O símbolo do curso de Educação Física do Campus Baixada Santista da Unifesp foi escolhido em processo de votação na qual a comunidade escolheu, por 65% dos votos, a criação coletiva desenvolvida por Gabriel Claro Nogueira e Miguel Pereira Puente, com apoio da Comissão organizadora da III Semana da Educação Física – Unifesp (2021).
O logotipo escolhido tem como elemento principal, Atena, a deusa da sabedoria, de pé em plano frontal segurando um escudo com Discóbolo de Mirón (símbolo da educação física) estampado na frente, representando a educação física. Esse conceito simboliza que a atividade física, o exercício físico e a cultura corporal devem sempre ser empunhados e suportados pelo conhecimento.
Há também, uma cobra representando o reconhecimento da educação física como área da saúde. Logo abaixo, possui o nome do curso, da instituição e o ano de início de nosso curso de Educação Física.