Shirley Cavalcante Vasconcelos nacionalidade brasileira

Universidade Federal de São Paulo

Escola Paulista de Medicina

Programa de Pós-Graduação: Infectologia

E-Mail: vasconcelos.shirley@unifesp.br


83
23
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De 2020 a 2024
Trabalhos publicados

Resumo

Ph.D em Infectologia pela Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo e realizou Pós-Doutorado na Universidade Federal de São Paulo. Professora Afiliada e Pesquisadora do Laboratório de Retrovirologia e Orientadora no Programa de Pós-Graduação em Infectologia na Universidade Federal de São Paulo. Atualmente, também é Professora Colaboradora no Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências-LIM 56 na Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Estuda diversidade viral, epidemiologia molecular, possui expertise nas áreas de Next Generation Sequencing, Real Time PCR, Pesquisa e Desenvolvimento e neuroaids.

Fonte: Lattes CNPq

Nomes em citações bibliográficas

KOMNINAKIS, S. V.;Komninakis, Shirley;S Vasconcelos Komninakis;KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS;KOMNINAKIS, S;Shirley Cavalcante Vasconcelos Komninakis;Komninakis SCV;Komninakis, Shirley Cavalcante Vasconcelos;KOMNINAKIS, S. C. V.;KOMNINAKIS, SHIRLEY V.;Komninakis SV;Shirley Komninakis;VASCONCELOS KOMNINAKIS, SHIRLEY


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Formação

  • Doutorado em Ciências (Fisiopatologia Experimental)

    Métodos sorológicos e moleculares para a identificação de variantes do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) do subtipo B presentes em São Paulo, Brasil

    Orientação: Jorge Simão do Rosário Casseb

    Universidade de São Paulo

      Desde 2003

  • Graduação em Ciências Biológicas

    Caracterização da região 5 dos agrupamentos de genes da trans-sialidase de trypanosoma cruzi.

    Orientação: Sergio Schenkman

    Universidade Presbiteriana Mackenzie

    1992 a 1995

  • Produção


    2023


    • Evaluation of the new Multi-HTLV serological assay: Improvement for HTLV-2 detection

      Artigo publicado

      Autores: FOLGOSI, VICTOR ANGELO; CASSEB, JORGE; Shirley Cavalcante Vasconcelos; DA SILVA, FELIPE DIAS; LEITE JUNIOR, PEDRO DOMINGOS; HAZIOT, MICHEL; PENALVA, AUGUSTO CESAR; SMID, JERUSA; ZREIN, MAAN; SALVADOR, FLORENT

      Conteúdo completo

      2023

      Fonte: AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES , v. 1 , p. 3

    • Diversidade, distribuição e aspectos ecológicos das espécies de Anopheles Vetores de Malária, em comunidades agroextrativistas do município de Mazagão, Amapá, Brasil

      Artigo publicado

      Autores: FONSECA, ERIQUE DA COSTA; DAVID, EVERSON DOS SANTOS; Shirley Cavalcante Vasconcelos; SOUTO, RAIMUNDO NONATO PICANÇO

      Conteúdo completo

      2023

      Fonte: CUADERNOS DE EDUCACIÓN Y DESARROLLO , v. 15 , p. 15047


    2022


    • Detection of human feces pecovirus in newly diagnosed HIV patients in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: SANZ DURO, RODRIGO LOPES; Leal, Élcio; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; MARINHO, ROBSON DOS SANTOS SOUZA; SANTANA, VALQUÍRIA LIMA; MONTI, ELIS MURIEL MARQUES; ONIAS, HUMBERTO; MATSUDA, ELAINE MONTEIRO; Ricardo Sobhie Diaz; ISIDORO, KARINA RENTE; DELWART, ERIC

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: PLoS One , v. 17 , p. e0272067

    • Environmental Changes and the Impact on the Human Infections by Dengue, Chikungunya and Zika Viruses in Northern Brazil, 2010-2019

      Artigo publicado

      Autores: MARINHO, ROBSON DOS SANTOS SOUZA; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; MOTA, MÂNLIO TASSO DE OLIVEIRA; HUNTER, JAMES; Ricardo Sobhie Diaz; KAWAKUBO, FERNANDO SHINJI; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: International Journal of Environmental Research and Public Health , v. 19 , p. 12665

    • Re-emergence of mayaro virus and coinfection with chikungunya during an outbreak in the state of Tocantins/Brazil

      Artigo publicado

      Autores: DOS SANTOS SOUZA MARINHO, ROBSON; SHINJI KAWAKUBO, FERNANDO; VASCONCELOS KOMNINAKIS, SHIRLEY; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; BELLINI CALDEIRA, DÉBORA; Juliana Galinskas; OLIVEIRA MOTA, MÂNLIO TASSO; HUNTER, JAMES; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; DE PÁDUA MILAGRES, FLÁVIO AUGUSTO; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2022

      Fonte: BMC RESEARCH NOTES , v. 15 , p. 271


    2021


    • Diversity of enteric and non-enteric human adenovirus strains in Brazil, 2006-2011

      Artigo publicado

      Autores: SOUZA, ELLEN VIANA DE; LUCHS, ADRIANA; DE SOUZA, YASMIN FRANÇA VIANA PIRES; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; DE QUEIROZ, TALITA GONÇALVES AIRES; SANZ-DURO, RODRIGO LOPES; MARINHO, ROBSON DOS SANTOS SOUZA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; TIMENETSKY, MARIA DO CARMO SAMPAIO TAVARES

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: ARCHIVES OF VIROLOGY , v. 1 , p. 1

    • Latency-associated DNA methylation patterns among HIV-1 infected individuals with distinct disease progression courses or antiretroviral virologic response

      Artigo publicado

      Autores: MANTOVANI, NATHALIA; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INÁCIO LOIOLA MEIRELLES; DA SILVA, BOSCO CHRISTIANO MACIEL; DA SILVA DUARTE, ALBERTO JOSÉ; CASSEB, JORGE; DE BARROS TENORE, SIMONE; HUNTER, JAMES; Ricardo Sobhie Diaz; Komninakis, Shirley Cavalcante Vasconcelos; DEFELICIBUS, ALEXANDRE; DA SILVA, ISRAEL TOJAL; CICERO, MAIRA FERREIRA; SANTANA, LUIZ CLAUDIO; ARNOLD, RAFAEL; DE CASTRO, DANIELA FUNAYAMA; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; NISHIYAMA-JR, MILTON YUTAKA

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: Scientific Reports , v. 11 , p. 22993

    • Metagenomics applied to the detection of diarrhea viruses in humans: Systematic Review

      Artigo publicado

      Autores: DAVID, EVERSON DOS SANTOS; FONSECA, ERIQUE DA COSTA; DE CARVALHO, JAQUES FRANCO NOVAES; MARINHO, ROBSON DOS SANTOS SOUZA; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; Shirley Cavalcante Vasconcelos; SOUTO, RAIMUNDO NONATO PICANÇO

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: ACTA TROPICA , v. 227 , p. 106287

    • Serological and molecular epidemiology of the Dengue, Zika and Chikungunya viruses in a risk area in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: MOTA, MAGALY LIMA; Ricardo Sobhie Diaz; DO SOCORRO LUCENA, MARIA; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; DOS SANTOS SOUZA MARINHO, ROBSON; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; HUNTER, JAMES; DE MENEZES, IRWIN ROSE ALENCAR; DE LIMA SILVA, JOÃO MARCOS FERREIRA; PEREIRA, GLAUBERVÂNIO LEITE TAVARES; Sabino, Ester Cerdeira; GRUMACH, ANETE

      Conteúdo completo

      2021

      Fonte: BMC INFECTIOUS DISEASES , v. 21 , p. 704


    2020


    • Nicotinamide activates latent HIV-1 ex vivo in ART suppressed individuals, revealing higher potency than the association of two methyltransferase inhibitors, chaetocin and BIX01294

      Artigo publicado

      Autores: SAMER, SADIA; OSHIRO, TELMA MIYUKI; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; Luiz Mário Ramos Janini; Ricardo Sobhie Diaz; ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; GIRON, LEILA BERTONI; ZUKUROV, JEAN PAULO LOPES; HUNTER, JAMES; SANTILLO, BRUNA TERESA; NAMIYAMA, GISLENE; GALINSKAS, JULIANA; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: Brazilian Journal of Infectious Diseases , v. 24 , p. 150

    • Detection and characterization of Ilheus and Iguape virus genomes in historical mosquito samples from Southern Brazil

      Artigo publicado

      Autores: CUNHA, MARIANA SEQUETIN; VILLANOVA, FABIOLA; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER CERDEIRA; DELWART, ERIC; LEAL, ÉLCIO; NOGUEIRA, MAURÍCIO LACERDA; MAIORKA, PAULO CÉSAR; LUCHS, ADRIANA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; Geovani de Oliveira Ribeiro; PEREIRA DOS SANTOS, FABIANA CRISTINA; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; SANTOS SOUZA MARINHO, ROBSON DOS; STEVEN S. WITKIN

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: ACTA TROPICA , v. 205 , p. 105401

    • Detection of coinfection with Chikungunya virus and Dengue virus serotype 2 in serum samples of patients in State of Tocantins, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: DOS SANTOS S. MARINHO, ROBSON; KOMNINAKIS, SHIRLEY V.; SANZ DURO, RODRIGO L.; SANTOS, GIULIA L.; HUNTER, JAMES; DA APARECIDA RODRIGUES TELES, MARIA; BRUSTULIN, RAFAEL; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO A.; Sabino, Ester C.; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2020

