Grupos de pesquisa do Instituto das Cidades (grupos certificados pela Unifesp e cadastrados no CNPq)

- Centro de Estudos Periféricos
Coordenador: Tiaraju Pablo D'Andrea

- CIDADE, PARTICIPAÇÃO E EDUCAÇÃO
Coordenador: Jorge Luiz Barcellos da Silva

- Grupo de Estudos Dinâmicas Territoriais e Conflitos Socioambientais (GETECON)
Coordenador: Tiago Damas Martins