Emerson Rodrigo da Silva
Escola Paulista de Medicina
Programa de Pós-Graduação: Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
E-Mail: er.silva@unifesp.br
Resumo
Professor Adjunto do Departamento de Biofísica da UNIFESP, obteve o título de Doutor em Física (2011) pelas Universidades de São Paulo e de Bordeaux (França) com tese sobre estrutura e dinâmica de DNA intercalado em fases lamelares de lipídeos. Durante o doutorado, foi bolsista do Programme de Bourses d'Excellence Eiffel-Egide. Tem experiência em métodos biofísicos voltados à caracterização estrutural de sistemas auto-organizados de biomoléculas, incluindo técnicas espectroscópicas, métodos de microscopia e ferramentas de espalhamento de espalhamento a baixo ângulo (raios X e nêutrons). Foi bolsista de pós-doutorado na UFABC, onde estudou sistemas auto-organizados à base de peptídeos anfifílicos. Entre maio de 2014 e maio de 2015 foi pesquisador visitante no Departamento de Química da Universidade de Reading, Reino Unido. Foi Professor visitante do Instituto de Física da Universidade Federal de Alagoas. Atualmente, coordenada o Laboratório de Biofísica Estrutural no Departamento de Biofísica da Escola Paulista de Medicina da UNIFESP. Membro pleno da Sociedade Brasileira de Física (SBF), da Sociedade Brasileira de Biofísica (SBBf) e da Sigma Xi, The Scientific Research Honor Society (USA).
Fonte: Lattes CNPq
Nomes em citações bibliográficas
da Silva, E.R.T.;Teixeira da Silva, E.R.;Silva,E.R.;Silva,E.R.T.;da Silva,E.R.;Teixeira da Silva, E. R.;Rodrigo Teixeira da Silva, E.;SILVA, E.R.;SILVA, EMERSON R. T.;SILVA, Emerson R.;DA SILVA, EMERSON RODRIGO;DA Silva, Emerson R.;SILVA, EMERSON RODRIGO DA;DA SILVA, E. R.;RODRIGO DA SILVA, EMERSON;SILVA, EMERSON;SILVA, EMERSON RODRIGO;SILVA, EMERSON R. DA
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Formação
Doutorado em Física
Estrutura e dinâmica de DNA confinado entre membranas lipídicas não-catiônicas
Estrutura de Líquidos e Sólidos; Cristalografia
Física da Matéria Condensada
Orientação: Elisabeth Andreoli de Oliveira
Universidade de São Paulo
Mestrado em Física
Estudo das Propriedades do Biospeckle e suas Aplicações
Orientação: Mikiya Muramatsu
Universidade de São Paulo - Instituto de Física/SP
2005 a 2007
Graduação em Bacharelado Em Física
Universidade de São Paulo
2001 a 2005
Produção
2024
-
Comparison of the self¿assembly and cytocompatibility of conjugates of Fmoc (9¿fluorenylmethoxycarbonyl) with hydrophobic, aromatic, or charged amino acids (2024)
Artigo publicado
Autores: CASTELLETTO, VALERIA; MELLO, LUCAS; Emerson Rodrigo da Silva; SEITSONEN, JANI; HAMLEY, IAN
Fonte: JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE , v. e , p. 3571 - Extrato QUALIS: A4
-
Influence of the degree of arginine substitution on chitosan-N-arginine-based chitosomes: Insights for improved gene delivery systems (2024)
Artigo publicado
Autores: GARCIA, BIANCA B.M.; MERTINS, OMAR; Emerson Rodrigo da Silva; HAN, SANG W.
Fonte: JOURNAL OF DRUG DELIVERY SCIENCE AND TECHNOLOGY , v. 92 , p. 105368 - Extrato QUALIS: A3
2023
-
DNA-templated self-assembly of bradykinin into bioactive nanofibrils (2023)
Artigo publicado
Autores: LOURENÇO, THIAGO C.; DE MELLO, LUCAS R.; ICIMOTO, MARCELO Y.; BICEV, RENATA N.; HAMLEY, IAN W.; CASTELLETTO, VALERIA; Clovis Ryuichi Nakaie; DA SILVA, EMERSON R.
Fonte: Soft Matter , v. 19 , p. 4869 - Extrato QUALIS: A2
-
Aggregation Limiting Cell-Penetrating Peptides Derived from Protein Signal Sequences (2023)
Artigo publicado
Autores: POROSK, LY; HÄRK, HELERI HEIKE; BICEV, RENATA NAPORANO; GAIDUT?IK, ILJA; NEBOGATOVA, JEKATERINA; ARMOLIK, EGER-JASPER; ARUKUUSK, PIRET; Emerson Rodrigo da Silva; LANGEL, ÜLO
Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24 , p. 4277 - Extrato QUALIS: A2
-
Modification of the Linker Amino Acid in the Cell-Penetrating Peptide NickFect55 Leads to Enhanced pDNA Transfection for In Vivo Applications (2023)
Artigo publicado
Autores: HÄRK, HELERI H.; POROSK, LY; DE MELLO, LUCAS R.; ARUKUUSK, PIRET; Emerson Rodrigo da Silva; KURRIKOFF, KAIDO
Fonte: PHARMACEUTICS , v. 15 , p. 883 - Extrato QUALIS: A1
-
Pyroglutamination-Induced Changes in the Physicochemical Features of a CXCR4 Chemokine Peptide: Kinetic and Structural Analysis (2023)
Artigo publicado
Autores: FERREIRA, MARIANA M. L.; DE SOUZA, SINVAL E. G.; DA SILVA, CAROLINE C.; SOUZA, LOUISE E. A.; BICEV, RENATA N.; DA SILVA, EMERSON R.; Clovis Ryuichi Nakaie
Fonte: BIOCHEMISTRY , v. 62 , p. 2530 - Extrato QUALIS: A1
-
Self-Assembly and Cytocompatibility of Amino Acid Conjugates Containing a Novel Water-Soluble Aromatic Protecting Group (2023)
Artigo publicado
Autores: CASTELLETTO, VALERIA; MELLO, LUCAS; Emerson Rodrigo da Silva; SEITSONEN, JANI; HAMLEY, IAN W
Fonte: BIOMACROMOLECULES , v. 24 , p. 5403 - Extrato QUALIS: A1
-
Harnessing Efficient ROS Generation in Carbon Dots Derived from Methyl Red for Antimicrobial Photodynamic Therapy (2023)
Artigo publicado
Autores: FERREIRA, RAUL L.; Emerson Rodrigo da Silva; LANDELL, MELISSA F.; DE OLIVEIRA, ITALO N.; JR, WALTER MUNIZ; SOUZA, LOUISE E. A.; NAVARRO, HECTOR M. C.; DE MELLO, LUCAS R.; MASTELARO, VALMOR R.; SALES, TASSO O.; BARBOSA, CINTYA D. A. E. S.; RIBEIRO, ADRIANA S.
