João Nobrega de Almeida Júnior nacionalidade brasileira

Escola Paulista de Medicina

Programa de Pós-Graduação: Infectologia

E-Mail: joao.nobrega@unifesp.br


112
4
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De 2015 a 2024
Trabalhos publicados
Participações em projetos

Resumo

Possui graduação em Ciências Médicas pela Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (2002). Residência Médica em Infectologia, Instituto de Infectologia Emílio Ribas (2005). Formation Spécialisée Approfondie, Maladies Infectieuses, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (2006). Complementação Especializada-Infecção Hospitalar, Universidade de São Paulo (2007). Médico Assistente Laboratório de Microbiologia, Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clínicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (2008-2021). Doutorado pela Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (2014). Curso de especialização em Micologia Médica pelo Institut Pasteur de Paris (2015). Pós-doutorado pela Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (2017). Fellowship Micologia Molecular no Center for Discovery and Innovation, Laboratório Dr. David S. Perlin (2019-2020). Título de especialista em Patologia Clínica (2022).

Fonte: Lattes CNPq

Nomes em citações bibliográficas

ALMEIDA JÚNIOR, J. N.;João Nobrega de Almeida,Júnior;Nóbrega de Almeida Júnior J;ALMEIDA-JUNIOR, JN;ALMEIDA-JR, JN;NÓBREGA DE ALMEIDA JÚNIOR, J.;de Almeida Júnior, JN;DE ALMEIDA JÚNIOR, J. N.;ALMEIDA JÚNIOR, J.N.;João Nobrega de Almeida Jr;JOÃO NÓBREGA DE ALMEIDA;DE ALMEIDA, JOÃO NÓBREGA;NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO;ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NÓBREGA DE;de ALMEIDA JN Júnior;de ALMEIDA JOÃO N;DE ALMEIDA, JOÃO N.;NOBREGA DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO;DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO N.;ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NÓBREGA;ALMEIDA JN Jr;João Nóbrega de Almeida Júnior;João, Nóbrega de Almeida;ALMEIDA, JOÃO NÓBREGA DE;DE ALMEIDA JÚNIOR, J N;JÚNIOR, JOÃO N. DE ALMEIDA;ALMEIDA JR, JOÂO NOBREGA DE;ALMEIDA JR, JOÃO NOBREGA DE;ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO NOBREGA DE;JUNIOR, JOAO N. DE ALMEIDA;JOÃO NÓBREGA, DE OLIVEIRA;DE OLIVEIRA, JOÃO NÓBREGA;DE ALMEIDA, JOÃO NOBREGA;DE ALMEIDA JR., JOÃO;DE ALMEIDA JUNIOR, JOÃO N.;ALMEIDA, JOAO NOBREGA DE;DE ALMEIDA JUNIOR, J.N.;DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO NOBREGA;ALMEIDA JUNIOR, J.N.;DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO NÓBREGA;DE ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NÓBREGA;NOBREGA DE ALMEIDA JUNIOR, JOÃO;ALMEIDA JÚNIOR, J.N. DE;DE ALMEIDA, JO'O N.;DE ALMEIDA, JOÃO N;DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO N;ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NOBREGA


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Formação

  • Doutorado em Medicina

    Padronização da espectrometria de massa MALDI-TOF para identificação de cepas de Trichosporon spp. de importância médica

    Micologia médica

    Orientação: Gil Benard

    Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

      Desde 2014

  • Graduação em Ciências Médicas

    Pontifícia Universidade Católica de São Paulo

    1997 a 2002

  • Produção


    2023


    • Short Tandem Repeat Genotyping and Antifungal Susceptibility Testing of Latin American Candida tropicalis Isolates (2023)

      Artigo publicado

      Autores: SPRUIJTENBURG, BRAM; DE GROOT, THEUN; BAQUEIRO, CYNTHEA C. S. Z.; Arnaldo Lopes Colombo; MEIJER, EELCO F. J.; DE ALMEIDA, JOÃO N.; BERRIO, INDIRA; FERNÁNDEZ, NORMA B.; CHAVES, GUILHERME M.; MEIS, JACQUES F.

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF FUNGI , v. 9 , p. 207 - Extrato QUALIS: A2

    • Worldwide emergence of fluconazole-resistant Candida parapsilosis: current framework and future research roadmap (2023)

      Artigo publicado

      Autores: DANESHNIA, FARNAZ; ZHAI, BING; HOHL, TOBIAS M; GABALDÓN, TONI; Arnaldo Lopes Colombo; HOENIGL, MARTIN; ARASTEHFAR, AMIR; DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO N; ILKIT, MACIT; LOMBARDI, LISA; PERRY, AUSTIN M; GAO, MARILYN; NOBILE, CLARISSA J; EGGER, MATTHIAS; PERLIN, DAVID S

      Conteúdo completo

      Fonte: Lancet Microbe , v. 4 , p. e470

    • Novel Non-Hot Spot Modification in Fks1 of Candida auris Confers Echinocandin Resistance (2023)

      Artigo publicado

      Autores: KORDALEWSKA, MILENA; CANCINO-PRADO, GESELLE; NOBREGA DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO; BRASIL BRANDÃO, IGOR; TIGULINI DE SOUZA PERAL, RENATA; Arnaldo Lopes Colombo; PERLIN, DAVID S.

      Conteúdo completo

      Fonte: ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY , v. 67 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1

    • Emergence of cryptic species and clades of Meyerozyma guilliermondii species complex exhibiting limited in vitro susceptibility to antifungals in patients with candidemia (2023)

      Artigo publicado

      Autores: FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; CORZO-LEÓN, DORA E; ZURITA, JEANNETE; CORTES, JORGE ALBERTO; NUCCI, MARCIO; Arnaldo Lopes Colombo; RIBEIRO, FELIPE DE CAMARGO; ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NOBREGA; PEDONI, DIEGO BETTO; DA MATTA, DANIEL ARCHIMEDES; DOLANDE, MARIBEL; MELO, ANALY SALLES DE AZEVEDO; LIMA, RICARDO FERREIRA; AQUINO, VALÉRIO RODRIGUES

      Conteúdo completo

      Fonte: MICROBIOLOGY SPECTRUM , v. 11 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1

    • Introdução ao Laboratório de Microbiologia Clínica. (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Thais Sabato Romano Di-Gioia; DE ARAÚJO, MARIA RITA ELMOR; Flavia Rossi

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 855

    • Infecção de corrente sanguínea. (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Ana Paula Inoue

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 861

    • Infecções Fúngicas Invasivas (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 901

    • Aspergilose Invasiva (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: BUCCHERI DE OLIVEIRA, RENATA; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 903

    • Fusariose Invasiva (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 915

    • Mucormicose (2023)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Laboratório na Prática Clínica. , p. 919


    2022


    • A Brazilian Inter-Hospital Candidemia Outbreak Caused by Fluconazole-Resistant Candida parapsilosis in the COVID-19 Era (2022)

      Artigo publicado

      Autores: THOMAZ, DANILO Y.; SEJAS, ODELI N. E.; ROSSI, FLÁVIA; ABDALA, EDSON; STRABELLI, TÂNIA M. V.; BENARD, GIL; DEL NEGRO, GILDA M. B.; RIBEIRO, LEIDIANE B.; DA SILVA, MIRIAN; CARVALHO, GABRIELLE O. M. H.; CAMARGO, CARLOS H.; João Nobrega de Almeida Júnior; MOTTA, ADRIANA L.; SICILIANO, RINALDO F.

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF FUNGI , v. 8 , p. 100 - Extrato QUALIS: A2

    • COVID-19-associated aspergillosis in a Brazilian referral centre: Diagnosis, risk factors and outcomes (2022)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; ARANHA, LUIS FERNANDO C.; SZARF, GILBERTO; SILVA TELES, GUSTAVO B.; FILIPPI, RENÉE ZON; PAES, VITOR RIBEIRO; BAETA, MARINA; HAMERSCHLAK, NELSON; MANGUEIRA, CRISTOVÃO LUIS P.; MARTINO, MARINES DALLA VALLE; DOI, ANDRÉ MARIO; WATANABE, MARIA JULIA L.; MALUF, MAIRA MARAGHELLO; CALDERON, CECÍLIA LEON; SILVA, MOACYR; PASTERNAK, JACYR; KOGA, PAULA CÉLIA M.; SANTIAGO, KELLY ALINE S.

      Conteúdo completo

      Fonte: MYCOSES (BERLIN. INTERNET) , v. 65 , p. 449 - Extrato QUALIS: A1

    • The emerging threat antifungal-resistant Candida tropicalis in humans, animals, and environment (2022)

      Artigo publicado

      Autores: LIMA, RICARDO; RIBEIRO, FELIPE C.; Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA, JO'O N.

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Fungal Biology , v. 3 , p. 1

    • Determinants of fluconazole resistance and the efficacy of fluconazole and milbemycin oxim combination against Candida parapsilosis clinical isolates from Brazil and Turkey (2022)

      Artigo publicado

      Autores: DANESHNIA, FARNAZ; HILMIO'LU POLAT, SÜLEYHA; ILKIT, MACIT; SHOR, ERIKA; DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO NOBREGA; FAVARELLO, LARISSA M.; Arnaldo Lopes Colombo; ARASTEHFAR, AMIR; PERLIN, DAVID S.