      Fonte: Journal of Infection and Public Health , v. 20 , p. 30386-5

    • HIV e subtipos: etiologia

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Sandro Veronesi; Roberto Focaccia; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Ester Cerdeira Sabino; Claudia Cortese Barreto; Sabri Saeed Sanabani

      2020

      Fonte: Tratado de Infectologia , p. 205


    2019


    • Detection and Characterization of Enterovirus B73 from a Child in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Geovani de Oliveira Ribeiro; SOARES, CASSIA; STEVEN S. WITKIN; VILLANOVA, FABIOLA; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER; DELWART, ERIC; Antonio Charlys da Costa; LEAL, ÉLCIO; LUCHS, ADRIANA; MILAGRES, FLÁVIO; Shirley Cavalcante Vasconcelos; GILL, DANIELLE; LOBATO, MÁRCIA; BRUSTULIN, RAFAEL; CHAGAS, ROGÉRIO; MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS ABRÃO

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Viruses-Basel , v. 11 , p. 16

    • First Detection of DS-1-like G1P[8] Double-gene Reassortant Rotavirus Strains on The American Continent, Brazil, 2013

      Artigo publicado

      Autores: LUCHS, ADRIANA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; CILLI, AUDREY; Shirley Cavalcante Vasconcelos; CARMONA, RITA DE CÁSSIA COMPAGNOLI; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; SABINO, ESTER CERDEIRA; TIMENETSKY, MARIA DO CARMO SAMPAIO TAVARES

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Scientific Reports , v. 9 , p. 1

    • Zika Virus Alters the Viscosity and Cytokines Profile in Human Colostrum

      Artigo publicado

      Autores: DE QUENTAL, OCILMA B.; FRANÇA, EDUARDO L.; HONÓRIO-FRANÇA, ADENILDA C.; MORAIS, TASSIANE C.; DABOIN, BLANCA E. G.; BEZERRA, ITALLA M. P.; Shirley Cavalcante Vasconcelos; DE ABREU, LUIZ C.

      2019

      Fonte: Journal of Immunology Research , v. 2019 , p. 1

    • Detection of RNA-Dependent RNA Polymerase of Hubei Reo-Like Virus 7 by Next-Generation Sequencing in Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus Mosquitoes from Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Geovani de Oliveira Ribeiro; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ÉLCIO; MONTEIRO, FRED JULIO COSTA; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S; RIBEIRO, EDCELHA SOARES D?ATHAIDE; CASTRO, DANIELA FUNAYAMA DE; CASEIRO, MARCOS MONTANI; SOUZA MARINHO, ROBSON DOS SANTOS; Shirley Cavalcante Vasconcelos; STEVEN S. WITKIN

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Viruses-Basel , v. 11 , p. 147

    • First identification of mammalian orthoreovirus type 3 by gut virome analysis in diarrheic child in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: ROSA, ULISSES ALVES; CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI DAS; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; TINKER, RORY J; PANDEY, RAMENDRA PATI; RAJ, V. SAMUEL; SABINO, ESTER CERDEIRA; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; COSTA, ANTONIO CHARLYS DA; Geovani de Oliveira Ribeiro; LEAL, ÉLCIO; VILLANOVA, FABIOLA; LUCHS, ADRIANA; MILAGRES, FLÁVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; TAHMASEBI, ROOZBEH; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; BRUSTULIN, RAFAEL

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Scientific Reports , v. 9 , p. 2210

    • Discovery of Cucumis melo endornavirus by deep sequencing of human stool samples in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; GILL, DANIELLE; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; DAS CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: VIRUS GENES , v. 55 , p. 332

    • Recombinant Strains of Human Parechovirus in Rural Areas in the North of Brazil

      Artigo publicado

      Autores: LEAL, ÉLCIO; SOARES, CÁSSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; VILLANOVA, FABIOLA; STEVEN S. WITKIN; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER CERDEIRA; DELWART, ERIC; COSTA, ANTÔNIO CHARLYS DA; LUCHS, ADRIANA; MILAGRES, FLÁVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; GILL, DANIELLE ELISE; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; BRUSTULIN, RAFAEL; CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI DAS; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Viruses-Basel , v. 11 , p. 488

    • Human sapovirus GI.2 and GI.3 from children with acute gastroenteritis in northern Brazil

      Artigo publicado

      Autores: CILLI, AUDREY; CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI DAS; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; COSTA, ANTONIO CHARLYS DA; LUCHS, ADRIANA; LEAL, ELCIO; GILL, DANIELLE; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 114 , p. 1

    • Epizootics due to Yellow Fever Virus in São Paulo State, Brazil: viral dissemination to new areas (2016-2017)

      Artigo publicado

      Autores: CUNHA, MARIANA SEQUETIN; RESSIO, RODRIGO ALBERGARIA; MAEDA, ADRIANA YURIKA; VASAMI, FERNANDA GISELE SILVA; KAIGAWA, URSULA MITSUE ABREU; DE AZEVEDO, LAÍS SAMPAIO; DE SOUZA FACIOLI, PALOMA ALANA; MACEDO, FERNANDO LUIZ LIMA; SABINO, ESTER CERDEIRA; LEAL, ÉLCIO; DE SOUZA, RENATO PEREIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; DE AZEVEDO FERNANDES, NATÁLIA COELHO COUTO; GUERRA, JULIANA MARIOTTI; DOS SANTOS, FABIANA CRISTINA PEREIRA; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; D?AGOSTINO, LEANDRO GUARIGLIA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; STEVEN S. WITKIN

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Scientific Reports , v. 9 , p. 5474

    • The rare enterovirus c99 and echovirus 29 strains in Brazil: potential risks associated to silent circulation

      Artigo publicado

      Autores: LUCHS, ADRIANA; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ELCIO; TARDY, KAELAN; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; DAS CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI

      Conteúdo completo

      2019

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 114 , p. 1


    2018


    • External Quality Assessment for Zika Virus Molecular Diagnostic Testing, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: FISCHER, CARLO; VIANA, ISABELLE F.T.; LEVI, JOSÉ EDUARDO; SCARPELLI, LUCIANO CESAR; NOGUEIRA, MAURICIO LACERDA; BASTOS, MICHELE DE SOUZA; SOUZA, NATHALIA C. SANTIAGO; KHOURI, RICARDO; LIRA, SANNY; Shirley Cavalcante Vasconcelos; BARONTI, CÉCILE; PEDROSO, CELIA; CHARREL, RÉMI N.; KÜMMERER, BEATE M.; DROSTEN, CHRISTIAN; BRITES, CARLOS; DE LAMBALLERIE, XAVIER; NIEDRIG, MATTHIAS; NETTO, EDUARDO MARTINS; DREXLER, JAN FELIX; MENDRONE, ALFREDO; BISPO DE FILIPPIS, ANA MARIA; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS ROSÁRIO; RIBEIRO, BERGMANN MORAIS; DURIGON, EDISON LUIZ; MARQUES, ERNESTO T.A.; CAMPOS, GUBIO S.

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: EMERGING INFECTIOUS DISEASES , v. 24 , p. 5

    • Wuhan large pig roundworm virus identified in human feces in Brazil

      Artigo publicado

      Autores: LUCHS, ADRIANA; SABINO, ESTER CERDEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ELCIO; Shirley Cavalcante Vasconcelos; DE PÁDUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; DA APARECIDA RODRIGUES TELES, MARIA; GILL, DANIELLE ELISE; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: VIRUS GENES , v. 54 , p. 470

    • Complete Genome Sequences of Six Human Bocavirus Strains from Patients with Acute Gastroenteritis in the North Region of Brazil

      Artigo publicado

      Autores: WATANABE, ARIPUANÃ SAKURADA ARANHA; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER CERDEIRA; DELWART, ERIC; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA; LEAL, ÉLCIO; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; GILL, DANIELLE ELISE; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 6 , p. e00235-18

    • Brazilian Guidelines for Hereditary Angioedema Management - 2017 Update Part 1: Definition, Classification and Diagnosis

      Artigo publicado

      Autores: Giavina-Bianchi, P; AT FRANÇA; FUSARO, G; GARCIA, JF; KOMNINAKIS, S; MAIA, LS; MANSOUR, E; MORENO, AS; MOTTA, AA; PESQUERO, JB; PORTILHO, N; LK ARRUDA; NA Rosário; SERPA, FS; Dirceu Solé; TAKEJIMA, P; TOLEDO, E; VALLE, SO; VERONEZ, CL; Grumach, AS; AUN, MV; CAMPOS, RA; CHONG-NETO, HJ; CONSTANTINO-SILVA, RN; FR Fernandes; FERRARO, MF; FERRIANI, MP

      2018

      Fonte: Clinics , v. 73 , p. e.310

    • Near full length genome of a recombinant (E/D) cosavirus strain from a rural area in the central region of Brazil

      Artigo publicado

      Autores: DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; SOARES, CASSIA VITÓRIA DE DEUS ALVES; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER CERDEIRA; DELWART, ERIC; LEAL, ÉLCIO; LUCHS, ADRIANA; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; GILL, DANIELLE ELISE; LOBATO, MÁRCIA CRISTINA ALVES BRITO SAYÃO; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGÉRIO TOGISAKI; ABRÃO, MARIA DE FÁTIMA NEVES DOS SANTOS