Fonte: Acs Applied Bio Materials , v. 6 , p. 4345 - Extrato QUALIS: B2
-
-
Glucose restriction in Saccharomyces cerevisiae modulates the phosphorylation pattern of the 20S proteasome and increases its activity (2023)
Artigo publicado
Autores: BICEV, RENATA NAPORANO; DE SOUZA DEGENHARDT, MAXIMILIA FRAZÃO; DE OLIVEIRA, CRISTIANO LUIS PINTO; Emerson Rodrigo da Silva; DEGROUARD, JÉRIL; TRESSET, GUILLAUME; RONSEIN, GRAZIELLA ELIZA; DEMASI, MARILENE; DA CUNHA, FERNANDA MARQUES
Fonte: Scientific Reports , v. 13 , p. 19383 - Extrato QUALIS: A1
2022
-
Molecular Structure and Antibacterial Activity of Degradation Products from Cephalexin Solutions Submitted to Thermal and Photolytic Stress (2022)
Artigo publicado
Autores: LOURENÇO, CECÍLIA; SOUZA, LOUISE E. A.; VALÊNCIO, ANDRÉ; MACHADO, MARCELO F. M.; Antonio de Miranda; SILVA, EMERSON R.
Fonte: ChemistrySelect , v. 7 , p. 101 - Extrato QUALIS: A4
-
Nanostructure Formation and Cell Spheroid Morphogenesis of a Peptide Supramolecular Hydrogel (2022)
Artigo publicado
Autores: DE MELLO, LUCAS R.; Emerson Rodrigo da Silva; CARRASCOSA, VINICIUS; REBELATO, EDUARDO; JULIANO, MARIA A.; HAMLEY, IAN W.; CASTELLETTO, VALERIA; VASSILIADES, SANDRA V.; ALVES, WENDEL A.; NAKAIE, CLOVIS R.
Fonte: LANGMUIR , v. 38 , p. 3434 - Extrato QUALIS: A2
-
A Biophysical Study of DNA Condensation Mediated by Histones and Protamines (2022)
Artigo publicado
Autores: B. S. SOUZA, BRUNA; LOURENÇO, THIAGO C.; GERBELLI, BARBARA B.; OSELIERO FILHO, PEDRO L.; L. P. OLIVEIRA, CRISTIANO; Antonio de Miranda; DA SILVA, EMERSON R.
Fonte: JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS , v. 368 , p. 120745 - Extrato QUALIS: A1
-
Methods for Small-Angle Scattering Measurements on Peptiplexes of DNA with Cell-Penetrating Peptides (2022)
Capítulo de livro publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Lucas Rodrigues de Mello; HAMLEY, IAN
Fonte: Methods in Molecular Biology, Cell Penetrating Peptides , p. 181
2021
-
Structure optimization of lipopeptide assemblies for aldol reactions in an aqueous medium (2021)
Artigo publicado
Autores: SOARES, BRUNA M.; SCHMUCK, CARSTEN; COUTINHO-NETO, MAURÍCIO D.; ALVES, WENDEL A.; SODRÉ, PEDRO T.; AGUILAR, ANDREA M.; GERBELLI, BARBARA B.; PELIN, JULIANE N. B. D.; ARGÜELLO, KARINA B.; Emerson Rodrigo da Silva; DE FARIAS, MARCELO A.; PORTUGAL, RODRIGO V.
Fonte: PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS , v. 23 , p. 10953 - Extrato QUALIS: A1
-
ZnO Nanoparticle/Poly(vinyl alcohol) Nanocomposites via Microwave-Assisted Sol-Gel Synthesis for Structural Materials, UV Shielding, and Antimicrobial Activity (2021)
Artigo publicado
Autores: FACTORI, IRINA M.; AMARAL, JÚLIA M.; CAMANI, PAULO H.; ROSA, DERVAL S.; LIMA, BRUNA A.; BROCCHI, MARCELO; Emerson Rodrigo da Silva; SOUZA, JULIANA S.
Fonte: ACS Applied Nano Materials , v. 4 , p. acsanm.1c01334 - Extrato QUALIS: A4
-
Microfluidic encapsulation of nanoparticles in alginate microgels gelled via competitive ligand exchange crosslinking (2021)
Artigo publicado
Autores: CINEL, VICTOR DAL POSOLO; TAKETA, THIAGO BEZERRA; CARVALHO, BRUNA GREGATTI; TORRE, LUCIMARA GAZIOLA; MELLO, LUCAS RODRIGUES; Emerson Rodrigo da Silva; HAN, SANG WON
Fonte: BIOPOLYMERS , v. 112 , p. e23432 - Extrato QUALIS: A2
-
Amyloid-like Self-Assembly of a Hydrophobic Cell-Penetrating Peptide and Its Use as a Carrier for Nucleic Acids (2021)
Artigo publicado
Autores: DE MELLO, LUCAS R.; POROSK, LY; LOURENÇO, THIAGO C.; GARCIA, BIANCA B. M.; COSTA, CARLOS A. R.; HAN, SANG W.; DE SOUZA, JULIANA S.; LANGEL, ÜLO; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: ACS Applied Bio Materials , v. 4 , p. 6404 - Extrato QUALIS: B2
2020
-
Amphipathic Design Dictates Self-Assembly, Cytotoxicity and Cell Uptake of Arginine-rich Surfactant-like Peptides (2020)
Artigo publicado
Autores: MELLO, LUCAS; AGUIAR, RODRIGO BARBOSA; YAMADA, RENATA; DE MORAES, JANE ZVEITER; HAMLEY, IAN; ALVES, WENDEL ANDRADE; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: Journal of Materials Chemistry B , v. 8 , p. 2495 - Extrato QUALIS: A1
-
Molecular structure and supramolecular assembly of a TGF-β1 mimetic oligopeptide (2020)
Artigo publicado
Autores: LOURENÇO, THIAGO C.; MELLO, LUCAS R.; SILVA, BRUNA B.S.; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE , v. 1219 , p. 128691 - Extrato QUALIS: A3
-
Amyloid Formation by Short Peptides in the Presence of Dipalmitoylphosphatidylcholine Membranes (2020)
Artigo publicado
Autores: GERBELLI, BARBARA B.; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; Emerson Rodrigo da Silva; HAMLEY, IAN W.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: LANGMUIR , v. 36 , p. 14793 - Extrato QUALIS: A2
-
Self-assembly and Intracellular Delivery of DNA by a Truncated Fragment Derived from the Trojan Peptide Penetratin (2020)
Artigo publicado
Autores: MELLO, LUCAS; HAMLEY, IAN; CASTELLETTO, VALERIA; GARCIA, BIANCA BONETTO MORENO; LOURENÇO, THIAGO DA COSTA; VASSILIADES, SANDRA VALERIA; ALVES, WENDEL ANDRADE; HAN, SANG WON; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: Soft Matter , v. 16 , p. 4746 - Extrato QUALIS: A2
-
Arginine-Modified Chitosan Complexed with Liposome Systems for plasmid DNA delivery (2020)
Artigo publicado
Autores: GARCIA, BIANCA B.M.; MERTINS, OMAR; Emerson Rodrigo da Silva; MATHEWS, PATRICK D.; HAN, SANG W.