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Fungal Biology , v. 3 , p. 1

    • Determinants of fluconazole resistance and echinocandin tolerance in C. parapsilosis isolates causing a large clonal candidemia outbreak among COVID-19 patients in a Brazilian ICU (2022)

      Artigo publicado

      Autores: DANESHNIA, FARNAZ; BUTLER, GERALDINE; PERLIN, DAVID S.; Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO N.; ARASTEHFAR, AMIR; LOMBARDI, LISA; SHOR, ERIKA; MORENO, LIS; VERENA MENDES, ANA; GORETH BARBERINO, MARIA; THOMAZ YAMAMOTO, DANILO

      Conteúdo completo

      Fonte: Emerging Microbes & Infections , v. 11 , p. 2264 - Extrato QUALIS: A1

    • Quandaries of deciding when to change first-line therapy in invasive pulmonary aspergillosis (2022)

      Artigo publicado

      Autores: Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA, JOÃO N; LEWIS, RUSSELL E; KONTOYIANNIS, DIMITRIOS P

      Fonte: JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY , v. 77 , p. 2897 - Extrato QUALIS: A1

    • ERG11 Analysis among Clinical Isolates of Trichosporon asahii with Different Azole Susceptibility Profiles (2022)

      Artigo publicado

      Autores: NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO; JIMENEZ-ORTIGOSA, CRISTINA; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; Arnaldo Lopes Colombo; PERLIN, DAVID S.

      Conteúdo completo

      Fonte: ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY , v. 66 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1


    2021


    • Surveillance of post-cataract endophthalmitis at a tertiary referral center: a 10-year critical evaluation (2021)

      Artigo publicado

      Autores: KATO, JULIANA MIKA; TANAKA, TATIANA; DE OLIVEIRA, LUIZA MANHEZI SHIN; DE OLIVEIRA, MAURA SALAROLI; ROSSI, FLAVIA; GOLDBAUM, MAURO; PIMENTEL, SERGIO LUIS GIANOTTI; João Nobrega de Almeida Júnior; YAMAMOTO, JOYCE HISAE

      Conteúdo completo

      Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF RETINA AND VITREOUS , v. 7 , p. 14 - Extrato QUALIS: A2

    • Breakthrough Candidemia in Pediatric Patients With Cancer From a Brazilian Center (2021)

      Artigo publicado

      Autores: BARRIENTOS, ANNA CARLOTA MOTT; BÁRBARO DEL NEGRO, GILDA MARIA; YAMAMOTO THOMAZ, DANILO; SOUSA MARQUES, HELOISA HELENA; João Nobrega de Almeida Júnior; LITVINOV, NADIA; BAIN, VERA; CRISTOFANI, LILIAN MARIA; BADUE PEREIRA, MARIA FERNANDA; SANSON YOSHINO DE PAULA, CAMILA; LOPES MOTTA, ADRIANA; ROSSI, FLAVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: PEDIATRIC INFECTIOUS DISEASE JOURNAL , v. 40 , p. 251 - Extrato QUALIS: A2

    • Environmental Clonal Spread of Azole-Resistant Candida parapsilosis with Erg11-Y132F Mutation Causing a Large Candidemia Outbreak in a Brazilian Cancer Referral Center (2021)

      Artigo publicado

      Autores: THOMAZ, DANILO Y.; MOTTA, ADRIANA L.; ROSSI, FLÁVIA; PERLIN, DAVID S.; FREIRE, MARISTELA P.; ABDALA, EDSON; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior; SEJAS, ODELI N. E.; DEL NEGRO, GILDA M. B.; CARVALHO, GABRIELLE O. M. H.; GIMENES, VIVIANE M. F.; DE SOUZA, MARIA EMILIA B.; ARASTEHFAR, AMIR; CAMARGO, CARLOS H.

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF FUNGI , v. 7 , p. 259 - Extrato QUALIS: A2

    • Emergence of Candida auris in Brazil in a COVID-19 Intensive Care Unit (2021)

      Artigo publicado

      Autores: DE ALMEIDA, JOÃO N.; Arnaldo Lopes Colombo; FRANCISCO, ELAINE C.; HAGEN, FERRY; BRANDÃO, IGOR B.; PEREIRA, FELICIDADE M.; PRESTA DIAS, PEDRO H.; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDÃO, REGIANE T.; DE GROOT, THEUN

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF FUNGI , v. 7 , p. 220 - Extrato QUALIS: A2

    • Trichosporon asahii superinfections in critically ill COVID-19 patients overexposed to antimicrobials and corticosteroids (2021)

      Artigo publicado

      Autores: NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO; MORENO, LIS; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; NORONHA MARQUES, GABRIELA; MENDES, ANA VERENA; BARBERINO, MARIA GORETH; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: MYCOSES , v. 64 , p. 817 - Extrato QUALIS: A1

    • Epidemiology, clinical aspects, outcomes and prognostic factors associated with fungaemia: results of an international multicentre study carried out at 23 medical centres (2021)

      Artigo publicado

      Autores: NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO; MARANHÃO CHAVES, GUILHERME; GRASSI DE MIRANDA, BIANCA; ARAÚJO MOTTA, FABIO; VARGAS SCHWARZBOLD, ALEXANDRE; OLIVEIRA, MÁRCIO; RIERA, FERNANDO; SARDI PEROZIN, JAMILE; PEREIRA NEVES, REJANE; FRANÇA E. SILVA, IVAN LEONARDO A; SZTAJNBOK, JAQUES; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; Arnaldo Lopes Colombo; HOLGUÍN RUIZ, ALEXIS; CUÉLLAR, LUIS E; RODRIGUES AQUINO, VALÉRIO; VERENA MENDES, ANA; QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO; SANTOS, DANIEL WAGNER; GUIMARÃES, THAIS

      Fonte: JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY , v. 1 , p. 1-10 - Extrato QUALIS: A1

    • Nanopore Genome Sequencing and Variant Analysis of the Susceptible Candida auris Strain L1537/2020, Salvador, Brazil (2021)

      Artigo publicado

      Autores: DE JONG, AUKE W.; Arnaldo Lopes Colombo; HAGEN, FERRY; FRANCISCO, ELAINE C.; DE ALMEIDA, JOÃO NÓBREGA; BRANDÃO, IGOR B.; PEREIRA, FELICIDADE M.; DIAS, PEDRO H. PRESTA; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDÃO, REGIANE T.; VU, DUONG

      Conteúdo completo

      Fonte: MYCOPATHOLOGIA , v. 186 , p. 883 - Extrato QUALIS: A3

    • Axillary Digital Thermometers uplifted a multidrug-susceptible Candida auris outbreak among COVID-19 patients in Brazil (2021)

      Artigo publicado

      Autores: NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO; SOUZA JORDÃO, REGIANE T.; MEIS, JACQUES F.; Arnaldo Lopes Colombo; FAVARELLO, LARISSA M; LIMA, SORAIA L.; LIMA, RICARDO; MIRANDA, ISMAIANE OLIVEIRA; JESUS LOPES, TAMARA L.; SOARES DA SILVA, DANNIELY C.; MOURA, LILIAN NOBRE; BRANDÃO, IGOR B.; RIBEIRO, LAÍSSE C.; FRANCISCO, ELAINE C.; ALMEIDA, SILVIO LUIS R.; OLIVEIRA DIAS, PATRÍCIA; PEREIRA, FELICIDADE M.; SANTOS FERREIRA, FÁBIO; ANDRADE, THAISSE SOUZA; MIRANDA COSTA, MAGDA M.

      Conteúdo completo

      Fonte: MYCOSES , v. 64 , p. 1062 - Extrato QUALIS: A1

    • Multidrug-resistant Trichosporon species: underestimated fungal pathogens posing imminent threats in clinical settings (2021)

      Artigo publicado

      Autores: ARASTEHFAR, AMIR; DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO N.; PERLIN, DAVID S.; ILKIT, MACIT; BOEKHOUT, TEUN; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: CRITICAL REVIEWS IN MICROBIOLOGY , v. 47 , p. 679 - Extrato QUALIS: A1

    • Clonal Candidemia Outbreak by Candida parapsilosis Carrying Y132F in Turkey: Evolution of a Persisting Challenge (2021)

      Artigo publicado

      Autores: ARASTEHFAR, AMIR; João Nobrega de Almeida Júnior; ILKIT, MACIT; PERLIN, DAVID S.; LASS-FLÖRL, CORNELIA; HILMIO'LU-POLAT, SULEYHA; DANESHNIA, FARNAZ; PAN, WEIHUA; HAFEZ, AHMED; FANG, WENJIE; LIAO, WANQING; 'AHBUDAK-BAL, ZÜMRÜT; METIN, DILEK YE'IM

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 11 , p. 676177 - Extrato QUALIS: A2

    • How different is invasive fusariosis in pediatric patients than in adults? A systematic review (2021)

      Artigo publicado

      Autores: ROSSATO, LUANA; CARLESSE, FABIANNE; NOBREGA DE ALMEIDA, JOÃO; KONTOYIANNIS, DIMITRIOS P.; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: CURRENT OPINION IN INFECTIOUS DISEASES , v. 34 , p. 619 - Extrato QUALIS: A1

    • Global guideline for the diagnosis and management of rare yeast infections: an initiative of the ECMM in cooperation with ISHAM and ASM (2021)

      Artigo publicado

      Autores: CHEN, SHARON C-A; GILROY, NICOLE; LASS-FLÖRL, CORNELIA; Ostrosky-Zeichner, Luis; PAGANO, LIVIO; PAPP, TAMAS; RAUTEMAA-RICHARDSON, RIINA; SALMANTON-GARCÍA, JON; SPEC, ANDREJ; STEINMANN, JOERG; ARIKAN-AKDAGLI, SEVTAP; PERFECT, JOHN; ARENZ, DOROTHEE E; Arnaldo Lopes Colombo; CORNELY, OLIVER A; GROLL, ANDREAS H; SEIDEL, DANILA; ALBUS, KERSTIN; DE ALMEDIA, JOAO N; GARCIA-EFFRON, GUILLERMO

      Conteúdo completo

      Fonte: LANCET INFECTIOUS DISEASES , v. 21 , p. e375 - Extrato QUALIS: A1

    • How a discerning cytological examination can aid in the diagnosis of infectious diseases: case reports (2021)

      Artigo publicado

      Autores: FARIA, D.K.; João Nobrega de Almeida Júnior; FARIA, C.S.; DURANTE, B.; FALASCO, B.F.; TERRERI NETO, E.; ANTONANGELO, L.