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: Scientific Reports , v. 8 , p. 1

    • Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential

      Artigo publicado

      Autores: Nuno R. Faria; DELLICOUR, S.; THÉZÉ, J.; CARVALHO, R. D. O.; BAELE, G.; WU, C.-H.; SILVEIRA, P. P.; ARRUDA, M. B.; PEREIRA, M. A.; PEREIRA, G. C.; LOURENÇO, J.; KRAEMER, M. U. G.; OBOLSKI, U.; ABADE, L.; VASYLYEVA, T. I.; GIOVANETTI, M.; YI, D.; WEISS, D. J.; WINT, G. R. W.; SHEARER, F. M.; FUNK, S.; NIKOLAY, B.; HILL, S. C.; FONSECA, V.; ADELINO, T. E. R.; OLIVEIRA, M. A. A.; SILVA, M. V. F.; SACCHETTO, L.; FIGUEIREDO, P. O.; REZENDE, I. M.; MELLO, E. M.; SAID, R. F. C.; SANTOS, D. A.; GOES DE JESUS, J.; FERRAZ, M. L.; BRITO, M. G.; SANTANA, L. F.; MENEZES, M. T.; BRINDEIRO, R. M.; TANURI, A.; DOS SANTOS, F. C. P.; CUNHA, M. S.; NOGUEIRA, J. S.; ROCCO, I. M.; AGUIAR, R. S.; Antonio Charlys da Costa; Shirley Cavalcante Vasconcelos; AZEVEDO, V.; CHIEPPE, A. O.; ARAUJO, E. S. M.; MENDONÇA, M. C. L.; DOS SANTOS, C. C.; DOS SANTOS, C. D.; MARES-GUIA, A. M.; NOGUEIRA, R. M. R.; IANI, F. C. M.; SEQUEIRA, P. C.; ABREU, R. G.; GARCIA, M. H. O.; ABREU, A. L.; OKUMOTO, O.; KROON, E. G.; DE ALBUQUERQUE, C. F. C.; LEWANDOWSKI, K.; PULLAN, S. T.; CARROLL, M.; XAVIER, J.; DE OLIVEIRA, T.; Ester C. Sabino; SOUZA, R. P.; SUCHARD, M. A.; LEMEY, P.; TRINDADE, G. S.; DRUMOND, B. P.; FILIPPIS, A. M. B.; LOMAN, N. J.; CAUCHEMEZ, S.; QUICK, J.; ALCANTARA, L. C. J.; Oliver G. Pybus; DU PLESSIS, L.

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: SCIENCE , v. 1 , p. eaat7115

    • Recombination Located over 2A-2B Junction Ribosome Frameshifting Region of Saffold Cardiovirus

      Artigo publicado

      Autores: DA COSTA, ANTÔNIO; SOARES, CASSIA; DENG, XUTAO; SABINO, ESTER; DELWART, ERIC; LEAL, ÉLCIO; LUCHS, ADRIANA; MILAGRES, FLÁVIO; Shirley Cavalcante Vasconcelos; GILL, DANIELLE; LOBATO, MÁRCIA; BRUSTULIN, RAFAEL; DAS CHAGAS, ROGÉRIO; ABRÃO, MARIA

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: Viruses-Basel , v. 10 , p. 520

    • A Novel Highly Divergent Strain of Cell Fusing Agent Virus (CFAV) in Mosquitoes from the Brazilian Amazon Region

      Artigo publicado

      Autores: FERNANDES, LICIA NATAL; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; SABINO, ESTER CERDEIRA; LEAL, ÉLCIO; COSTA, ANTONIO CHARLYS DA; COLETTI, THAÍS DE MOURA; MONTEIRO, FRED JULIO COSTA; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA SILVA; RIBEIRO, EDCELHA SOARES D?ATHAIDE; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; MARINHO, ROBSON DOS SANTOS SOUZA; Shirley Cavalcante Vasconcelos; WITKIN, STEVEN S.

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: Viruses-Basel , v. 10 , p. 666

    • Spread of the emerging equine-like G3P[8] DS-1-like genetic backbone rotavirus strain in Brazil and identification of potential genetic variants

      Artigo publicado

      Autores: LUCHS, ADRIANA; Antonio Charlys da Costa; CILLI, AUDREY; Shirley Cavalcante Vasconcelos; CARMONA, RITA DE CÁSSIA COMPAGNOLI; BOEN, LAIS; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; SABINO, ESTER CERDEIRA; Maria do Carmo Sampaio Tavares Timenetsky

      Conteúdo completo

      2018

      Fonte: JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY , v. 99 , p. 1


    2017


    • Identification of a new hepatitis B virus recombinant D2/D3 in the city of São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: SANTANA, LUIZ CLAUDIO; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS; MANTOVANI, NATHALIA PENA; FERREIRA, MAIRA CICERO; ARNOLD, RAFAEL; DURO, RODRIGO LOPES SANZ; Paulo Roberto Abrão Ferreira; HUNTER, JAMES RICHARD; LEAL, ÉLCIO; DIAZ, RICARDO SOBHIE

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: ARCHIVES OF VIROLOGY , v. 162 , p. 457

    • The Pace of Co-receptor Tropism Switch in HIV-1 Infected Individuals after Recent Infection

      Artigo publicado

      Autores: ARIF, MUHAMMAD SHOAIB; Luiz Mário Ramos Janini; SUCUPIRA, MARIA CECILIA; Diaz, Ricardo Sobhie; HUNTER, JAMES; LÉDA, ANA RACHEL; ZUKUROV, JEAN PAULO LOPES; SAMER, SADIA; CAMARGO, MICHELLE; GALINSKAS, JULIANA; Esper Georges Kallás; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: JOURNAL OF VIROLOGY , v. 00 , p. JVI.00793-17

    • Spread of Chikungunya Virus East/Central/South African Genotype in Northeast Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Antonio Charlys da Costa; Adriana Avila Moura; José Lourenço; Xutao Deng; Eric L. Delwart; Maria Raquel dos Anjos Silva Guimarães; Oliver G. Pybus; Ester C. Sabino; Nuno R. Faria; Julien Thézé; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Rodrigo Lopes Sanz Duro; Marta Rejane Lemos Felinto; Lúcia Cristina Corrêa Moura; Ivoneide Moreira de Oliveira Barroso; Lucineide Eliziario Correia Santos; Mardjane Alves de Lemos Nunes

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: EMERGING INFECTIOUS DISEASES , v. 23 , p. 1742

    • Late Presentation HIV/AIDS Are Still a Challenge in Brazil and Worldwide

      Artigo publicado

      Autores: Komninakis, Shirley; MOTA, MAGALY LIMA; HUNTER, JAMES RICHARD; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2017

      Fonte: AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES , v. Feb , p. 129


    2016


    • Is Hepatitis Delta infections important in Brazil?

      Artigo publicado

      Autores: CICERO, MAIRA FERREIRA; PENA, NATHALIA MANTOVANI; SANTANA, LUIZ CLAUDIO; ARNOLD, RAFAEL; AZEVEDO, RAFAEL GONÇALVES; LEAL, ÉLCIO DE SOUZA; Ricardo Sobhie Diaz; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2016

      Fonte: BMC INFECTIOUS DISEASES , v. 16 , p. 100968551


    2014


    • Prevalence of transmitted HIV-1 antiretroviral resistance among patients initiating antiretroviral therapy in Brazil: a surveillance study using dried blood spots

      Artigo publicado

      Autores: DE MORAES SOARES, CELINA M P; Michelle Camargo; Luiz Mário Ramos Janini; Komninakis, Shirley; SUCUPIRA, MARIA C A; DIAZ, RICARDO S; VERGARA, TANIA R C; BRITES, CARLOS; BRITO, JOSE D U; GRINBERG, GORKI; CASEIRO, MARCOS M; CORREA, CARLOS; SUFFERT, THEODORO A; PEREIRA, FLAVIO R

      Conteúdo completo

      2014

      Fonte: Journal of the International AIDS Society , v. 17 , p. 19042


    2013


    • Molecular Characterization of Partial and Full-length Genome of the Hepatitis B Virus (HBV) Among Chronic Patients in the City São Paulo, Brazil.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Claudio Santana; Nathalia Mantovani Pena; Maira Cicero Ferreira; Rafael Arnold; Dercy Jose de Sa-Filho; Paulo Roberto Abrao Ferreira; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2013

      Fonte: The Journal of Virus Hepatitis , p. 16

    • Full length genome characterization of Hepatitis Delta virus in teh Amazon regions of Brazil, using dried blood samples collection

      Trabalhos em eventos

      Autores: CICERO, M; MANTOVANI, N; SANTANA, L; ARNOLD, R; AZEVEDO, R; Dercy Jose de Sa-Filho; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2013

      Fonte: Journal of Viral Hepatitis , p. 16

    • Evaluation of HIV-1 genotypic tropism among HIV-1 infected patients failing HAART in Santos and São Paulo cities, Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maira Cicero Ferreira; Nathalia Mantovani Pena; Luiz Claudio Santana; Rafael Arnold; Rafael Gonçalves Azevedo; Marcos Montani Caseiro; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2013

      Fonte: Journal of the internationsl Aids Society , p. 23

    • Detection of lamivudine-resistant variants and mutations related to reduced antigenicity of HBsAg in individuals from the cities of Santos and Sao Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: MANTOVANI, NATHALIA; CICERO, MAIRA; SANTANA, LUIZ CLAUDIO; SILVEIRA, CARLA; DO CARMO, ELIANE PEREIRA; Paulo Roberto Abrão Ferreira; CASEIRO, MARCOS MONTANI; KOMNINAKIS, SHIRLEY VASCONCELOS

      Conteúdo completo

      2013

      Fonte: Virology Journal , v. 10 , p. 320


    2012


    • Short Communication: Evaluation of GB Virus C/Hepatitis G Viral Load Among HIV Type 1-Coinfected Patients in São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: ALVES-SOUSA, VIVIANE K.; KOMNINAKIS, SHIRLEY C.V.; BAGGIO-ZAPPIA, GIOVANA L.; BARBOSA, ALINE J.; MANTOVANI, NATHÁLIA P.; DIAZ, RICARDO S.; Paulo Roberto Abrão Ferreira; LANZARA, GRAZIELA A.; GRANATO, CELSO F.H.

