; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; TRUONG, HONG-HA M.; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: PATHOGENS , v. 11 , p. 534

    • 3D Bioprinted Neural-Like Tissue as a Platform to Study Neurotropism of Mouse-Adapted SARS-CoV-2

      Artigo publicado

      Autores: MELO, BRUNA A. G.; MANTOVANI, NATHALIA; SANTANA, LUIZ C.; DURÃES'CARVALHO, RICARDO; DIAZ, RICARDO S.; JANINI, LUIZ M. R.; MARICATO, JULIANA T.; PORCIONATTO, MARIMELIA A.; MUNDIM, MAYARA V.; LEMES, ROBERTHA M. R.; CRUZ, ELISA M.; RIBEIRO, TAIS N.; SANTIAGO, CAROLINA F.; FONSÊCA, JÉSSICA H. L.; BENINCASA, JULIA C.; Roberta Sessa Stilhano Yamaguchi

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: Advanced Biology , v. 1 , p. 2200002

    • Immunogenicity of personalized dendritic-cell therapy in HIV-1 infected individuals under suppressive antiretroviral treatment: interim analysis from a phase II clinical trial

      Artigo publicado

      Autores: DE ALMEIDA BAPTISTA, MARCELLA VASSÃO; FERREIRA, PAULO ROBERTO ABRÃO; CUNHA-NETO, EDÉCIO; GALINSKAS, JULIANA; DIAS, DANILO; Sucupira, Maria Cecilia Araripe; DE ALMEIDA-NETO, CESAR; SALOMÃO, REINALDO; DA SILVA DUARTE, ALBERTO JOSÉ; Luiz Mário Ramos Janini; HUNTER, JAMES R.; DA SILVA, LAÍS TEODORO; SAVARINO, ANDREA; JULIANO, MARIA APARECIDA; Ricardo Sobhie Diaz; SAMER, SADIA; OSHIRO, TELMA MIYUKI; SHYTAJ, IART LUCA; GIRON, LEILA B.; PENA, NATHALIA MANTOVANI; CRUZ, NICOLLY; GOSUEN, GISELE CRISTINA

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: AIDS Research and Therapy , v. 19 , p. 2

    • Humoral and cellular responses to vaccination with homologous CoronaVac or ChAdOx1 and heterologous third dose with BNT162b2

      Artigo publicado

      Autores: HAYASHI, JACKELINNE Y.; SOANE, MICHEL M.; BRACONI, CARLA T.; MARICATO, JULIANA T.; JANINI, LUIZ M.; SALOMÃO, REINALDO; POPI, ANA F.; GLEZER, ISAIAS; BONETTI, TATIANA; Alexandre Keiji Tashima; SIMIZO, ADRIANA; MIYAMOTO, JACKSON G.; COSTA, LUCAS V.S.; SOUZA, OLÍVIA F.; CHIARELLI, TASSIA; BACAROV, NATÁLIA B.S.; HIDALGO, RAFAELA; GARCIA, LETÍCIA D.

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: JOURNAL OF INFECTION , v. 84 , p. 834


    2021


    • Direct RNA Sequencing Reveals SARS-CoV-2 m6A Sites and Possible Differential DRACH Motif Methylation among Variants

      Artigo publicado

      Autores: CAMPOS, JOÃO H. C.; MARICATO, JULIANA T.; BRACONI, CARLA T.; Fernando Martins Antoneli Junior; JANINI, LUIZ MARIO R.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: Viruses-Basel , v. 13 , p. 2108

    • Research Article Temporal data series and logistic models reveal the dynamics of SARS-CoV-2 spike protein D614G variant in the COVID-19 pandemic

      Artigo publicado

      Autores: Fernando Martins Antoneli Junior; FURUYAMA, T.N.; CARVALHO, I.M.V.G.; Marcelo Ribeiro da Silva Briones; JANINI, L.M.R.

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 20 , p. gmr18960

    • Fitness Cost of Antiretroviral Drug Resistance Mutations on the pol Gene during Analytical Antiretroviral Treatment Interruption among Individuals Experiencing Virological Failure

      Artigo publicado

      Autores: HUNTER, JAMES R.; DOS SANTOS, DOMINGOS E. MATOS; Patricia Munerato; Luiz Mário Ramos Janini; Castelo, Adauto; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; TRUONG, HONG-HA M.; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: PATHOGENS , v. 10 , p. 1425

    • Nitazoxanide superiority to placebo to treat moderate COVID-19 - A Pilot prove of concept randomized double-blind clinical trial.

      Artigo publicado

      Autores: BLUM, VINICIUS FONTANESI; MANTOVANI, NATHALIA; VASSAO, MARCELLA; DIAS, DANILO; GALINSKAS, JULIANA; KARCHER, DANIEL; FONSECA, FATIMA MORGANA PIO; PINTO, RENAN NOVAES; JANINI, LUIS MÁRIO RAMOS; SANTOS-OLIVEIRA, JOANNA REIS; DA-CRUZ, ALDA MARIA; CIMERMAN, SÉRGIO; DIAZ, RICARDO SOBHIE; HUNTER, JAMES R.; TIERNO, PAULO; Acioly Luiz Tavares de Lacerda; SOEIRO, ALEXANDRE; CARDOSO, FLORENTINO; BELLEY, NANCY CRISTINA; MARICATO, JULIANA

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: eClinicalMedicine , v. 37 , p. 100981

    • Photoinduced Photosensitizer-Antibody Conjugates Kill HIV Env-Expressing Cells, Also Inactivating HIV

      Artigo publicado

      Autores: SADRAEIAN, MOHAMMAD; DA CRUZ, EDGAR FERREIRA; BOYLE, ROSS W.; BAHOU, CALISE; CHUDASAMA, VIJAY; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; GUIMARÃES, FRANCISCO E. G.

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: ACS Omega , v. 6 , p. 16524

    • Corrigendum to -Nitazoxanide superiority to placebo to treat moderate COVID-19 - A Pilot prove of concept randomized double-blind clinical trial.- [EClinicalMedicine 37 (2021) 100981]

      Artigo publicado

      Autores: BLUM, VINICIUS FONTANESI; MANTOVANI, NATHALIA; VASSAO, MARCELLA; DIAS, DANILO; GALINSKAS, JULIANA; Luiz Mário Ramos Janini; SANTOS-OLIVEIRA, JOANNA REIS; DA-CRUZ, ALDA MARIA; Ricardo Sobhie Diaz; CIMERMAN, SÉRGIO; HUNTER, JAMES R; TIERNO, PAULO; LACERDA, ACIOLY; SOEIRO, ALEXANDRE; CARDOSO, FLORENTINO; BELLEI, NANCY CRISTINA; MARICATO, JULIANA

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: EClinicalMedicine , v. 41 , p. 101203

    • 17β-estradiol reduces SARS-CoV-2 infection in vitro

      Artigo publicado

      Autores: Robertha Mariana Rodrigues Lemes; Edgar Ferreira da Cruz; Ana Lopez Ramirez; Juliana Terzi Maricatto; Luiz Mário Ramos Janini; Carla Máximo Prado; Roberta Sessa Stilhano Yamaguchi; Rodrigo Portes Ureshino; Angelica Jardim Costa; Cynthia Silva Bartolomeo; Taysa Bervian Bassani; Michelle Sayuri Nishino; Gustavo José da Silva Pereira; Soraya Soubhi Smaili; Rui Monteiro de Barros Maciel; Carla Torres Braconi

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: PHYSIOLOGICAL REPORTS , v. 9 , p. 1

    • A Single Dose of a Hybrid hAdV5-Based Anti-COVID-19 Vaccine Induces a Long-Lasting Immune Response and Broad Coverage against VOC

      Artigo publicado

      Autores: M. Verónica López; Juliana T. Maricato; Carla Torres Braconi; Vanessa B Silveira; Tatiane Montes-de Andrade; Tatiana Carvalho-de Souza Bonetti; Luiz M. Ramos Janini; Manoel J. B. Castello Girão; Andrea S. Llera; Karina A. Gomez; Hugo H. Ortega; Sabrina E. Vinzón; Paula M. Berguer; Osvaldo L. Podhajcer; Eduardo G. A. Cafferata; Felipe J. Nuñez; Ariadna Soto; Maximiliano Sanchez-Lamas; M. Jimena Afonso; Diana Aguilar-Cortes; Gregorio D. Ríos

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: Vaccines , v. 9 , p. 1-19 / 1116


    2020


    • Is the human T-cell lymphotropic virus type 2 in the process of endogenization into the human genome?

      Artigo publicado

      Autores: CASSEB, JORGE; Luiz Mário Ramos Janini; BARROS KANZAKI, LUIS ISAMU; LOPES, LUCIANO RODRIGO; PAIVA, ARTHUR MAIA

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: JOURNAL OF VIRUS ERADICATION , v. 6 , p. 100009

    • Photoimmunotherapy Using Cationic and Anionic Photosensitizer-Antibody Conjugates against HIV Env-Expressing Cells

      Artigo publicado

      Autores: SADRAEIAN, MOHAMMAD; BAHOU, CALISE; DA CRUZ, EDGAR FERREIRA; Luiz Mário Ramos Janini; SOBHIE DIAZ, RICARDO; BOYLE, ROSS W.; CHUDASAMA, VIJAY; EDUARDO GONTIJO GUIMARÃES, FRANCISCO

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 21 , p. 9151

    • Nicotinamide activates latent HIV-1 ex vivo in ART suppressed individuals, revealing higher potency than the association of two methyltransferase inhibitors, chaetocin and BIX01294

      Artigo publicado

      Autores: SAMER, SADIA; OSHIRO, TELMA MIYUKI; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; GIRON, LEILA BERTONI; ZUKUROV, JEAN PAULO LOPES; HUNTER, JAMES; SANTILLO, BRUNA TERESA; NAMIYAMA, GISLENE; GALINSKAS, JULIANA; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: Brazilian Journal of Infectious Diseases , v. 24 , p. 150


    2019


    • Laboratory surrogate markers of residual HIV replication among distinct groups of individuals under antiretroviral therapy

      Artigo publicado

      Autores: GIRON, LEILA BERTONI; TENORE, SIMONE B.; Luiz Mário Ramos Janini; Sucupira, Maria Cecilia Araripe; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: PLoS One , v. 14 , p. e0217502

    • Potential impact of the antirheumatic agent auranofin on proviral HIV-1 DNA in individuals under intensified antiretroviral therapy: results from a randomized clinical trial

      Artigo publicado

      Autores: DIAZ, RICARDO SOBHIE; GOSUEN, GISELE; FERREIRA, PAULO ABRÃO; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; MARICATO, JULIANA; FACKLER, OLIVER; LUSIC, MARINA; SAVARINO, ANDREA; SHYTAJ, IART LUCA; GIRON, LEILA B; OBERMAIER, BENEDIKT; Ermelindo Della Libera Junior; GALINSKAS, JULIANA; DIAS, DANILO; HUNTER, JAMES; JANINI, MARIO

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS , v. 54 , p. 592

    • HIV-1 infection modulates IL-24 expression which contributes to cell apoptosis

      Artigo publicado

      Autores: STRUMILLO, SCHEILLA TEIXEIRA; CURCIO, MARLI FERREIRA; DE CARVALHO, FÁBIO FERREIRA; SUCUPIRA, MARIACECÍLIA ARARIPE; DIAZ, RICARDO SOBHIE; Hugo Pequeno Monteiro; JANINI, LUIZ MÁRIO RAMOS

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: CELL BIOLOGY INTERNATIONAL , v. 43 , p. 574

    • Nitric oxide stimulates a PKC-Src-Akt signaling axis which increases human immunodeficiency virus type 1 replication in human T lymphocytes

      Artigo publicado

      Autores: Marli Ferreira Curcio; DIAZ, RICARDO S.; Monteiro, Hugo P.; JANINI, LUIZ MÁRIO R.; Wagner Luiz Batista; CASTRO, ELOÍSA D.; STRUMILLO, SCHEILLA T.; OGATA, FERNANDO T.; ALKMIM, WAGNER; BRUNIALTI, MILENA K.C.; SALOMÃO, REINALDO; TURCATO, GILBERTO