      Conteúdo completo

      Fonte: Brazilian Journal of Medical and Biological Research (on line) , v. 54 , p. e10462 - Extrato QUALIS: A3


    2020


    • Lack of efficacy of echinocandins against high metabolic activity biofilms of Candida parapsilosis clinical isolates (2020)

      Artigo publicado

      Autores: THOMAZ, DANILO YAMAMOTO; MELHEM, MARCIA DE SOUZA CARVALHO; João Nobrega de Almeida Júnior; BENARD, GIL; DEL NEGRO, GILDA MARIA BARBARO

      Conteúdo completo

      Fonte: BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 51 , p. 1129 - Extrato QUALIS: A2

    • Diagnostic performance of the Xpert Carba-R- assay directly from rectal swabs for active surveillance of carbapenemase-producing organisms in the largest Brazilian University Hospital (2020)

      Artigo publicado

      Autores: CURY, ANA PAULA; João Nobrega de Almeida Júnior; COSTA, SILVIA F.; SALOMÃO, MATIAS C.; BOSZCZOWSKI, ÍCARO; DUARTE, ALBERTO J.S.; ROSSI, FLÁVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS , v. 171 , p. 105884 - Extrato QUALIS: B1

    • Increasing Prevalence of Multidrug-Resistant Candida haemulonii Species Complex among All Yeast Cultures Collected by a Reference Laboratory over the Past 11 Years (2020)

      Artigo publicado

      Autores: LIMA, SORAIA LOPES; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; DE ALMEIDA JÚNIOR, JOÃO NÓBREGA; SANTOS, DANIEL WAGNER DE CASTRO LIMA; CARLESSE, FABIANE; QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO; MELO, ANALY SALLES DE AZEVEDO; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF FUNGI , v. 6 , p. 110 - Extrato QUALIS: A2

    • Correlation of Trichosporon asahii Genotypes with Anatomical Sites and Antifungal Susceptibility Profiles: Data Analyses from 284 Isolates Collected in the Last 22 Years across 24 Medical Centers (2020)

      Artigo publicado

      Autores: FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; HAHN, ROSANE C.; CHAVES, GUILHERME M.; Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA JUNIOR, JOÃO N.; QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO; AQUINO, VALÉRIO RODRIGUES; MENDES, ANA VERENA A.; DE OLIVEIRA SILVA, MARCIO; CASTRO, PAULO DE TARSO O. E; GUIMARÃES, THAIS; PONZIO, VINICIUS

      Conteúdo completo

      Fonte: ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY , v. 65 , p. AAC.01104-20 - Extrato QUALIS: A1

    • Novos Desafios para o estudo das infecções por fungos (2020)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Boas Práticas em Laboratório Clínico , p. 304


    2019


    • Lung Phaeohyphomycosis Mimiking ANCA-Associated Vasculitis. (2019)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Ayrosa RS; João Nobrega de Almeida Júnior; Costa NA

      Fonte: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine , p. 6890

    • Clinical Characteristics, outcome, and management of Staphylococcus epidermidis endophthalmitis. (2019)

      Trabalhos em eventos

      Autores: TANAKA, TATIANA; KATO, JULIANA MIKA; João Nobrega de Almeida Júnior; YAMAMOTO, JOYCE HISAE

      Fonte: Investigative Ophthalmology & Visual Sciences , p. 2027

    • Trends in Pathogens and antibiotic resistance of corneal culture isolates in infectious keratitis in São Paulo (2019)

      Trabalhos em eventos

      Autores: TANAKA, TATIANA; Juliana Mika Kato; João Nobrega de Almeida Júnior; Miyuki SAnto, R

      Fonte: Investigative Ophthalmology & Visual Sciences , p. 855

    • Paracoccidioidomycosis in Immunocompromised Patients: A Literature Review (2019)

      Artigo publicado

      Autores: DE ALMEIDA JR., JOÃO; PEÇANHA-PIETROBOM, PAULA; Arnaldo Lopes Colombo

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Fungi , v. 5 , p. 2 - Extrato QUALIS: A2

    • Diagnostic value of pediatric blood culture bottles for acute postoperative endophthalmitis (2019)

      Artigo publicado

      Autores: TANAKA, TATIANA; João Nobrega de Almeida Júnior; FERREIRA, BRUNO FORTALEZA DE AQUINO; OLIVEIRA, LUIZA MANHEZI SHIN DE; KATO, JULIANA MIKA; GIOIA, THAIS SABATO ROMANO DI; ROSSI, FLAVIA; NAKASHIMA, YOSHITAKA; PIMENTEL, SERGIO LUIS GIANOTTI; YAMAMOTO, JOYCE HISAE

      Fonte: Clinics , v. 74 , p. e837 - Extrato QUALIS: A4

    • Species distribution and antifungal susceptibility of 358 Trichosporon clinical isolates collected in 24 medical centres (2019)

      Artigo publicado

      Autores: FRANCISCO, E.C.; Ana Carolina B. Padovan; CHAVES, G.M.; Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA JUNIOR, J.N.; DE QUEIROZ TELLES, F.; AQUINO, V.R.; MENDES, A.V.A.; DE ANDRADE BARBERINO, M.G.M.; DE TARSO O. CASTRO, P.; GUIMARÃES, T.; HAHN, R.C.

      Conteúdo completo

      Fonte: CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION , v. 25 , p. 909.e1 - Extrato QUALIS: A1

    • Polysaccharide diversity in VNI isolates of Cryptococcus neoformans from Roraima, Northern Brazil (2019)

      Artigo publicado

      Autores: DAL PUPO, HALAN D.; SENA, BIANCA A.G.; REIS, FLAVIA C.G.; MACHADO, LUMENA; FORTES, SILVANA T.; João Nobrega de Almeida Júnior; GODINHO, RODRIGO M.C.; RODRIGUES, MARCIO L.

      Conteúdo completo

      Fonte: Fungal Biology , v. 123 , p. 699 - Extrato QUALIS: A2

    • Trichosporon (2019)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Pocket Guide to Mycological Diagnosis , p. 1


    2018


    • Molecular Identification, genotyping and Antifungal susceptibility of 500 clinical isolates of Trichosporon spp. from different Brazilian Medical Centers. (2018)

      Trabalhos em eventos

      Autores: FRANCISCO, ELAINE C.; PADOVAN, A.C.B.; João Nobrega de Almeida Júnior; COLOMBO, A L

      Fonte: Medical Mycology , p. 116

    • Visual Prognosis in infectious endophthalmitis based on rapid identification of etiologic agent by MALDI-TOF. (2018)

      Trabalhos em eventos

      Autores: TANAKA, TATIANA; Flavia Rossi; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Investigative Ophthalmology & Visual Sciences , p. 4426

    • Candida blankii: an emergent opportunistic yeast with reduced susceptibility to antifungals (2018)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; ROSSI, FLÁVIA; BENARD, GIL; CAMPOS, SILVIA V.; THOMAZ, DANILO Y.; THOMAZ, LUCIANA; DE ALMEIDA, RENATO K. G.; DEL NEGRO, GILDA M. B.; GIMENES, VIVIANE F.; GRENFELL, RAFAELLA C.; MOTTA, ADRIANA L.

      Conteúdo completo

      Fonte: Emerging Microbes & Infections , v. 7 , p. 1 - Extrato QUALIS: A1

    • Lomentospora prolificans fungemia in hematopoietic stem cell transplant patients: First report in South America and literature review (2018)

      Artigo publicado

      Autores: PENTEADO, FERNANDO D.; MARQUES, HELOISA HELENA S.; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior; LITVINOV, NADIA; SZTAJNBOK, JAQUES; THOMAZ, DANILO Y.; DOS SANTOS, ANTONIO M.; VASCONCELOS, DEWTON M.; MOTTA, ADRIANA L.; ROSSI, FLÁVIA; FERNANDES, JULIANA F.