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 28 , p. 1301

    • Analysis of Transmitted Resistance to Raltegravir and Selective Pressure among HIV-1-Infected Patients on a Failing HAART in Sao Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Mantovani, N. P.; Rafael Gonçalves de Azevedo; Rabelato, J. T.; Sanabani, S.; Ricardo Sobhie Diaz; Komninakis, S. V.

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology (Print) , v. 50 , p. 2122

    • HIV-1 Proviral DNA Loads (as Determined by Quantitative PCR) in Patients Subjected to Structured Treatment Interruption after Antiretroviral Therapy Failure

      Artigo publicado

      Autores: Komninakis, S. V.; Domingos Ezenildo Matos dos Santos; Santos, C.; Marcia Perez Rezende Oliveros; Sanabani, S.; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2012

      Fonte: Journal of Clinical Microbiology (Print) , v. 50 , p. 2132


    2011


    • Prevalence of Transmitted HIV-1 Antiretroviral Resistance among Patients Initiating ART in Brazil: A Surveillance Using Dried Blood Spots

      Trabalhos em eventos

      Autores: Celina Maria Pereira de Moraes Soares; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Ricardo Sobhie Diaz; Tania Regina Constant Vergara; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Carlos Roberto Brites Alves; Jose David Urbaez-Brito; Marcos Montani Caseiro; Carlos Manuel Corrêa; Theodoro Armando Süffert; Flávio Ribeiro Pereira

      2011

      Fonte: Abstracts of 18th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections (CROI 2011) , p. 624

    • Study of the Genotypes of the Hepatitis B Virus in Baixada Santista

      Trabalhos em eventos

      Autores: Luiz Claudio Santana; Maira Cicero Ferreira; Nathalia Mantovani Pena; Eliane Pereira do Carmo; Daniela Funayama de Castro; Marcos Montani Caseiro; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2011

      Fonte: ESCV 2011

    • gp41 evolution among HIV-1 patients receiving T20 in Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Rafael Gonçalves Azevedo; Eliane Pereira do Carmo; Simone Barros Tenore; Márcia Perez Resende Oliveros; Clarice Gameiro da Fonseca Pachi; Celina Maria Pereira de Moraes Soares; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2011

      Fonte: ESCV 2011


    2010


    • The Detection of and HIV Type 1 B/F Profiles in Brazil Using a Real-Time PCR Assay for Five HIV Type 1 Genomic Regions

      Artigo publicado

      Autores: Daniela Teixeira; Patricia Munerato; Komninakis, Shirley Cavalcante Vasconcelos; Erika Etsuko Fusuma; Luiz Mário Ramos Janini; Maria Cecilia Araripe Sucupira; Diaz, Ricardo Sobhie

      Conteúdo completo

      2010

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 26 , p. 981

    • Short Communication: High Polymorphism Rates in the HR1 and HR2 gp41 and Presence of Primary Resistance-Related Mutations in HIV Type 1 Circulating in Brazil: Possible Impact on Enfuvirtide Efficacy

      Artigo publicado

      Autores: Teixeira, Carla; de Sá-Filho, Dercy; Alkmim, Wagner; Luiz Mário Ramos Janini; Diaz, Ricardo Sobhie; Komninakis, Shirley

      Conteúdo completo

      2010

      Fonte: AIDS Research and Human Retroviruses , v. 26 , p. 307

    • COINFECÇÃO HIV/HCV: CONSIDERAÇÕES SOBRE O TRATAMENTO

      Textos em jornais de notícias/revistas

      Autores: Rafael Gonçalves Azevedo; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2010

      Fonte: Tendências em HIV.Aids , p. 19


    2009


    • Benefit of genotyping after virologic failure among HIV-1 infected children

      Trabalhos em eventos

      Autores: Maria Luzinete Sabino da Silva; Eliane Pereira do Carmo; Daniela Funayama de Castro; Fernando Kauffmann Barbosa; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2009

      Fonte: Livro de Resumos do VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS , p. 7

    • Influence of hepatitis B virus (HBV) genotype on the clinical course of disease in patients coinfected with HBV and hepatitis delta virus.

      Artigo publicado

      Autores: Dagmar Kiesslich; Myuki Alfaia Esashika Crispim; Carlos Santos; Fernando de Lima Ferreira; Nelson Abrahim Fraiji; Shirley Cavalcante Vasconcelos Komninakis; Ricardo Sobhie Diaz

      Conteúdo completo

      2009

      Fonte: The Journal of Infectious Diseases , v. 199 , p. 1608

    • Toll-like receptor pathway signaling is differently regulated in neutrophils and peripheral mononuclear cells of patients with sepsis, severe sepsis, and septic shock*

      Artigo publicado

      Autores: Reinaldo Salomão; Milena Karina Colo Brunialti; Natalia Estevam Gomes; Marialice Erdelyi Mendes; Ricardo S Diaz; Shirley Vasconcelos Komninakis; Flávia Ribeiro Machado; Ismael Dale Cotrim Guerreiro da Silva; Otelo Rigato Jr.

      Conteúdo completo

      2009

      Fonte: Critical Care Medicine , v. 37 , p. 132

    • Noções básicas de biologia molecular

      Capítulo de livro publicado

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2009

      Fonte: Alergia e imunologia na infância e na adolescência , p. 21


    2008


    • HIV-1 pol gene diversity and antiretroviral drug resistance mutations in Itanhaém city, Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Rafael Bragança Rodrigues Matias; Katia C. P. Guatelli; Rafael Favero Ambar; Natalia Brenneken Duarte; Luiz Henrique Gagliani; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Valéria dos Santos Candido; Marcos Montani Caseiro; Dercy Jose de Sa-Filho

      Conteúdo completo

      2008

      Fonte: 9th International Congress on Drug Therapy in HIV Infection , p. P196

    • HIV-1 pol gene diversity drug resistance mutations in drug naïve patientes from Santos metropolitan area, Brazil

      Trabalhos em eventos

      Autores: Rafael Favero Ambar; Natalia Brenneken Duarte; Marcelo Thome; Rafael Bragança Rodrigues Matias; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Luiz Henrique Gagliani; Marcos Montani Caseiro; Dercy Jose de Sa-Filho

      2008

      Fonte: XVII International AIDS Conference

    • Toll-like receptor pathway signaling is differently regulated in neutrophils and peripheral mononuclear cells of patients with sepsis, severe sepsis and septic shock

      Trabalhos em eventos

      Autores: Milena Karina Colo Brunialti; Natalia Estevan Gomes; Marialice Erdely Mendes; Maria da Luz Fernandes; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Flavia Ribeiro Machado; Ismael Dale Cotrim Guerreiro da Silva; Reinaldo Salomao

      2008

      Fonte: Abstracts da XXIII Reunião Anual da FeSBE - Federação de Sociedades de Biologia Experimental , p. 23022

    • Tratamento anti-HIV: Novas estratégias

      Textos em jornais de notícias/revistas

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Rafael Gonçalves Azevedo

      2008

      Fonte: Tendências em HIV-AIDS , p. 20


    2007


    • Techniques used to identify the Brazilian variant of HIV-1 subtype B.

      Artigo publicado

      Autores: Shirley Vasconcelos Komninakis; Ligia Maria Ichimura Fukumori; Rosana Alcalde; Marcelo Augusto Cortina Gonçalves dos Santos; L Abdala; Adriana Brito; Sabri Saeed Mohamed Ahmed Al-Sanabani; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simao do Rosario Casseb

      Conteúdo completo

      2007

      Fonte: Brazilian Journal of Medical and Biological Research , v. 40 , p. 301

    • Real Time PCR: a Powerful Tool to Quantify HIV-1 Proviral Load

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Carlos Santos; Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Michelle Zanoni; Dercy Jose de Sa-Filho; Ricardo Sobhie Diaz

      2007

      Fonte: VII Simposio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007

    • Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) Proviral Load in Structured Treatment Interruption (STI)

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Michelle Zanoni; Dercy Jose de Sa-Filho; Ricardo Sobhie Diaz

      2007

      Fonte: VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS

    • Reação em Cadeia pela Polimerase em Tempo Real

      Textos em jornais de notícias/revistas

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2007

      Fonte: Tendências em HIV-AIDS , p. 5


    2006


    • Women infected with Human Immunodeficiency Virus type 1 Brazilian variant, subtype B (B-GWGR motif) show a slower progression to AIDS as compared with patients infected with subtype B (B-GPGR motif).

