Dentro da área de Ciências do Mar, as linhas de pesquisa desenvolvidas pelo corpo docente atual e seus colaboradores, são apresentadas a seguir:
Análise geocronológica de sedimentos e fósseis;
Análises radiométricas ambientais em sedimentos e áreas de extração de petróleo e gás;
Automação e Controle aplicada em Ambientes Artificiais e Naturais;
Avaliação Ambiental, Biogeoquimica ambiental, dragagem portuária e Bioacumulação de contaminantes;
Biomarcadores moleculares de contaminação aquática;
Caracterização de materiais utilizando Fluorescência de Raios X, Termoluminescência e Ressonância Paramagnética Eletrônica aplicados à monitoração ambiental e dosimetria das radiações;
Cartografia digital a partir de imagens sensoriais e dados GNSS;
Catálise heterogênea para produção de combustíveis alternativos (hidrogênio, dimetil-éter, biodiesel);
Cogestão adaptativa de sistemas socioecológicos costeiros;
Desenvolvimento de novas linhas de evidência em avaliações ambientais integradas;
Desenvolvimento de técnicas de manejo e sistemas de cultivo para organismos aquáticos, com ênfase em tecnologias sustentáveis de produção;
Diversidade e sucesso evolutivo de nemátodas de vida livre;
Divulgação Científica;
Ecologia aquática;
Estrutura de comunidades de meiofauna;
Ecologia de Ecossistemas Costeiros;
Ecologia de praias arenosas;
Ecologia e Conservação de Sistemas Recifais rasos e mesofóticos;
Ecologia e fisiologia do fitoplâncton em ambientes marinhos;
Ecologia marinha;
Ecotoxicologia aquática;
Estudos observacionais e de modelagem numérica e estatística do impacto do clima, da variabilidade e mudança climática e de extremos climáticos sobre o meio ambiente;
Estudos sociais da ciência e da tecnologia;
Evolução de sistemas deposicionais quaternários;
Ferramentas de Modelagem Numérica e Aquisição de Dados Ambientais aplicados aos Recursos Renováveis de Energia;
Genética e Conservação de Recursos pesqueiros;
Impacto ambiental e exposição a TENORM no segmento de exploração e produção de petróleo;
Impacto das mudanças climáticas nos ecossistemas costeiros;
Impactos antrópicos em ambientes marinhos costeiros;
Interação homem-tecnologia-ambiente;
Interações sociedade-tecnologia-ambiente;
Materiais compósitos poliméricos (derivados de petróleo) na dosimetria das radiações;
Meio ambiente e fenômenos da poluição;
Microbiologia aplicada à Engenharia Sanitária e Bioenergia;
Monitoramento e modelagem de dispersão de poluentes atmosféricos;
Operação logística;
Operação portuária;
Paleoclimatologia
Potencial terapêutico de produtos extraídos de organismos marinhos;
Processos ecológicos e impactos antrópicos reguladores da biodiversidade marinha;
Produção de Material Didático Alternativo;
Psicologia Ambiental e Desenvolvimento Humano;
Qualidade em processos industriais e interação com o Meio Ambiente através do manuseio Sustentável de recursos Naturais;
Rede Neural Artificial aplicada a estudos de interação Oceano-Atmosfera;
Sistemática e história evolutiva de metazoários, com ênfase em organismos construtores de habitat em mar profundo;
Tratamento de esgotos sanitários por biorreatores de membranas submersas visando o reúso de água;
Virologia Marinha e Ecologia Molecular de Micro-Organismos.