      Conteúdo completo

      Fonte: Transplant Infectious Disease , v. 4 , p. e12908 - Extrato QUALIS: A4

    • Colistin susceptibility testing and Vitek-2-: is it really useless? (2018)

      Artigo publicado

      Autores: GIRARDELLO, RAQUEL; CURY, ANA PAULA; FRANCO, MARIA RENATA GOMES; DI GIÓIA, THAIS ROMANO; João Nobrega de Almeida Júnior; DE ARAÚJO, MARIA RITA ELMOR; DA SILVA DUARTE, ALBERTO JOSÉ; ROSSI, FLAVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE , v. 91 , p. 309 - Extrato QUALIS: A4

    • Chronic Meningitis and Hydrocephalus due to Sporothrix brasiliensis in Immunocompetent Adults: A Challenging Entity (2018)

      Artigo publicado

      Autores: MIALSKI, RAFAEL; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior; DA SILVA, LARISSA HONORATO; KONO, ADRIANA; PINHEIRO, ROSANGELA LAMEIRA; TEIXEIRA, MANOEL JACOBSEN; GOMES, RENATA RODRIGUES; DE QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO; PINTO, FERNANDO GOMES

      Fonte: OPEN FORUM INFECTIOUS DISEASES , v. 5 , p. 081 - Extrato QUALIS: A3

    • An Azole-Resistant Candida parapsilosis Outbreak: Clonal Persistence in the Intensive Care Unit of a Brazilian Teaching Hospital (2018)

      Artigo publicado

      Autores: THOMAZ, DANILO YAMAMOTO; João Nobrega de Almeida Júnior; LIMA, GLAUCIA MOREIRA ESPINDOLA; NUNES, MAÍNA DE OLIVEIRA; CAMARGO, CARLOS HENRIQUE; GRENFELL, RAFAELLA DE CARVALHO; BENARD, GIL; DEL NEGRO, GILDA M. B.

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Microbiology , v. 9 , p. 02997 - Extrato QUALIS: A2

    • Evaluation of Vitek MS- for the differentiation of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii genotypes (2018)

      Artigo publicado

      Autores: MACHADO SIQUEIRA, LUMENA P.; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior; FAVERO GIMENES, VIVIANE M.; DE FREITAS, ROSELI SANTOS; DE SOUZA CARVALHO MELHEM, MÁRCIA; BONFIETTI, LUCAS XAVIER; DA SILVA, AFONSO RAFAEL; SOUZA SANTOS, LETÍCIA B.; MOTTA, ADRIANA L.; ROSSI, FLAVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY , v. 57 , p. e01282 - Extrato QUALIS: A1

    • Identification of pathogenic and nonpathogenic Leptospira species of Brazilian isolates by Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization and Time Flight mass spectrometry (2018)

      Artigo publicado

      Autores: KARCHER, DANIEL; GRENFELL, RAFAELLA C.; MORENO, ANDREA MICKE; MORENO, LUISA ZANOLLI; VASCONCELLOS, SILVIO ARRUDA; HEINEMANN, MARCOS B.; João Nobrega de Almeida Júnior; JULIANO, LUIZ; JULIANO, MARIA A.

      Conteúdo completo

      Fonte: BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 49 , p. 900 - Extrato QUALIS: A2


    2017


    • Bactec- blood culture bottles allied to MALDI-TOF mass spectrometry: rapid etiologic diagnosis of bacterial endophthalmitis (2017)

      Artigo publicado

      Autores: TANAKA, TATIANA; OLIVEIRA, LUIZA MANHEZI DE FREITAS; FERREIRA, BRUNO FORTALEZA DE AQUINO; KATO, JULIANA MIKA; ROSSI, FLAVIA; CORREA, KAROLINE DE LEMES GIUNTINI; PIMENTEL, SERGIO LUIS GIANOTTI; YAMAMOTO, JOYCE HISAE; João Nobrega de Almeida Júnior

      Conteúdo completo

      Fonte: DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE , v. 88 , p. 222 - Extrato QUALIS: A4

    • Evaluating and Improving Vitek MS for Identification of Clinically Relevant Species of Trichosporon and the Closely Related Genera Cutaneotrichosporon and Apiotrichum (2017)

      Artigo publicado

      Autores: DE ALMEIDA, JOÃO N.; ROSSI, FLAVIA; FAVERO GIMENES, VIVIANE M.; FRANCISCO, ELAINE C.; MACHADO SIQUEIRA, LUMENA P.; GONÇALVES DE ALMEIDA, RENATO K.; GUITARD, JULIETTE; HENNEQUIN, CHRISTOPHE; Arnaldo Lopes Colombo; BENARD, GIL

      Conteúdo completo

      Fonte: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY , v. 55 , p. 2439 - Extrato QUALIS: A1

    • Candida and invasive mould diseases in non-neutropenic critically ill patients and patients with haematological cancer (2017)

      Artigo publicado

      Autores: Arnaldo Lopes Colombo; DE ALMEIDA JÚNIOR, J N; SLAVIN, MONICA A; CHEN, SHARON C-A; SORRELL, TANIA C

      Conteúdo completo

      Fonte: LANCET INFECTIOUS DISEASES , v. 17 , p. e-344 - Extrato QUALIS: A1

    • Emerging multidrug-resistant Candida species (2017)

      Artigo publicado

      Autores: Arnaldo Lopes Colombo; JÚNIOR, JOÃO N. DE ALMEIDA; GUINEA, JESUS

      Conteúdo completo

      Fonte: CURRENT OPINION IN INFECTIOUS DISEASES , v. 30 , p. 528 - Extrato QUALIS: A1

    • Emergence of Trichosporon mycotoxinivorans (Apiotrichum mycotoxinivorans) invasive infections in Latin America (2017)

      Artigo publicado

      Autores: ALMEIDA JR, JOÃO NOBREGA DE; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; BARBERINO, MARIA GORETH M DE ANDRADE; SILVA FILHO, LUIZ VICENTE RIBEIRO F DA; BRANDÃO, ORIANA M; Arnaldo Lopes Colombo; PADOVAN, ANA CAROLINA BARBOSA

      Conteúdo completo

      Fonte: MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ , v. 112 , p. 719 - Extrato QUALIS: A4

    • Epidemiology and prognostic factors of invasive trichosporonosis: alarming findings from a multicenter cohort study involving 12 tertiary care centers from Brazil (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; H M P Morales; J S Perozin; F Carlesse; M G Lucca Oliveira; A L Colombo; F Q Telles-Filho; V R Aquino-Vaquino; A V Mendes; E C Francisco; Flavia Rossi; G M Chaves; Thaís Guimarães; F A Motta

      Fonte: Mycoses , p. 44

    • BactecTM blood culture bottles allied do MALD-TOF mass spectrometry: Rapid etiologic disgnosis of bacterial endophthalmitis (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: TANAKA, TATIANA; Luiza Mannhezi de Freitas Oliveira; Bruno Fortaleza de Aquino Ferreira; Juliana Mika Kato; Flávia Rossi; Karoline Giuntini Correa; Sergio Luis Gianotti Pimentel; YAMAMOTO, JOYCE HISAE; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Programs & Abstract

    • Positividade e etiologia dos fungos isolados biópsias ? Ajuste de procedimento técnico e aumento de sensibilidade (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Adriana Lopes Motta; João Nobrega de Almeida Júnior; Afonso Rafael da Silva Júnior; Maria Isabel da Cunha Pinto; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Abstracts

    • Avaliação de um fluxo para identificação rápida de BLAKPC por GENEXPERT® diretamente de frascos de hemocultura positivas (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Renata Gomes Franco; Ana Paula Cury; Karoline Giuntini Correa; João Nobrega de Almeida Júnior; R Girardello; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Abstracts

    • Fungos em urina - positividade e distribuíção das principais epécies isoladas em urina em um complexo de 10 hospitais públicos em 2016 (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Adriana Lopes Motta; João Nobrega de Almeida Júnior; Afonso Rafael da Silva Júnior; Maria Isabel da Cunha Pinto; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Abstracts

    • Ocorrência de candida em hemocultura ? dados de um complexo hospitalar público, universitário de 10 hospitais de 1996-2016 (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Adriana Lopes Motta; João Nobrega de Almeida Júnior; Afonso Rafael da Silva Júnior; Maria Isabel da Cunha Pinto; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Anstracts

    • Fusariose em pacientes oncológicos (2017)

      Trabalhos em eventos

      Autores: RAQUEL KEIKO DE LUCA ITO; Patricia Rodrigues Bonazzi; Lígia Camera Pierrotti; Michely Fernandes Vieira; Juliana Pereira; João Nobrega de Almeida Júnior; Lucas Xavier Bonfietti; Dulcilena Matos Castro Silva; Marcia S. Carvalho Melhem; Edson Abdala

      Fonte: Programs & Abstracts


    2016


    • Rhizopus arrhizus and Fusarium solani Concomitant Infection in an Immunocompromised Host (2016)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; ROSSI, FLÁVIA; PIERROTTI, LIGIA C.; FREIRE, MARISTELA P.; BELLESSO, MARCELO; PEREIRA, JULIANA; ABDALA, EDSON; BENARD, GIL; IBRAHIM, KARIM Y.; DEL NEGRO, GILDA M. B.; BEZERRA, EVANDRO D.; DUARTE NETO, AMARO N.; BATISTA, MARJORIE V.; SICILIANO, RINALDO F.; GIUDICE, MAURO C.; MOTTA, ADRIANA L.