      Artigo publicado

      Autores: Adriana de Brito; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Patricia Correia Rodrigues Novoa; Rafael M de Oliveira; Luiz Augusto M. Fonseca; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      Conteúdo completo

      2006

      Fonte: Clinical Infectious Diseases , v. 11 , p. 1476

    • Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Dercy Jose de Sa-Filho; Michelle Zanoni; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2006

      Fonte: XVI International AIDS Conference

    • Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Dercy Jose de Sa-Filho; Michelle Zanoni; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2006

      Fonte: 14th International Symposium on HIV & Emerging Infectious Disesases

    • Mutations and polymorphisms in the GP41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkmim Maia; Dercy José de Sá-Filho; Michelle Zanoni; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos Komninakis

      2006

      Fonte: Book and Abstract of 7th Annual Symposium on Antiviral Drug Resistance: Targets and Mechanisms , p. 80

    • Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naive patients receiving HAART

      Trabalhos em eventos

      Autores: Carla Cristina Teixeira; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Dercy Jose de Sa-Filho; Michelle Zanoni; Ricardo Sobhie Diaz; Shirley Cavalcante Vasconcelos

      2006

      Fonte: . Virus - Reviews & Research , p. 80

    • DNA proviral em indivíduos infectados pelo HIV-1

      Textos em jornais de notícias/revistas

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Carla Cristina Teixeira

      2006

      Fonte: Tendências em HIV. AIDS/Disciplina de Infectologia-UNIFESP , p. 11


    2004


    • Human immunodeficiency virus type 1 Brazilian subtype B variant showed an increasing avidity of the anti-V3 antibodies over time compared to the subtype B US/European strain in São Paulo, Brazil

      Artigo publicado

      Autores: Jorge Simão do Rosario Casseb; Patricia Aparecida Montanheiro; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Adriana de Brito; Alberto Jose da Silva Duarte

      Conteúdo completo

      2004

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso) , v. 99 , n. 1 , p. 69

    • Serological and Molecular Techniques for Identification of the HIV-1 subtype B, B"-GWGR variant

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Ligia Maria Ichimura Fukumori; Rosana Alcalde; Marcelo Augusto Cortina Gonçalves dos Santos; Adriana de Brito; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2004

      Fonte: Abstracts da AIDS 2004 - The XV International AIDS Conference , p. 10500


    2003


    • Prevalence of codon which codificate the tryptophan in the V3 loop region of the envelope of the HIV-1 in São Paulo city

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Ligia Maria Ichimura Fukumori; Rosana Alcalde; Marcelo Augusto Cortina Gonçalves dos Santos; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2003

      Fonte: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa Básica em HIV/AIDS , p. 47


    2002


    • HIV disease progression: is the Brazilian variant subtype B' (GWGR motif) less pathogenic than US/European subtype B (GPGR)?

      Artigo publicado

      Autores: Jorge Simão do Rosario Casseb; R. Michael Hendry; Alberto Jose da Silva Duarte; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Leslie Abdala Diniz; Luis Fernando de Macedo Brigido; Rosangela Rodrigues; Fabio O. Araújo; Ana Paula Rocha Veiga; Alexandre de Almeida; Brendan Flannery

      Conteúdo completo

      2002

      Fonte: International Journal of Infectious Diseases , v. 6 , p. 164

    • Humoral response to hepatitis B vaccination and its relationship with T CD4+ cell subsets in HIV-1 infected subjects

      Trabalhos em eventos

      Autores: Ana Paula Rocha Veiga; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Noemia Mie Orii; R Stellin; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2002

      Fonte: International AIDS Conference

    • Comparison between anti-V3 serology and RFLP for identification of the brazilian variant of subtype B

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Ligia Maria Ichimura Fukumori; Patricia Aparecida Montanheiro; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2002

      Fonte: International AIDS Conference


    2001


    • Algorithm for HIV-1 serotyping using an modified V3 EIA in São Paulo

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Patricia Aparecida Montanheiro; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2001

      Fonte: International AIDS Society , p. 191

    • Highty avidity antibdies (HAAV3) for the subtype B (motif GPGR) and the brazilian variant B.

      Trabalhos em eventos

      Autores: Patricia Aparecida Montanheiro; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2001

      Fonte: The Brazilian Journal of Infectious Disease , p. S2


    2000


    • Analysis of the seroreactivity in individuals users of drugs and of different sexual risks for V3 of HIV-1 in the city of São Paulo

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Patricia Aparecida Montanheiro; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      2000

      Fonte: Fórum 2000 , p. 202


    1999


    • Comparison between two appoaches (EIA-solid phase an liquid phase) to distinguish the brazilian variant of subtype B of HIV-1

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      1999

      Fonte: Virus Reviews & Research- Journal of Brazilian Society for Virology , p. 119

    • Pattern of seroreactivity anti V3: comparison between two EIAS (liquid and solid phase) using synthetic peptides

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Leslie Abdala Diniz; Alberto Jose da Silva Duarte; Jorge Simão do Rosario Casseb

      1999

      Fonte: Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo , p. S20


    1998


    • In vitro induced antibody production (IVIAP) by peripheral blood mononuclear cells (PBMC) in brazilian HIV-1-infected subjects

      Trabalhos em eventos

      Autores: Jorge Simão do Rosario Casseb; Marisa Ailin Hong; Reinaldo Salomao; Wagner Tadeu Alkimim Maia; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Alberto Jose da Silva Duarte

      1998

      Fonte: International Society for Infectious Disease , p. 12

    • Avaliação preliminar da sororeatividade para a região V3 do HIV-1 em indivíduos usuários de drogas endovenosas

      Trabalhos em eventos

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos; Marisa Ailin Hong; Jorge Simão do Rosario Casseb; Alberto Jose da Silva Duarte

      1998

      Fonte: Revista Brasileira de Alergia e Imunopatologia , p. 162


    1995


    • A highly repeated DNA sequence is present dowstream of group of trans-sialidase genes

      Trabalhos em eventos

      Autores: Lucio Holanda Gondim de Freitas Junior; Claudia Massako Egima; Shirley Cavalcante Vasconcelos; Sergio Schenkman

      1995

      Fonte: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Online) , p. 112

    Atuações

    Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP

    • Pós-graduanda

      1997 a 2003

    Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas

    • Pesquisadora Colaboradora

      2004 a 2012

    Plos One

    • Revisor de periódico

      Desde 2011

    The Brazilian Journal of Infectious Diseases (Impresso)

    • Revisor de periódico

      Desde 2012

    (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

    • Revisor de projeto de fomento

      Desde 2010

    (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

    • Membro de comitê assessor

      Desde 2009

    Universidade Federal de São Paulo

    • Pesquisador Colaborador

      Desde 2004

    • Professor Visitante

      2019 a 2021

    • Professor Afiliado

      Desde 2023

    Journal of Clinical Microbiology (Print)

    • Revisor de periódico

      Desde 2012

    AIDS Research and Human Retroviruses

    • Revisor de periódico

      Desde 2011

    Universidade de São Paulo

    • Pós-Graduando

      Bolsista

      1999 a 2003

    Faculdade de Medicina do ABC

    • Pesquisador Sênior

      2014 a 2020

    Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

    • Membro de comitê assessor

      Desde 2015

    • Revisor de projeto de fomento

      Desde 2015

    International Journal of Infectious Diseases

    • Revisor de periódico

      Desde 2020

    Scientific Reports

    • Revisor de periódico

      Desde 2021

    Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo

    • Revisor de periódico

      Desde 2021

    Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

    • Pesquisador Colaborador

      Desde 2021

    Insects

    • Revisor de periódico

      Desde 2022

    Centro Universitário Lusíada

    • Professor e Pesquisador

      2008 a 2010

    • Professor e Pesquisador

      2012 a 2014

    Microbial Pathogenesis

    • Revisor de periódico

      Desde 2022

    Viruses-Basel

    • Revisor de periódico

      Desde 2022

    Ensino

    Orientações e supervisões

    Dissertação de mestrado em andamento

    • Anne Caroline da Siva

      Utilização de metagenômica na identificação de vírus em culicídeos (Díptera: Culicidae) coletados no município de Mazagão-AM

      Ciências Farmacêuticas

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal do Amapá

      Desde 2019

    Tese de doutorado concluídas

    • Celina Maria Pereira de Moraes Soares

      PREVALÊNCIA DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA DO HIV-1 AOS ANTI-RETROVIRAIS NO BRASIL

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Rafael Gonçalves de Azevedo

      Análise da expressão gênica da IL28B e possível associação com progressão da doença em pacientes HCV positivos.

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2010

    • Nathália Mantovani Pena

      ALTERAÇÕES EPIGENÉTICAS EM PACIENTES INFECTADOS PELO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA HUMANA-1

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2012

    • Maíra Cícero Ferreira

      Expressão do Retrovírus Endógeno Humano da família K (HERV-K) em indivíduos infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1)

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Rafael Arnold

      AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE RESISTÊNCIA TRANSMITIDA E/OU POLIMORFISMOS AOS ANTIRRETROVIRAIS RALTEGRAVIR, DARUNAVIR E ETRAVIRINA EM INDIVÍDUOS COM DIAGNÓSTICO TARDIO PELO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA HUMANA TIPO 1 (HIV-1)

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Daniela Funayama de Castro

      INCIDÊNCIA DA INFECÇÃO PELO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA HUMANA (HIV) NA BAIXADA SANTISTA UTILIZANDO A METODOLOGIA STARHS.