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: NITRIC OXIDE-BIOLOGY AND CHEMISTRY , v. 1 , p. 1


    2018


    • Stochastic Modeling and Simulation of Viral Evolution

      Artigo publicado

      Autores: FABRETI, LUIZA GUIMARÃES; CASTRO, DIOGO; GORZONI, BRUNO; JANINI, LUIZ MARIO RAMOS; Fernando Martins Antoneli Junior

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: Bulletin of Mathematical Biology , v. 81 , p. 1031

    • Modulation of epigenetic factors during the early stages of HIV-1 infection in CD4 + T cells in vitro

      Artigo publicado

      Autores: NUNES, JORGE MENESES; FURTADO, MARIA NADIEGE; DE MORAIS NUNES, EDSEL RENATA; Sucupira, Maria Cecilia Araripe; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: VIROLOGY , v. 523 , p. 41


    2017


    • Evidence of Noncompetent HIV after Ex Vivo Purging Among ART-Suppressed Individuals

      Artigo publicado

      Autores: SAMER, SADIA; NAMIYAMA, GISLENE; OSHIRO, TELMA; ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; DA SILVA, WANESSA CARDOSO; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES , v. 10 , p. 993

    • Genetic diversity of HIV-1 gene vif among treatment-naïve Brazilians

      Artigo publicado

      Autores: VILLANOVA, FABIOLA; BARREIROS, MARTA; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; LEAL, ELCIO

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES , v. 9 , p. 952

    • Correction: Plasma Metabolomics Biosignature According to HIV Stage of Infection, Pace of Disease Progression, Viremia Level and Immunological Response to Treatment

      Artigo publicado

      Autores: SCARPELLINI, BRUNO; Michelle Zanoni; Sucupira, Maria Cecilia Araripe; TRUONG, HONG-HA M.; Luiz Mário Ramos Janini; DA SILVA, ISMAEL DALE; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: PLoS One , v. 12 , p. e0173164

    • The Pace of Co-receptor Tropism Switch in HIV-1 Infected Individuals after Recent Infection

      Artigo publicado

      Autores: ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; Luiz Mário Ramos Janini; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; Diaz, Ricardo Sobhie; HUNTER, JAMES; LÉDA, ANA RACHEL; ZUKUROV, JEAN PAULO LOPES; SAMER, SADIA; CAMARGO, MICHELLE; GALINSKAS, JULIANA; Esper Georges Kallás; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: JOURNAL OF VIROLOGY , v. 00 , p. JVI.00793-17


    2016


    • Estimation of genetic diversity in viral populations from next generation sequencing data with extremely deep coverage

      Artigo publicado

      Autores: ZUKUROV, JEAN P.; DO NASCIMENTO-BRITO, SIEBERTH; VOLPINI, ANGELA C.; OLIVEIRA, GUILHERME C.; JANINI, LUIZ MARIO R.; Fernando Martins Antoneli Junior

      Conteúdo completo

      2016

      Fonte: Algorithms for Molecular Biology , v. 11 , p. 2

    • Plasma Metabolomics Biosignature According to HIV Stage of Infection, Pace of Disease Progression, Viremia Level and Immunological Response to Treatment

      Artigo publicado

      Autores: SCARPELINI, BRUNO; ZANONI, MICHELLE; Maria Cecilia Araripe Sucupira; TRUONG, HONG-HA M.; Luiz Mário Ramos Janini; SEGURADO, ISMAEL DALE COTRIN; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2016

      Fonte: Plos One , v. 11 , p. e0161920


    2015


    • HIV-1 Tropism Determines Different Mutation Profiles in Proviral DNA

      Artigo publicado

      Autores: NASCIMENTO-BRITO, SIEBERTH; JANINI, LUIZ MÁRIO R.; PAULO ZUKUROV, JEAN; MARICATO, JULIANA T.; VOLPINI, ANGELA C.; SALIM, ANNA CHRISTINA M.; ARAÚJO, FLÁVIO M. G.; COIMBRA, RONEY S.; OLIVEIRA, GUILHERME C.; Fernando Martins Antoneli Junior

      Conteúdo completo

      2015

      Fonte: Plos One , v. 10 , p. e0139037

    • Epigenetic Modulations in Activated Cells Early after HIV-1 Infection and Their Possible Functional Consequences

      Artigo publicado

      Autores: Juliana Terzi Maricato; Juliana Terzi Maricato; DIAZ, RICARDO SOBHIE; JANINI, LUIZ M. R.; FURTADO, MARIA N.; TAKENAKA, MAISA C.; NUNES, EDSEL R. M.; FINCATTI, PATRICIA; MELISO, FABIANA M.; DA SILVA, ISMAEL D. C. G.; JASIULIONIS, MIRIAM G.; CECÍLIA DE ARARIPE SUCUPIRA, MARIA

      Conteúdo completo

      2015

      Fonte: Plos One , v. 10 , p. e0119234

    • High prevalence and incidence of HIV-1 in a counseling and testing center in the city of Itajaí, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: GRINBERG, GORKI; Diaz, Ricardo Sobhie; GIRON, LEILA BERTONI; KNOLL, ROSALIE KUPKA; GALINSKAS, JULIANA; Michelle Camargo; ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; SAMER, SADIA; Luiz Mário Ramos Janini; Maria Cecilia Araripe Sucupira

      Conteúdo completo

      2015

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , v. 19 , p. 631


    2014


    • Analysis of HIV-1 Protease Gene Reveals Frequent Multiple Infections Followed by Recombination among Drug Treated Individuals Living in São Paulo and Santos, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: NUNES, EDSEL RENATA DE MORAIS; Juliana Terzi Maricato; ZUKUROV, JEAN PAULO; Juliana Terzi Maricato; SUCUPIRA, MARIA CECÍLIA ARARIPE; DIAZ, RICARDO SOBHIE; JANINI, LUÍZ MÁRIO RAMOS

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: Plos One , v. 9 , p. e84066

    • Homogenous HIV-1 subtype B quasispecies in Brazilian men and women recently infected via heterosexual transmission

      Artigo publicado

      Autores: GOUVEIA, NANCY LIMA; CAMARGO, MICHELLE; Marcos Montani Caseiro; Luiz Mário Ramos Janini; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: Virus Genes , v. 48 , p. 421

    • High rates of HIV-1 mutational profiles by single-genome amplification after48-hour propagation in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) at different levels of cell activation.

      Artigo publicado

      Autores: Cristiano Teodoro Russo; Alkimin; Patricia Munerato; Jean Paulo L Zukurov; Juliana Terzi Maricato; Juliana Terzi Maricato; Maria Cecília Sucupira; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mario Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: Intervirology , v. 57 , p. 277

    • In vivo HIV-1 Hypermutation and viral loads among antiretroviral naïve Brazilian patients.

      Artigo publicado

      Autores: DE LIMA-STEIN, MARIANA LEÃO; JANINI, L.MARIO; ALKMIM, WAGNER T; BIZINOTO, MARIA CLARA; LOPEZ, LUIS FERNANDEZ; BURATTINI, MARCELO NASCIMENTO; Juliana Terzi Maricato; Juliana Terzi Maricato; GIRON, LEILA; SUCUPIRA, MARIA CECILIA ARARIPE; DIAZ, RICARDO SOBHIE

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 30 , p. 140726153618003

    • Prevalence of transmitted HIV-1 antiretroviral resistance among patients initiating antiretroviral therapy in Brazil: a surveillance study using dried blood spots

      Artigo publicado

      Autores: DE MORAES SOARES, CELINA M P; Michelle Camargo; Luiz Mário Ramos Janini; Komninakis, Shirley; SUCUPIRA, MARIA C A; DIAZ, RICARDO S; VERGARA, TANIA R C; BRITES, CARLOS; BRITO, JOSE D U; GRINBERG, GORKI; CASEIRO, MARCOS M; CORREA, CARLOS; SUFFERT, THEODORO A; PEREIRA, FLAVIO R

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: Journal of the International AIDS Society , v. 17 , p. 19042


    2013


    • Virus Replication as a Phenotypic Version of Polynucleotide Evolution

      Artigo publicado

      Autores: Fernando Martins Antoneli Junior; Francisco de Assis Ribas Bosco; Diogo Castro dos Santos; Luiz Mario Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2013

      Fonte: Bulletin of Mathematical Biology (Print) , v. 75 , p. 602

    • Phenotypic Susceptibility to Antiretrovirals Among Clades C, F, and B/F Recombinant Antiretroviral-Naive HIV Type 1 Strains

      Artigo publicado

      Autores: SUCUPIRA, MARIA CECILIA A.; Patricia Munerato; SILVEIRA, JUSSARA; SANTOS, ANDRÉ F.; Luiz Mário Ramos Janini; SOARES, MARCELO A.; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2013

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 29 , p. 880

    • Codon pairs of the HIV-1 vif gene correlate with CD4+ T cell count

      Artigo publicado

      Autores: Bizinoto, Maria Clara; YABE, SHIORI; Leal, Élcio; KISHINO, HIROHISA; MARTINS, LEONARDO DE; DE LIMA, MARIANA LEÃO; MORAIS, EDSEL RENATA; Diaz, Ricardo Sobhie; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2013

      Fonte: BMC Infectious Diseases (Online) , v. 13 , p. 173


    2012


    • A Recombinant Protein Based on Trypanosoma cruzi P21 Enhances Phagocytosis

      Artigo publicado

      Autores: Adele A Rodrigues; Juliana Terzi Maricato; Flavia A Martins; Diana Bahia; Juliana Terzi Maricato; Luiz Mario Ramos Janini; Eduardo H Reboredo; Mortara, Renato Arruda; Claudio Vieira da Silva; Tatiana M Clemente; Marlus A dos Santos; Fabricio C Machado; Rafael GB Gomes; Heline HT Moreira; Mario C Cruz; Paula Brigido; Paulo Cesar dos Santos

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: Plos One , v. 7 , p. e51384

    • ACTIVATED AND QUIESCENT HOST CELLS INFECTED BY HIV-1 DISPLAY OPPOSITE EPIGENETIC PROFILESACTIVATED AND QUIESCENT HOST CELLS INFECTED BY HIV-1 DISPLAY OPPOSITE EPIGENETIC PROFILES

      Trabalhos em eventos

      Autores: Juliana Terzi Maricato; Juliana Terzi Maricato; Fabiana Melisso; Patrícia Fincatti; Edsel Renata Morrais Nunes; Maria Nadiege Furtado; Bosco, F. A. R.; MIRIAM GALVONAS JASIULIONIS; Luiz Mario Ramos Janini

      2012

      Fonte: Anais do XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology

    • Genetic Diversity Generation in HIV-1 is related to viral tropism

      Trabalhos em eventos

      Autores: Sieberth do Nascimento Brito; R Torrieri; L R Leite; Luiz Mário Ramos Janini; Zukurov, Jean; Fernando Antonelli; Francisco Bosco; Juliana Terzi Maricato; G Oliveira; Ângela Volpini; RS Coimbra; F M G Araujo

      2012

      Fonte: Anais do XXIII Brazilian Congress of Virology & Mercosur Meeting of Virology (XXIII CBV).

    • Faster HIV-1 Disease Progression among Brazilian Individuals Recently Infected with CXCR4-Utilizing Strains

      Artigo publicado

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Diaz, Ricardo Sobhie; Sanabani, Sabri; Cortes, Rodrigo M.; Giret, Maria Teresa M.; Tomiyama, Helena; Sauer, Mariana M.; Sabino, Ester Cerdeira; Luiz Mário Ramos Janini; Kallas, Esper Georges

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: Plos One , v. 7 , p. e30292

    • Intermediate Levels of Transmitted Antiretroviral Drug Resistance in Midwestern Brazil

      Artigo publicado

      Autores: PFRIMER, IRMTRAUT A.H.; BIZINOTO, MARIA C.; BRANDÃO, NATÁLIA A.A.; Michelle Camargo; SUCUPIRA, MARIA C.A.; Luiz Mário Ramos Janini; Diaz, Ricardo S.