      Conteúdo completo

      Fonte: Mycopathologia (1975. Print) , v. 181 , p. 125 - Extrato QUALIS: A3

    • Candida haemulonii Complex Species, Brazil, January 2010-March 2015 (2016)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; PIERROTI, LIGIA CAMARA; STRABELLI, TANIA; MUNHOZ, ANA LUCIA; ROSSI, FLÁVIA; BENARD, GIL; ASSY, JOÃO GUILHERME PONTES LIMA; LEVIN, ANNA S.; DEL NEGRO, GILDA M.B.; GIUDICE, MAURO C.; TRINGONI, MARCELA PULLICE; THOMAZ, DANILO YAMAMOTO; MOTTA, ADRIANA LOPES; ABDALA, EDSON

      Conteúdo completo

      Fonte: EMERGING INFECTIOUS DISEASES , v. 22 , p. 561 - Extrato QUALIS: A1

    • Rapid identification of moulds and arthroconidial yeasts from positive blood cultures by MALDI-TOF mass spectrometry (2016)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; ROSSI, FLÁVIA; BENARD, GIL; SZTAJNBOK, JAQUES; DA SILVA JUNIOR, AFONSO RAFAEL; VIEIRA, VINICIUS ADRIANO; GALASTRI, ANNE LAYZE; BISSOLI, LEANDRO; LITVINOV, NADIA; DEL NEGRO, GILDA MARIA BARBARO; MOTTA, ADRIANA LOPES

      Fonte: Medical Mycology (Oxford. Print) , v. 17 , p. myw044 - Extrato QUALIS: A1

    • Invasive Trichosporon Infection: a Systematic Review on a Re-emerging Fungal Pathogen (2016)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; christophe

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Microbiology , v. 7 , p. 1629 - Extrato QUALIS: A2

    • Emergence of colistin resistance in the largest university hospital complex of São Paulo, Brazil, over five years (2016)

      Artigo publicado

      Autores: ROSSI, FLÁVIA; GIRARDELLO, RAQUEL; CURY, ANA PAULA; GIOIA, THAIS SABATO ROMANO DI; João Nobrega de Almeida Júnior; DUARTE, ALBERTO JOSÉ DA SILVA

      Conteúdo completo

      Fonte: Brazilian Journal of Infectious Diseases , v. 21 , p. 98 - Extrato QUALIS: B1

    • Trichosporon Infection in lung transplant patients: An emerging fungal infection (2016)

      Trabalhos em eventos

      Autores: S V Campos; P M Pêgo-Fernandes; João Nobrega de Almeida Júnior; M N Samano; R M Carraro; A N Costa; R O Teixeira; J Afonso-Junior; P L Camargo; L Abdalla

      Fonte: The Journal of Heart and Lung Transplantation , p. S307

    • Detailed MALDI-TOF mass spectrometry analysis for the discrimination of candida haemulonii complex species (2016)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; R C Grenfell; A Da Silva Júnior; Gilda M.B. del Negro; Adriana Lopes Motta; R Botelho Munhoz; Flavia Rossi; L Juliano-Neto; G Bernard

      Fonte: Journal de Mycologie Médicale , p. e14

    • Identification of Candida haemulonii Complex Species: Use of ClinProToolsTM to Overcome Limitations of the Bruker BiotyperTM, VITEK MSTM IVD, and VITEK MSTM RUO Databases (2016)

      Artigo publicado

      Autores: GRENFELL, RAFAELLA C.; JULIANO, LUIZ; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior; DA SILVA JUNIOR, AFONSO R.; DEL NEGRO, GILDA M. B.; MUNHOZ, REGINA B.; GIMENES, VIVIANE M. F.; ASSIS, DIEGO M.; ROCKSTROH, ANNA C.; MOTTA, ADRIANA L.; ROSSI, FLAVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: Frontiers in Microbiology (Online) , v. 7 , p. 940 - Extrato QUALIS: A2


    2015


    • Trichosporon inkin as an Emergent Pathogen in Patients With Severe Pemphigus (2015)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; GIULI SANTI, CLAUDIA; BENARD, GIL; BUCCHERI DE OLIVEIRA, RENATA; DUARTE, AMARO; LOPES MOTTA, ADRIANA; ROSSI, FLÁVIA; SACHIKO YAMAMOTO DE FIGUEIREDO, DULCE; BARBARO DEL NEGRO, GILDA MARIA; AOKI, VALERIA; WAKISAKA MARUTA, CELINA

      Conteúdo completo

      Fonte: JAMA Dermatology , v. 151 , p. 642 - Extrato QUALIS: A1

    • Streptococcus pyogenes strains in Sao Paulo, Brazil: molecular characterization as a basis for StreptInCor coverage capacity analysis (2015)

      Artigo publicado

      Autores: FRESCHI DE BARROS, SAMAR; KALIL, JORGE; GUILHERME, LUIZA; DE AMICIS, KARINE MARAFIGO; ALENCAR, RAQUEL; SMEESTERS, PIERRE ROBERT; TRUNKEL, ARIEL; POSTÓL, EDILBERTO; ALMEIDA JUNIOR, JOÃO NÓBREGA; ROSSI, FLAVIA; Antonio Carlos Campos Pignatari

      Conteúdo completo

      Fonte: BMC Infectious Diseases (Online) , v. 15 , p. 308 - Extrato QUALIS: A3

    • Variation in the polysaccharide capsule size interferes with indentification of cryptococcus neoformans and C. gattii by MALDI-TOF mass spectrometry (2015)

      Trabalhos em eventos

      Autores: THOMAZ, DANILO Y.; M S M Vidal; R C Grenfell; M C Giudice; JULIANO NETO, LUIZ; G Bernard; G M B Del-Negro; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Mycoses , p. 220

    • Infections invasive à Trichosporon : étude rétrospective française sur 10ans (2004?2013) (2015)

      Trabalhos em eventos

      Autores: christophe; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Journal de Mycologie Médicale , p. 229

    • The influence of antifungal prophylaxis in invasive Fungal infections in liver transplantation (2015)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Alice Tung Wan Song; João Nobrega de Almeida Júnior; Maristela Freire; Adriana Proença; Luciana Haddad; Luiz A C Albuquerque; Edson Abdala; Luciana Becker Mau

      Fonte: Transplatation , p. 276

    • Does the capsule interfere with the performance of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of Cryptococcus neoformans/C.gattii species? (2015)

      Artigo publicado

      Autores: THOMAZ, DANILO Y.; GRENFELL, RAFAELLA C.; VIDAL, MONICA S. M.; GIUDICE, MAURO C.; DEL NEGRO, GILDA M. B.; JULIANO, LUIZ; BENARD, GIL; João Nobrega de Almeida Júnior

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology (Print) , v. 54 , p. JCM.02635-15 - Extrato QUALIS: A1

    • MALDI-TOF mass spectrometry for rapid identification of the dimorphic fungi Paracoccidioides brasiliensis and Paracoccidioides lutzii (2015)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; DEL NEGRO, GILDA M. B.; GRENFELL, RAFAELLA C.; VIDAL, MONICA S. M.; THOMAZ, DANILO Y.; DE FIGUEIREDO, DULCE S. Y.; BAGAGLI, EDUARDO; JULIANO NETO, LUIZ; BENARD, GIL

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology (Print) , v. 53 , p. JCM.02847-14 - Extrato QUALIS: A1


    2014


    • Usefulness of matrix-assisted laser desorption ionisation-time-of-flight mass spectrometry for identifying clinical Trichosporon isolates (2014)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; ANGOULVANT, A.; MAZIER, D.; Gil Benard; HENNEQUIN, C.; Dulce Sachiko Yamamoto de Figueiredo; TOUBAS, D.; DEL NEGRO, G. M. B.; MOTTA, A. L.; Rossi, F.; GUITARD, J.; MORIO, F.; BAILLY, E.

      Conteúdo completo

      Fonte: CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION , v. 20 , p. n/a - Extrato QUALIS: A1

    • Invasive Trichosporon infection in solid organ transplant patients: a report of two cases identified using IGS1 ribosomal DNA sequencing and a review of the literature (2014)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Gil Benard; HENNEQUIN, C.; SONG, A.T.W.; CAMPOS, S.V.; STRABELLI, T.M.V.; DEL NEGRO, G.M.; FIGUEIREDO, D.S.Y.; Adriana; Rossi, F.; GUITARD, J.