Fonte: COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES , v. 193 , p. 111131 - Extrato QUALIS: A2
-
Polyionic complexes of chitosan-N-arginine with alginate as pH responsive and mucoadhesive particles for oral drug delivery applications (2020)
Artigo publicado
Autores: FERNANDES PATTA, ANA C.M.; MATHEWS, PATRICK D.; MADRID, RAFAEL R.M.; RIGONI, VERA L.S.; Emerson Rodrigo da Silva; MERTINS, OMAR
Fonte: INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 148 , p. 550 - Extrato QUALIS: A1
2019
-
Structure of Rhoptry Neck Protein 2 is essential for the interaction in vitro with Apical Membrane Antigen 1 in Plasmodium vivax (2019)
Artigo publicado
Autores: SALGADO-MEJIAS, PERLA; ALVES, FLAVIO L.; FRANÇOSO, KÁTIA S.; RISKE, KARIN A.; SILVA, EMERSON R.; Antonio de Miranda; SOARES, IRENE S.
Fonte: MALARIA JOURNAL , v. 18 , p. 1 - Extrato QUALIS: A2
-
β - sheet assembly in amyloidogenic glutamic acid nanostructures: Insights from X-ray scattering and infrared nanospectroscopy (2019)
Artigo publicado
Autores: MELLO, LUCAS R.; HAMLEY, IAN W.; Antonio de Miranda; ALVES, WENDEL A.; SILVA, EMERSON R.
Fonte: JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE , v. 1 , p. e3170 - Extrato QUALIS: A4
-
Model Self-Assembling Arginine-Based Tripeptides Show Selective Activity Against Pseudomonas Bacteria (2019)
Artigo publicado
Autores: CASTELLETTO, VALERIA; EDWARDS-GAYLE, CHARLOTTE; HAMLEY, IAN; BARRETT, GLYN; SEITSONEN, JANI; RUOKOLAINEN, JANNE; MELLO, LUCAS; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: CHEMICAL COMMUNICATIONS , v. 56 , p. 615 - Extrato QUALIS: A1
-
Nanoscopic Structure of Complexes Formed Between DNA and the Cell Penetrating Peptide Penetratin (2019)
Artigo publicado
Autores: DE MELLO, LUCAS RODRIGUES; HAMLEY, IAN W.; CASTELLETTO, VALERIA; GARCIA, BIANCA BONETTO MORENO; HAN, SANG WON; OLIVEIRA, CRISTIANO LUIS PINTO; Emerson Rodrigo da Silva
Fonte: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B , v. 123 , p. 8861 - Extrato QUALIS: A2
2018
-
Hybrid Conjugates Formed between Gold Nanoparticles and an Amyloidogenic Diphenylalanine-Cysteine Peptide (2018)
Artigo publicado
Autores: PELIN, JULIANE N. B. D.; ALVES, WENDEL A.; GATTO, EMANUELA; VENANZI, MARIANO; CAVALIERI, FRANCESCA; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; MARTINHO, HERCULANO; Emerson Rodrigo da Silva; AGUILAR, ANDREA M.; SOUZA, JULIANA S.
Fonte: ChemistrySelect , v. 3 , p. 6756 - Extrato QUALIS: A4
-
Sequence length dependence in arginine/phenylalanine oligopeptides: Implications for self-assembly and cytotoxicity (2018)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; LISTIK, EDUARDO; HAN, SANG W.; ALVES, WENDEL A.; SOARES, BRUNA M.; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; HAMLEY, IAN W.
Fonte: BIOPHYSICAL CHEMISTRY , v. 233 , p. 1 - Extrato QUALIS: A3
-
Poly(vinyl alcohol) as a structuring agent for peroxotungstic acid (2018)
Artigo publicado
Autores: DE MOURA, DIEGO SOARES; PAZINATO, JULIA CRISTINA OLIVEIRA; PEREIRA, MARCELO BARBALHO; MERTINS, OMAR; Emerson Rodrigo da Silva; GARCIA, IRENE TERESINHA SANTOS
Fonte: JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS , p. 92 - Extrato QUALIS: A1
-
Insights on Structuration of Peroxotungstic Acid in Aqueous Media (2018)
Artigo publicado
Autores: PAZINATO, JULIA; VILLETTI, MARCOS; MERTINS, OMAR; Emerson Rodrigo da Silva; GARCIA, IRENE
Fonte: JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 30 , p. 752 - Extrato QUALIS: A2
2017
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Nanostructured Antigen-Responsive Hydrogels Based on Peptides for Leishmaniasis Detection (2017)
Artigo publicado
Autores: SOUZA, SIVONEY; KOGIKOSKI JR., SERGIO; Emerson Rodrigo da Silva; ALVES, WENDEL
Fonte: JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 28 , p. 1619 - Extrato QUALIS: A2
-
Shear Alignment of Bola-Amphiphilic Arginine-Coated Peptide Nanotubes (2017)
Artigo publicado
Autores: HAMLEY, IAN W; DATTANI, RAJEEV; HERMIDA-MERINO, DANIEL; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; STASIAK, JOANNA; BURHOLT, SAMUEL; HUTCHINSON, JESSICA; CASTELLETTO, VALERIA; Emerson Rodrigo da Silva; ALVES, WENDEL ANDRADE; GUTFREUND, PHILIPP; NEWBY, GEMMA E; PORCAR, LIONEL
Fonte: Biomacromolecules , v. 18 , p. 141 - Extrato QUALIS: A1
-
Multilamellar-to-unilamellar transition induced by diphenylalanine in lipid vesicles (2017)
Artigo publicado
Autores: GERBELLI, BÁRBARA BIANCA; Emerson Rodrigo da Silva; MIRANDA SOARES, BRUNA; ALVES, WENDEL ANDRADE; OLIVEIRA, ELISABETH ANDREOLI DE
Fonte: LANGMUIR , v. 34 , p. 2171 - Extrato QUALIS: A2
-
Conjugation with L,L-diphenylalanine Self-Assemblies Enhances In Vitro Antitumor Activity of Phthalocyanine Photosensitizer (2017)
Artigo publicado
Autores: SOUZA, MÁRCIA I.; PRIETO, TATIANA; RODRIGUES, TIAGO; Fabio Furlan Ferreira; NASCIMENTO, FRANCISCO B.; RIBEIRO, ANDERSON O.; Emerson Rodrigo da Silva; GIUNTINI, FRANCESCA; ALVES, WENDEL A.