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 29 , p. 121009060659002


    2011


    • V3 region of gp120 genetic diversity and co-receptor use among Brazilian CladeB HIV-1 strains from individuals in whom disease progressed

      Trabalhos em eventos

      Autores: Elizabeth Cavalieri; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Daniela Teixeira; Erika Etsuko Fusuma; Luiz Mário Ramos Janini; Shirley Cavalcante Komninakis; Ricardo Sobhie Diaz

      2011

      Fonte: Antiviral Therapy , p. A134

    • HIV-1 is able to infect resting TCD4+ cells efficiently in a short time of viral exposure.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Juliana Terzi Maricato; Wagner Alkmim; Edsel Renata de Morais Nunes; Sieberth do Nascimento Brito; Luiz Mário Ramos Janini

      2011

      Fonte: Anais do 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases

    • The Association Between Primary Antiretroviral Resistance and HAART Virologic Failure in a Developing Set

      Artigo publicado

      Autores: Gagliani, Luiz Henrique; Alkmim Maia, Wagner T.; Sá-Filho, Dercy; Luiz Mário Ramos Janini; Sucupira, Maria Cecilia; Marcos Montani Caseiro; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2011

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 27 , p. 251

    • Loci Polymorphisms of the APOBEC3G Gene in HIV Type 1-Infected Brazilians

      Artigo publicado

      Autores: Bizinoto, Maria Clara; Leal, Élcio; Diaz, Ricardo Sobhie; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2011

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 27 , p. 137

    • Analysis of the Origin and Evolutionary History of HIV-1 CRF28_BF and CRF29_BF Reveals a Decreasing Prevalence in the AIDS Epidemic of Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Ristic, Natalia; Zukurov, Jean; Alkmim, Wagner; Diaz, Ricardo Sobhie; Luiz Mário Ramos Janini; Chin, Mario P. S.

      Conteúdo completo

      2011

      Fonte: Plos One , v. 6 , p. e17485

    • Differential Persistence of Transmitted HIV-1 Drug Resistance Mutation Classes

      Artigo publicado

      Autores: Jain, V.; Grant, R. M.; Cortes, R.; Deeks, S. G.; Hecht, F. M.; Sucupira, M. C.; Bacchetti, P.; Hartogensis, W.; Ricardo Sobhie Diaz; Esper Georges Kallas; Luiz Mário Ramos Janini; Liegler, T.; Pilcher, C. D.

      2011

      Fonte: The Journal of Infectious Diseases , v. 203 , p. 1174


    2010


    • Faster HIV-1 disease progression among Brazilian recently infected individual harbouring CXCR4-using strains

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Sabri Sanabani; Helena Tomoko Iwashita Tomyiama; Mariana Melilo Sauer; Ester Cerdeira Sabino; Luiz Mário Ramos Janini; Esper Georges Kallas; Ricardo Sobhie Diaz

      2010

      Fonte: Antiviral Therapy , p. A163

    • RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM AS AN USEFUL TOOL TO STUDY HIV-1 SUBTYPES AND RECOMBINANTS

      Trabalhos em eventos

      Autores: Edsel Renata de Morais Nunes; Jean Paulo Lopes Zukurov; Luiz Mário Ramos Janini

      2010

      Fonte: Virus Reviews & Research , p. 193

    • APOBEC3G GENETIC VARIATIONS IN HIV-1 INFECTED PATIENTS FROM SANTOS, BRAZIL.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Lucas Nogueira Simão; Joice Bueno; Aline Monho Ribeiro; Eloísa Dognani Castro; Alkmim Maia, Wagner T.; Luiz Mário Ramos Janini

      2010

      Fonte: Virus Reviews & Research , p. 321

    • HIV-1 CAN PRODUCTIVELY INFECT RESTING TCD4+ CELLS AFTER JUST 30 MINUTES OF VIRAL EXPOSURE.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Juliana Terzi Maricato; Alkmim Maia, Wagner T.; Patrícia Fincatti; Edsel Renata de Morais Nunes; Sieberth do Nascimento Brito; Luiz Mário Ramos Janini

      2010

      Fonte: Anais do XXXV Congress of the Brazilian Society for Immunology III ESCI - Extra Section in Clinical Immunology Effector Immune Responses and Viral Immunity

    • HIV Type 1 Antiretroviral Resistance Mutations in Subtypes B, C, and F in the City of São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Patricia Munerato; Sucupira, Maria Cecilia; Oliveros, Márcia P.R.; Luiz Mário Ramos Janini; de Souza, Denise Ferreira; Pereira, Anderson Alvarenga; Inocencio, Lilian Amaral; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2010

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 26 , p. 265

    • The Detection of and HIV Type 1 B/F Profiles in Brazil Using a Real-Time PCR Assay for Five HIV Type 1 Genomic Regions

      Artigo publicado

      Autores: Daniela Teixeira; Patricia Munerato; Komninakis, Shirley Cavalcante Vasconcelos; Erika Etsuko Fusuma; Luiz Mário Ramos Janini; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2010

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 26 , p. 981

    • Short Communication: High Polymorphism Rates in the HR1 and HR2 gp41 and Presence of Primary Resistance-Related Mutations in HIV Type 1 Circulating in Brazil: Possible Impact on Enfuvirtide Efficacy

      Artigo publicado

      Autores: Teixeira, Carla; de Sá-Filho, Dercy; Alkmim, Wagner; Luiz Mário Ramos Janini; Diaz, Ricardo Sobhie; Komninakis, Shirley

      Conteúdo completo

      2010

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 26 , p. 307


    2009


    • Surveillance programs for detection and characterization of emergent pathogens and antimicrobial resistance: results from the Division of Infectious Diseases, UNIFESP

      Artigo publicado

      Autores: Arnaldo Lopes Colombo; Luiz Mario Ramos Janini; Reinaldo Salomão; Eduardo Alexandrino Servolo de Medeiros; Sergio Barsanti Wey; Antonio Carlos Campos Pignatari

      Conteúdo completo

      2009

      Fonte: Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso) , v. 81 , p. 571

    • Primary antiretroviral resistance among individuals with recent HIV infection in the city of Sao Paulo, Brazil: use of full-length genome sequencing to evaluate six antiretroviral classes

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Sabri Sanabani; Rodrigo M Cortes; Luiz Mário Ramos Janini; Ester Cerdeira Sabino; Esper Georges Kallas; Ricardo Sobhie Diaz

      2009

      Fonte: Antiviral Therapy , p. A172

    • Intrahost and Interhost Variability of the HIV Type 1 Gene in Brazilian Children

      Artigo publicado

      Autores: Elizabeth Cavalieri; Camila Florido; Leal, Élcio; Machado, Daisy Maria; Michelle Camargo; Diaz, Ricardo S.; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2009

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 25 , p. 1129


    2008


    • Variable contexts and levels of hypermutation in HIV-1 proviral genomes recovered from primary peripheral blood mononuclear cells

      Artigo publicado

      Autores: KIJAK, G; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2008

      Fonte: Virology , v. 376 , p. 101

    • Evolutionary Dynamics of HIV-1 BF and CB Recombinants and Its Parental Counterparts in South America

      Artigo publicado

      Autores: Elcio de Souza Leal; Leonardo O Martins; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      2008

      Fonte: Retrovirology: Research and Treatment , v. 1 , p. 1

    • Selective regimes and evolutionary rates of HIV-1 subtype B V3 variants in the Brazilian epidemic

      Artigo publicado

      Autores: Ricardo Sobhie Diaz; LEAL, E; SANABANI, S; SUCUPIRA, M; TANURI, A; SABINO, E; JANINI, L; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2008

      Fonte: Virology , v. 381 , p. 184

    • Molecular and structural characterization of HIV-1 subtype B Brazilian isolates with GWGR tetramer at the tip of the V3-loop

      Artigo publicado

      Autores: LEAL, E; SILVA, W; SUCUPIRA, M; JANINI, L; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2008

      Fonte: Virology , v. 381 , p. 222

    • Short Communication: Profiling Resistance-Related Mutations in the Protease Region of the pol Gene: Single Genome Sequencing of HIV in Plasma and Peripheral Blood Mononuclear Cells

      Artigo publicado

      Autores: Guimarães, Ana Paula; Sa-Filho, Dercy Jose; Sucupira, Maria Cecilia; Janini, Luiz Mario; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2008

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 24 , p. 969


    2007


    • HyperPack: A Software Package for the Study of Levels, Contexts, and Patterns of APOBEC-Mediated Hypermutation in HIV

      Artigo publicado

      Autores: Kijak, Gustavo H.; Janini, Mario; Tovanabutra, Sodsai; Sanders-Buell, Eric E.; Birx, Debora L.; Robb, Merlin L.; Michael, Nelson L.; McCutchan, Francine E.; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2007

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 23 , p. 554

    • Near Full-Length Genomic Analysis of 45 HIV-1 isolates from recently infected patients in São Paulo, Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Sabri Saeed Mohamed Ahmed Al-Sanabani; Ester Cerdeira Sabino; Walter Kleine Neto; Mariana Melilo Sauer; Helena Tomoko Iwashita Tomyiama; Suelene Mamede de Oliveira; Katia Cristina Bassicheto; Esper Georges Kallas; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2007

      Fonte: Livro de Abstracts do VII Simpósio de Pesquisa em AIDS , p. 20

    • Real-Time PCR as a Possible Detection Tool for HIV Hypermutation.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Mariana Leao de Lima; Wagner Tadeu Alkmim Maia; Erika Etsuko Fusuma; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2007

      Fonte: Livro de Abstracts do VII Simpósio de Pesquisa em AIDS , p. 27

    • Genetic diversity of the HIV-1 in recently infected men and women.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Michelle Camargo; Nanci Alves Lima Gouvea; Sandra Mara Sampaio Andreo; Maria Cecilia Araripe; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      2007

      Fonte: Livro de Abstracts do VII Simpósio de Pesquisa em AIDS , p. 31

    • In Vitro Evaluation of the Correlation between Cellular Activation and HIV-1 Genetic Variability.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Wagner Tadeu Alkmim Maia; Cristiano Teodoro da Silva; Patricia Munerato; Sandra Mara Sampaio Andreo; Elcio de Souza Leal; Camila Mauricio dos Santos; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2007

      Fonte: Livro de Abstracts do VII Simpósio de Pesquisa em AIDS , p. 32

    • Intra and Interhost Variability of Nef Gene of HIV-1 During Pediatric Infection.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Elizabeth Cavalieri; Camila Florido; Elcio de Souza Leal; Luiz Mário Ramos Janini; Michelle Camargo; Daisy Maria Machado; Regina Celia de Menezes Succi; Ricardo Sobhie Diaz

      2007

      Fonte: Livro de Abstracts do VII Simpósio de Pesquisa em AIDS , p. 44

    • Characterization of the Full-Length Human Immunodeficiency Virus-1 Genome from Recently Infected Subjects in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; Esper Georges Kallas; Sabri Saeed Mohamed Ahmed Al-Sanabani; Ester Cerdeira Sabino; Maria Cecilia Araripe; Ana Carolina Denadai Sanchez; Graziela Tescarollo; Helena Tomoko Iwashita Tomyiama; Katia Cristina Bassicheto

      Conteúdo completo

      2007

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 23 , p. 1087

    • Selective pressures of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) during pediatric infection

      Artigo publicado

      Autores: Elcio de Souza Leal; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2007

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution , v. 7 , p. 694

    • High Levels of Primary Antiretroviral Resistance Genotypic Mutations And B/F Recombinants in Santos, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Luiz Mário Ramos Janini; Marcos Montani Caseiro; Katia Alves; Graziela Tescarollo; Janini, Luiz Mario; Sabino, Ester Cerdeira; Castelo, Adauto; Kim PAGE-SHAFER; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2007

      Fonte: AIDS patient care and STDs , v. 21 , p. 116


    2006


    • Analysis of the near full length genomes of HIV-1 subtypes B, F and BF recombinant from a cohort of 14 patients in São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: SANABANI, S; NETO, W; KALMAR, E; Ricardo Sobhie Diaz; JANINI, L; SABINO, E; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2006