      Conteúdo completo

      Fonte: Transplant Infectious Disease (Print) , v. 16 , p. 135 - Extrato QUALIS: A4

    • INCIDENCE OF DIARRHEA BY Clostridium difficile IN HEMATOLOGIC PATIENTS AND HEMATOPOIETIC STEM CELL TRANSPLANTATION PATIENTS: RISK FACTORS FOR SEVERE FORMS AND DEATH (2014)

      Artigo publicado

      Autores: SPADÃO, FERNANDA; GERHARDT, JULIANA; GUIMARÃES, THAIS; DULLEY, FREDERICO; João Nobrega de Almeida Júnior; BATISTA, MARJORIE VIEIRA; SHIKANAI-YASUDA, MARIA APARECIDA; LEVIN, ANNA SARA; COSTA, SILVIA FIGUEIREDO

      Conteúdo completo

      Fonte: Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (Impresso) , v. 56 , p. 325 - Extrato QUALIS: B1

    • Evaluation of the MALDI-TOF VITEK MS- system for the identification of Candida parapsilosis, C. orthopsilosis and C. metapsilosis from bloodstream infections (2014)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; DE SOUZA, LETÍCIA BONATO; MOTTA, ADRIANA LOPES; ROSSI, FLÁVIA; ROMANO DI GIOIA, THAIS SABATO; BENARD, GIL; DEL NEGRO, GILDA MARIA BARBARO

      Conteúdo completo

      Fonte: Journal of Microbiological Methods , v. 105 , p. 105 - Extrato QUALIS: B1

    • Evaluation of VITEK 2 for discriminating Trichosporon species: misidentification of Trichosporon non-T. asahii (2014)

      Artigo publicado

      Autores: DE FIGUEIREDO, DULCE SACHIKO YAMAMOTO; João Nobrega de Almeida Júnior; MOTTA, ADRIANA LOPES; CASTRO E SILVA, DULCILENA MATTOS; SZESZS, MARIA WALDEREZ; DEL NEGRO, GILDA MARIA BARBARO

      Conteúdo completo

      Fonte: Diagnostic Microbiology and Infectious Disease , v. 90 , p. 59 - Extrato QUALIS: A4

    • Espectrometria de Massa MALDI-TOF em laboratório de microbiologia clínica: parâmetros e conceitos pré e pós analíticos úteis para a rotina (2014)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Recomendações da Sociedade Brasileira de Patologia Clínica/Medicina Laboratorial (SBPC/ML) , p. 153


    2013


    • Typage par séquençage multilocus de souches de Trichosporon mucoides et Trichosporon dermatis (2013)

      Trabalhos em eventos

      Autores: S Hennequin; Gil Benard; João Nobrega de Almeida Júnior; Dominique Toubas; Gilda M.B. del Negro; F Morio; ANGOULVANT, A.; J Chandenier; DE FIGUEIREDO, DULCE S. Y.; Juliette Guitard

      Fonte: Journal de Mycologie Médicale , p. 207

    • Avaliação do teste de hodge modificado na detecção de KPC em amostras clínicas do grupo CESP isoladas em hospitais universitários (2013)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Flavia Rossi; Ana Paula Cury; Thais Sabato Romano Di-Gioia; Andre Mario Doi; Maria Renata Gomes Franco; Márcia Maffucci; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Braz J Infect Dis

    • Candida dubliniensis em hemocultura: situação HC-FMUSP e identificação por espectrometria de massa MALDI-TOF vitek MS® (2013)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Claudio Campos do Porto; Flavia Rossi; Adriana Lopes Motta; Luciane Sarahyba da Silva; Hélio Hehl Caiaffa Filho; Thais Sabato Romano Di-Gioia; Andre Mario Doi; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases , p. 35

    • Comparação entre espectrometria de massa MALDI-TOF versus métodos convencionais para identificação de leveduras (2013)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Thais Sabato Romano Di-Gioia; Débora; Maria Renata Gomes Franco; Ana Paula Cury; Adriana Lopes Motta; Andre Mario Doi; João Nobrega de Almeida Júnior; Flavia Rossi

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases , p. 35

    • detecção e caracterização molecular do primeiro S. AUREUS resistente à vancomicina no Brasil (Br-vrsa) (2013)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Flavia Rossi; Lorena Diaz; Thais Sabato Romano Di-Gioia; Denise Brandão; Inneke Marie Van der Heijden; João Nobrega de Almeida Júnior; Andre Mario Doi; Cesar Arias

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases , p. 161


    2012


    • First report of a clinical isolate of Candida haemulonii in Brazil (2012)

      Artigo publicado

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; MOTTA, AL; ROSSI, F; ABDALA, E; PIERROTTI, LC; KONO, AS; DIZ, MD; BENARD, G; DEL NEGRO, GMB

      Fonte: Clinics , v. 67 , p. 1229 - Extrato QUALIS: A4

    • Nosocomial outbreak of Pantoea agglomerans bacteraemia associated with contaminated anticoagulant citrate dextrose solution: new name, old bug? (2012)

      Artigo publicado

      Autores: BOSZCZOWSKI, Í.; SOARES, R.E.; Rossi, F.; COSTA, S.F.; LEVIN, A.S.; João Nobrega de Almeida Júnior; PEIXOTO DE MIRANDA, É.J.; PINHEIRO FREIRE, M.; GUIMARÃES, T.; CHAVES, C.E.; CAIS, D.P.; STRABELLI, T.M.V.; RISEK, C.F.

      Conteúdo completo

      Fonte: The Journal of Hospital Infection , v. 80 , p. 255 - Extrato QUALIS: A2

    • Diferença de tempo de positividade: método útil no diagnóstico de infecção de corrente sanguínea relacionada com cateter? (2012)

      Artigo publicado

      Autores: CORRÊA, KAROLINE DE LEMES GIUNTINI; ALMEIDA, GISELE MADEIRA DUBOC DE; João Nobrega de Almeida Júnior; ROSSI, FLÁVIA

      Conteúdo completo

      Fonte: JORNAL BRASILEIRO DE PATOLOGIA E MEDICINA LABORATORIAL (IMPRESSO) , v. 48 , p. 195 - Extrato QUALIS: B3

    • Application de la spectrométrie de masse MALDI-TOF à l?identification de trichosporon SPP. (2012)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Gil Benard; Dulce Sachiko Yamamoto de Figueiredo; Gilda M.B. del Negro; Adriana Lopes Motta; Flavia Rossi; Juliette Guitard; Dominique Mazier; christophe

      Fonte: Journal de Mycologie Médicale , p. 77


    2011


    • Carbapenem stewardship - positive impact on hospital ecology (2011)

      Artigo publicado

      Autores: Ana Lucia Lima; Priscila Rosalba Oliveira; Ana Paula Paula; K Dal-Paz; João Nobrega de Almeida Júnior; S Cda Felix; Rossi, F.

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , v. 15 , p. 1 - Extrato QUALIS: B1

    • Valor preditivo negativo do teste Hodge modificado na exclusão de enterobactérias produtoras de KPC (2011)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Ana Paula Cury; Débora; Márcia Maffucci; Hélio Hehl Caiaffa Filho; João Nobrega de Almeida Júnior; Flavia Rossi

      Fonte: Programs & Abstract

    • Primeiro caso de bacteremia por enterococcus faecium resistente a linezolida isolado de hemocultura no HC-FMUSP (2011)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Renata Gomes Franco; Débora; João Nobrega de Almeida Júnior; Patricia Rodrigues Bonazzi; Flavia Azevedo Abrantes; Luiz Augusto Carneiro D'Albuquerque; Edson Abdala; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Abastrcts

    • Perfil de suscetibilidade aos antifúngicos de candída SPP de fungemias do Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (2011)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Adriana Lopes Motta; Lígia Camera Pierrotti; Maristela Pinheiro Freire; Karim Yaqub Ibrahim; Adriana Satie Gonçalves Kono Magri; Paulo Marcelo Gehm Hoff; Edson Abdala; Flávia Rossi

      Fonte: Programs & Abstracts

    • Icterícias Febris (2011)

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Alice Tung Wan Song; João Nobrega de Almeida Júnior

      Fonte: Fundamentos de Emergências Clínicas , p. 413


    2010


    • KPC antibiogram in a large teaching Brazilian hospital (2010)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Ana Paula Cury; Márcia Maffucci; Hélio Hehl Caiaffa Filho; José Alberto Duarte; Flavia Rossi

      Fonte: International Journal of Infectious Diseases , p. e42

    • Decreased susceptibility to polymyxins emerging during treatment for carbapenem-resistant enterobacter aero-genes infection (2010)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Hélio Hehl Caiaffa Filho; Ana Paula Cury; Gisele Madeira Duboc de Almeida; D O Garcia; MARCELO NASCIMENTO BURATTINI; Flavia Rossi

      Fonte: International Journal of Infectious Diseases , p. e42

    • Analysis of candidemia epidemiological data and anti-fungigram by distinct methodologies in a large Brazillian teaching hospital (2010)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Adriana; GISELE MADEIRA DUBOC DE ALMEIDA; João Nobrega de Almeida Júnior; M I Pinto; MARCELO NASCIMENTO BURATTINI; Flavia Rossi

      Fonte: International Journal of Infectious Diseases , p. e125

    • Cryptococcus: species distribuition and susceptibility profile of isolates in a teching hospital from São Paulo-Brazil (2010)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Adriana Lopes Motta; Gisele Madeira Duboc de Almeida; João Nobrega de Almeida Júnior; M I Pinto; S Onorio; Flavia Rossi

      Fonte: International Journal of Infectious Diseases , p. e126

    • Candidemia epidemiology and susceptibility profile in the largest Brazilian teaching hospital complex (2010)

      Artigo publicado

      Autores: Adriana Lopes Motta; Gisele Madeira Duboc de Almeida; João Nobrega de Almeida Júnior; Marcelo Nascimento Burattini; Flávia Rossi

      Conteúdo completo

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , v. 14 , p. 441 - Extrato QUALIS: B1


    2009


    • Detecção de Metalo-beta-lactamases entre Pseudomonas aeruginosa isoladas de sangue em um Hospital Universitário de São Paulo (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Renata Gomes Franco; João Nobrega de Almeida Júnior; Luciana Rodrigues; ROSSI, F