Fonte: Scientific Reports , v. 7 , p. 13166-1 - Extrato QUALIS: A1
2016
-
Polycaprolactone fibers with self-assembled peptide micro/nanotubes: a practical route towards enhanced mechanical strength and drug delivery applications (2016)
Artigo publicado
Autores: Michelle S Liberato; KOGIKOSKI, S.; DA SILVA, E. R.; Daniele Ribeiro de Araujo; Suchismita Guha; Wendel Andrade Alves
Fonte: J MATER CHEM B , v. 4 , p. 1405 - Extrato QUALIS: A1
-
Structural Behaviour and Gene Delivery in Complexes Formed Between DNA and Arginine-Containing Peptide Amphiphiles (2016)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; COONEY, GARY; HAMLEY, IAN; ALVES, WENDEL ANDRADE; LEE, SHANNON; O'CONNOR, BRENDAN; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; WALLS, DERMOT
Fonte: Soft Matter (Print) , v. 12 , p. 9158 - Extrato QUALIS: A2
-
Chiral Organocatalysts Based on Lipopeptide Micelles for Aldol Reactions in Water (2016)
Artigo publicado
Autores: SOARES, BRUNA MIRANDA; AGUILAR, ANDREA MARIA; Emerson Rodrigo da Silva; COUTINHO, MAURICIO; HAMLEY, IAN; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; ALVES, WENDEL ANDRADE
Fonte: PCCP. Physical Chemistry Chemical Physics (Print) , v. 19 , p. 1181 - Extrato QUALIS: A1
-
Polycaprolactone-Polyaniline Blend: Effects of the Addition of Cysteine on the Structural and Molecular Properties (2016)
Artigo publicado
Autores: KOGIKOSKI JR, SERGIO; LIBERATO, MICHELLE DA SILVA; FACTORI, IRINA MARINHO; Emerson Rodrigo da Silva; DE OLIVEIRA, CRISTIANO LUIS PINTO; ANDO, ROMULO A.; ALVES, WENDEL ANDRADE
Fonte: Journal of Physical Chemistry. C , v. 121 , p. 863 - Extrato QUALIS: A1
2015
-
Self-assembly pathway of peptide nanotubes formed by a glutamatic acid-based bolaamphiphile (2015)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; ALVES, WENDEL ANDRADE; CASTELLETTO, VALERIA; REZA, MEHEDI; RUOKOLAINEN, JANNE; HUSSAIN, ROHANAH; HAMLEY, IAN WILLIAM
Fonte: Chemical Communications (London. 1996. Print) , v. 51 , p. 11634 - Extrato QUALIS: A1
-
Self-Assembled Arginine-Capped Peptide Bolaamphiphile Nanosheets for Cell Culture and Controlled Wettability Surfaces (2015)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; WALTER, MERLIN NATHANIEL MARK; REZA, MEHEDI; CASTELLETTO, VALERIA; RUOKOLAINEN, JANNE; CONNON, CHE JOHN; ALVES, WENDEL ANDRADE; HAMLEY, IAN WILLIAM
Fonte: Biomacromolecules , v. 16 , p. 3180 - Extrato QUALIS: A1
-
Self-Assembly of a Designed Alternating Arginine/Phenylalanine Oligopeptide (2015)
Artigo publicado
Autores: Carla Cristina Decandio; Emerson Rodrigo da Silva; HAMLEY, IAN W.; CASTELLETTO, VALERIA; LIBERATO, MICHELLE S.; OLIVEIRA, VANI X.; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: LANGMUIR , v. 31 , p. 4513 - Extrato QUALIS: A2
2014
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The role of water and structure on the generation of reactive oxygen species in peptide/hypericin complexes (2014)
Artigo publicado
Autores: SOUZA, MÁRCIA I.; Emerson Rodrigo da Silva; JAQUES, YGOR M.; Fábio Furlan Ferreira; FILETI, EUDES E.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: Journal of Peptide Science (Print) , v. 20 , p. 554 - Extrato QUALIS: A4
-
A Nonenzymatic Biosensor Based on Gold Electrodes Modified with Peptide Self-Assemblies for Detecting Ammonia and Urea Oxidation (2014)
Artigo publicado
Autores: BIANCHI, ROBERTA C.; Emerson Rodrigo da Silva; DALL'ANTONIA, LUIZ H.; FERREIRA, FABIO FURLAN; ALVES, WENDEL ANDRADE
Fonte: Langmuir , v. 30 , p. 140918155008002 - Extrato QUALIS: A2
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2013
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Nanocomposites based on Poly-epsilon-caprolactone/L-diphenylalanine nanotubes (2013)
Trabalhos em eventos
Autores: LIBERATO, MICHELLE S.; KOGIKOSKI, SERGIO; Ligia Maria Manzine Costa; Carla Cristina Decandio; Mariselma Ferreira; Derval dos Santos Rosa; Emerson Rodrigo da Silva; ALVES, WENDEL A.
Fonte: PepMat 2013 Peptide Materials for Biomedicine and Nanotechnology , p. 50
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Structure dependence of ROS production in peptide nanotubes functionalized with hypericin (2013)
Trabalhos em eventos
Autores: SOUZA, MÁRCIA I.; JAQUES, YGOR M.; Emerson Rodrigo da Silva; RIBEIRO, ANDERSON O.; Fábio Furlan Ferreira; FILETI, EUDES E.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: PepMat 2013 Peptide Materials for Biomedicine and Nanotechnology , p. 82
-
Fibrillation of Arg/Phe peptides investigated by Small-Angles X-rays Scattering (2013)
Trabalhos em eventos
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; LIBERATO, MICHELLE S.; KOGIKOSKI, SERGIO; Carla Cristina Decandio; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: PepMat 2013 Peptide Materials for Biomedicine and Nanotechnology , p. 85
-
Structural and Photophysical Properties of Peptide Micro/Nanotubes Functionalized with Hypericin (2013)
Artigo publicado
Autores: SOUZA, MÁRCIA I.; ALVES, WENDEL A.; JAQUES, YGOR M.; DE ANDRADE, GISLAINE P.; RIBEIRO, ANDERSON O.; Emerson Rodrigo da Silva; FILETI, EUDES E.; ÁVILLA, ÉRICK DE SOUZA; PINHEIRO, MAURÍCIO V. B.; KRAMBROCK, KLAUS
Fonte: The Journal of Physical Chemistry. B (1997 : Online) , v. 117 , p. 2605 - Extrato QUALIS: A2
-
L-diphenylalanine microtubes as potential drug-delivery system: characterization, release kinetics and cytotoxicity (2013)
Artigo publicado
Autores: SILVA, RONDES FERREIRA; Daniele Ribeiro de Araujo; SILVA, EMERSON RODRIGO DA; ANDO, RÔMULO AUGUSTO; ALVES, WENDEL ANDRADE
Fonte: Langmuir , v. 29 , p. 10205 - Extrato QUALIS: A2
-
Steric-Induced Effects on Stabilizing a Lamellar Structure (2013)
Artigo publicado
Autores: GERBELLI, BARBARA B.; RUBIM, RAFAEL L.; Emerson Rodrigo da Silva; NALLET, FRÉDÉRIC; NAVAILLES, LAURENCE; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; DE OLIVEIRA, ELISABETH A.