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2013

    • Rodrigo Lopes Sanz Duro

      Metagenômica Viral em Indivíduos Recém Diagnosticados pelo vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1)

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2021

    • Robson dos Santos Souza Marinho

      Sequenciamento do genoma completo do Vírus Chikungunya e identificação de arbovírus no Estado do Tocantins

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2022

    • Magaly Lima Mota

      Epidemiologia molecular dos vírus Zika, Chikungunya e Dengue na cidade de Juazeiro do Norte, Ceará

      Ciências da Saúde

      Faculdade de Medicina do ABC

      Concluído em 2014

    Dissertação de mestrado concluídas

    • Viviane Kelly Alves

      Desenvolvimento de técnicas para avaliação da carga viral do vírus HGV/GBV-C em pacientes co-infectados pelo HIV-1 e determinação de sua relevância clínica

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2008

    • Daniela Teixeira

      Otimização de técnica de detecção de subtipos B e F de HIV-1 e seus recombinantes por reação em cadeia pela polimerase (PCR) em tempo real para as regiões pol (protease) e env (V3)

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Erika Etsuko Fusuma

      Avaliação clonal das vias mutacionais para resistência aos anti-retrovirais

      Infectologia

      Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2007

    • Rafael Gonçalves de Azevedo

      Genotipagem da gp41 do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos respondedores e não respondedores ao inibidor de fusão T20.

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2009

    • Maria Luzinete Sabino da Silva

      Estudo da possível contribuição do resultado do teste de genotipagem dos genes da transcriptase reversa e protease do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) para crianças da cidade de Santos

      Mestrado em Clínica Médica

      Fundação Lusíada

      Concluído em 2010

    • Eliane Pereira do Carmo

      ANÁLISE DA RESISTÊNCIA PRIMÁRIA AO ANTIRRETROVIRAL ETRAVIRINA EM INDIVÍDUOS INFECTADOS PELO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA HUMANA TIPO 1 (HIV-1) NA BAIXADA SANTISTA.

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Nathalia Mantovani Pena

      Análise do gene da integrase do vírus da imunodeficiencia humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha ao HAART e sem tratamento com raltegravir

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2012

    • Marcos Ricardo Menegazzo

      Estudo de polimorf ismos no gene TGF alpha relacionados ao ocorrência de Fissuras Labio Palatina (FMP) em crianças da Baixada Santista.

      Clínica Médica

      Centro Universitário Lusíada

      Concluído em 2009

    • Luiz Claudio Santana da Silva

      Caracterização do genoma completo do Vírus da Hepatite B (HBV) de indivíduos monoinfectados das regiões Norte e Sudeste do Brasil

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Maira Cícero Ferreira

      Caracterização do genoma completo do Vírus da Hepatite Delta (HDV) de indivíduos da região Norte do Brasil.

      Infectologia

      Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2011

    • Everson dos Santos David

      Identificação de vírus entéricos por meio da técnica de metagenômica, em comunidades ribeirinhas do município de Santana-AP

      Ciências Farmacêuticas

      Universidade Federal do Amapá

      Concluído em 2021

    • Gabriela de Souza Amanajás

      Identificação de arbovírus em Aedes aegypti (Diptera:Culicidae) e Anopheles spp. (Diptera:Culicidae) nos municípios de Macapá/AP, Santana/AP e Mazagão

      CIÊNCIAS DA SAÚDE

      Universidade Federal do Amapá

      Concluído em 2021

    • Rodrigo Lopes

      Avaliação da presença de resistência transmitida aos antirretrovirais nos genes da integras, protease e transcriptase reversa do HIV-1 em indivíduos em falha virológica

      Infectologia

      Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

      Universidade Federal de São Paulo

      Concluído em 2014

    Gestão

    Pesquisa

    Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas

    Universidade Federal de São Paulo

    • Avaliação da resistência transmitida em indivíduos infectados pelo vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) e em falha ao HAART usando Sequenciamento de Nova Geração

      Em 1996 foi iniciada a Terapia Antirretroviral Altamente Ativa (HAART), que reduziu tanto a mortalidade quanto a morbidade dos infectados pelo HIV-1, porém junto com o HAART houve a emergência de populações virais resistentes selecionadas pela pressão seletiva dos medicamentos. Essas populações virais surgem a partir da falta de adesão do paciente ao tratamento, farmocinética dependente da genética do hospedeiro, presença de tecidos santuários, entre outros. Juntamente a isso, há a presença de mutações transmitidas aos antirretrovirais (ARVs), onde o indivíduo é infectado por um vírus já resistente. Por esses motivos a pesquisa de novas drogas direcionadas a diferentes alvos do ciclo viral é essencial, pois estas podem ser utilizadas em terapia de resgate para indivíduos em falha ao HAART. Apesar do monitoramento das mutações de resistência aos ARVs, não há dados suficientes relacionados à resistência transmitida e aos polimorfismos causados pelas drogas usadas no tratamento de resgate. Também há muita divergência sobre a importância das variantes minoritárias para o tratamento antirretroviral. Atualmente, as classes de drogas utilizadas para o resgate de indivíduos em falha ao HAART, são: inibidor de integrase - Raltegravir, inibidor de protease - Darunavir e o inibidor da transcriptase reversa não análogo de nucleosídeo (ITRNN) de segunda geração - Etravirina. Esses medicamentos são cruciais no tratamento de resgate, pois possuem ação eficaz contra todas as variantes virais resistentes aos ARV utilizados atualmente. Sendo assim, o principal objetivo deste estudo foi avaliar através do sequenciamento de ultima geração a ocorrência de resistência transmitida e/ou polimorfismos que poderiam impedir ou diminuir a susceptibilidade aos ARVs Raltegravir, Darunavir e Etravirina no resgate de pacientes multifalidos da cidade de São Paulo.

      2013 a 2015

    • Alterações epigenéticas em pacientes infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana-1

      Sabe-se dos mecanismos epigenéticos que atuam no genoma do HIV-1, entretanto, não há estudos sobre as modificações no padrão de metilação no genoma humano, que podem interferir na expressão gênica no ambiente celular. No genoma humano, a metilação de regiões promotoras é essencial para a manutenção dos níveis de expressão gênica na célula, que se encontram alterados em pacientes que apresentam divergência na progressão da doença.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Rafael Gonçalves Azevedo, Luiz Claudio Santana, Ricardo Sobhie Diaz, Maira Cicero Ferreira, Rafael Arnold, Nathalia Mantovani Pena

      2013 a 2015

    • Caracterização do genoma completo do vírus da hepatite delta (HDV) e do vírus da hepatite B da regiao norte e sudeste do Brasil

      A região Amazônica possui o maior número de casos de hepatite Delta no Brasil, já a cidade de São Paulo é uma das cidades mais populosas e com maior diversidade étnica do mundo. No mundo há 350 milhões de portadores crônicos do HBV e 15-20 milhões de coinfectados pelo HDV. A evolução da hepatite Delta é mais severa quando comparada com os outros tipos de hepatites crônicas, uma vez que o HDV aumenta o risco da ocorrência da hepatite fulminante, que por sua vez causa óbito em 80% dos casos. A hepatite fulminante ocorre com mais frequência em coinfectados pelos vírus HDV-3/HBV-F, esses genótipos são encontrados na região Amazônica do Brasil. O HBV é dividido em oito genótipos, sendo que no Brasil são encontrados os genótipos A, D e o F. Estudos com o HDV demonstraram a existência de também oito genótipos deste vírus, onde cada genótipo possui uma distribuição e grau de patogenicidade característico. No Brasil já foram encontrados os genótipos 1, 3 e 8. A caracterização do genoma completo do HDV e HBV da região Amazônica brasileira e do genoma completo do HBV da cidade de São Paulo permitirá à análise epidemiológica e molecular de ambas as infecções, a caracterização das partículas virais, e a pesquisa da presença de partículas virais recombinantes no Norte e Sudeste do Brasil. Este projeto permitirá um estudo mais preciso do genoma completo do HDV e HBV, e em relação ao HBV permitirá o estudo das mutações de resistência transmitida, secundárias e modificações no gene S que podem causar o escape vacinal.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Luiz Claudio Santana, Ricardo Sobhie Diaz, Maira Cicero Ferreira, Rafael Arnold, Nathalia Mantovani Pena

      2012 a 2015

    • Análise da expressão gênica da interleucina 28B (IL-28B) em pacientes monoinfectados pelo HCV E coinfectados HCV/HIV na semana 4 de tratamento anti-HCV

      Atualmente, o melhor tratamento para a infecção crônica pelo Vírus da Hepatite C (HCV) é realizado por meio da administração de interferon-alfa peguilado (PEG-IFN-±) combinado com ribavirina (RBV). Nessa última década, pesquisas mostraram que fatores epidemiológicos, virais e principalmente do hospedeiro possuem grande influência na cura ou progressão de infecções virais, com ou sem a presença de tratamento. No caso do HCV não foi diferente. Isto tem sido verificado naqueles indivíduos infectados pelo HCV que apresentam resposta e cura sem a intervenção de medicamentos. Pesquisas recentes mostraram que polimorfismos em um único nucleotídeo (SNP - single nucleotide polymorphism) no cromossomo 19, mais especificamente no gene que codifica a interleucina 28B (IL-28B), também conhecido como interferon-lambda tipo 3 (IFN-»-3), estão associados com a resposta ou falha virológica em pacientes infectados cronicamente pelo HCV. O SNP rs12979860 de 3 kilobases localizado acima do gene que codifica a IL-28B, esta associado com a cura espontânea sem tratamento e com a cura após tratamento preconizado de 48 semanas com administração semanal de PEG-IFN-± mais Ribavirina. Também foi observado que este SNP é mais frequente na população européia do que na população africana, explicando as melhores taxas de resposta virologica sustentada (RVS) entre europeus comparada com as observadas em africanos, sugerindo assim que descendentes europeus possuem maior probabilidade de cura ou RVS do que descendentes africanos. O objetivo principal do trabalho é comparar as medidas de expressão gênica da IL-28B entre os indivíduos HCV monoinfectados e HCV/HIV-1 coinfectados, que apresentarem o SNP rs12979860, aqueles que não apresentarem e indivíduos sadios.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Rafael Gonçalves Azevedo, Luiz Claudio Santana, Ricardo Sobhie Diaz, Maira Cicero Ferreira, Nathalia Mantovani Pena