      Fonte: Infection, Genetics and Evolution , v. 6 , n. 2 , p. 368

    • Full-Length Genome Analysis of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Subtype C in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Sanabani, Sabri; Neto, Walter Kleine; Filho, Dercy José De Sa; Diaz, Ricardo Sobhie; Munerato, Patrícia; Luiz Mário Ramos Janini; Sabino, Ester Cerdeira

      Conteúdo completo

      2006

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 22 , p. 171

    • Identification of Two HIV Type 1 Circulating Recombinant Forms in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Filho, Dercy Jose De Sa; Sucupira, M. Cecilia A.; Casiero, Marcos M.; Sabino, Ester C.; Ricardo Sobhie Diaz; Janini, Luiz Mario; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2006

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 22 , n. 1 , p. 1


    2005


    • Analysis of Full-Length Human Immunodeficiency Virus Type 1 Genome Reveals a Variable Spectrum of Subtypes B and F Recombinants in Sao Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Sanabani, Sabri; Ricardo Sobhie Diaz; Patricia Munerato; Adriana Brunstein; Fusuma, Erika; Sabino, Ester Cerdeira; Janini, Luiz Mario; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2005

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 21 , n. 2 , p. 145

    • Phylogenetic analysis of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) B/F recombinants from Brazil and Argentina

      Trabalhos em eventos

      Autores: Elcio de Souza Leal; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Graziela Tescarollo; Sandra Mara Sampaio Andreo; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2005

      Fonte:

    • Analysis of full-gength genomes of HIV-1 prevalent strains in Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Sabri Saeed M A Al Sanabani; Walter Kleine Neto; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; Ester Cerdeira Sabino

      2005

      Fonte:

    • Selective pressures on nef gene of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1): a comparative analysis between children and adults

      Trabalhos em eventos

      Autores: Elcio de Souza Leal; Luiz Mário Ramos Janini; Elizabeth Cavalieri; Ricardo Sobhie Diaz

      2005

      Fonte:

    • Shifting of Darwinian Selection Regimen Due to Local Adaptation on a Canine Parvovirus Population

      Trabalhos em eventos

      Autores: Elcio de Souza Leal; C A D Pereira; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; Edson L Durigon

      2005

      Fonte:

    • Duplication of Peri-B and NF-B Sites of the First Human Immunodeficiency Virus Type 2 (HIV-2) Transmission in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Fusuma, Erika E.; Caruso, Sylvia C.; David Francisco Lopez; Luciana Jesus Costa; Janini, Luiz Mario; De Mendonca, Joao Silva; Kallas, Esper Georges; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      Conteúdo completo

      2005

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 21 , n. 11 , p. 965


    2004


    • Levels of Primary Antiretroviral Genotipic Resistance and B/F Recombinants in Santos SP

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Graziela Tescarollo; Luiz Mário Ramos Janini; Marcos Montani Caseiro; Katia Alves; Ester Cerdeira Sabino; Adauto Castelo Filho; Kimberly PAGE-SHAFER; Ricardo Sobhie Diaz

      2004

      Fonte:

    • Characterization of Human Immunodeficiency virus (HIV-1) subtypes and intersubtype recombinant forms in the city of Sao Paulo, Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Sabri Saeed Al Sanabani; Erika Etsuko Fusuma; Adriana Brustein; Ester Cerdeira Sabino; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2004

      Fonte:

    • Characterization of full-length HIV-1 genome obtained from recently infected subjects in Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Dercy José de Sá Filho; K C BASSICHETTO; S S SANABANI; Ester Cerdeira Sabino; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; Fabio Mesquita; Esper Georges Kallas

      2004

      Fonte:


    2003


    • Characterization of human immunodeficiency virus (HIV-1) subtypes and intersubtypes recombinants forms in São Paulo city/Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Sabry Saeed Al Sanabani; Erika Etsuko Fusuma; Adriana Brustein; Ester Cerdeira Sabino; Ricardo Sobhie Diaz; Luiz Mário Ramos Janini

      2003

      Fonte:

    • High levels of primary antiretroviral genotypic resistance and B/F recombinants in Santos SP, Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Graziela Tescarollo; Luiz Mário Ramos Janini; Marcos Montani Caseiro; Karia Alves; Ester Cerdeira Sabino; Adauto Castelo Filho; Kimberly PAGE-SHAFER; Ricardo Sobhie Diaz

      2003

      Fonte:

    • Analysis of full-length genomes of HIV-1 strains prevalent in Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Sabri Saeed Al Sanabani; Luiz Mário Ramos Janini; Walter N Kleine; Dercy José de Sá Filho; Ricardo Sobhie Diaz; Ester Cerdeira Sabino

      2003

      Fonte:

    • High levels of primary antiretroviral genotipic resistance and B/F recombinants in Santos SP, Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Cecilia Araripe Sucupira; Graziela Tescarollo; Luiz Mário Ramos Janini; Marcos Montani Caseiro; Katia Alves; Ester Cerdeira Sabino; Adauto Castelo Filho; Kim PageShafer; Ricardo Sobhie Diaz

      2003

      Fonte:

    • HIV-1 clade profile and primary resistance in recently infected individuals from Sao Paulo, Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Graziela Tescarollo; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Ana Carolina Denadai Sanchez; Dercy José de Sá Filho; Luiz Mário Ramos Janini; Katia Bassicheto; Fabio Mesquita; Esper Georges Kallas; Ricardo Sobhie Diaz

      2003

      Fonte:

    • Absence of HIV-1 superinfection in a HIV-1 positive blood recipient transfused with HIV-1 positive unit.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Fabio Araujo Feio Nobre; Ester Cerdeira Sabino; Dercy José de Sá Filho; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      2003

      Fonte:


    2002


    • Analysis of the protease sequences from Brazilian HIV-1 infected individuals demonstrate the evidence of a frequent pattern of B/F Intersubtype Recombination.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Luiz Mário Ramos Janini; Wilson Pereira da Silva; Luciana Jesus da Costa; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Ricardo Sobhie Diaz

      2002

      Fonte:

    • Analysis of the protease sequences from Brazilian HIV-1 infected individuals demonstrate the evidence of a frequent pattern of B/F Intersubtype Recombination.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Dercy José de Sá Filho; Luciana Jesus da Costa; Wilson Pereira da Silva; N A Pereira; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz

      2002

      Fonte:


    2001


    • Human Immunodeficiency Virus Type 1 DNA Sequences Genetically Damaged by Hypermutation Are Often Abundant in Patient Peripheral Blood Mononuclear Cells and May Be Generated during Near-Simultaneous Infection and Activation of CD4+ T Cells

      Artigo publicado

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; M Rogers; D Birx; F McCutchan

      Conteúdo completo

      2001

      Fonte: Journal of Virology (Print) , v. 75 , n. 17 , p. 7973

    • Near-simultaneous PHA Activation and HIV-1 Infection of Primary CD4+ T-Cells Generates Irreparably Damaged, Hypermutated Proviruses

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; M Rogers; M Louder; S Perfetto; D Birx; F McCuthan

      2001

      Fonte:

    • Non-Functional Hypermutated HIV-1 DNA Sequences Resulting From Infection of Early Activated T- Cells Are Abundant in Infected Patients

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; M Rogers; D Birx; F McCutchan

      2001

      Fonte:

    • Hypermutation of HIV-1 Genomes Follows a Defined Pattern Consistent with Dual Initiation Points for First-Strand Viral DNA Synthesis

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; J Carr; D Birx; F McCutchan

      2001

      Fonte:


    2000


    • Quasispecies analyses of a familial cluster infected with multiple HIV-1 subtypes.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; Luciana Jesus da Costa; Gedson Humberto de Novaes Pinto; Ricardo Sobhie Diaz

      2000

      Fonte:


    1999


    • HIV-1 subtype F in single and dual infections in Puerto Rico: A potential sentinel site for monitoring novel genetic HIV variants in North America.

      Artigo publicado

      Autores: I Flores; A Ramos; M Rayfield; M Yamamura; D Pieniazek; N Moran; A Soler; N Rodriguez; M Alegria; M Vera; Luiz Mário Ramos Janini; C I Bandea

      1999

      Fonte: Emerging Infectious Diseases , v. 5 , n. 3 , p. 481

    • Predominance of Human Immunodeficiency Virus Type 2 Subtype B in Abidjan, Ivory Coast

      Artigo publicado

      Autores: Pieniazek, Danuta; Bandea, Claudiu; Amilcar Tanuri; Greenberg, Alan E.; Wiktor, Stefan Z.; Rayfield, Mark A.; Luiz Mário Ramos Janini; Ellenberger, Dennis; Janini, Luiz M.; Ramos, Artur C.; Nkengasong, John; Sassan-Morokro, Madeleine; Hu, Dale J.; Coulibally, Issa-Malick; Ekpini, Ehounou

      Conteúdo completo

      1999

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 15 , n. 6 , p. 603

    • Genetic Analysis of Human Immunodeficiency Virus in Abidjan, Ivory Coast Reveals Predominance of HIV Type 1 Subtype A and Introduction of Subtype G

      Artigo publicado

      Autores: Ellenberger, Dennis L.; Hu, Dale J.; Coulibaly, Issa-Malick; Ekpini, Ehounou; Wiktor, Stefan Z.; Greenberg, Alan E.; Schochetman, Gerald; Rayfield, Mark A.; Luiz Mário Ramos Janini; Pieniazek, Danuta; Nkengasong, John; Luo, Chi-Cheng; Devare, Sushil; Maurice, Chantal; Janini, Mario; Ramos, Artur; Fridlund, Carol

      Conteúdo completo

      1999

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 15 , n. 1 , p. 3

    • Genetic variation and susceptibilities to protease inhibitors among subtype B and F isolates in Brazil.

      Artigo publicado

      Autores: Amilcar Tanuri; A C Vicente; K Otsuki; C A Ramos; O C Ferreira Junior; Mauro Schechter; Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek; M A Rayfield

      1999

      Fonte: Antimicrobial Agents and Chemotherapy , v. 43 , n. 2 , p. 253

    • Detecting G to A Hypermutation by Agarose Gel Electrophoresis

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; C Vibbard; D L Birx; F E McCutchan

      1999

      Fonte:


    1998


    • Introduction of HIV-2 and multiple HIV-1 subtypes to Lebanon.

      Artigo publicado

      Autores: D Pieniazek; Luiz Mário Ramos Janini; Amilcar Tanuri; C Fridlund; C Schable; L Heyndrickx; M A Rayfield; W Heneine; J Baggs; D J Hu; G M Matar; A M Abdelnoor; J E Mokhbat; M Uwaydah; A R Bizri; A Ramos

      1998

      Fonte: Emerging Infectious Diseases , v. 4 , n. 4 , p. 649

    • Horizontal and vertical transmission of human immunodeficiency virus type 1 dual infections caused by viruses of subtypes B and C.