Fonte: Langmuir , v. 29 , p. 13717 - Extrato QUALIS: A2
-
Self-Assembly of Arg-Phe Nanostructures via the Solid-Vapor Phase Method (2013)
Artigo publicado
Autores: LIBERATO, MICHELLE S.; KOGIKOSKI, SERGIO; Emerson Rodrigo da Silva; COUTINHO-NETO, MAURICIO D.; SCOTT, LUIS P. B.; SILVA, RICARDO H.; OLIVEIRA, VANI X.; ANDO, RÔMULO A.; ALVES, WENDEL A.
Fonte: Journal of Physical Chemistry. B , v. 117 , p. 733 - Extrato QUALIS: A2
2012
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Synthesis and characterization of [Arg-Phe]-octapeptide nanostructures prepared via solid-vapor phase (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: MIchelle da Silva Liberato; Sergio Kogikoski Jr.; Emerson Rodrigo da Silva; Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva; Vani Xavier de Oliveira Junior; Luis Paulo Barbour Scott; Wendel Andrade Alves
Fonte: International Conference on Bioinspired and Biobased Chemistry and Materials Program and Abstract , p. 112
-
Self-assembled diphenylalanine micro/nanotubes prepared via solid-vapor phase (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Sergio Kogikoski Jr.; Heliane Rosa do Amaral; Emerson Rodrigo da Silva; José Antônio Souza; Wendel Andrade Alves
Fonte: International Conference on Bioinspired and Biobased Chemistry and Materials Program and Abstract , p. 205
-
L-diphenylalanine assemblies as potential carriers for drug delivery (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Rondes Ferreira da Silva; Daniele Ribeiro de Araújo; Emerson Rodrigo da Silva; Wendel Andrade Alves
Fonte: International Conference on Bioinspired and Biobased Chemistry and Materials Program and Abstract , p. 204
-
-
-
Anisotropic Brownian motion in ordered phases of DNA fragments (2012)
Artigo publicado
Autores: Jens Dobrindt; Emerson Rodrigo da Silva; Cássio Alves; Cristiano Luís Pinto de Oliveira; Nallet, F.; Andreoli de Oliveira, E.; Navailles, L.
Fonte: The European Physical Journal. E, Soft Matter (Print) , v. 35 , p. 3 - Extrato QUALIS: A4
-
Micro- and nano-sized peptidic assemblies prepared via solid-vapor approach: Morphological and spectroscopic aspects (2012)
Artigo publicado
Autores: AMARAL, H.R.; KOGIKOSKI, S.; Emerson Rodrigo da Silva; SOUZA, J.A.; ALVES, W.A.
Fonte: Materials Chemistry and Physics , v. 137 , p. 628 - Extrato QUALIS: A2
-
Gaussian deconvolution: a useful method for a form-free modeling of scattering data from mono- and multilayered planar systems (2012)
Artigo publicado
Autores: OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; GERBELLI, BARBARA B.; Emerson Rodrigo da Silva; NALLET, FRÉDÉRIC; NAVAILLES, LAURENCE; OLIVEIRA, ELISABETH A.; PEDERSEN, JAN SKOV
Fonte: Journal of Applied Crystallography , v. 45 , p. 1278 - Extrato QUALIS: A2
-
Microscopy tools for investigating nano-to-mesoscale peptide assemblies (2012)
Capítulo de livro publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; MIchelle da Silva Liberato; Márcia Isabel de Souza; Iorquirene de Oliveira Matos; Rondes Ferreira da Silva; Sergio Kogikoski Jr.; Roberta Costa Bianchi; Wendel Andrade Alves
Fonte: Current Microscopy Contributions to Advances in Science and Technology , p. 1456
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Gaussian deconvolution: a powerful method for modeling scattering profiles of mono and multilayered vesicles (2012)
Trabalhos em eventos
Autores: Cristiano Luís Pinto de Oliveira; Emerson Rodrigo da Silva; Barbara Bianca Gerbelli; Nallet; Navailles, L.; Elisabeth Andreoli de Oliveira; Jan Skov Pedersen
Fonte: ICOMF14 (LB14) , p. PA082
2011
2010
-
Transient process in ice cream evaluated by laser speckles (2010)
Artigo publicado
Autores: Elieste da Silva Júnior; Emerson Rodrigo da Silva; Mikiya; Suzana Caetano da Silva Lannes
Fonte: Food Research International , v. 43 , p. 1470 - Extrato QUALIS: A1
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2009
-
The optical analysis of the abdominal wall using the biospeckle after implants of polypropylene mesh in rats (2009)
Artigo publicado
Autores: Tâmara Maria Nieri; Marco Antônio de Oliveira Peres; Emerson Rodrigo da Silva; Mikiya; Inácio Maria Dal Fabro; Nelson Adami Andreollo
Fonte: Acta Cirurgica Brasileira (Impresso) , v. 24 , p. 442 - Extrato QUALIS: A4
2008
-
Application of biospeckle phenomenon on monitoring of leavening process in breadmaking (2008)
Trabalhos em eventos
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Elieste da Silva Júnior; Mauro Favoretto Júnior; Suzana Caetano da Silva Lannes; Muramatsu, Mikiya (Mikiya Muramatsu)
Fonte: RIAO/OPTILAS 2007 AIP Conf. Proc. 992 , p. 309
-
-
-
Estudo do comportamento difusivo de DNA em soluções usando técnicas de FRAPP (2008)
Trabalhos em eventos
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Sandra Nakamatsu; Bruno Silveira de Lima Honda; Elisabeth Andreoli de Oliveira
Fonte: Resumos do XXXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada , p. ID:340-1
2007
-
O fenômeno do speckle como introdução à metrologia óptica no laboratório didático (2007)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Muramatsu, Mikiya (Mikiya Muramatsu)
Fonte: Revista Brasileira de Ensino de Física (São Paulo) , v. 29 , p. 283 - Extrato QUALIS: A1
-
Monitoramento de fluxo sangüíneo por espalhamento de laser: o fenômeno do biospeckle como ferramenta de diagnóstico (2007)
Artigo publicado
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Mauro Favoretto Júnior; André Luis de Oliveira Ramos; Nathali Cordeiro Pinto; Maria Cristina Chavantes; Muramatsu, Mikiya (Mikiya Muramatsu)
Fonte: Jornal Brasileiro de Laser , v. 1 , p. 28
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Monitoramento de úlcera venosa por espalhamento de laser, usando o biospeckle como ferramenta de diagnóstico (2007)
Trabalhos em eventos
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Mauro Favoretto Júnior; André Luis de Oliveira Ramos; Nathali Cordeiro Pinto; Maria Cristina Chavantes; Mikiya Muramatsu
Fonte: Livro de resumos do XXX ENFMC , p. 999-1
-
-
-
-
-
2006
2005
-
-
Uso das Propriedades do Speckle Dinâmico no Monitoramento de Secagem de Tintas e Mapeamento de Atividade Biológica (2005)
Trabalhos em eventos
Autores: Emerson Rodrigo da Silva; Mikiya Muramatsu
Fonte: Uso das Propriedades do Speckle Dinâmico no Monitoramento de Secagem de Tintas e Mapeamento de Atividade Biológica , p. 417
-
2004
Atuações
Toledo do Brasil Indústria de Balanças Ltda
-
Funcionário
1999 a 2001
Universidade de São Paulo
-
Estagiário (Estação Ciência)
Aluno
2002 a 2003