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases , p. 74

    • Diagnóstico de Infecção de corrente sanguínea relacionada à cateter: diferença de tempo de positividade entre hemoculturas pareadas (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: CORREA, KAROLINE DE LEMES GIUNTINI; Luciana Rodrigues; João Nobrega de Almeida Júnior; ALMEIDA, GISELE MADEIRA DUBOC DE; ROSSI, F

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases

    • Determinação do perfil de sensibilidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isolada no Hospital das Clínicas de São Paulo - HC-FMUSP (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luciana Rodrigues; CORREA, KAROLINE DE LEMES GIUNTINI; João Nobrega de Almeida Júnior; ROSSI, F

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases

    • Epidemiologia e perfil de suscetibilidade de candidemias do Hospital das Clínicas da FMUSP (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: MOTTA, A. L.; ALMEIDA, GISELE MADEIRA DUBOC DE; João Nobrega de Almeida Júnior; M I Pinto; ROSSI, F

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases

    • Avaliação de metodologias automatizadas e manuais para detecção de Enterobactérias produtoras de carbapenemase KPC (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Ana Paula Cury; João Nobrega de Almeida Júnior; Márcia Maffucci; ROSSI, F

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases

    • ENTEROBACTÉRIAS ISOLADAS EM UROCULTURAS DE PACIENTES AMBULATORIAIS E HOSPITALIZADOS NO HC-FMUSP E PERFIL DE SUSCETIBILIDADE (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior; Rosilaine Arruda Teberges; Rossi, F.

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , p. 74

    • Klebsiella Pneumoniae Produtora de KPC em São Paulo (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Rossi, F.; Márcia Maffucci; João Nobrega de Almeida Júnior; Inneke Marie Van der Heijden; Silvia Figueiredo Costa; Thaís Guimarães; Hélio Hehl Caiaffa Filho

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , p. 88

    • DIVERSIDADE DAS ESPÉCIES DE MICOBACTÉRIAS ISOLADAS NO HC-FMUSP (2009)

      Trabalhos em eventos

      Autores: FABIO OLIVEIRA LATRILHA; João Nobrega de Almeida Júnior; SHEILA AUGUSTO RITA TOLENTINO DE FREITAS; Rosilaine Arruda Teberges; Rossi, F.

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso) , p. 63

    Atuações

    Hospital das Clínicas de São Paulo

    • Médico Assistente Divisão Laboratório Central

      2008 a 2021

    Frontiers in Microbiology

    • Revisor de periódico

      Desde 2017

    Frontiers in Microbiology

    • Membro de corpo editorial

      Desde 2017

    MYCOPATHOLOGIA

    • Revisor de periódico

      Desde 2014

    PLoS One

    • Revisor de periódico

      2014 a 2014

    TRANSPLANT INFECTIOUS DISEASE (ONLINE)

    • Revisor de periódico

      Desde 2017

    JOURNAL DE MYCOLOGIE MEDICALE

    • Revisor de periódico

      Desde 2017

    BMJ CASE REPORTS

    • Revisor de periódico

      Desde 2017

    HEMATOLOGICAL ONCOLOGY

    • Revisor de periódico

      2016 a 2016

    JOURNAL DE MYCOLOGIE MEDICALE

    • Membro de corpo editorial

      2016 a 2020

    MYCOSES (BERLIN. INTERNET)

    • Membro de corpo editorial

      Desde 2020

    Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein

    • Laboratório de Microbiologia

      Assessoria

      Desde 2021

    Hospital São Paulo

    • Infectologia

      Desde 2021

    Universidade Federal de São Paulo

    • Desde 2017

    Fundação Oswaldo Cruz

    • Desde 2022

    Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo

    • 2017 a 2020

    Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP

    • 2019 a 2020

    CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION

    • Revisor de periódico

      Desde 2021

    Medical Mycology

    • Revisor de periódico

      Desde 2020

    Ensino

    Orientações e supervisões

    Tese de doutorado em andamento

    • Lumena Siqueira Machado

      Identificação por espectrometria de massas MALDI-TOF e teste de suscetibilidade aos antifúngicos de fungos filamentosos patogênicos

      Dermatologia

      Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

      Desde 2018

    Dissertação de mestrado em andamento

    • Karoline Kemmerich

      Padrões de virulência de diferentes cepas de Candida auris

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Desde 2021

    Dissertação de mestrado concluídas

    • Letícia Bonato Souza Santos

      Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus

      Medicina

      Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

      Concluído em 2019

    • Fernanda Marques Américo Antunes

      Avaliação da metodologia de espectrometria de massas MALDI-TOF (VItek MS) para identificação de espécies de Aspergillus de importância médica

      Medicina

      Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

      Concluído em 2019

    Gestão

    Pesquisa

    Hospital das Clínicas de São Paulo

    Universidade Federal de São Paulo

    • Identificação Molecular da Coleção de Fungos da Micoteca do Instituto de Medicina Tropical e de Leptospiras da Medicina Veterinária da Universidade de São Paulo: Construção de Bibliotecas de Referência para Identificação por Espectrometria de Massa MALDI-

      Este projeto dá continuidade á exploração biotecnológica de microrganismos que vimos desenvolvendo na Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP) na unidade de produção de composto orgânico (UPCO). Este trabalho está em progresso, no entanto nos deparamos com apreciável quantidade de fungos e que merecem ser explorados tal como estamos fazendo com as bactérias. Para tanto a FPZSP está ampliando os espaços para laboratórios de pesquisa e incluindo um de micologia que deverá abrigar uma micoteca. O impacto das infecções fúngicas na saúde humana e animal não é amplamente reconhecido, no entanto milhões de indivíduos irão contrair infecções fúngicas invasivas (IFIs) que são de difícil diagnóstico e tratamento, com alta mortalidade. Candidíase invasiva, candidíase crônica mucocutânea, meningoencefalitecriptocócica, aspergilose invasiva e cromoblastomicose são exemplos de IFI que acarretam alta morbidade e mortalidade superior a 50%. O diagnóstico precoce e correto de tais infecções tem impacto na sobrevida dos pacientes e pode preencher as lacunas epidemiológicas existentes. A tecnologia de espectrometria de massa por ionização/dessorção a laser assistida por matriz em analisador por tempo de vôo (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight-MALDI-TOF) aparece como uma nova ferramenta aos laboratórios para identificação de microrganismos, e sua precisão e agilidade, pode revolucionar a identificação de fungos patogênicos. Porém, os bancos de espectros de referência fornecidos pelos fabricantes (Bruker®, BioMérieux®) são insuficientes para identificação de toda gama de espécies patogênicas. Sendo assim, novos bancos de ER com maior diversidade taxonômica e clonal são necessários para identificação correta de fungos filamentos e leveduriformes. Há dificuldades técnicas de lidar com fungos devido às características de suas paredes celulares e potencial patogenicidade. Em vista disso o Dr João Nobrega de Almeida Júnior do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, especialista na aplicação da tecnologia MALDI-TOF no estudo de resistência fúngica, o Professor Gil Benard da USP, responsável pelo Laboratório de Micologia Médica LIM-53 do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, e também da Dra. Gilda Maria Bárbaro Del Negro, Pesquisadora Científico I, no Instituto de Medicina Tropical de São Paulo participarão neste projeto. Enquanto as instalações da FPZSP estão sendo construídas, lidaremos com os fungos patogênicos da valiosa coleção da micoteca do Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo (IMT/USP). Esta coleção é composta por 515 isolados de 120 gêneros, contém a diversidade necessária para construção de uma nova biblioteca de ER de impacto nacional e internacional. A identificação das espécies da coleção de fungos do IMT/USP através de técnicas de biologia molecular permitirá criar as bases para a construção de uma biblioteca de ER para MS-MALDI-TOF. Os objetivos propostos são: identificar as espécies de fungos da coleção de culturas de fungos patogênicos do IMT/USP por metodologia padrão-ouro, autenticação dos microrganismos (identificação polifásica). Construir uma biblioteca de espectros de referência para identificação de fungos por MS MALDI-TOF. Validar a nova biblioteca com isolados de origem clínica. Patentear a biblioteca e tornar disponível para os centros Universitários do país. Outra coleção de alto interesse que abordaremos é a de leptospiras da Faculdade de Medicina Veterinaria da USP em São Paulo organizada pelo Prof Dr. Silvio Arruda Vasconcellos e mantida na instituição. A importância médica e epidemiológica tanto para humanos como para animais selvagens é reconhecida. Faremos, tal como para os fungos, os espectros de referencia (ER) desta coleção e serão disponibilizados para uso diagnostico. Estudamos metaloproteases como fator de virulência em leptospiras

      2014 a 2016

    • Rede multidisciplinar internacional para caracterização de aspectos microbiológicos e da história natural de infecções fúngicas invasivas (IFI) por espécies do gênero Candida