      Artigo publicado

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; V Soriano; G Schochetman; M A Rayfield; D Pieniazek; Amilcar Tanuri; Mauro Schechter; J M Peralta; A C Vicente; N Dela Torre; N J Pieniazek; C C Luo; A Ramos

      1998

      Fonte: The Journal of Infectious Diseases , v. 177 , n. 1 , p. 227

    • A molecular epidemiologic survey of HIV in Uganda

      Artigo publicado

      Autores: M A Rayfield; T J Dondero; Luiz Mário Ramos Janini; HIV Variant Working Group; R G Downing; J Baggs; Hu, Dale J.; Pieniazek, Danuta; Luo, Chi-Cheng; B Biryahwaho; R A Otten; S D K Sempala

      1998

      Fonte: AIDS (London) , v. 12 , p. 521

    • Heterogenic Distribution Patterns of HIV-1 Epidemic in Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Alvaro Ramos; Amilcar Tanuri; M A Rayfield; Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek

      1998

      Fonte:


    1997


    • Two Cases of HIV-1 Infection in Puerto Rico Associated with pol Type F Strains

      Trabalhos em eventos

      Autores: I Flores; N Moran; M Alegria; M Vera; D Pieniazek; Luiz Mário Ramos Janini; C Bandea; Y Yamamura

      1997

      Fonte:

    • Genetic Analysis of Human Immunodeficiency Virus Type 2 Strains in Cote D'Ivoire: Evidence of Endemicity of HIV-2 Subtype B

      Trabalhos em eventos

      Autores: D Pieniazek; V Soriano; D Ellenberger; Luiz Mário Ramos Janini; A E Greenberg; J Nkengasong; C Bandea; G Schochetman; M A Rayfield

      1997

      Fonte:

    • HIV-1 Strains from Brazil May Consist of Mosaic Genome Structure

      Trabalhos em eventos

      Autores: A Ramos; Amilcar Tanuri; Luiz Mário Ramos Janini; M A Rayfield; G Schochetman; D Pieniazek

      1997

      Fonte:

    • Horizontal and Vertical Transmission of HIV-1 Dual Infections Caused by Viruses of Subtypes B and C

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; Amilcar Tanuri; Mauro Schechter; Alvaro Ramos; G Schochetman; M A Rayfield; D Pieniazek

      1997

      Fonte:


    1996


    • Identification of single and dual infections with distinct subtypes of human immunodeficiency virus type 1 by using restriction fragment length polymorphism analysis.

      Artigo publicado

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; M L Kalish; G Schochetman; M A Rayfield; D Pieniazek; J M Peralta; Mauro Schechter; Amilcar Tanuri; A C Vicente; N DelaTorre; N J Pieniazek; C C Luo

      1996

      Fonte: Virus Genes , v. 13 , n. 1 , p. 69

    • Mixed Infections with HIV-1 Strains of Different Phylogenetic Subtypes: Implications for the Evolution of the HIV/AIDS Pandemic

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek; A Ramos; C Bandea; V Soriano; R Drowning; B Biryahwaho; G Schochetman; M A Rayfield

      1996

      Fonte:

    • HIV-1 Mixed Infections Caused by Viruses of Distinct Subtypes are Sexually and Maternally Transmissible

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; J M Peralta; Amilcar Tanuri; Mauro Schechter; A Ramos; G Schochetman; M A Rayfield; D Pieniazek

      1996

      Fonte:

    • Analysis of Genetic Diversity of HIV-1 in Cote D'Ivoire Using Restriction Fragment Length Polymorphism ( RFLP ) Analyses

      Trabalhos em eventos

      Autores: D Ellenberger; G Schochetman; M A Rayfield; C C Luo; D Pieniazek; C Maurice; J Nkengasong; Luiz Mário Ramos Janini; I M Coulibaly; S Z Wiktor; A E Greenberger

      1996

      Fonte:

    • HIV-1 Infections in Brazil: Single, Duals, and Recombinants

      Trabalhos em eventos

      Autores: A Ramos; D Pieniazek; Amilcar Tanuri; Luiz Mário Ramos Janini; M Pinto; Mauro Schechter; J M Peralta; C Bdandea; G Schochetman; M A Rayfield

      1996

      Fonte:


    1995


    • HIV-1 patients may harbor viruses of different phylogenetic subtypes: implications for the evolution of the HIV/AIDS pandemic.

      Artigo publicado

      Autores: D Pieniazek; M A Rayfield; Luiz Mário Ramos Janini; A Ramos; Amilcar Tanuri; Mauro Schechter; J M Peralta; A C Vicente; N K Pieniazek; G Schochetman

      1995

      Fonte: Emerging Infectious Diseases , v. 1 , n. 3 , p. 86

    • Fluctuation in Culture of Distinct HIV-1 Strains from Dually Infected Persons

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek; C C Luo; N de La Torre; J M Peralta; Mauro Schechter; Amilcar Tanuri; N J Pieniazek

      1995

      Fonte:

    • Confirmation of Homotypic Dual Infections with HIV-1 and Phylogenetic Analysis of the Contributing Subtypes

      Trabalhos em eventos

      Autores: D Pieniazek; G Schochetman; M A Rayfield; Luiz Mário Ramos Janini; C C Luo; N de La Torre; J M Peralta; Amilcar Tanuri; Mauro Schechter; N J Pieniazek; M Kalish

      1995

      Fonte:

    • HIV-1 Subtypes Classified by Endonuclease Restriction Polymorphism in POL and GAG.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek; A Ramos; M A Rayfield; G Schochetman

      1995

      Fonte:


    1994


    • Phylogenetic Analysis of Geographically Distinct HIV-1 Genotypes

      Trabalhos em eventos

      Autores: D Pieniazek; C C Luo; M Kalish; N de La Torre; Luiz Mário Ramos Janini; G Schochetman; M A Rayfield

      1994

      Fonte:

    • Identification of Three Distinct Subtypes in Brazil Based on the Protease Gene

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini; D Pieniazek; C C Luo; J M Peralta; Mauro Schechter; M Kalish; N J Pieniazek; N de La Torre; G Schochetman; M A Rayfield

      1994

      Fonte:

    Atuações

    Universidade Federal de São Paulo

    • Professor Adjunto Visitante

      2004 a 2006

    • Professor Adjunto

      Desde 2006

    • Professor Colaborador

      Desde 2002

    Tendencias em HIV/AIDS

    • Membro de corpo editorial

      Desde 2006

    AIDS Research and Human Retroviruses

    • Revisor de periódico

      Desde 2005

    Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

    • Revisor de projeto de fomento

      Desde 2009

    Ensino

    Orientações e supervisões

    Supervisão de pós-doutorado em andamento

    • Robert Andreata Santos

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2021

    Tese de doutorado em andamento

    • Taima Naomi Furuyama

      Evolução viral em ambiente variável: simulando a infecção de tecidos placentários pelo vírus ZIKA e sua modulação pelos retrovírus endógenos humanos

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2020

    • Daniel Karcher

      Análise comparativa do secretoma das PBMCs de indivíduos voluntários participantes do protocolo de imunização com a vacina ChAdOx1 nCoV19

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2020

    • Alberto Hiroyuki Tomiyama

      Análise da taxa mutacional do HIV - 1 após ciclo único de replicação e cultivo celular

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2018

    • Danilo Rosa Nunes

      Análise das características moleculares e evolutivas de SARS-CoV2 obtidos a partir de isolados clínicos na epidemia do Estado de São Paulo

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2020

    Dissertação de mestrado em andamento

    • Vanessa Barbosa da Silveira

      Avaliação e detecção de anticorpos protetores por teste de neutralização e redução de placas para o Coronavírus responsável pela síndrome respiratória aguda grave 2 (Sars-CoV-2)

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2022

    • Wagner Migge dos Santos Guimarães

      Estudo da frequência de Dinucleotídeos Cpgs nos terminais repetidos longos (LTRs) e nas sequências dos genes do HIV-1.

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2019

    • Vanessa Barbosa da Silveira

      Avaliação e detecção de anticorpos protetores por teste de neutralização e redução de placas para o Coronavírus responsável pela síndrome respiratória aguda grave2 (SARS-CoV2).rs

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2020

    Tese de doutorado concluídas

    • Patricia Munerato

      Co-infecção de culturas linfocitárias primárias com diferentes subtipos de HIV-1: estudo de recombinação in vitro e competição viral

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2008

    • Samanta Mattei de Mello

      Construção e Avaliação de Vetores Adenovirais Condicionalmente Replicativos Expressando Interleucinas e Receptores de Interleucinas para Redução e/ou Erradicação in vivo de Células Tumorais Murinas B16F10-Nex2 e Aplicação em Terapia Gênica

      Ciências Médicas e Biológicas

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Wagner Tadeu Alkmim Maia

      Avaliação da diversidade genética e cinética de produção das formas circulares do HIV-1 em cultivo celular: impacto na manutenção da infecção viral.

      Ciências Médicas e Biológicas

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Jean Paulo Lopes Zukurov

      Desenvolvimento de Metodologia de Analise para Estimativa da Diversidade Genética Populacional do Hiv-1 Através do Sequenciamento de Nova Geração

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2015

    • Michel Moraes Soane

      Algoritmo de Predição de Desenvolvimento de Resistência no Gene Pol do Hiv-1

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2015

    • Jorge Meneses Nunes

      Estudo da modulação dos fatores epigenéticos envolvidos nos momentos iniciais da infecção pelo HIV-1 em células TCD4 no repouso

      Ciências Médicas e Biológicas

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Diogo Castro dos Santos

      Estudo da Contribuição da Recombinação na Evolução de Vírus RNA Usando Modelo Computacional Fenotípico

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Michelle Carolina dos Santos Bastos

      ESTRATÉGIAS DE INTERFERÊNCIA DE REPLICAÇÃO DO HIV-1 EM CULTIVO CELULAR

      Ciências Médicas e Biológicas

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2014

    • Anderson Luis da Costa

      Investigação das alterações na expressão dos HERVs, expressão de interleucinas e fatores de transcrição da resposta imune nos tecidos placentários ocasionados pelo vírus Zika

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2016

    • Maria Nadiege Furtado

      ANÁLISE DA VIA DE SINALIZAÇÃO DE RSK2 EM LINFÓCITOS TCD4 ATIVADOS EM CURTOS PERÍODOS DE EXPOSIÇÃO AO VIRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA ADQUIRIDA TIPO 1 HIV-1

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2014

    • Bruno Zanardo Gorzoni

      EVOLUÇÃO VIRAL: MECANISMOS QUE PODEM EVITAR OU INDUZIR A EXTINÇÃO DAS POPULAÇÕES DE VIRUS RNA

      Ciências Médicas e Biológicas

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Debora Bellini Caldeira

      Prevalência da resistência transmitida do HIV-1 aos antirretrovirais.

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2018

    • Elizabeth Cavalieri

      Estudo do tropismo viral do HIV-1

      Ciênicas Básicas em Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2010

    Dissertação de mestrado concluídas

    • Fabio Araujo Feio Nobre

      Pesquisa de superinfecção pelo HIV-1. estudo de quasispecies através do uso de metodologias moleculares

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2003

    • Cristiano Teodoro da Silva

      Estudo dos efeitos do ciclo celular sobre a variação genetica do HIV-1

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2005

    • Camila Florido

      Análise da diversidade genética no gene nef do vírus da imunodeficiência humana, tipo 1 (HIV-1) em crianças e em adultos recém infectados.

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Wagner Tadeu Alkmim Maia

      Estudo da Geração da Diversidade Genética do HIV-1 em ciclo de infecção único durante o cultivo celular

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2008

    • Michelle Camargo

      Caracterização Genética e das Pressões Seletivas Atuantes na Região do Envelope e das Variantes GWGR do Subtipo B Brasileiro.

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Mariana Leão de Lima

      Correlação entre hipermutação e carga viral em pacientes infecados pelo vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1)

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Juliana Galinskas

      Analise de similaridade entre sequencias dos genes do HIV-1 e o genoma humano

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Maria Clara Bizinoto

      Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1

      Infectologia

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Fernando Marques Rodrigues

      Caracterização molecular de recombinantes intersubtipos do vírus da imunodeficiência humana tipo 1(HIV-1) em pacientes provenientes da epidemia do estado de São Paulo, Brasil

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Michel Moraes Soane

      Comparação da Diversidade Genética do HIV-1 Gerada após Ciclos Únicos e Múltiplos de Infecção Presentes nos Compartimentos Intracelular e Sobrenadante de Cultivo Celular. 

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Edsel Renata de Morais Nunes

      Aplicação de um método de restrição enzimática sobre o gene da protease do HIV-1 para detecção de infecções duplas em pacientes infectados pelo HIV-1

      Ciências Básicas em Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Diogo Castro dos Santos

      Simulação Computacional e Análise de um Modelo Fenotípico de Evolução Viral

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Lucas Nogueira Simão

      Estudo do regime mutacional do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) em cultivo celular durante o bottleneck e após estabilização da população viral

      Microbiologia e Imunologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2012

    • Scheilla Teixeira Strumillo

      A influência do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV-1) na expressão da Interleucina 24 humana (IL-24) em Células Mononucleares do Sangue Periférico

      Ciências Básicas em Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2012

    • André Lanna de Oliveira

      Diversidade genética do gene da protease do HIV-1 após um único ciclo de replicação em células ativadas e em repouso.