-
Bolsista de Iniciação Científica (IFUSP)
Aluno
2004 a 2005
-
Estudante de pós graduação
Bolsista de pós-graduação
2005 a 2011
-
Monitor
Monitor bolsista
2011 a 2011
-
Monitor
Monitor bolsista
2008 a 2008
-
Monitor
Monitor bolsista
2006 a 2006
-
Monitor
Monitor bolsista
2006 a 2006
-
Monitor
Monitor bolsista
2005 a 2005
Universidade Federal do ABC
-
Pesquisador pós-doutor
Bolsista
2012 a 2013
-
Professor Voluntário
2012 a 2012
-
Professor Voluntário
2013 a 2013
-
Pós-doutor
Bolsista
2013 a 2016
Engenharia Agrícola (Impresso)
-
Revisor de periódico
Desde 2012
Materials Chemistry and Physics
-
Revisor de periódico
Desde 2013
University of Reading
-
Visitor
Post-doctoral researcher
2014 a 2015
Biomacromolecules
-
Revisor de periódico
Desde 2016
Universidade Federal de Alagoas
-
Professor Adjunto Visitante
2016 a 2016
Universidade Federal de São Paulo
-
Professor Adjunto, classe C, nível I
Desde 2016
Interface Focus
-
Revisor de periódico
Desde 2016
Scientific Reports
-
Revisor de periódico
Desde 2017
Industrial & Engineering Chemistry Research
-
Revisor de periódico
Desde 2018
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2018
ACS Combinatorial Science
-
Revisor de periódico
Desde 2019
JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE
-
Revisor de periódico
Desde 2019
MATERIALS RESEARCH
-
Revisor de periódico
Desde 2019
Polymers
-
Revisor de periódico
Desde 2019
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2020
MOLECULES
-
Revisor de periódico
Desde 2020
Journal of Molecular Liquids
-
Revisor de periódico
Desde 2020
National Science Centre (Narodowe Centrum Nauki)
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2020
Computational and Structural Biotechnology Journal
-
Revisor de periódico
Desde 2021
BIOPOLYMERS PEPTIDE SCIENCE
-
Revisor de periódico
Desde 2021
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2021
ChemistrySelect
-
Revisor de periódico
Desde 2021
Dutch Research Council
-
Revisor de projeto de fomento
Desde 2022
Acs Applied Bio Materials
-
Revisor de periódico
Desde 2022
Soft Matter
-
Revisor de periódico
Desde 2023
JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE
-
Revisor de periódico
Desde 2023
Computers in Biology and Medicine
-
Revisor de periódico
Desde 2023
Food Bioscience
-
Revisor de periódico
Desde 2023
Communication Chemistry
-
Revisor de periódico
Desde 2023
CHEMMEDCHEM (INTERNET)
-
Revisor de periódico
Desde 2023
Advanced Science
-
Revisor de periódico
Desde 2024
Reports on Progress in Physics
-
Revisor de periódico
Desde 2024
Ensino
Orientações e supervisões
Supervisão de pós-doutorado em andamento
-
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
Tese de doutorado em andamento
-
Investigações estruturais da interface de biofilmes sob ataque de bacteriófagos
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2023
-
Desenvolvimento de matrizes nanoestruturadas para bioimpressão
Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
Dissertação de mestrado em andamento
-
Preparação e caracterização de uma matriz híbrida orgânica-inorgânica para encapsulamento de fármacos anti-HIV
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2023
-
Desenvolvimento de hidrogéis para encapsulamento de quimioterápicos análogos a bases nitrogenadas de DNA
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Universidade Federal de São Paulo
Desde 2022
Tese de doutorado concluídas
-
Bioctive peptide matrices: from molecular structure to biomedical applications
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2019
-
Mariana Machado Leiva Ferreira
ESTUDOS SINTÉTICOS E CONFORMACIONAIS DE FRAGMENTOS DA HÉLICE 8 DE ALGUNS RECEPTORES ACOPLADOS À PROTEÍNA G
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2019
-
Conjugados Híbridos de L,L-Difenilalanine e Fotossensibilizadores
Nanociências e Materiais Avançados
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal do ABC
Concluído em 2016
Dissertação de mestrado concluídas
-
Caracterização Ultraestrutural da Parede de Microrganismos Sob Ação do CPP AIP6
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2021
-
Fabricação de nanoestruturas baseadas no hormônio peptídico bradicinina
Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2020
-
Análise de subprodutos de degradação forçada do antibiótico cefalexina
Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2019
-
Estrutura de Condensados de DNA Miméticos de Cromatina
Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2018
-
Estrutura de Carreadores de Ácidos Nucleicos Baseados no Peptídeo Troiano Penetratina
Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de São Paulo
Concluído em 2017
-
Molhagem e interações moleculares em filmes peptídicos
Física da Matéria Condensada
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Universidade Federal de Alagoas
Concluído em 2016
-
Estudo de agregação de uma sequência peptídica de arginina e fenilalanina
Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia/Química
Universidade Federal do ABC
Concluído em 2014
Gestão
Pesquisa
Universidade Federal do ABC
-
Auto-Organização Hierárquica de Peptídeos Anfifílicos: Mecanismos Fundamentais e Potenciais Aplicações
2013 a 2015
-
Conjugados polímero-peptídeo para formulação de hidrogéis e seu uso em detecção
Propomos estudar o processo de hidrogelação de sequências peptídicas de baixo peso molecular, conjugados com polímeros orgânicos baseados em PEG. As matrizes de hidrogel obtidas por esse processo poderão ser utilizadas, por exemplo, para imobilização dos antígenos da leishmaniose visando o desenvolvimento de imunossensores. Essas espécies são amplamente capazes de estabelecer biointerfaces por meio de operações de reconhecimento molecular, ampliando significativamente seu leque de aplicações. Estudaremos em detalhe a síntese e formulação desses sistemas, empreendendo análises detalhadas de seus aspectos físico-químicos. Um amplo conjunto de ferramentas analíticas será empregado para trazer informações acerca de propriedades estruturais, reológicas e térmicas que, presumivelmente, guardam relação direta com as características químicas desenvolvidas nas etapas de síntese e formulação. Para ampliar nossa contribuição para o entendimento desses sistemas, essas informações experimentais serão combinadas experimentos in silico tendo em vista a elucidação de mecanismos fundamentais presentes na formação das nanoestruturas. Em uma segunda etapa, essas matrizes serão funcionalizadas com compostos ativos, assim como variações das estruturas dos polímeros sintéticos derivados do polietileno glicol, com intuito de se obterem diferentes organizações supramoleculares com possíveis aplicações em arquiteturas de detecção.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, Cristiano Luís Pinto de Oliveira, ALVES, W.A., FILETI, EUDES E., Fábio Furlan Ferreira, Alexandre Reily Rocha
