A Pró-Reitoria de Administração (ProAdm) é um órgão executivo de assessoramento à Reitoria, cujo objetivo é propiciar atividades de apoio aos diversos campi, gerenciando os processos administrativos, por intermédio dos seguintes departamentos que o compõem: Coordenadoria de Importação, Coordenadoria de Conceção de Diárias e Passagens, Coordenadoria de Diplomas, Assessoria de Gestão e Governança, Departamento de Gestão Contábil e Financeira, Departamento de Gestão Orçamentária, Departamento de Gestão e Segurança Ambiental e Departamento de Convênios e Análise de Prestação de Contas.
Suas principais atribuições envolvem a execução de procedimentos licitatórios de compras nacionais e internacionais; o gerenciamento, análise e execução dos recursos financeiros; o registro dos atos e fatos contábeis, controle do patrimônio e suas variações; a formalização e gerenciamento de convênios e termos de parcerias; a análise de prestação de contas de contratos firmados com fundações de apoio/convênios; e a implementação de ações e políticas de responsabilidade socioambiental e sustentabilidade na instituição.
As câmaras técnicas, vinculadas à ProAdm, são órgãos normativos e deliberativos, cujo intuito é aprimorar os fluxos de trabalho dos departamentos, buscando a normatização e padronização dos procedimentos no âmbito da Unifesp. Estão estabelecidas no âmbito da Pró-Reitoria de Administração as Câmaras Técnicas de Contratos, de Convênios, de Compras, de Serviços, de Controladoria, de Patrimônio e de Gestão e Segurança Ambiental, além das Câmaras Técnicas Ampliadas que são as realizadas com mais de uma temática em conjunto.
O Conselho de Planejamento e Administração (COPLAD), órgão deliberativo acima da Pró-Reitoria de Administração, orienta e coordena as atividades administrativas, acompanhando o desempenho dos departamentos. Atua também na execução da proposta orçamentária e dos respectivos planos de aplicação, entre outras funções estabelecidas em seu regimento.