      Infecções de corrente sanguínea (ICSs) por Candida spp. representam hoje um problema de saúde pública em todo o mundo, em particular no Brasil, onde ao lado de alta incidência esta complicação infecciosa apresenta taxas de mortalidade global da ordem de 50 a 70%. Ampliar o conhecimento de aspectos relacionados à epidemiologia e patogênese destas infecções, incluindo aquelas causadas por patógenos emergentes, é etapa fundamental para estabelecermos estratégias mais eficientes para o diagnóstico, controle e tratamento de candidemia. Neste contexto, estabelecemos uma rede multidisciplinar e internacional de investigadores para estudar os seguintes aspectos: 1) Epidemiologia das infecções de corrente sanguínea por Candida em centros médicos do Brasil e América Latina; 2) Avaliação da ocorrência de disseminação clonal de cepas de espécies prevalentes de Candida em amostras de hemocultivo obtidas de pacientes internados em hospitais terciários do Brasil e Espanha; 3) Epidemiologia das infecções invasivas por espécies crípticas de Candida e desenvolvimento de estratégias para sua identificação; 4) Mecanismos de virulência e patogenicidade expressos por cepas de C. albicans ao longo de episódios de candidemia persistente; 5) Prevalência de resistência de Candida spp. a antifúngicos e mecanismos moleculares envolvidos. Utilizaremos dados clínicos, epidemiológicos e microbiológicos de mais de 2.000 episódios de fungemia coletados ao longo de estudos de colaboração envolvendo 21 centros médicos no Brasil e América Latina. A identificação de espécies de Candida envolverá técnicas de sequenciamento da região ITS de rDNA, obtendo-se ainda a análise do perfil proteico por técnica de MALDI-TOF MS. A tipagem molecular para caracterização de disseminação clonal de cepas de Candida no ambiente hospitalar será feita por técnica de microssatélites ou AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), na dependência das espécies envolvidas. O perfil genômico e transcriptômico de isolados de C. albicans obtidos de episódios de fungemia persistente será analisado para caracterização de fatores de virulência. A triagem de cepas resistentes a antifúngicos será realizada por ensaios de microdiluição em caldo (CLSI), sendo que isolados com valores de CIMs acima do ECV (valor de cutoff epidemiológico) serão investigados em relação a presença de mutações nos genes ERG11, FKS1 e FKS2, expressão de bombas de efluxo e instabilidade genética em genes reparadores de mutações, na dependência do padrão de resistência encontrado. Ao final, esperamos consolidar nossa rede de colaboração com centros de pesquisa no Brasil e no exterior, trabalhando em conjunto com 8 pesquisadores de 3 diferentes continentes para esclarecer aspectos relevantes da história natural de infecções causadas por diferentes espécies de Candida, validar novas estratégias diagnósticas e ampliar o conhecimento sobre mecanismos envolvidos na patogênese de episódios de candidemia persistente e sobre os mecanismos moleculares de resistência destes agentes a diferentes antifúngicos

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior, Gil Benard, Gilda M.B. del Negro, Luiz Juliano Neto

      Desde 2017

    Fundação Oswaldo Cruz

    Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo

    • Aplicação da espectrometria de massa MALDI-TOF para Identificação de cepas de Trichosporon spp. responsáveis por Infecção Fúngica Invasiva e caracterização do perfil de suscetibilidade aos antifúngicos.

      Nas últimas três décadas a incidência de infecções fúngicas invasivas cresceu consideravelmente. Trichosporon spp começa a ganhar evidência, principalmente em pacientes oncohematológicos com cateter venoso central. Recentes análises da taxonomia do gênero Trichosporon através de biologia molecular descrevem 37 espécies, sete delas responsáveis por infecções em humanos: Trichosporon asahii, Trichosporon asteroides, Trichosporon cutaneum, Trichosporon inkin, Trichosporon mucoides, Trichosporon ovoides e Trichosporon loubieri. A mortalidade de infecções invasivas por Trichosporon spp pode chegar a 100% em casos de neutropenia persistente. A análise dos casos de infecção invasiva por Trichosporon spp, com identificação das espécies por espectrometria de massa MALDI-TOF ainda não foi realizado no Brasil, e servirá como base para a aplicação de tal tecnologia na rotina de identificação de fungos da Divisão de Laboratório Central do HC-FMUSP. A aplicação da tecnologia MALDI-TOF no estudo do fenômeno de resistência aos antifúngicos é incipiente e o grupo francês do ?Laboratoire de Parasitologie-Mycologie et INSERM/UPMC UMR S 945? do Centro Hospitalar Pitié-Salpêtrière é pioneiro. A comparação entre as concentrações inibitórias mínimas dos antifúngicos e as concentrações mínimas de antifúngicos que produzem alteração do perfil de espectrometria para os isolados de Trichosporon será realizada em parceria ao grupo francês e é inédito na literatura.

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior, Márcio Luiz Moore Nucci, COLOMBO, ARNALDO L

      2011 a 2013

    • Diagnóstico precoce de candidemia em pacientes críticos: análise comparativa entre os métodos de PCR em tempo real, MALDI-TOF e detecção de 1,3-Beta-D-glucana

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior, Gil Benard, Gilda M.B. del Negro, DA SILVA DUARTE, ALBERTO JOSÉ

      2017 a 2020

    Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP

    • Caracterização Clínico-Microbiológica de isolados clínicos de leveduras pertencentes ao complexo Candida haemulonii no HC-FMUSP

      Fatores como uso de dispositivos invasivos, antimicrobianos de amplo espectro e imunosupressores são responsáveis por infecções por patógenos raros que podem ser relacionados a alta morbi-mortalidade. Infecção de corrente sanguínea por Candida spp. tem mortalidade atribuída de 50% com custos de US$40.000 por episódio. As espécies do complexo Candida haemulonii são leveduras emergentes que ainda são pouco estudadas no país. Foram descritos isolados com resistência à anfotericina e ao fluconazol. As equinocandinas podem ser opção terapêutica, porém existem poucos estudos que analisaram a atividade in vitro de tais antifúngicos contra isolados pertencentes às espécies do complexo C. haemulonii. Como o perfil de sensibilidade aos antifúngicos dos isolados do HC-FMUSP ainda é pouco conhecido, a melhor escolha terapêutica depende de testes de sensibilidade aos antifúngicos, atrasando a prescrição do melhor antifúngico. Desde a publicação do primeiro caso de infecção no país em 2012 em paciente do Instituto do Câncer de São Paulo, novos isolados foram identificados. Até março de 2014 já foram identificados 25 pacientes no HC-FMUSP com infecção por isolados caracterizados como Candida haemulonii apenas por metodologia fenotípica convencional (VITEK2, BioMérieux, França), provavelmente uma das maiores casuísticas do mundo. Porém em 2012, após análises moleculares,Candida haemulonii passou a ser considerada um complexo formado por três espécies: Candida haemulonii, C. duobushaemulonii e C. haemulonii var. vulnera. Este estudo retrospectivo tem como objetivos caracterizar espécies do complexo C. haemulonii com aprofundamento do estudo clínico epidemiológico microbiológico, análises inéditas no país. A identificação dos isolados por técnica padrão-ouro (sequenciamento região ITS1do rDNA) servirá de base para padronização de especiação por espectrometria de massa MALDI-TOF no HC-FMUSP. O estudo da clonalidade poderá estabelecer possíveis transmissões cruzadas que desencadearão medidas de controle de infecção hospitalar. A correlação entre o desfecho clínico, tratamento e teste de suscetibilidade in vitro (método padrão-ouro: microdiluição em caldo) através de ferramentas estatísticas permitirá estabelecer qual a melhor opção terapêutica para infecções por espécies do complexo C. haemulonii no HC-FMUSP, diminuindo custos e mortalidade pela infecção, além de servir de referência para outros centros do país.

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior, Gil Benard, Gilda M.B. del Negro

      2014 a 2016

    • Caracterização de mecanismos moleculares associados à resistência aos derivados azólicos em cepas clínicas de Trichosporon asahii.

      Trichosporon asahii é um agente emergente de infecção fúngica invasiva em pacientes imunodeprimidos ou com dispositivos invasivos. Os derivados azólicos são a única opção terapêutica para tais infecções, porém falência terapêutica é documentada em até 40% dos casos. Dados obtidos por Nóbrega e Colombo na coordenação da Rede Trichosporon Brasil mostram isolados de T. asahii com elevadas concentrações inibitórias mínimas para fluconazol (>32mg/L) e voriconazol (>2mg/L). Não há dados disponíveis sobre mecanismos moleculares de resistência aos azólicos em amostras de T asahii, mas acredita-se que mutações em genes relacionados à síntese de ergosterol da membrana celular e efluxo podem estar envolvidos. Recentemente, um novo conceito de desenvolvimento de resistência aos antifúngicos em Candida glabrata e Cryptococcus neoformans foi proposto: defeitos no reparo da síntese de DNA (sistema mismatch repair) levaria ao surgimento de um fenótipo hipermutante, "mutator phenotype". Assim, com o objetivo de caracterizar mecanismos de resistência aos derivados azólicos em amostras clínicas de T. asahii, este estudo investigará a associação entre mutações nos genes envolvidos na síntese do ergosterol, hiperexpressão de bombas de efluxo, e mutações no sistema mismatch repair. Este projeto consolida parcerias em andamento entre instituições brasileiras (UNIFESP e USP) e o Instituto de Pesquisa Center for Discovery and Innovation do Hackensack Meridian Health Institute.

      Autores: João Nobrega de Almeida Júnior, Gil Benard, Gilda M.B. del Negro

      2019 a 2020

    Atualização Lattes em 2024-02

    Processado em 2024-07-22