2016 a 2018
-
Investigações estruturais em sistemas-modelo baseados em peptídeos anfifílicos
Propomos a síntese e caracterização de novas nanoestruturas peptídicas, a partir de reações de auto-organização. Serão preparadas sequências peptídicas inéditas do tipo bola-anfifílicos e lipopeptídicos. A escolha por essas classes está apoiada no rico polimorfismo de mesofases que elas são capazes de formar e na sua capacidade de estabelecer biointerfaces por meio de operações de reconhecimento molecular, ampliando significativamente seu leque de aplicações. Estudaremos a formação desses sistemas e os tipos de interações presentes em sua construção. Técnicas de espalhamento a baixo ângulo (raios X e nêutrons) serão utilizadas para determinação de aspectos estruturais a fim de lançar luz sobre mecanismos físico-químicos envolvidos em sua automontagem. Uma vez determinadas as condições ótimas para a formação dos arranjos, os respectivos diagramas de fases serão levantados. Para isso, técnicas que fornecem informações complementares nos espaços direto e recíproco serão utilizadas. Por meio delas, além de informações de morfologia e estrutura, parâmetros elásticos e/ou termodinâmicos serão obtidos. Essas informações, combinadas a experimentos in silico realizados por colaboradores, contribuirão para a elucidação dos processos em nível fundamental. Posteriormente, serão realizados estudos de modificações estruturais destes peptídeos, variando-se os resíduos de aminoácidos empregados na formação de micro- e nanoestruturas. O intuito é a obtenção de diferentes organizações supramoleculares com possíveis aplicações em arquiteturas de detecção. Ainda, este tipo de formação hierárquica poderá ser acompanhado in situ utilizando a técnica de SAXS, como demonstrado em diversas aplicações prévias.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, ALVES, W.A., FILETI, EUDES E., SOUZA, SIVONEY
2013 a 2016
Universidade Federal de São Paulo
-
Caracterização ultraestrutural de nanoscaffolds bioativos
Matrizes nanoestruturadas obtidas a partir da auto-organização de biomoléculas são uma classe promissora para formulação da próxima geração de biomateriais. Nesse contexto, scaffolds tridimensionais constituídos por redes fibrilares nanoscópicas que mimetizam o meio biológico estão entre os sistemas mais atraentes para aplicação biotecnológica. Obviamente, o conhecimento detalhado da organização espacial desses arranjos em escala nanométrica é um aspecto crucial para seu pleno desenvolvimento e aplicação. O presente projeto visa o desenvolvimento e consolidação de uma linha de pesquisa ligada à caracterização estrutural de scaffolds nanoscópicos dotados de bioatividade. As matrizes aqui desenvolvidas serão constituídas por hidrogéis baseados em peptídeos capazes de reproduzir o microambiente encontrado em tecidos biológicos e modular respostas celulares. Em particular, formularemos sistemas contendo motivos de adesão celular e peptídeos penetrantes de células. A ultraestrutura desses materiais será analisada por um conjunto amplo de técnicas biofísicas, com especial ênfase em microscopia de força atômica (AFM). Trata-se de um projeto integrado que, por meio do treinamento de estudantes de graduação e pós-graduação, terá como resultado estruturante a implementação a técnica de AFM para análise de materiais biológicos no campus São Paulo da UNIFESP.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, Wendel Andrade Alves, HAMLEY, IAN WILLIAM
Desde 2023
-
Matrizes Peptídicas Bioativas: da Estrutura Molecular às Aplicações Biomédicas
Este projeto de tese tem por objetivo a produção e caracterização de matrizes nanoestruturadas obtidas a partir da auto-organização de peptídeos bioativos. Nossa atenção será concentrada em sequências pertencentes a três classes de compostos bioativos: peptídeos penetrantes de células, peptídeos constituintes da matriz extracelular (colágeno e elastina) e peptídeos anti-inflamatórios. Buscaremos responder a perguntas fundamentais ligadas à estruturação desses sistemas bem como providenciar informação acerca de suas propriedades estruturais supramoleculares. A estrutura desses sistemas na presença de drogas modelo será investigada. Um conjunto de técnicas experimentais avançadas que incluem nanoespectroscopia de infravermelho acoplada à microscopia de força atômica (AFM-IR), espalhamento de raios X a baixo ângulo (SAXS) e microscopia por espalhamento Raman coerente anti-Stokes (CARS) será utilizado para investigar a organização dos sistemas com elevado grau de resolução. Além da caracterização estrutural detalhada, pretendemos testar a bioatividade desses sistemas para determinar se as funções exibidas pelos blocos moleculares são preservadas ou mesmo amplificadas mediante a organização em superestruturas. Baseados nos resultados estruturais e de bioatividade, desejamos estabelecer relações do tipo estrutura-atividade e contribuir para otimizar a formulação de materiais biomédicos baseados nessas moléculas bioativas.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, Clovis Ryuichi Nakaie, BICEV, RENATA N., Emerson Rodrigo da Silva, Lucas Rodrigues de Mello
Desde 2020
-
Organização estrutural e bioatividade em sistemas auto-organizados de peptídeos e nucleotídeos