      2011 a 2013

    • Análise do gene da Integrase do Vírus da Imunodeficiencia Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha ao HAART e sem tratamento com Raltegravir

      Desde 1996, a terapia anti-retroviral altamente ativa (HAART) reduziu a mortalidade e morbidade do HIV-1. Por outro lado, tivemos a emergência de populações virais resistentes, como consequência da falta de adesão ao tratamento, da farmocinética dependente da genética do hospedeiro, tecidos santuários, entre outros. A pesquisa de novas drogas direcionadas a diferentes alvos do ciclo viral são essenciais por serem utilizadas em terapia de resgate para indivíduos em falha ao HAART. A integração do genoma do HIV-1 ao do hospedeiro é uma etapa chave em que há a formação e estabelecimento de arquivo que representa o principal impedimento para a erradicação deste vírus. O Raltegravir é o primeiro inibidor de integração a ser aprovado pelo FDA sendo um diketo que impede a etapa de transferência da fita viral a do genoma do hospedeiro. Juntamente a isso, temos o grande problema da presença de mutações primárias a determinados antivirais mesmo sem o indivíduo tê-los recebido, como conseqüência de sua transmissão. O Brasil possui um programa de distribuição gratuita de antivirais e a cidade de São Paulo foi à precursora. Desta forma, o objetivo principal deste estudo é padronizar um teste para avaliação da presença de resistência ao anti-retroviral Raltegravir e avaliar a presença de mutações de resistência primária em indivíduos em falha ao HAART que são elegíveis para receberem o Raltegravir.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Rafael Gonçalves Azevedo, Luiz Claudio Santana, Ricardo Sobhie Diaz, Maira Cicero Ferreira, Maria Lucia Gomes Cardoso Ferraz

      2009 a 2011

    • Avaliação da presença de mutações de resistência primária e secundária para os antivirais lamivudina, adefovir e entecavir em indivíduos co-infectados HBV/HIV

      O projeto tem por objetivo estudar os diferentes perfis de mutação primária para os antivirais mais utilizados no tratamento de indivíduos co-infectados pelo HIV e HBV em amostras das cidades de Santos e São Paulo. Outro aspecto a ser abordado é o conhecimento dos genótipos circulantes e a influência das mutações sobre a região do envelope do vírus causando resistência a vacina utilizada para o HBV.O maior objetivo deste trabalho é iniciar na pesquisa científica alunos da Graduação do Curso de Biomedicina na UNILUS.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Rafael Gonçalves Azevedo, Marcos Montani Caseiro, Ricardo Sobhie Diaz, Dercy Jose de Sa-Filho, Nathalia Mantovani Pena

      2008 a 2011

    • Análise da resistência primária ao antirretroviral Etravirina em indivíduos infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) na Baixada Santista.

      A presença de mutações de resistência primária ao Etravirina (ETV) pode interferir na sua susceptibilidade. Apesar disso, pode ser usado como terapia de resgate de pacientes HIV multifalidos apresentando queda da carga viral com alto perfil de segurança. Objetivo: analisar a presença de mutações de resistência primária ao Etravirina em indivíduos HIV positivos. Metodologia: 44 amostras da Baixada Santista foram avaliadas no período de 2009 a 2010. Foi amplificado a região da RT utilizando primers específicos e realizado sequenciamento por Sager. As sequências foram editadas e analisadas utilizando o Programa Sequencher (Gene Code - Miami) e o Bioedit (Carlsbad, California). A Subtipagem foi realizada utilizando o site da Universidade de Stanford. Resistência primária na TR foi avaliada de acordo com os projetos DUET 1 e 2. Resultados: 86,4% das amostras foram provenientes da cidade de Santos, 6,8% da Praia Grande, 4,5% de São Vicente e 2,3% do Guarujá. 50% dos pacientes eram homens. A mediana da CV foi de 26.920 cópias/mL (1785 ? 380580) e a média de CD4 foi de 302 mm3/mL (10 ? 1211). 45,5% dos pacientes estavam com o esquema de tratamento na hora da genotipagem de 2 NRTI + 2 IP e 27,3% estavam com 2 NRTI + 1 NNRTI. Dois pacientes (4,4%) não estavam utilizando medicamento. 68,3% das amostras são subtipos B, 29,3% F/B e 2,4% B/F. 24% das amostras possuíam mutação K103N. Em 13 sequências foram encontradas 31,7% de RAMs ao ETV, entre elas: 4,9% de V90I, 4,9% de A98G, 2,4% de L100I, 2,4% de K101E, 2,4% de K101H, 12,2% de V106I, 4,9% de Y181C e 9,8% de G190A. 3/44 amostras não foi possível analisar a sequência. Conclusão: Apesar da elevada porcentagem de pacientes com mutações de resistência aos outros NNRTI, 4,4% apresentaram mutações de resistência primária conferindo baixa susceptibilidade e 2,2% uma resposta intermediária com o uso do ETV. Concluímos que o ETV pode ser usado no tratamento de resgate de pacientes com resistência a outros NNRTI.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Janayna Thayna Rabelato, Henrique dos Reis Barbosa da Silva, Luiz Claudio Santana, Ricardo Sobhie Diaz, Maira Cicero Ferreira, Paulo Roberto Abrao Ferreira, Nathalia Mantovani Pena

      2008 a 2010

    • Análise molecular da gp41 do Virus da Imunodeficiencia Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha terapêutica aos antiretrovirais

      A gp41 é uma glicoproteína transmembrana do HIV-1 que, juntamente com a gp120, é responsável pelo evento de aproximação e fusão das membranas viral e da célula hospedeira. O sequenciamento das duas regiões da gp41 responsáveis pelo evento de fusão, a HR1 e HR2, mostrou a ocorrência de mutações que conferem resistência primária a uma nova classe de drogas em pacientes não tratados. Essas drogas consistem em peptídeos sintéticos derivados da região carboxiterminal da gp41 (peptídeos C) e podem ser potentes inibidores de entrada do HIV-1 na célula hospedeira.O T20, o primeiro dessa classe de drogas a ser aprovado, demostrou atividade antiretroviral, de acordo com 24 semanas de dois estudos multinacionais (TORO 1 e TORO2) realizados na Europa, Austrália e América no tratamento experimental de pacientes adultos. Esse estudo pretende analisar mudanças nos códons das regiões HR1 e HR2 da gp41 que poderiam determinar uma possível resistência primária em pacientes que estejam em falha no tratamento com os antiretrovirais atuais e que seriam possíveis candidatos ao uso do T20.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Eliane Pereira do Carmo, Marcos Montani Caseiro, Ricardo Sobhie Diaz

      2004 a 2007

    • Monitorização da carga proviral do HIV-1 em pacientes recebendo terapia antiretroviral combinada e associação com a progressão da doença.

      Desenvolvimento de método de quantificação do DNA proviral do HIV-1 por meio do Real Time PCR. A quantificação do DNA proviral do HIV-1 é importante para o estudo da dinâmica da semeadura do reservatório viral, enquanto a carga viral plasmática representa o vírus produzido naquele momento.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Jorge Simão do Rosario Casseb, Carla Cristina Teixeira, Ricardo Sobhie Diaz

      2004 a 2008

    • Sexagem fetal

      Desenvolvimento de um teste de quantificação do cromossomo Y no plasma materno, por meio da PCR em tempo real. Este teste tem por objetivo a determinação do sexo fetal

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Jorge Simão do Rosario Casseb, Carlos Santos, Domingos Ezenildo Matos dos Santos, Ricardo Sobhie Diaz

      2006 a 2006

    • Metagenômica viral em indivíduos com diagnóstico tardio pelo HIV/aids

      Um aspecto importante do imunocomprometimento é o aumento da diversidade das comunidades virais (viroma) plasmáticas e entéricas verificadas em estudos recentes de metagenômica. Com as novas tecnologias de sequenciamento, é possível identificar e caracterizar toda a microbiota viral de uma determinada população, assim como as funções dos genes virais e associação com diferentes patologias. Neste projeto o objetivo é realizar a metagenômica viral no plasma e nas fezes de indivíduos tardiamente diagnosticados como HIV+ e assim, caracterizar todos os vírus presentes, inclusive vírus novos; caracterizar as mutações de resistência transmitida às drogas antirretrovirais nas populações virais do HIV-1; verificar a incidência do diagnóstico tardio, bem como o perfil socioeconômico que caracterizam estes pacientes.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Ricardo Sobhie Diaz

      Desde 2017

    • Estudo da diversidade da região V3 do HIV-1 em pacientes em diferentes estágios clínicos