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Maria Nadiege Furtado

      Estudo dos fatores epigenéticos modulados em células TCD4 ativadas nos momentos iniciais da infecção pelo HIV-1.

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2014

    • Mariana Bernardo Da Rocha

      Detecção de Recombinantes em Sequências da Região Pol de Hiv-1 de Bancos de Dados e Determinação de Prováveis Pontos de Quebra

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2015

    • Helio Benites Gil

      Caracterização Molecular de Um Deltabaculovirus (Baculoviridae) Identificado em Culex Quinquefasciatus (Diptera: Culicidae)

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2015

    • Bruno Gorzoni

      Modelo matemático e computacional para o estudo de evolução e adaptação viral com presença de reservatório.

      Ciências Médicas e Biológicas

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Taima Naomi Furuyama

      MODELAGEM MATEMÁTICA E COMPUTACIONAL DO GARGALO DE TRANSMISSÃO DURANTE O ESTABELECIMENTO DA INFECÇÃO PELO HIV

      Ciências Médicas e Biológicas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2017

    • Tatiane Montes de Andrade

      Estudo sobre o possível papel da proteína Ezrina e do receptor β2 adrenérgico no aumento da replicação viral mediado pelo estímulo adrenérgico em linfócitos TCD4+ de linhagem infectados pelo HIV-1

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2019

    • Thamires Prolo de Brito

      Silenciamento de HERVs e a modulação do ambiente imune frente a infecção com isolados de ZIKA vírus, em células de linhagens placentárias

      Micro-Imuno-Parasitologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2019

    • Gabriela Vasconde dos Santos

      Ensaio de soroneutralização do HIV-1 no paciente de São Paulo, utilizando dois tipos celulares: células mononucleares de sangue periférico PBMCs e JLTR-gfp

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2020

    • Iris Braz Ribeiro de Oliveira

      Transmissão Vertical Natural de Flavivirus de Interesse Médico em Aedes aegypti e Aedes albopictus

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2019

    • Luiza Guimarães Fabreti

      MÉTODO DE APRENDIZADO DE MÁQUINA NÃO SUPERVISIONADO APLICADO AO ESTUDO DA PROPAGAÇÃO DE CICLO ÚNICO DO HIV EM CULTIVO CELULAR

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2018

    • Douglas de Andrade de Almeida

      Algoritmo para predição de seleção de resistência aos inibidores de NS5A do vírus da hepatite C

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2020

    • Carla Cristina Teixeira

      Avaliação in vivo e in vitro da reativação de progenies ancestrais no envelope do HIV-1 em pacientes sob Interrupção Estruturada do Tratamento: repercussão no tropismo viral

      Ciências Básicas em Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2008

    Gestão

    Universidade Federal de São Paulo

    • Chefe do Laboratório de Segurança Nivel III (PIII)

      Departamento de Medicina

      Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias

    Pesquisa

    Universidade Federal de São Paulo

    • Estudo por Genoma Completo do Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo 1 Isolado de Pacientes Brasileiros com Diagnóstico de Infecção Viral Recente.

      Contexto: Brasil é o país da América do Sul mais afetado pela epidemia do HIV/AIDS com 600,000 indivíduos infectados pelo vírus. O estudo por genoma completo de vírus isolados de pacientes recém infectados no permite ter uma idéia mais precisa dos vírus circulantes atuais da epidemia. Métodos: Pacientes foram identificados com o diagnóstico de infecção recente pelo HIV-1 entre Junho e Agosto de 2003, empregando-se o algoritmo STARHS. 21 destes pacientes foram recrutados a participar de um estudo propectivo laboratorial e clínico. A amplificação do genoma completo proviral foi realizada através de PCR nested em fragmentos subgenômicos sobrepostos. Produtos de PCR foram sequenciados em ambas as direções, a análise filogenética foi realizada com método de Máxima VeroSemelhança presente no programa PAUP. O cálculo da diversidade genética foi realizado pelos métodos de Tamura-Nei e Nei-Gojobori. Os eventos de recombinação foram avaliados pela metodologia Bootscan. Resultados: Sequenciamento parcial viral das 21 amostras selecionadas, incluindo as regiões gag, pol, env, revelou que 17 eram do subtipo B, 2 eram recombinantes B/F, e 2 pertenciam ao subtipo C. 12 amostras foram então selecionadas para caracterização por genoma completo, 10 do subtipo B, e 2 recombinantes B/F. Os recombinantes apresentaram padrões únicos de recombinação nos genes gag, pol, vif e env. Os dados de genoma completo viral das amostras do HIV-1 do subtipo B demonstraram haver um aumento de diversidade de seqüência em gag (0.079), pol (0.058), env (0.140), e no genoma completo (0.095), quando comparadas a amostras do subtipo B Norte-americanas coletadas em 1980 que possuíam uma diversidade de 0.046, 0.035, 0.084, e 0.058 respectivamente (p<0.05, teste t). Conclusões: É de grande importância se estudar a diversidade genética de amostras do HIV-1 originárias de indivíduos com infecção recente porque através destes estudos tendências evolutivas da epidemia local podem vir a ser identificadas

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Sabri Saeed Sanabani, Ricardo Sobhie Diaz, Dercy José de Sá Filho

      2003 a 2007

    • Pesquisa de superinfecção pelo HIV-1. Estudo de quasispecies através do uso de metodologias moleculares.

      Quantidade de Recursos: R$ 8.000,00 No início da década de 80, uma nova síndrome começou a chamar atenção das entidades de saúde dos EUA. Pacientes adultos do sexo masculino, homossexuais, que apresentavam sarcoma de Kaposi, pneumonia por Pneumocystis carinii e comprometimento do sistema imune eram registrados em hospitais de São Francisco e Nova York. Outras populações, como a de usuários de drogas endovenosas, hemofílicos, pacientes que receberam transfusão de sangue, neonatos e imigrantes também foram sendo atingidas (GOTTLIEB et al.,1981; MASUR et al.,1981). Em 1986 o termo aids (Síndrome da Imunodeficiência Humana Adquirida) era usado para descrever clinicamente esta nova doença (COFFIN et al.,1986). Observações epidemiológicas sugeriam que esta síndrome er causada por um agente infeccioso de transmissão sexual, sanguínea e de mãe para filho (LEVY, 1988). O agente etiológico da aids foi isolado independentemente por três pesquisadores. Barré-Sinoussi e associados do Instituto Pasteur isolaram um retrovírus que então denominaram LAV (Lymphadenopathy Associated Virus) (BARRÉ-SINOUSSI et al., 1983), entretanto a sua relação com a aids permanecia apenas uma suspeita. Em 1984 Gallo e colaboradores caracterizaram outro retrovírus distinto dos HTLV conhecidos e o classificaram como HTLV-III (GALLO et al.,1984; POPOVIC et al.,1984; SARNGADHARAN, 1984; SCHUPBACH, 1984), este já isolado de um paciente adulto com aids. Na mesma época Levy e colaboradores (LEVY et al., 1984) identificaram também um retrovírus relacionado a aids, que foi denominado ARV (AIDS Relataded Virus). Posteriormente estes três protótipos isolados (LAV, HTLV-III, ARV) foram agrupados à família Lentivirinae. Em 1986 o Comitê Internacional de Viroses recomendou o nome de HIV (Human Immunodeficiency Virus) para o agente causador da aids (COFFINS, et al., 1986).

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Fabio Araujo Feio Nobre, Ricardo Sobhie Diaz

      2002 a 2004

    • Imunidade inata à infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) mediada pelo gene APOBEC3G: Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1

      Imunidade inata à infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) mediada pelo gene APOBEC3G: Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Elcio de Souza Leal, Mariana Leao de Lima, Ricardo Sobhie Diaz

      2006 a 2010

    • Co-infecção de culturas linfocitárias primárias com diferentes subtipos de HIV-1: estudo de recombinação

      A literatura já descreveu 13 CFRs, as quais representam genomas de HIV-1 que tenham infectado duas ou mais pessoas não relacionadas epidemiologicamente e portanto, podem ser consideradas relevantes para a epidemia. O HIV-1 é diplóide, sendo que ambas as fitas de RNA possuem potencial replicativo. Eventos de recombinação homóloga ocorrem com freqüência no HIV-1 devido à característica da transcriptase reversa de ?saltar? entre as fitas de RNA durante a síntese do cDNA. A presença de recombinates interclade de HIV-1 in vivo mostra a importância da recombinação como um salto evolutivo na manutenção da espécie, como acontece na Ásia, onde os subtipos A e E co-circulam e um recombinate A/E de padrão definido prevaleceu naquela região. No Brasil, onde pelo menos 3 subtipos (B/C/F) são os responsáveis pela epidemia, seria de grande importância conhecer as características fenotípicas e genotípicas dos possíveis recombinantes, o seu comportamento frente aos anti-retrovirais in vitro, a frequência de recombinação e o padrão genômico do recombinante mais adaptado.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Patricia Munerato, Cristiano Teodoro da Silva, Daniela Teixeira, Wagner Tadeu Alkmim Maia, Ricardo Sobhie Diaz

      2003 a 2007

    • Estudo da Geração da Diversidade Genética do HIV-1 em ciclo de infecção único durante o cultivo celular

      O HIV-1possui importante diversidade genética. As populações virais correspondem a uma distribuição de mutantes denominada ?quasispecies?. A redução de variabilidade e tamanho dessas populações, como as que acontecem durante a transmissão do HIV-1, colocam em risco a sua sobrevivência. A diversidade genética do HIV-1 pode ser influenciada pelo estágio de ativação em que as células alvo se encontram no momento da infecção. Um aumento brusco dessa diversidade pode fazer parte de uma estratégia do vírus em recuperar a diversidade genética perdida na população durante os eventos de transmissão. Para uma melhor elucidação das mudanças de diversidade ocorridas nas populações do HIV-1 após sua propagação de curta duração em cultivo celular, PBMCs serão submetidas a estímulos por diferentes mitógenos e infectadas por partículas do HIV-1 capazes de realizarem apenas um ciclo de infecção. As mutações acumuladas em um evento único de transcrição viral serão analisadas e comparadas com a seqüência do genoma do HIV-1 presente no inóculo original.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Wagner Tadeu Alkmim Maia, Shirley Cavalcante Komninakis

      2006 a 2009

    • Padronização da técnica de detecção do DNA proviral do HIV-1 em amostras de sangue seco utilizando PCR em tempo real.