Ácidos nucleicos e peptídeos ocupam posição privilegiada no espectro de materiais usados para a fabricação de bionanoestruturas. Essas espécies moleculares exibem alta versatilidade físico-química concomitantemente à biocompatibilidade intrínseca. Inspirados por essas propriedades únicas, visamos nesse projeto formular materiais nanoestruturados baseados na auto-organização de peptídeos e nucleotídeos. Um conjunto de técnicas avançadas incluindo nanoespectroscopia de infravermelho, espalhamento de raios-X a baixo ângulo resolvido no tempo, microscopia de força atômica em meio líquido e microscopia de espalhamento Raman anti-Stokes será utilizado para revelar detalhes dessas nanopartículas através da escala mesoscópica, da estrutura secundária à interação com membranas celulares na escala micrométrica. Nosso foco será em três classes principais de peptídeos bioativos: peptídeos penetrantes de células (CPPs), constituintes da matriz extracelular (sequências tipo colágeno e elastina) e peptídeos anti-inflamatórios. Os blocos nucleotídicos serão monofosfatos baseados nas bases purinas adenina e guanosina. As capacidades dessas matrizes para encapsular drogas modelo será investigada. Além da caracterização estrutural detalhada, desejamos testar a bioatividade desses sistemas para determinar se as funções exibidas pelos blocos moleculares são preservadas ou mesmo amplificadas mediante a organização em superestruturas. Baseados nas informações estruturais e de bioatividade, desejamos estabelecer relações do tipo estrutura-atividade e contribuir para otimizar a formulação de materiais biomédicos baseados nessas moléculas bioativas.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, Cristiano Luís Pinto de Oliveira, CASTELLETTO, VALERIA, HAMLEY, IAN WILLIAM, Sang Won Han, Lucas Rodrigues de Mello
2020 a 2023
-
Fabricação de Nanoestruturas de Bradicinina Mediada por DNA
A auto-organização de biomoléculas constitui uma estratégia central em campos emergentes como a engenharia biomolecular, a bionanotecnologia e a nanomedicina. Inspirados pelo rico polimorfismo observado em componentes biológicos fundamentais, cientistas trabalhando na interface Física-Química-Biologia têm tirado vantagem das características únicas exibidas por blocos moleculares extremamente versáteis como os amino ácidos e as nucleobases para construir uma série de novos materiais com aplicações que vão desde o transporte intracelular até a produção de matrizes teciduais. Neste projeto, pretendemos desenvolver estratégias de fabricação de nanoestruturas inéditas baseadas na Bradicinina, um peptídeo-hormônio com potente efeito hipotensor. A extensa presença de prolinas na composição deste peptídeo confere a ele rigidez estrutural que dificulta a formação de estruturas de com simetria definida em solução. Para contornar esse problema, a estratégia central será o uso de cadeias lineares de DNA como template que, através de interações eletrostáticas, mediarão a automontagem das nanoestruturas peptídicas. Diversos parâmetros físico-químicos, envolvendo desde modificações no desenho da molécula de Bradicinina até características iônicas do meio de promoção da automontagem, serão testados. A estrutura dos arranjos formados será elucidada por meio de uma série de ferramentas biofísicas compreendendo métodos espectroscópicos, espalhamento a baixo ângulo e microscopia avançada. O sucesso da formulação desses sistemas e a compreensão detalhada de sua organização nanoscópica abrirão portas para a produção de nanoestruturas bioativas com propriedades de controle de pressão arterial.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, HAMLEY, IAN, Clovis Ryuichi Nakaie
2019 a 2022
-
CAPES-Print: Desenvolvimento de tratamentos e terapias para doenças inflamatórias
A inflamação aguda é definida como reação imunológica do corpo Humano com o objetivo de defesa contra elementos estranhos - estes incluem microrganismos e toxinas. Esse processo ocorre em diversas etapas (podendo ser única ou múltipla) com lesões e reparações teciduais em busca do retorno ao estado fisiológico normal. Não raramente, em processos inflamatórios leves a moderados, de curta duração, ocorre a reparação tecidual sem sequelas, no entanto, a severidade com cronicidade do processo inflamatório pode levar a modificações teciduais de diversos graus e contribuir para a indução de várias doenças, podendo levar a falência dos órgãos afetados e até mesmo a morte do paciente. Este projeto tem como objetivo a compreensão fisiopatológica com foco no tratamento e desenvolvimento de terapias de diversos tipos de doenças de cunho inflamatório, que incluem doenças isquêmicas (ex. cerebrais, cardíacas, de membros e de estruturas sensoriais da orelha interna); doenças respiratórias causadas pela poluição ambiental, alergias; doenças metabólicas (como diabetes e suas consequências) e tóxicas (ex. acidentes com toxinas de animais peçonhentos). Dessa maneira, aproveitando os conhecimentos gerados por pesquisas em ciências básicas e translacionais, pretende-se desenvolver terapias baseadas na modulação de genes que controlam a atividade das células inflamatórias (como monócitos e macrófagos), no uso de células-tronco entre outras abordagens que visam potenciais tratamentos anti-inflamatórios e regenerativos.
Autores: Emerson Rodrigo da Silva, Sang Won Han
Desde 2019
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Peptídeos Penetrantes de Células para Transporte de DNA Plasmidial e microRNA: da Estrutura Nanoscópica à Entrega de Genes
Em fins da década de 1980, pesquisas relacionadas ao HIV conduziram à descoberta surpreendente de que certos domínios proteicos são capazes de transpor membranas eucarióticas. Essas sequências curtas, contendo tipicamente entre 5 e 40 aminoácidos, logo foram denominadas peptídeos penetrantes de células (CPPs) e seu potencial para a produção de vetores sintéticos aplicados à terapia gênica foi prontamente reconhecido. A literatura atual apresenta cerca 150 CPPs eficazes para o transporte de compostos bioativos; no entanto, análises detalhadas da organização nanoscópica de conjugados baseados em CPPs ainda são bastante escassas. Este cenário leva à ausência de informações fundamentais para se estabelecer correlações entre estrutura e transfecção, dificultando a otimização desses transportadores. Neste projeto, contribuiremos para o preenchimento dessas lacunas por meio de investigações sistemáticas acerca do ordenamento nanoscópico de conjugados de CPPs e ácidos nucleicos. Estudaremos complexos envolvendo tanto sequências circulares longas (4.7 kb) de DNA plasmidial quanto RNA pequeno (20-22 nt). A organização nanoscópica será elucidada por meio de uma combinação sofisticada de técnicas biofísicas envolvendo espalhamento de raios X e de nêutrons a baixo ângulo, difração de raios X em fibras, microscopia eletrônica e de força atômica e métodos espectroscópicos. Paralelamente, ensaios de transfecção serão realizados para investigar tanto a expressão quanto a supressão de proteína fluorescente verde em células de mamíferos para revelar o papel da estrutura na eficiência desses vetores. Como objetivo final, pretendemos identificar aspectos estruturais comuns a diferentes tipos de CPPs e, a partir desses traços universais, produzir novos CPPs com estrutura otimizada para transfecção.
2017 a 2020
Atualização Lattes em 2024-07
Processado em 2024-07-22