      O envelope do vírus HIV contém a glicoproteína 120 (gp120) que é formada por cinco regiões constantes e cinco variáveis, dentre as quais está a alça V3. A alça/região V3 é formada por 35 aminoácidos sendo um dos principais alvos do sistema imune e em seu topo (motif) possui uma tétrade de aminoácidos que distingue as variantes antigênicas americana (GPGR) da brasileira (GWGR). Ela é responsável pelo tropismo do vírus e eventos de entrada, além disso, podem induzirambas respostas imunes celulares: as de células T helper e células T citotóxicas. Por estes motivos vem sendo estudada ao longo dos anos para o desenho de vacinas e drogas. Por ser alvo do sistema imune e também de uma droga ocorre a seleção de variantes (quasispécies) virais com melhor capacidade de replicação e sobrevivência no hospedeiro, o que leva a constante geração de diversidade. Neste projeto o objetivo principal é analisar a diversidade da região V3 do HIV-1 entre amostras de pacientes HIV positivos em falha terapêutica a diferentes esquemas de drogas antirretrovirais e recém diagnosticados.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Ricardo Sobhie Diaz, Rodrigo Lopes Sanz Duro, LEAL, ÉLCIO, DELWART, ERIC, Robson dos Santos Souza Marinho, Elaine Matsuda, Shirley Cavalcante Vasconcelos, Jorge Simão do Rosario Casseb, Ricardo Sobhie Diaz, Rodrigo Lopes Sanz Duro, Matheus Borri Marroni, Robson dos Santos Souza Marinho

      Desde 2018

    • Estudo da diversidade genética dos arbovírus que circulam na região Norte do Brasil

      O Brasil é um país de dimensões continentais com climas diversificados o que facilita a disseminação de várias espécies de mosquitos e consequentemente de arbovírus. Estes vírus são transmitidos na natureza por meio de artrópodes hematófagos ou hospedeiro artrópode e se multiplicam produzindo viremia nos vertebrados. Os arbovírus mais relevantes atualmente são o Chickugunya (CHIKV) e Zika (ZIKV) que representam um problema de saúde pública no Brasil e no mundo, juntamente com o vírus causador da dengue. Os sintomas dessas infecções são parecidos e ocorre reação cruzada nos testes sorológicos dificultando o diagnóstico, necessitando de testes moleculares. Outro enfoque é estudar os vírus presentes na microbiota dos mosquitos. Há locais no Brasil, onde não foi estudada a presença da circulação de outros arbovírus e sua diversidade genética. Assim, nosso principal objetivo é estudar o viroma de mosquitos coletados no Estado do Amapá e identificar a diversidade dos vírus patogênicos para humanos e os vírus de mosquitos.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Ricardo Sobhie Diaz, Rodrigo Lopes Sanz Duro, Élcio Leal, DELWART, ERIC, Robson dos Santos Souza Marinho, Raimundo Nonato Picanço Souto, Mânlio Tasso de Oliveira Mota

      Desde 2018

    • Estratégia com intervenções múltiplas para eliminação dos reservatórios virais do HIV-1 entre pacientes em tratamento antirretroviral almejando a remissão sustentada do HIV sem antirretrovirai

      Uso de estratégias combinadas para mitigar o tamanho reservatório proviral da infecção pelo HIV entre pacientes com tratamento antirretroviral supressor e redução do DNA do HIV presente em células e redução da ativação das células T CD4+ e T CD8+.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Maria Cecilia Araripe Sucupira, Luiz Mario Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, Nathalia Mantovani Pena, HUNTER, JAMES, Alfredo Mendrone Junior, Andrea Savarino, César de Almeida Neto, Iart Luca Shytaj, Maria Apaprecida Juliano, Marli Ferreira Curcio, Isabela Nassar, Cássia Aparecida Garcia

      Desde 2020

    • Estudo da diversidade genética e triagem in silico de epítopos candidatos vacinais para SARS-CoV-2 na região Norte do Brasil

      As infecções por COVID-19 no Brasil, especificamente nos estados da região Norte, apresentaram um aumento significativo tanto da taxa de incidência, quanto da taxa de mortalidade no país até o mês de maio de 2020. O genoma de SARS-CoV-2 constitui-se de genoma de RNA fita simples (ssRNA) de polaridade positiva, com um comprimento em torno de 30000 nucleotídeos. Sua estrutura é composta de proteínas não estruturais correspondentes a 2/3 do RNA viral, bem como de proteínas estruturais correspondentes a 1/3 do RNA viral. Uma importante proteína estrutural é a glicoproteína spike (S), que se constitui em duas subunidades S1 e S2, sendo responsável pela entrada do SARS-CoV-2 nas células hospedeiras. A subunidade S1 contém um domínio de ligação ao receptor (RBD) que se liga especificamente na enzima de conversão da angiotensina 2 (ACE2 humana (hACE2)) das células hospedeiras humanas acarretando a entrada viral na célula. Outro componente importante do vírus é a RNA polimerase dependente de RNA (RdRp) ou proteína não estrutural nsp12, que catalisa a síntese do RNA viral e, por conseguinte, desempenha um papel central no ciclo de replicação e transcrição do vírus. Em razão de tudo o que foi apresentado decidimos analisar os epítopos candidatos a vacina nas regiões RdRp e da RDB do SARS-CoV-2 circulante na população de diferentes estados da região Norte utilizando ferramentas de imunoinformática.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Ricardo Sobhie Diaz, Rodrigo Lopes Sanz Duro, Robson dos Santos Souza Marinho

      Desde 2020

    • Novel mechanisms contributing to failure of dolutegravir-containing cART in clinical practice.? The major goal is to provide a scientific basis for optimal large-scale and long-term treatment of PLWH with DTG in Brazil. The central hypothesis is that nove

      The specific aims of this proposal are: 1) To characterize the pattern of INSTI resistance mutations that emerge during failure of DTG-containing cART in individuals infected with subtypes C, F, and BF recombinant forms in Brazil. These are the most prevalent non-B subtypes on the South-American continent. 2) To determine which changes in the 3?-PPT are observed in viruses from DTG failing individuals. Results of this study will show if this novel resistance pathway contributes to acquired drug resistance in clinical practice. 3) To determine the phenotypic consequences of mutations identified in specific aims 1 and 2. These studies assess and compare the effect of novel viral mutations on INSTI susceptibility and viral fitness in HIV subtypes A, B, C, and F in vitro (representing 70% of all infections worldwide), and the molecular mechanism of 3?-PPT mediated INSTI resistance will be determined. The insights generated with these studies will contribute to a more effective use of second generation INSTIs in the future.

      Desde 2019

    • Características sorológicas e moleculares de vírus da hepatite B em indivíduos com infecção única ou com infecção dupla por vírus da hepatite Delta na Amazônia Ocidental

      A Amazônia Ocidental caracteriza-se por uma elevada prevalência de infecção por vírus das hepatites B e Delta (HBV e HDV), estando a infecção dupla associada a uma maior morbi-mortalidade. De modo a contribuir para a história natural destas infecções, estabeleceu-se um protocolo de estudo com o objetivo de comparar as características sorológicas e moleculares de indivíduos com infecção única por HBV com indivíduos com infecção adicional por HDV. O estudo terá um delineamento do tipo caso-controle, e os grupos para estudo serão selecionados entre portadores crônicos de HBV no Hemocentro do Amazonas e Ambulatório da Universidade do Amazonas. Amostras de soro dos participantes serão submetidas à identificação dos marcadores sorológicos HBeAg/Anti-HBe e anti-Delta, detecção e quantificação de HBV DNA e HDV RNA, genotipagem de ambos os vírus, frequência de mutações na região pre-core e promotora do core do HBV, análise bioquímica e contagem de plaquetas. Casos e controles serão comparados quanto a estas características.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Maria Cecilia Araripe Sucupira, Luiz Mario Ramos Janini, Ricardo Sobhie Diaz, James Richard Hunter, Juliana Terzi Maricato

      2003 a 2008

    Universidade de São Paulo

    • Incidência, fatores de risco, mecanismos patogênicos e prevenção de distúrbios neurocognitivos (HAND) entre indivíduos infectados com HIV-1

      A prognóstico da HAND apresenta uma difícil abordagem, especialmente na primeira fase da doença, o que pode impedir o tratamento precoce e a prevenção de formas mais graves. O projeto visa combinar vários estudos anteriores que descrevem fatores virológicos e imunológicos que poderiam ser considerados marcadores de potenciais de diagnóstico, bem como fatores mais recentemente identificados. Ele também abrangerá a resposta à ART, como o uso de inibidores de integrase, que atualmente são vistos como padrão-ouro na terapia anti-HIV

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Dagmar Kiesslich, Myuki Alfaia Esashika Crispim, Carlos Santos, Ricardo Sobhie Diaz

      Desde 2019

    • Metodos sorológicos e moleculares para identificação de variantes do vírus da imunodeficiência humana do tipo 1 (HIV-1) do subtipo B presente em São Paulo, Brasil.

      Comparar métodos sorológicos e moleculares para ajudar em estudos epidemiológicos do HIV-1.

      Autores: Shirley Cavalcante Vasconcelos, Jorge Simão do Rosario Casseb, Augusto Cesar Penalva de Oliveira, Simone Kashima Haddad, Wilson Domingues

      1999 a 2003

    Outras atividades técnico científicas

    Atualização Lattes em 2023-12

    Processado em 2023-12-28