      A transmissão vertical é a principal via de infecção pelo HIV na população infantil. No Brasil 85,5 % dos casos notificados na população menores de 13 anos são por infecção perinatal. Grandes avanços têm sido alcançados no Brasil para diminuir os índices de transmissão materno-fetal, como a oferta em rede pública do teste anti-HIV, o uso de terapia antiretroviral assistida para gestantes durante todo o período gestacional, durante o trabalho de parto e recém-nascido e substituição do aleitamento materno através de bancos de leite. Para avaliar o desempenho das medidas adotadas faz-se necessário o acompanhamento contínuo da prevalência da infecção nas gestantes e principalmente a prevalência da infecção no recém nascido que seria o indicador de impacto das ações profiláticas desenvolvidas. Além disto, um diagnóstico de certeza de infecção pelo HIV em recém nascidos diminuiria muito a ansiedade dos tutores relacionadas a longa espera pelo diagnóstico e evitaria manipulações desnecessárias ao recém nascido não infectado, como uso de antimicrobianos profiláticos e consultas freqüentes com especialistas. Como o diagnóstico da infecção do recém nascido deve ser feito através de detecção do acido nucléico viral devido à persistência dos anticorpos maternos até um ano ou mais, o objetivo do projeto é a padronização e estabelecimento da técnica de detecção do DNA viral do HIV-1 em amostras de sangue seco. Desta forma utilizar-se-ia o PCR em tempo real, produzindo-se um teste simples, sensível e específico. As amostras coletadas em papel de filtro podem ser transportadas e estocadas em temperatura ambiente o que tornaria possível o acompanhamento e testagem de grávidas e recém nascidos de todas as regiões do Brasil de forma prática e barata.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Maria Cecilia Araripe Sucupira, Sandra Mara Sampaio Andreo, Ricardo Sobhie Diaz

      2005 a 2009

    • Caracterização Genética e das Pressões Seletivas Atuantes na Região do Envelope e das Variantes GWGR do Subtipo B Brasileiro

      No Brasil, desde o inicio da década de 90, amostras contendo a variante GWGR foram encontradas nas amostras do subtipo B. Cerca de 50% das variantes do subtipo B circulante no Brasil formam um agrupamento genético e antigênico distinto. Essa variante possui como característica a codificação da seqüência de aminoácidos GWGR (ao invés do comum GPGR) na coroa da alça V3. A diferença em relação aos aminoácidos entre as seqüências GWGR e GPGR nas regiões V1-V2 do env sugerem que os isolados virais podem diferir substancialmente em suas propriedades biológicas. Logo, pressões adaptativas talvez possam ter ocorrido durante a disseminação do HIV-1 no Brasil e então, é possível essa variante tenha um antecessor filogenético comum. Atualmente, não se sabe se as amostras GWGR são uma linhagem distinta ou apenas variantes de topo da alça V3 do env, pois o env é muito variável e possui sinal filogenético grande. Além disso, também é desconhecida a comprovação por biologia molecular de que a seqüência GWGR tenha uma progressão diferenciada daquela presente na GPGR, havendo, portanto, necessidade de confirmação. Dessa forma, dados gerados a partir do seqüenciamento completo da região env do HIV-1 funcionam como um excelente banco de informações que permitem um melhor entendimento da epidemia HIV/aids no Brasil. A utilização de metodologias menos sensíveis que são baseadas na análise de fragmentos menores pode, eventualmente, apresentar artefatos que superestimem os resultados encontrados.

      2006 a 2008

    • Determinação da prevalência de resistência genotipica e da diversidade genética em casos de infecção recente pelo vírus da Imunodeficiência humana (HIV-1)

      A infecção pelo HIV-1 no Brasil continua crescendo a níveis elevados. Entretanto, dados de incidência da infecção e dados de epidemiologia molecular são extremamente escassos em nosso meio. Através de metodologia laboratorial recentemente descrita poderemos determinar a incidência da infeção pelo HIV-1 e detectar pacientes com infecção recente (período inferior a 4 meses) em população que procura o Centro de Testagem Anônima para HIV (COAS) de Santos. Desta forma, compararemos a prevalência dos diferentes subtipos do HIV-1 que co-circulam no Brazil entre as infecções recentes e não recentes e com isso poderemos ter um indicativo da dinâmica de variação desses subtipos em nosso meio, assunto extremamente relevante em epidemiologia molecular e para estratégias de desenhos de vacinas. Também teremos a possibilidade de determinar genotipicamente nas infecções recentes, os epitopos de regiões do gp120 do HIV-1 que podem ser úteis para produção de vacinas. Será também determinada a prevalência de resistência genotípica primária às drogas anti-retrovirais nos pacientes com infecção recente. O encontro de cepas com resistência primária em infecção recente nos fornece evidências de que cepas resistentes estão sendo transmitidas. Este dado, a nível de saúde pública, potencialmente ajuda na definição da terapêutica anti-retroviral empírica que deve ser utilizada em nosso meio e dos esquemas anti-retrovirais profiláticos com maior chance de serem eficazes (transmissão vertical e acidentes profissionais).

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Marcos Montani Caseiro, Ester Cerdeira Sabino, Adauto Castelo Filho, Esper Georges Kallas, Ricardo Sobhie Diaz

      1998 a 2003

    • Caracterização genotípica e fenotípica de recombinantes do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV-1) em amostras do Município de Santos/SP.

      O Estado de São Paulo é considerado como um dos epicentros da epidemia de AIDS no Brasil, reportando 47% dos casos. O Município de Santos possuí um dos maiores portos da América Latina e devido as rotas de comércio internacional atua como introdutor e difusor do HIV no sudeste brasileiro. No Brasil já foram identificados três subtipos do HIV-1: B, C e F sendo que o subtipo B é o de maior prevalência. Quando se tem mais de um subtipo viral estabelecido numa população, como é o caso da brasileira, podem ocorrer eventos de recombinação entre estes vírus previamente identificados. No presente projeto serão analisadas amostras de HIV-1 estocadas no Laboratório de Retrovirologia da UNIFESP provenientes do Centro de Testagem e Aconselhamento de Santos (SP) coletadas para o Projeto Temático da FAPESP n 1998/14381-4. Pretendemos analisar as formas recombinantes do HIV-1 no Município de Santos pela análise do genoma completo viral e estudar a dinâmica de replicação viral das formas recombinantes e dos parentais por ensaios ?in vitro?.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Elidamar Nunes de Carvalho, Ricardo Sobhie Diaz, Dercy José de Sá Filho

      2003 a 2007

    • Interrupção Parcial do Tratamento (IPT) em pacientes infectados pelo HIV-1 com falha aos Anti-retrovirais

      Atualmente, muitos pacientes em uso de combinações potentes de anti-retrovirais (também conhecida como HAART ? highly active antiretroviral therapy) não mantêm a viremia plasmática em níveis indetectáveis. Como conseqüência desta supressão viral incompleta ocorre a emersão de cepas virais mutantes resistentes aos anti-retrovirais.(1,2) Pacientes com vírus resistentes aos anti-retrovirais normalmente evoluem para falha terapêutica em tratamentos subseqüentes, particularmente porque a resistência cruzada é muito comum. Quando os pacientes com vírus resistentes interrompem a terapia, os níveis plasmáticos de RNA do HIV aumentam e a contagem de células T CD4+ diminui, levando estes pacientes a progressão clínica.(3) Em decorrência da resposta limitada a terapias subseqüentes e ao risco inerente de interrupção da terapia, muitos pacientes são mantidos sob regimes estáveis a despeito da replicação viral. Esta estratégia terapêutica é particularmente comum na prática clínica porque muitos pacientes se mantém clinicamente e imunologicamente estáveis, mesmo após anos de terapia com um regime parcialmente efetivo.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Esper Georges Kallas, Ricardo Sobhie Diaz

      2005 a 2008

    • Análise prospectiva das características virológicas e imunológicas em indivíduos com infecção recente pelo HIV-1 das cidades de São Paulo e Santos, SP

      O objetivo inclui o desenvolvimento de uma cohort de indivíduos com infecção recente pelo HIV-1, a partir da qual conduziremos estudos virológicos, imunológicos, clínicos e epidemiológicos. A cohort servirá como base para três estudos científicos motivados a partir de hipóteses científicas bem definidas. O estudo envolvendo pessoas com infecção recente pelo HIV proporcionará a oportunidade única e importante de análise das tendências na epidemia, da história natural da infecção pelo HIV sob circunstâncias especiais (tratamento anti-retroviral universal) e explorará prospectivamente questões importantes que podem surgir em locais onde as intervenções terapêuticas tem aumentado. Conduziremos estudos clínicos/laboratoriais relacionados a (i) aquisição de resistência primária aos anti-retrovirais e progressão da doença, (ii) resposta imunológica durante a infecção recente pelo HIV e (iii) diversidade genética da população viral como fator relacionado à progressão da doença. A análise epidemiológica irá incluir estudos comportamentais e correlações com co-infecções.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ester Cerdeira Sabino, Esper Georges Kallas, David Salomão Lewi, Joao Eduardo Ferreira, Ricardo Sobhie Diaz

      Desde 2005

    • Estudo da evolução viral dos subtipos B (GPGR), B brasileiro (Bbz) (GWGR) E não-B do HIV-1 em indivíduos com diagnóstico de infecção recente pelo HIV-1.

      Cepas do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) apresentam um alto grau de diversidade genética. Esta diversidade potencialmente pode influenciar em aspectos biológicos, transmissibilidade e imunogenicidade. Para se entender a epidemiologia molecular do HIV-1 no Brasil, o monitoramento da diversidade genética é importante para determinar a evolução do vírus. Através de processos evolutivos, novas variantes virais podem vir a imergir as quais possuem potencial patogênico diferenciado, ou melhor transmissibilidade. Também é concebível que a diversidade genética do vírus possa enfraquecer a resposta imunológica a vacinas candidatas, e ocasionar resultados falso negativos no diagnóstico/monitoramento com testes laboratoriais, especialmente aqueles que utilizam ácidos nucléicos, podendo também estar associada ao surgimento de resistência aos antiretrovirais. Este trabalho consiste em um estudo prospectivo observacional da evolução viral do HIV-1 em indivíduos com diagnóstico inicial de infecção recente. Assim, nossa proposta de estudo é descrever a evolução genética dos vírus dos subtipos não-B do HIV-1 comparadas às do subtipo B(GPGR) e Bbz (GWGR) ao longo de um período de no mínimo 4 anos, com início da análise em amostras de indivíduos com diagnóstico de infecção recente do Município de Santos e São Paulo, vis a vis a pressão seletiva de sistemas imunes de hospedeiros diferentes. A hipótese é que vírus de subtipos diferentes ou com a assinatura genética definindo os vírus B e Bbz, terão um ritmo de evolução qualitativa e quantitativamente diferente.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Adauto Castelo Filho, Sandra Mara Sampaio Andreo, Ricardo Sobhie Diaz

      2005 a 2009

    • Estudo da prevalência de mutações de resistência primária em uma população recentemente infectada em Goiânia, Brasil.

      Estudo pioneiro na regiaõ qeu avalia a prevalência de mutações de resistência em uma população virgem de tratamento. É importante saber a prevalência destas mutações primárias de resistências pois elas podem impactuar nas estratégias futuras de tratamento.

      2008 a 2012

    • Estudo da prevalência das infecções duplas do HIV-1 em indivíduos em falha virológica submetidos ao tratamento antiretroviral intensivo

      O Vírus da Imunodeficiência Humana, HIV-1, possui uma importante diversidade genética. No Brasil, os subtipos de maior circulação são B, C e F. Toda essa diversidade é resultado direto da incorporação de erros durante a replicação viral. A capacidade de diversificação da informação genética contida em seu genoma permite ao HIV adaptar-se às pressões seletivas impostas pelo meio onde está se replicando. A própria imunopatogênese da doença, na era pré e pós-tratamento empregando-se antiretrovirais, é influenciada pela variabilidade genética viral. A co-circulação de múltiplos subtipos e a presença de co-infecção ou superinfecção favorece o surgimento de vírus recombinantes entre subtipos distintos de HIV-1, o que pode significar a seleção de uma estrutura viral mais adaptada. Acredita-se que a resposta imunológica a infecção por HIV-1 impede a superinfecção por um segundo vírus. No entanto recentes estudos têm documentado casos de superinfecção por HIV-1 em humanos quer de diferentes ou de mesmo subtipo viral. A proposta desse estudo é avaliar a presença de infecção dupla em pacientes tratados com terapia antiretroviral distribuída pelo Programa Nacional de Doenças Sexualmente Transmitidas (PN-DST), através do Ministério da Saúde, que podem estar sendo indicativas desse tipo de infecção. O esclarecimento desse fato poderá, inclusive, contribuir para a idealização de novas estratégias terapêutico-vacinais.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Irmtraut Araci Hoffmann Pfrimer, Celso Granato, Reinaldo Salomão, Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, Wagner Alkmim, Fernando Marques Rodrigues, Jean Paulo Lopes Zukurov, Edsel Renata de Morais Nunes

      2009 a 2011

    • Análise da taxa de mutação do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) em ciclo único de infecção in vitro

      Os Vírus da Imunodeficiência Humana tipos 1 e 2 (HIV-1 e HIV-2) são retrovírus nos quais a diversidade genética é muita alta. Esta diversidade é gerada por processos biológicos inerentes aos próprios vírus, sendo em grande parte conseqüência da falta de atividade revisora da enzima transcriptase reversa (TR). Outras características que interferem na geração de sua heterogeneidade genética são, por exemplo, a recombinação entre vírus de cepas distintas e a alta taxa de replicação viral no hospedeiro. Com esta diversidade genética, estes vírus são capazes de evadir das ações do sistema imune humano e sobrepujar o efeito dos medicamentos empregados. Tal propriedade dificulta ainda o desenvolvimento de vacinas e novas drogas antiretovirais. As taxas de mutação do genoma do HIV-1 foram estimadas com emprego de transcriptase reversa purificada ou sistema de infecção de ciclo único nos quais seqüências curtas foram usadas como modelo. Estas seqüências muitas vezes foram derivadas de outros organismos. Noutros estudos, as técnicas de detecção das mutações foram baseadas em característica fenotípica em sistema bacteriano. Assim, a taxa de mutação do HIV-1 pode ter sido erroneamente avaliada. Pretendemos avaliar a taxa de mutação do HIV-1 diretamente, pela análise de seqüências longas obtidas de provírus. Células mononucleares do sangue periférico humano serão infectadas em ciclo único, de onde obteremos o ADN proviral. Realizaremos o seqüenciamento de região do genoma com aproximadamente 600 pares de bases (gene env). A partir destes resultados calcularemos a freqüência de mutação/base/ciclo replicativo.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, Wagner Alkmim, Sieberth do Nascimento Brito, Michel Moraes Soane, Fernando Marques Rodrigues, Lucas Nogueira Simão

      2009 a 2011

    • Análise das Modificações Epigenéticas observadas em Células Mononucleares de Sangue Periférico mediante Infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV-1)

      2009 a 2011

    • Vírus da Imunodeficiência Humana tipo I (HIV-I) como Agente Modificador do Ambiente

      Vírus são parasitas intracelulares obrigatórios e dependem absolutamente do ambiente celular e seus componentes para serem capazes de realizar um ciclo de replicação completo. Os vírus devem ser capazes de transmitir seus genomas entre organismos infectados e não infectados e atingir células alvo no novo organismo. Com dimensões limitadas e estrutura simples os vírus evoluíram para explorar todas as possibilidades funcionais dos seus hospedeiros. Esta evolução é representada pela ativação de diversos mecanismos celulares que acabam auxiliando e suportando a replicação viral. Como conseqüência ocorre uma eficiente entrega de genes virais no citoplasma ou núcleo celular. Tal adaptação celular tornou os vírus ferramentas fundamentais para o estudo da biologia celular e funções celulares. Durante a invasão celular os vírus acionam mecanismos celulares logo após se fixarem à membrana celular. O estudo dos momentos inicias da entrada viral permite a identificação de alterações celulares promovidas pelos vírus que podem resultar na ativação de cascatas de sinalização e de propagação de sinal que serão fundamentais para o sucesso viral. Contrariamente, vias de ativação celular desencadeadas a partir da fixação dos vírus à superfície celular podem antagonizar os vírus. A identificação de tais vias pode levar à formulação de estratégias de contenção das infecções virais e suas aplicações terapêuticas. A defesa imune contra os vírus é iniciada através do reconhecimento viral e posterior sinalização celular que culminam na ativação de mecanismos inatos da defesa antiviral que limitarão a replicação viral. Resumindo, os vírus dependerão de estruturas celulares para promoverem suas infecções e as células responderão ativamente aos sinais induzidos pelos vírus. Estes sinais se originam precocemente com a fixação viral ao receptor celular e ativação de cascata de sinalização subseqüente. O presente projeto propõe o estudo dos vírus como agentes modificadores do ambiente celular

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini

      2010 a 2014

    • Estudo da modulação dos fatores epigenéticos envolvidos nos momentos iniciais da infecção pelo HIV-1 em células TCD4+ em repouso.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, Juliana Terzi Maricato, Marli Curcio

      2013 a 2016

    • Desenvolvimento de um novo ensaio fenotípico baseado na região C2-V3 da gp120 do Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo 1 (HIV-1) para a determinação do tropismo viral.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini

      2012 a 2014

    • Uso de vacina de células dendríticas em associação com estratégias para eliminação de reservatórios virais almejando a cura esterilizante da infecção pelo HIV-1 em pessoas cronicamente infectadas em uso de tratamento antirretroviral

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz

      2015 a 2017

    • A evolução genética do HIV entre indivíduos sobre tratamento antirretroviral

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz

      2014 a 2017

    • Análise da via de sinalização MAP cinase em linfócitos TCD4+ ativados em curtos períodos de exposição ao vírus da imunodeficiência adquirida do tipo 1 HIV-1

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz

      2017 a 2019

    • Uso de vacina de células dendríticas em associação com estratégias para eliminação de reservatórios virais almejando a cura esterilizante da infecção pelo HIV-1 em pessoas cronicamente infectadas em uso de tratamento antirretroviral

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Luiz Mário Ramos Janini, Diaz, Ricardo S.

      2014 a 2017

    • Uso de vacina de células dendríticas em associação com estratégias para eliminação de reservatórios virais almejando a cura esterilizante da infecção pelo HIV-1 em pessoas cronicamente infectadas em uso de tratamento antirretroviral

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Diaz, Ricardo S.

      2014 a 2017

    • Avaliação de compostos com potencial terapêutico para SARS-CoV-2: enfoque em compostos com atividade estrogênica, moduladores da autofagia e ECA2

      A pandemia do SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) tornou-se uma grande preocupação mundial, principalmente devido aos impactos nos sistemas de saúde de diversos países e o grande número de mortes em um curto espaço de tempo. Muitos estudos recentes em modelos celulares e ensaios clínicos têm apontado que apontado que a hidroxicloroquina, um medicamento utilizado no tratamento da malária, lúpus e artrite reumatoide, é uma possível escolha terapêutica farmacológica. Este composto tem sido capaz de reduzir a carga viral em amostras de alguns pacientes, porém há necessidade de estudos adicionais para se comprovar a eficácia deste fármaco, cujo mecanismo de ação é a alteração do pH lisossomal, e consequentemente inibição do processo da autofagia. A autofagia é um processo catabólico altamente regulado e fundamental para a manutenção da homeostase celular. Nosso grupo de pesquisa tem estudado o papel de moduladores do processo autofágico para combater doenças neurodegenerativas, metabólicas e oncológica. O acúmulo das evidências epidemiológicas indicam que a população idosa é a mais vulnerável e sob maior risco de sofrer complicações da doença, além de indicar maior prevalência de óbitos em pacientes do sexo masculino. Trabalhos anteriores apontam para diferenças na gravidade da doença de acordo com o gênero, e indicam que o estrógeno possa ter uma relação de proteção fisiológica contra o coronavírus. Portanto, os objetivos deste projeto serão: 1) avaliar fármacos e protocolos de tratamento laboratoriais focados na modulação da autofagia e sinalização estrogênica; 2) avaliação da vulnerabilidade celular e sua relação com a expressão da ECA2 (Enzima conversora da angiotensina 2); 3) estudo de vias de sinalização celulares na infecção pelo SARS-CoV-2. Com a colaboração de uma equipe multidisciplinar iremos inicialmente cultivar o vírus e identificar a linhagens celulares que possam suportar a replicação viral, dentre elas: HEK293T, BEAS, A549, entre outras. A produção viral será avaliada quantitativamente por qPCR. A viabilidade celular será acessada por ensaios de MTT e citometria de fluxo (7-AAD). Para a identificação de compostos com potencial antiviral, uma biblioteca de compostos com atividade estrogênica e compostos que modulam o processo autofágico será utilizada para tratar as células durante a infecção por SARS-CoV-2, avaliando a carga viral e viabilidade celular. Também será avaliada a expressão da ECA2, que age como receptor do vírus para a infecção, e cuja atividade pode ser reduzida pelo estrógeno. Em uma segunda etapa, iremos superexpressar a ECA2 em linhagem celular escolhida, verificando se ocorrerá a potencialização da infecção, simulando uma situação de sensibilização da célula para a infeção viral, quadro associado a pacientes mais vulneráveis ao óbito como diabéticos e portadores de imunodeficiências. Os mecanismos de ação dos fármacos serão avaliados em etapa posterior, considerando: o tipo de receptor e a via de sinalização. Assim, com a iniciativa e esforços de pesquisadores de diferentes áreas de conhecimento (virologia, fisiopatologia pulmonar, farmacologia celular e molecular) iremos selecionar alvos para terapia que possam ser aplicadas imediatamente, focando no reaproveitamento de fármacos através do uso "off-label" objetivando reduzir a capacidade de replicação viral em laboratório que eventualmente poderá ser traduzida como alternativa terapêutica para pacientes internados, principalmente de grupo de alto risco. (AU)

      Desde 2020

    • Investigação de elementos induzidos pela resposta vacinal nos indivíduos submetidos aos testes clínicos com a vacina ChAdOx1 nCOV-19

      Esta proposta de pesquisa consiste em um desdobramento do projeto internacional com amostras de indivíduos voluntários para o teste da vacina Oxford-UNIFESP ChAdOx1 nCoV-19. A proposta envolverá as 2.000 amostras de voluntários, e os períodos correspondentes, e será responsável por compor o Biobanco da instituição-sede para toda a comunidade acadêmica do Estado de São Paulo. Além disso, as amostras armazenadas no Biobanco serão usadas para realizar análises que não se sobrepõem às "Medidas de resultados primários e secundários", conforme descrito na documentação do ensaio clínico disponível em ClinicalTrials.gov (Institutos Nacionais de Saúde, ID NCT04400838). O projeto será coordenado pelo Prof. Luiz Mario Ramos Janini e incluirá uma equipe de pesquisadores principais em diferentes áreas, referentes aos objetivos específicos e histórico de pesquisa da FAPESP. Os objetivos deste projeto são: (1) armazenar e disponibilizar todas as amostras obtidas de voluntários antes e depois da vacinação no Biobanco da UNIFESP. Esse Biobanco foi construído de acordo com os procedimentos legais, com o objetivo de armazenar corretamente e disponibilizar amostras para toda a comunidade científica do Estado de São Paulo, nacional e internacional; (2) avaliar a capacidade de neutralização de soros de indivíduos vacinados contra isolados de SARS-CoV-2 circulantes específicos do Brasil e outros isolados específicos de coronavírus para avaliação da imunidade cruzada;(3) caracterizar isolados 2 brasileiros de SARS-CoV-2 e estudar a variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína ?Spike? específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos; (4) gerar e analisar perfis de citocinas de soros de voluntários antes e após a vacinação para avaliar a resposta inflamatória e efeitos associados; (5) analisar e comparar os transcriptomas sanguíneos de voluntários, por RNA-seq, antes e após a vacinação. Essa análise será quantitativa e qualitativa para avaliar o impacto da vacina nos níveis diferenciais de expressão gênica e avaliar a variação individual na resposta genética à vacina e (6) analisar o perfil de secretoma no sangue total dos voluntários, antes e após a vacinação, para avaliar o tipo de resposta imune predominante e possível ?priming? por outro coronavírus.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, Juliana Terzi Maricato, Rodrigo Portes Ureshino, Carla Máximo Prado, Carla Torres Braconi, Gustavo José da Silva Pereira, Nancy Cristina Junqueira Bellei, Roberta Sessa Stilhano Yamaguchi, Soraya Soubhi Smaili

      Desde 2020

    • ?Uso de Organ-On-Chip para Estudo do Eixo Endotélio-Rim-Sistema Imune na infecção por SARS-CoV-2; e Estratégias Terapêuticas com Células-Tronco Mesenquimais.?

      Investigar o perfil do secretoma no eixo rim-endotélio-sistema imune, na presença/ausência de CTMs e infecção por SARS-CoV-2. Desenvolver dispositivos microfluídicos do tipo órgãos-em-chip para representar a interação sistêmica possibilitando a descoberta de possíveis alvos moleculares na COVID-19.

      Autores: Luiz Mário Ramos Janini, Maria Isabel de Moraes Pinto, Lily Yin Weckx, Marcelo R S Briones

      Desde 2020

    Outras atividades técnico científicas

    Atualização Lattes em 2023-03

    Processado em 2023-12-28